DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment l(2)gl and Llgl2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523439.2 Gene:l(2)gl / 33156 FlyBaseID:FBgn0002121 Length:1161 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_006247786.3 Gene:Llgl2 / 360661 RGDID:1560307 Length:1078 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1121 Identity:389/1121 - (34%)
Similarity:587/1121 - (52%) Gaps:196/1121 - (17%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MLKFIRGKGQQPSADRHRLQKDLFAYRKTAQHGFPHKPSALAYDPVLKLMAIGTQTGALKVFGQP 65
            |.:|:| .|..|:  |.||::|||.:.||.:|||||:||||.|.|.|:::||||::||:|::|.|
  Rat    52 MRRFLR-TGHDPA--RERLKRDLFQFNKTVEHGFPHQPSALGYSPSLRILAIGTRSGAVKLYGAP 113

  Fly    66 GVELYGQHTLLNNSASELNVQLLEWVYGTGRILSLTAANQLILWE-------------------- 110
            |||..|.|.  .|:|    |..:.::.|..::::|...|.|.||.                    
  Rat   114 GVEFMGLHK--ENNA----VLQIHFLPGQCQLVTLLDDNSLHLWSLKVKGGVSELQEEESFTLRG 172

  Fly   111 PVGATLLPIKTLPFDGKLKKVSSLCCSLSKDLLWIGTEGGNIYQLDLHTF-TIKEPVIYHDVVLE 174
            |.||.  |..|        :::.:....|.:||::|||.|:::.:.|..| .:.:..|..|.||:
  Rat   173 PPGAA--PSAT--------QITEILPHSSGELLYLGTESGSVFVVRLPGFCALHDRTISSDEVLQ 227

  Fly   175 QVPP------AYKLNPGAIESIRQLPNSPSKLLVAYNRGLCVLWDFESASVQRAYIAPGHGQSVG 233
            .:|.      .:::    :|::::.|..|:::|:.|:|||.|:||..::.|...:::  |.|...
  Rat   228 WLPEEARHRRVFEM----VEALQEHPRDPNQILIGYSRGLVVIWDLRASRVLSHFLS--HQQLEN 286

  Fly   234 LTVNFEGSEFTWYHADGSYATWSI----DNPEPPSNVNYVPYGPDPCKSINRLY-KGKRRSNDVI 293
            ::...:|......|:|||:..||:    .:|||..  :.|||||.|||:|.::: ...|:.....
  Rat   287 VSWQRDGCLIVTCHSDGSHCQWSVPSDTQSPEPLR--SSVPYGPFPCKAITKIFWLTTRQGLPFT 349

  Fly   294 VFSGGMPRSAYGDHNCVSVHASDGHKVCLDFTSKVIDFFVTFENNR----DVAEVLVVLLEEELC 354
            :|.|||||::|||.:|:|| ..:|.:...||||:||||.|..|.:.    |....||||.||||.
  Rat   350 IFQGGMPRASYGDRHCISV-VHNGQQTAFDFTSRVIDFTVLMEADPVAAFDDPYALVVLAEEELV 413

  Fly   355 AYDLTDPNICAIKAPYLHSVHASAVTCNYLASEVVQSVYESILRAGDEQDIDYSNISWPITGGT- 418
            ..||..|....::.|||.|:|.||:||::..|.:...::|.|:.||..|:..:|.:.|||.||| 
  Rat   414 VIDLQTPGWPPVQLPYLASLHCSAITCSHHVSNIPLKLWERIIAAGSRQNSHFSTMEWPIDGGTS 478

  Fly   419 -LPDNLEESVEEDATKLYEILLTGHEDGSVKFWDCTGVLLKPIYNFKTSSIFGSESDFRDDAAAD 482
             .|...:.          ::||||||||:|:|||.:||.|:.:|...|..:|.:::|..:    :
  Rat   479 LAPPPPQR----------DLLLTGHEDGTVRFWDASGVCLRLLYKLSTVRVFLTDTDLSE----N 529

  Fly   483 MSAEQVDEGEPPFRKSGLFDPYSDDPRLAVKKIAFCPKTGQLIVGGTAGQIVIADFIDLPEKVSL 547
            :||:..||. ||.||.|.||||||||||.::||..|..:|.|.|.|||||:::.:..|...:.::
  Rat   530 LSAQGEDEW-PPLRKVGSFDPYSDDPRLGIQKIFLCKYSGYLAVAGTAGQVLVLELNDEAAEHAV 593

