DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Plc21C and Plcb2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_995605.1 Gene:Plc21C / 33204 FlyBaseID:FBgn0004611 Length:1318 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_063140803.1 Gene:Plcb2 / 85240 RGDID:621004 Length:1188 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1275 Identity:469/1275 - (36%)
Similarity:700/1275 - (54%) Gaps:172/1275 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    15 EVPQALQDGEKFIRWDDDSGTGTPVTMRVDAKGFFLYWVDQNNELDILDIATIRDVRTGQYAKRP 79
            :|...|..||:||:|||::...:||.:|||.||::|||..|:.|::.||:.:|||.|.|::||.|
  Rat    12 KVKAYLSQGERFIKWDDETSIASPVILRVDPKGYYLYWTHQSKEMEFLDVTSIRDTRFGKFAKIP 76

  Fly    80 KDNKLRQIVTLG-PQDTLEEKTVTVCHGSDFVNMTFVNFCCTRRDIAQLWTDGLIKLAYSLAQLN 143
            |..|||::..:. |.:....||.||..|.|.|.:||.||...:.::.:.|.:.::.||......|
  Rat    77 KSQKLREVFNMDFPDNHFLLKTFTVVSGPDMVGLTFHNFVSYKENVGKDWAEDVLALAKHPMTAN 141

  Fly   144 GSAIMFLQKAHTKLCLQVDKSGRIPVKNIIKLFAQNKEDRKRVEKALDVTGLPSGKVDSISVSKF 208
            .|...||.|...||.:|:...|:|||||..::|   ..||||||.||....|..||.|:|:...|
  Rat   142 ASRSTFLDKILVKLKMQLSPEGKIPVKNFFQMF---PADRKRVEAALSACHLAKGKNDAINPEDF 203

  Fly   209 QFEDFYNLYKYLTQRSEVERLFDSIVGNSKRKCMSIAQLVEFLNKTQRDPRLNEILYPYANPARA 273
            ....:.:....|..|.|::.:|.|....:| ..|:...|.:|:|:.|||||||.:|:|.|.|.:.
  Rat   204 PESVYKSFLMSLCPRPEIDEIFTSYHAKAK-PYMTKEHLTKFINQKQRDPRLNSLLFPPARPEQV 267

  Fly   274 KELIQQYEPNKFNAQKGQLSLDGFLRYLMGDDNPIMAPSKLDLCDDMDQPMSHYFINSSHNTYLT 338
            :.||.:|||:..|.|:||||.:|.:.:|.|.:|.::|...|.:..||.||::|||||||||||||
  Rat   268 QALIDKYEPSGINVQRGQLSPEGMVWFLCGPENSVLAHDTLRIHQDMTQPLNHYFINSSHNTYLT 332

  Fly   339 GHQLTGKSSVEIYRQCLLAGCRCVELDFWNGR--TEEPVIVHGYTFVPEIFAKDVLEAIAESAFK 401
            ..|.:|.||.|:|||.||:||||||||.|.|:  .|||:|.||:|...:|..|:.:|||||||||
  Rat   333 AGQFSGPSSAEMYRQVLLSGCRCVELDCWKGKPPDEEPIITHGFTMTTDILFKEAVEAIAESAFK 397

  Fly   402 TSEYPVILSFENHC-NPRQQAKIANYCREIFGDMLLDKPLDSHPLEPNMDLPPPAMLRRKIIIKN 465
            ||.||||||||||. :||||||:|.|||.:||:.||.:||::.||:|.|.||.|..||.||:|||
  Rat   398 TSPYPVILSFENHVDSPRQQAKMAEYCRTMFGETLLTEPLENFPLKPGMPLPSPEDLRGKILIKN 462

  Fly   466 KKKHHHHHHHHHHKKPAQVGTPAANNKLTTANSVDAKAAQQVGLSASHEDGGVTRSTANGDVATG 530
            ||.              |...||:.||            :..|:|    :||...|.   .|...
  Rat   463 KKN--------------QFSGPASPNK------------KPDGVS----EGGFPSSV---PVEED 494

  Fly   531 TG-TGSAAGTAGHAPPLQQIRQSSKDSTGSSDSDSSSEDESLPNTTPNLPSGNEPPPEKAQKETE 594
            || |.............:::.:..::.:|:.|.:...:.:|...|              |..|..
  Rat   495 TGWTAEDRTEVEEGEEEEEVEEEEEEESGNLDEEEIKKMQSDEGT--------------AGLEVT 545

  Fly   595 AGAEISALVNYVQPIHFSSFENAEKKNRCYEMSSFDEKQATTLLKERPIEFVNYNKHQLSRVYPA 659
            |..|:|:||||:||..|.|||.:.:|||.|.:|||.|.:|..||.:..::||:|||.|:|||||.
  Rat   546 AYEEMSSLVNYIQPTKFISFEFSAQKNRSYLVSSFTELKAYELLSKASMQFVDYNKRQMSRVYPK 610

