DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment mEFG1 and Gfm1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_609105.1 Gene:mEFG1 / 34004 FlyBaseID:FBgn0263133 Length:745 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_446077.2 Gene:Gfm1 / 114017 RGDID:631396 Length:751 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:709 Identity:478/709 - (67%)
Similarity:580/709 - (81%) Gaps:1/709 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    38 PIERIRNIGISAHIDSGKTTLTERILFYTGRIAEMHEVRGKDNVGATMDSMELERQRGITIQSAA 102
            |.|:||||||||||||||||||||:|:||||||.||||:|||.|||.||||||||||||||||||
  Rat    43 PNEKIRNIGISAHIDSGKTTLTERVLYYTGRIATMHEVKGKDGVGAVMDSMELERQRGITIQSAA 107

  Fly   103 TYTLWKDTNINIIDTPGHVDFTVEVERALRVLDGAVLVLCAVGGVQSQTLTVNRQMKRYNVPCLA 167
            |||:|:|.||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||.||:||:|||||||||.|.
  Rat   108 TYTMWRDVNINIIDTPGHVDFTIEVERALRVLDGAVLVLCAVGGVQCQTMTVSRQMKRYNVPFLT 172

  Fly   168 FINKLDRLGSNPYRVLSQMRSKMNHNAAFIQLPIGVESNCKGIVDLVREKAIYFEGEHGMDIRLD 232
            |||||||:||||.|.|.|||||:||||||:|:|||:|.:.|||:||:.|:||||:|:.|..:|.|
  Rat   173 FINKLDRMGSNPARALQQMRSKLNHNAAFVQIPIGLEGDFKGIIDLIEERAIYFDGDFGQIVRYD 237

  Fly   233 EIPQDMRVESLERRQELIEHLSNADETLGELFLEEKPFTEDDIKAALRRTCINRTFTPVLVGTAL 297
            |||.|:|..:.:.||||||.::|:||.|||||||||..:..|:|.|:||..::|:||||.:|:||
  Rat   238 EIPADLRAAAADHRQELIECVANSDEQLGELFLEEKIPSVSDLKLAIRRATLSRSFTPVFLGSAL 302

  Fly   298 KNKGVQPLLDAVLDYLPNPGEVENLGFI-EKEGQDPEKVVLNPARDGKDPFVGLAFKLEAGRFGQ 361
            |||||||||||||::||||.||:|...: :.:.::..|:::||.||...||||||||||||||||
  Rat   303 KNKGVQPLLDAVLEFLPNPSEVQNYALLNQNDSKEKNKILMNPKRDDSHPFVGLAFKLEAGRFGQ 367

  Fly   362 LTYLRCYQGVLRKGDNIFNARTNKKVRIARLVRLHSNQMEDVNEVYAGDIFALFGVDCASGDTFT 426
            |||:|.|||.|:||..|:|.||.||||:.||||:|::.||||.|||||||.||||:|||||||||
  Rat   368 LTYVRNYQGELKKGSTIYNTRTGKKVRVQRLVRMHADMMEDVEEVYAGDICALFGIDCASGDTFT 432

  Fly   427 TNPKNNLSMESIFVPEPVVSMAIKPNNTKDRDNFSKAIARFTKEDPTFHFFFDNDVKETLVSGMG 491
            ....::||||||.||:||:|:|:||:|..|.:.|||.|||||:|||||...||.:.|||:|||||
  Rat   433 NKDNSDLSMESIHVPDPVISVAMKPSNKNDLEKFSKGIARFTREDPTFKVHFDTESKETIVSGMG 497

  Fly   492 ELHLEIYAQRMEREYGCPVTLGKPKVAFRETLVGPCEFDYLHKKQSGGSGQYARIIGVMEPLPPN 556
            ||||||||||||||||||...||||||||||:..|..||:.|||||||:|||.::|||:|||.|.
  Rat   498 ELHLEIYAQRMEREYGCPCITGKPKVAFRETVTAPVPFDFTHKKQSGGAGQYGKVIGVLEPLAPE 562

  Fly   557 QNTLLEFVDETVGTNVPKQFVPGVEKGYREMAEKGMLSGHKLSGIRFRLQDGGHHIVDSSELAFM 621
            ..|.|||.|||.|.||||||||.||||:.:..|||.||||||||:||.||||.||:|||:|::|:
  Rat   563 DYTKLEFSDETFGANVPKQFVPAVEKGFLDACEKGPLSGHKLSGLRFVLQDGAHHMVDSNEISFI 627

  Fly   622 LAAHGAIKEVFQNGSWQILEPIMLVEVTAPEEFQGAVMGHLSKRHGIITGTEGTEGWFTVYAEVP 686
            .|..||:|:...:.:..|:||||.|||.||.||||||...:::|||:|||.:|.|.:||:||:||
  Rat   628 RAGEGALKQALASATLCIIEPIMSVEVIAPNEFQGAVFAGINRRHGVITGQDGIEDYFTLYADVP 692

  Fly   687 LNDMFGYAGELRSSTQGKGEFTMEYSRYSPCLPDVQDQIVRQYQESQGLAQPDKKKKKN 745
            ||:||||:.||||.|:||||:||||:||.||.|..|:::|.:|.|:.|.....|.|.||
  Rat   693 LNNMFGYSTELRSCTEGKGEYTMEYNRYQPCSPSTQEELVNKYLEATGQLPVKKGKAKN 751

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
mEFG1NP_609105.1 FusA 38..731 CDD:440248 472/693 (68%)
Gfm1NP_446077.2 FusA 45..735 CDD:440248 470/689 (68%)

Return to query results.
Submit another query.