DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment: Sgs1 and SPBPJ4664.02

Sequence 1:NP_523475.3 Gene:Sgs1 FlyBaseID:FBgn0003372 Length:1286 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_595277.1 Gene:SPBPJ4664.02 PomBaseID:SPBPJ4664.02 Length:3971 Species:Schizosaccharomyces pombe

Alignment Length:1387 Identity:440/1388 (32%)
Similarity:658/1388 (47%) Gaps:301/1388 (22%)


  Fly    59 SNPTTTKPRQKTKRPKSTRRTTKRTKRPRRKTTKWTTKRATKRTTKRTTRRRPT----------- 112
            |.|.|:.....:..| .|..|...|..|   .|:::...::...|..|.....|           
pombe   561 STPITSSSVLNSSTP-ITSSTVVNTSTP---ITRYSVLNSSTPITSSTVLNSSTPITSSSVLNSS 621

  Fly   113 TPKTPDT---TDSPITTTGAECTCSDRTTASSTDSTTDRTTVTNTDWTTP------LCTDTP--- 165
            ||.|..|   |.:|||::....:.:..|::|..:|:|..|:.|..:.:||      |.:.||   
pombe   622 TPITSSTALNTSTPITSSSVLNSSTPITSSSVLNSSTPITSSTALNTSTPITSSSVLNSSTPITS 686

  Fly   166 --------PCTCSE--ESSTAIPSSPCIDTSTVIPTSPCTQETTTPTPTCSTQGTQTTPCTCAQ- 219
                    |.|.|.  .|||||.||..::|||.| ||.....::||. |.||....:||.|.:. 
pombe   687 STALNTSTPITSSSVLNSSTAITSSTALNTSTPI-TSSSVLNSSTPI-TSSTALNTSTPITSSSV 749

  Fly   220 -TTTTP--------RSTTTTSTSRPTTTTP-RSTTTTTTSRPTT-------TTP-RSTTTTTTRR 266
             .::||        .||..||:|...::|| .|:|...||.|.|       :|| .|:|...:..
pombe   750 LNSSTPITSSSILNSSTPITSSSVLNSSTPITSSTVVNTSTPITSSSVLNSSTPITSSTVLNSST 814

  Fly   267 PTT-------TTPRCTTTTSTCAPTTTTPRSTTTTTTSRPTT-------TTPRCTTTTSTCSPTR 317
            |.|       :||   .|:||...|:|...|:|...:|.|.|       :||   .|:||...|.
pombe   815 PITSSSVLNSSTP---ITSSTVVNTSTPITSSTVVNSSTPITSSSVLNSSTP---ITSSTALNTS 873

  Fly   318 TTPRSTTTTSTSRP-TTTTPRCTTTPSTSRPTTTTPRSTTKTSTCAPTTTTP------RPTTTPS 375
            |...|::..::|.| |::|...|:||.||  :|....||..||:.|..|:||      ..::||.
pombe   874 TPITSSSVLNSSTPITSSTVVNTSTPITS--STVVNSSTPITSSTALNTSTPITSSSVLNSSTPI 936

  Fly   376 TSRP--TTTTP--------RSTTTTSTSRPTTTTP-RSTTTTTTRRPTTTTP---RSTTTTSTSR 426
            ||..  .|:||        .||..||::...::|| .|:|...|..|.|::.   .||..||:|.
pombe   937 TSSTGLNTSTPITSSSVLNSSTPITSSTVLNSSTPITSSTALNTSTPITSSSVLNSSTPITSSSV 1001

  Fly   427 PTTTTP-------------RSTTTTTTSRPTT-------TTP-RSTTTTCTCSPTT-------TT 463
            ..|:||             .|:|...||.|.|       :|| .|:|...|.:|.|       :|
pombe  1002 LNTSTPITSSSVLNSSTAITSSTALNTSTPITSSSVLNSSTPITSSTVVNTSTPITSSTVVNSST 1066

  Fly   464 P-RSTTTTSTSRPTT-------TTP--------RSTTTTSTSGPTTTTP-RSTTTTTTSGP-TTT 510
            | .|:|..:||.|.|       :||        .||..||:|...::|| .|:|...||.| |::
pombe  1067 PITSSTALNTSTPITSSSVLNSSTPITSSTVLNSSTPITSSSVLNSSTPITSSTVVNTSTPITSS 1131

  Fly   511 TPRSTTTTCTCSP--------TTTTPRSTTTPSTSRPTTTTPRSTTTTCTCSPTTTTP-RSTTTT 566
            |..:|:|..|.|.        |::|..:|:||.||  :|....||..|.:....|:|| .|:|..
pombe  1132 TALNTSTPITSSSVLNSSTPITSSTVVNTSTPITS--STVVNSSTPITSSTVVNTSTPITSSTVV 1194

