Protein Alignment Hsp60C and cct4

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608948.2
• Gene: Hsp60C / 33796
• FlyBaseID: FBgn0031728
• Length: 576
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_956877.1
• Gene: cct4 / 393555
• ZFINID: ZDB-GENE-040426-1421
• Length: 533
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 559
• Identity: 122/559 - (21%)
• Similarity: 235/559 - (42%)
• Gaps: 98/559 - (17%)

  Fly    35 EVRAMMLQGVDVLADAVAVTMGPKGRNVIIEQSWGSPKITKDGVTVAKSIALKDKFQNIGAKLVQ 99
            ::|...:.....:|||:..::||||.:.:|:...|...||.||.|:.|.:    :..:..||::.
Zfish    26 QIRYSNINAGKAVADAIRTSLGPKGMDKMIQDGKGDVTITNDGATILKQM----QVLHPAAKMMV 86

  Fly   100 DVANNTNEEAGDGTTTATVLARAIAKEGFEKISRGASPVEIRRGVMLAIETVKDNLRRLSRP--V 162
            :::...:.|||||||:..|:|.|:.....:.:.:|..|..|......|::...:.|..:|.|  :
Zfish    87 ELSKAQDIEAGDGTTSVVVIAGALLDACAKLLQKGIHPTIISESFQKAVDKGVEVLTSISTPLLL 151

  Fly   163 NTPEEICQVATIS------ANGDKSVGNLISEAIKKV----------GRDGVITVKDGKTLCDEL 211
            :..|.:...|:.|      :.....:..:..:|:.||          .||..:..|.|.|: |:.
Zfish   152 SDRESLLNSASTSLCSKVVSQNSSLLAPMSVDAVMKVIDPATATSVDLRDINVVKKLGGTI-DDC 215

  Fly   212 EVIEGMKFDRGYISPYFINTSKGAKVEFQDALLLFCEKKIKSAPSIVPALELANAQRKPLVIIAE 276
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Zfish   216 ELVDGMVLTQRVASTGVSRVEK-AKI----GLIQFC-----LSP---PKTDMDNQ------IVVS 261

  Fly   277 DL---------EAEALSTLVVNRLKVGLQVCAVKAPGFGDNRKENLMDMAVATGGIVFGDEANMV 332
            |.         |...:..||....|.|..|..:        :|..|.| |::...:.|.::..::
Zfish   262 DYAQMDRVLREERAYILNLVKQVKKAGCTVLLI--------QKSILRD-ALSDLALHFLNKMKIM 317

  Fly   333 RLEDIKMSDFGRVGEVVVSK------DDTMLLKGKGQKAEVEKRVEGLREAIKESTSSYEKEKMQ 391
            .::||:..:...:.:.:.:|      ..|..:.|..:..| |..::|..:.:|.:..:
Zfish   318 VIKDIEREEIEFICKTIGTKPIAHIDQFTPEMLGSAELVE-EVSLDGSGKLVKITGCA------- 374

  Fly   392 ERLARLSSGVAL-LRVGGSSDVEVSEKKDRVIDALNATRAAVEE-GIVPGGGTALLRCIQKLNDL 454
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Zfish   375 ------SPGKTVSIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLVKKRALIAGGGAPEIELALRL--- 430

  Fly   455 KGANEDQNMG------IEIIRRALRMPCLTIAKNAGVDGAMVVAKV--EILDGD--YGYDALKGE 509
              |...:::|      :.....||.:...|:|:|||::....|.::  ....|:  .|.:..||.
Zfish   431 --AEYARSLGGMEAYCVRAYADALEVIPSTLAENAGLNPISTVTELRNRHAQGETTAGINVRKGG 493

  Fly   510 YGNMIERGIIDPTKVVRTAISDAA-GVASLLTTAEAVVT 547
            ..|::|..::.|..|..:|::.|. .|.|:|...:.|.|
Zfish   494 ISNILEELVVQPLLVSISALTLATETVRSILKIDDLVNT 532

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Hsp60C	NP_608948.2	GroEL	28..548	CDD:239460	122/559 (22%)
cct4	NP_956877.1	TCP1_delta	20..532	CDD:239454	121/557 (22%)