  Fly   660 GTRFDSSNFMPQLFWNAGCQLVALNFQTLDLAMQLNLGIFEYNARSGYLLKPEFMRRSDRRLDPF 724
            |||.||||:|||:|||||||:|||||||:||.||.|:.:||:|.:||||||.|||||.|::.:||
  Rat   611 GTRMDSSNYMPQMFWNAGCQMVALNFQTMDLPMQQNMALFEFNGQSGYLLKHEFMRRQDKQFNPF 675

  Fly   725 AESTVDGIIAGTVSITVLSGQFLTDKRANTFVEVDMYGLPADTVRKKFRTK-TVRDNGMNPLYDE 788
            :...:|.::|.|:||||:|||||:::...|:|||:::|||.|. ::::||| :...|.:||::.|
  Rat   676 SVDRIDVVVATTLSITVISGQFLSERSVRTYVEVELFGLPGDP-KRRYRTKLSPTANSINPVWKE 739

  Fly   789 EPFVFKKVVLPELASIRIAAYEEGGKLIGHRVLPVIGLCPGYRHVNLRSEVGQPIALASLFLCVV 853
            |||:|:|:::|||||:|||..|||||.||||::|:..|..||.|:.||||...|:.:.:||:.:.
  Rat   740 EPFIFEKILVPELASLRIAVMEEGGKFIGHRIIPINALHSGYHHLCLRSESNMPLTMPALFVFLE 804

  Fly   854 VKDYVPDDLSNFAEALANPIKYQSELEKRDIQLSVLTDEAEALGSADED--LSKSFVFVQVGGQK 916
            :||||||..::...||||||||.|..:|:.::|.      |..||..|.  :.|.|..:.|..| 
  Rat   805 MKDYVPDTWADLTVALANPIKYFSAHDKKSVKLK------EVTGSLPEATLIQKLFSGIPVASQ- 862

  Fly   917 KELRPVESLATSPKHRPSISAAAAMSVDVTVDRTDGGRGEDSISIVAPSIQHQHSLDQSVSTSIR 981
                               |..|.:|         .|.|.     .||..:.:....:.|     
  Rat   863 -------------------SNGAPVS---------AGNGS-----TAPGTKAKEEATKEV----- 889

  Fly   982 QVESSQFDVDLVLAEP----LEKILDHKSVKEKRLEMEKKLESLRKKHDKEKIKIAGQKSSPLEG 1042
                         |||    ||::.:.|.|.:           |:::|:||..::..:.:...| 
  Rat   890 -------------AEPQTTSLEELRELKGVVK-----------LQRRHEKELRELERRGARRWE- 929

  Fly  1043 KKPKFAITNKLVKRLSNKSLNCLSPHSEPGVEIPACPLDLGDSSEESAAADAGEDLAGGSSSLDG 1107
                     :|::|.:.:    |:...:|..   :|.|..|..|.:.......|.:......|:|
  Rat   930 ---------ELLQRGAAQ----LAELQDPAA---SCKLRPGKGSRKKRIVPCEETIVVPREVLEG 978

  Fly  1108 ---RTQE--SRLRSACREY-TSQYRELQEKYHEAIYSAAEKVL---KTSQTGQTKQLKASLDKVT 1163
               |.|:  .||....::. ..|||.:.::..:.:.....|::   :..|..:.|..|.:.:..|
  Rat   979 PDPRVQDLKDRLEQELQQQGEEQYRSVLKRKEQHVTEQIAKMMELAREKQAAELKSFKETSETDT 1043

  Fly  1164 GEVMHQLQEARRNEVKNLATVHRDRDELIRMKREVASSVVERGVAERVRLKQTFDRRTDELQKQH 1228
            .|:..:|:..|...::.:..|..|:....|:|||:.:|.::..|....::.:|.:|..::|:::.
  Rat  1044 KEMKKKLEAKRLERIQAMTKVTTDKVAQERLKREINNSHIQEVVQAVKQMTETLERHQEKLEEKQ 1108

  Fly  1229 DSV------------RNALAEHRSKARQILDKEAES-RSC 1255
            .:.            ..||||:.:|.:.:..:..|| |:|
  Rat  1109 TACLEQIQAMEKQFQEKALAEYEAKMKGLEAEVKESMRAC 1148

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Plc21CNP_995605.1 PH_PLC_beta 20..145 CDD:270167 50/125 (40%)
EFh_PI-PLC21 151..305 CDD:320043 60/153 (39%)
EF-hand motif 151..180 CDD:320043 11/28 (39%)
EF-hand motif 187..216 CDD:320043 9/28 (32%)
EF-hand motif 225..255 CDD:320043 8/29 (28%)
EF-hand motif 272..305 CDD:320043 14/32 (44%)
PI-PLCc_beta 317..702 CDD:176533 185/388 (48%)
C2_PLC_like 736..855 CDD:175974 59/119 (50%)
PTZ00121 <981..>1253 CDD:173412 56/297 (19%)
Plcb2XP_063140803.1 None

Return to query results.
Submit another query.