  Fly   567 STSRPTT-------TTP-RSTTTTTTSRPTTTTP---RSTTTTSTSGPTTTTP--------RSTT 612
            :||.|.|       :|| .|:|...||.|.|::.   .||..||:|...::||        .||.
pombe  1195 NTSTPITSSTVVNSSTPITSSTVLNTSTPITSSSVLNSSTPITSSSILNSSTPITSSSVLNSSTP 1259

  Fly   613 TTSTSGPTTTTP-RSTTTTSTSGPTT-------TTP--------RSTTTTSTSGPTTTTP-RSTT 660
            .||::...::|| .|:|..:||.|.|       :||        .||:.||:|...::|| .|:|
pombe  1260 ITSSTVVNSSTPITSSTALNTSIPITSSSVLNSSTPITSSTALNTSTSITSSSVLNSSTPITSST 1324

  Fly   661 TTSTSGPTTTTP---RSTTTTSTSGPTTTTP-RSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPR 721
            ..:||.|.|::.   .||..||::...::|| .|:|..:||.|.|    |:|..:||.|.|    
pombe  1325 VVNTSTPITSSSVLNSSTPITSSTVVNSSTPITSSTVVNTSTPIT----SSTVVNTSTPIT---- 1381

  Fly   722 STTTTSTSGPTTTTP---RSTTTTSTSGPTTTTP-RSTTTTSTSGPTT-------TTP-RSTTTT 774
            |:|..::|.|.|::.   .||..||:|...::|| .|:|..:||.|.|       :|| .|:|..
pombe  1382 SSTVVNSSTPITSSTVLNSSTPITSSSVLNSSTPITSSTVVNTSTPITSSTVVNSSTPITSSTVV 1446

  Fly   775 STSGPTT-------TTP-RSTTTTSTSGPTTTTP---RSTTTTSTSGPTTTTP-RSTTTTSTSGP 827
            :||.|.|       :|| .|:|..:||.|.|::.   .||..||::...|:|| .|:|..:||.|
pombe  1447 NTSTPITSSSVLNSSTPITSSTVVNTSTPITSSTVVNSSTPITSSTVVNTSTPITSSTVVNTSTP 1511

  Fly   828 TT-------TTP-RSTTTTSTSGPTTTTP---RSTTTTSTSGPTTTTP-RSTTTTSTSGPTTTTP 880
            .|       :|| .|:|..:||.|.|::.   .||..||:|...::|| .|:|..:||.|.|::.
pombe  1512 ITSSTVVNSSTPITSSTVLNTSTPITSSSVLNSSTPITSSSVLNSSTPITSSTVVNTSTPITSSS 1576

  Fly   881 ---RSTTTTSTSGPTTTTP--------RSTTTTSTSGPTTTTP--------RSTTTTSTSCPTTT 926
               .||..||::...|:||        .||..||::...|:||        .||..||::...::
pombe  1577 VVNSSTPITSSTALNTSTPITSSSVLNSSTPITSSTALNTSTPITSSSVLNSSTPITSSTVLNSS 1641

  Fly   927 TPRSTTTTCTSGP----TTTTPRSTTTTCTSCPTTTTP-RSTTTTCTSCP-TTTTPRSTTTTCTS 985
            ||.:::|...:.|    :|....||..|.::...|:|| .|:|...:|.| |::|..:|:|..||
pombe  1642 TPITSSTALNTSPPITSSTVVNSSTPITSSTVVNTSTPITSSTVVNSSTPITSSTALNTSTPITS 1706

  Fly   986 GPTTTTPRSTTKTSTCAPTTTTP-RSTTTTSTSRPTTTTPRSTTTTTTSRP-TTTTPRSTTTPST 1048
            .....:  ||..||:....|:|| .|:|..::|.|.|    |:|...:|.| |::|..:|:||.|
pombe  1707 SSVLNS--STPITSSTVVNTSTPITSSTVVNSSTPIT----SSTVVNSSTPITSSTALNTSTPIT 1765

  Fly  1049 SRP--TTTTP-RSTTTTSTSRPTTTTP---RSTTKTSTCAPTTTTP--------RSTTTTTTSRP 1099
            |..  .::|| .|:|..:||.|.|::.   .||..||:.|..|:||        .||..|:::..
pombe  1766 SSSVLNSSTPITSSTALNTSTPITSSSVLNSSTPITSSTALNTSTPITSSSVLNSSTPITSSTVV 1830

  Fly  1100 TTTTP-RSTTTTTTSRP-TTTTPRSTTTPCTSRP--TTTTP-RSTTTTTTSRPTT-------TTP 1152
            .|:|| .|:|...:|.| |::|..:|:||.||..  .::|| .|:|...||.|.|       :||
pombe  1831 NTSTPITSSTVVNSSTPITSSTALNTSTPITSSSVLNSSTPITSSTALNTSTPITSSSVLNSSTP 1895