  Fly   548 KYISMNLVSDRDGFVWKGHDQLNVRSNLLDGEAIPTTERGVNISGVLQVLPPASITCMALEASWG 612
            :.:..:|:.|::|:.||||::|..|...:..||      |.....::|..|||.:|.:||.:.|.
  Rat   594 EQVEADLLQDQEGYRWKGHERLAARPGPVRFEA------GFQPFVLVQCQPPAVVTSLALHSEWR 652

  Fly   613 LVSGGTAHGLVLFDFKNFVPVFHRCTLNPNDLTGAGEQLSRRKSFKKSLRESFRKLRKGRSTRTN 677
            ||:.||:||..|||.:....||.:|||:|:|.......|||.||.|||||:|||::|:.|::...
  Rat   653 LVAFGTSHGFGLFDHQQRRQVFVKCTLHPSDQLALEGPLSRVKSLKKSLRQSFRRMRRSRASSHK 717

  Fly   678 QSNQVPT------------------TLEARPVERQIEARCADDGLGSMVRCLLFAKTYVTNVNIT 724
            :....||                  .:|..||:|:||||.|:|.....||.|.||.||:.:.:..
  Rat   718 RRPGGPTGEAQAQAVNTKAERTGLQNMELAPVQRKIEARSAEDSFTGFVRTLYFADTYLRDSSRH 782

  Fly   725 SPTLWSATNASTVSVFLLHLPPAQTAATAVPSASGNAPPHMPRRISAQLAKEIQLKHRAPVVGIS 789
            .|:||:.||..||..|.|.:|||:..|        :.|      :.|:.||||||.||||||||.
  Rat   783 CPSLWAGTNGGTVYAFSLRVPPAERRA--------DEP------VRAEQAKEIQLMHRAPVVGIL 833

  Fly   790 IFDQAGSPVDQ-------LNAGENGSPPHRVLIASEEQFKVFSLPQLKPINKYKLTANEGARIRR 847
            :.|....|:.:       |:...:....|::|:.||||||||:||::....|.||||.||:|:||
  Rat   834 VLDGHNVPLPEPLEVAHDLSKSPDMQGSHQLLVVSEEQFKVFTLPKVSAKLKLKLTALEGSRVRR 898

  Fly   848 I---HFGSFSCRISPETLQSMHGCSPTKSTRSHGDGEADPNISGSLAVSRGDVYNETALICLTNM 909
            :   ||||               |                         |.:.|.|..|..|||:
  Rat   899 VGVAHFGS---------------C-------------------------RAEDYGEHHLAVLTNL 923

  Fly   910 GDIMVLSVPELKRQLNAAAVRREDINGVSSLCFTNSGEALYMMSSSELQRIALATSRVVQPTGVV 974
            |||.|:|||.||.|:..:.:||||::|::|..||..|:..|::|.||.:|.:|:|..:|:|..:|
  Rat   924 GDIQVVSVPLLKPQVRYSCIRREDVSGIASCVFTKYGQGFYLISPSEFERFSLSTKWLVEPRCLV 988

  Fly   975 PVEPLENEESVLEENDAENNKETYACDEVVNTYEIKNPSGISICTRPAEENVGRNSVQQVNGVNI 1039
            ......|      .|...|...|..          |..||           ..|||..|.:|...
  Rat   989 DSAKARN------HNRPSNGNSTGP----------KRTSG-----------QVRNSRSQSDGAET 1026

  Fly  1040 SNSPNQANETISSSIG 1055
            ...|...:..:|.:.|
  Rat  1027 KPGPVMEHALLSDASG 1042

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
l(2)glNP_523439.2 WD40 repeat 39..78 CDD:293791 20/38 (53%)
WD40 repeat 84..126 CDD:293791 12/61 (20%)
WD40 repeat 131..174 CDD:293791 12/43 (28%)
WD40 repeat 188..224 CDD:293791 12/35 (34%)
LLGL 268..>338 CDD:462446 33/70 (47%)
Llgl2XP_006247786.3 None

Return to query results.
Submit another query.