  Fly  1153 RSTTTPCPTTTPSASPTRTTTT 1174
            .:::|...::||..|.|...|:
pombe  1896 ITSSTVLNSSTPITSSTALNTS 1917

Known Domains:


GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Sgs1NP_523475.3 None
SPBPJ4664.02NP_595277.1 DUF963 432..467 CDD:283731
DUF963 468..503 CDD:283731
DUF963 492..527 CDD:283731
DUF963 552..587 CDD:283731 7/27 (26%)
DUF963 588..623 CDD:283731 5/35 (14%)
DUF963 612..647 CDD:283731 8/35 (23%)
DUF963 648..683 CDD:283731 10/35 (29%)
DUF963 672..706 CDD:283731 8/34 (24%)
DUF963 696..731 CDD:283731 16/36 (44%)
DUF963 768..803 CDD:283731 12/35 (34%)
DUF963 792..827 CDD:283731 8/35 (23%)
DUF963 828..863 CDD:283731 11/35 (31%)
DUF963 876..911 CDD:283731 13/37 (35%)
DUF963 900..935 CDD:283731 12/37 (32%)
DUF963 924..959 CDD:283731 9/35 (26%)
DUF963 960..995 CDD:283731 11/35 (31%)
DUF963 1008..1043 CDD:283731 7/35 (20%)
DUF963 1032..1067 CDD:283731 9/35 (26%)
DUF963 1080..1115 CDD:283731 9/35 (26%)
DUF963 1116..1151 CDD:283731 11/35 (31%)
DUF963 1152..1187 CDD:283731 13/37 (35%)
DUF963 1176..1211 CDD:283731 11/35 (31%)
DUF963 1260..1295 CDD:283731 11/35 (31%)
DUF963 1332..1367 CDD:283731 11/35 (31%)
DUF963 1368..1403 CDD:283731 14/43 (33%)
DUF963 1416..1451 CDD:283731 12/35 (34%)
DUF963 1464..1499 CDD:283731 12/35 (34%)
DUF963 1488..1523 CDD:283731 12/35 (34%)
DUF963 1512..1547 CDD:283731 11/35 (31%)
DUF963 1536..1571 CDD:283731 12/35 (34%)
DUF963 1596..1631 CDD:283731 9/35 (26%)
DUF963 1632..1667 CDD:283731 9/35 (26%)
DUF963 1656..1691 CDD:283731 10/35 (29%)
DUF963 1680..1715 CDD:283731 12/37 (32%)
DUF963 1716..1751 CDD:283731 13/39 (33%)
DUF963 1740..1775 CDD:283731 13/39 (33%)
DUF963 1788..1823 CDD:283731 11/35 (31%)
DUF963 1812..1847 CDD:283731 9/35 (26%)
DUF963 1836..1871 CDD:283731 12/35 (34%)
DUF963 1860..1895 CDD:283731 11/35 (31%)
DUF963 1896..1931 CDD:283731 6/23 (26%)
DUF963 1932..1967 CDD:283731
DUF963 1956..1991 CDD:283731
DUF963 2004..2039 CDD:283731
DUF963 2028..2063 CDD:283731
DUF963 2052..2087 CDD:283731
DUF963 2088..2123 CDD:283731
DUF963 2124..2159 CDD:283731
DUF963 2172..2207 CDD:283731
DUF963 2208..2243 CDD:283731
DUF963 2244..2279 CDD:283731
DUF963 2268..2303 CDD:283731
DUF963 2316..2351 CDD:283731
DUF963 2436..2471 CDD:283731
DUF963 2460..2495 CDD:283731
DUF963 2496..2531 CDD:283731
DUF963 2532..2567 CDD:283731
DUF963 2580..2615 CDD:283731
DUF963 2604..2639 CDD:283731
DUF963 2676..2711 CDD:283731
DUF963 2724..2759 CDD:283731
DUF963 2760..2795 CDD:283731
DUF963 2796..2831 CDD:283731
DUF963 2832..2867 CDD:283731
DUF963 2904..2939 CDD:283731
DUF963 2928..2963 CDD:283731
DUF963 3000..3035 CDD:283731
DUF963 3024..3059 CDD:283731
DUF963 3048..3083 CDD:283731
DUF963 3216..3251 CDD:283731
DUF963 3240..3275 CDD:283731
DUF963 3372..3407 CDD:283731
DUF963 3408..3443 CDD:283731
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 OOG5_126579
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 00.000 Not matched by this tool.
RoundUp 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
10.900

Return to query results.
Submit another query.