Protein Alignment Abcd3 and abcd4

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608354.1
• Gene: Abcd3 / 32992
• FlyBaseID: FBgn0031069
• Length: 665
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001070185.2
• Gene: abcd4 / 767748
• ZFINID: ZDB-GENE-050517-30
• Length: 604
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 620
• Identity: 186/620 - (30%)
• Similarity: 316/620 - (50%)
• Gaps: 62/620 - (10%)

  Fly    67 FFKQLRQLLPILIPGFWSVETGLLFLVAAALIGRSVSDIWMIQNATVVES----TIIHMNRTKFK 127
            |.::...:|.||.|. ||.:...:|:   .|:|.::|...:|....::.|    .:...:..|||
Zfish    18 FLQRFYSILKILFPS-WSNQNVRMFM---TLLGVTLSVQLVIYQVGLIPSQFYRVLSERSYGKFK 78

  Fly   128 TALLKYLTALPAISVVTNVLKWSLGELKLRFRTNLTHHLYSQYLNGYTYYKMSNLDNRIANADQL 192
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Zfish    79 DLVVFAVVLILINSTLKSLDQYICSLLYVRWRKTLTEDLHHLYFKGRVYYTLNILCKDIDNPDQR 143

  Fly   193 LTTDIDKFCESATDLYSNISKPVLDIFIYVYRLTVNLGGKTPSILMLYLLFAGVFLTR-LRRPTG 256
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Zfish   144 ISQDVERLCKQMSTMASRLLITPFTVTYYTYQ-CFNSAGWIGFVSIFSYFVVGTIINKILIGPIV 207

  Fly   257 RLTVEEQKLEGEFRYVNSRLITNSEEVAFYQ-GNVR-----EKLTLLASYSKLRSHLRKFLEFRV 315
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Zfish   208 SMLVEQEKLEGDFRFKHMQIRVNAESAAFYRASNVEHMRTDRKLQMLLSTQ--RSLMNKELWLYL 270

  Fly   316 SMGIIDNIIGKYFASIVGFYAVSIPFFSENHP-LLSGENSGQRLQAYYTYGRML-VKLAEAIGRL 378
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Zfish   271 GVNTFD-----YMGSILSYIVIAIPIFAGNYDHLTPGE-----LSALISKNAFVCIYLINCFTQL 325

  Fly   379 VLAGREMSRLAGFTARMTELIKVLSDLNK---GTYERTMV-----NGNNLAQNAVGSASSNFGPN 435
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Zfish   326 IDLSTTVSDVAGYTHRIGELQEAMADIAKKQRDEYQYDPVSKAESNSDRELQSV--PADTAFVLD 388

  Fly   436 KGIMCFEDNIIRFEKVPLVTPNGDVLLQELSFEVKSGTNVLVCGPNGCGKSSLFRILGELWPTWG 500
            :  :|:        |.||   :.::|:::|:..:..||::||.|..|.||:||.|:|..||....
Zfish   389 R--LCY--------KSPL---SEELLVKDLTLSISQGTHLLVVGNTGTGKTSLLRVLNSLWEPCR 440

  Fly   501 GKVTKPS----RGKLFYVPQRPYMTLGTLRDQIIYPHTRDDMRRLGH-SDEDLMHYLDIVQLTYL 560
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Zfish   441 GSVQMTTCFGPRG-LMFLPQKAYLTDGTLRDQIIYP-LKDIYPSSGSIDDERILKYLELVGLSNL 503

  Fly   561 EQRENGLDS--IEDWIDVLSGGEKQRIAMARLFYHKPQFAILDECTSAVSVDVEGKMYSYCREVG 623
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Zfish   504 LTRIGGLDTEVTWNWYDVLSPGEMQRLCFARLLYLQPKFAVLDEATSALTEEAEGQLYNACKQQG 568

  Fly   624 ITLFTVSHRKSLWAHHDYYLQFDGRGSYEFATIDQ 658
            :||.::.||.:|..|||..|:..|.|.:|.:.:.:
Zfish   569 MTLISLGHRSTLEKHHDVMLRLCGGGQWELSKLKE 603

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Abcd3	NP_608354.1	3a01203	3..653	CDD:273360	185/613 (30%)
abcd4	NP_001070185.2	YddA	17..604	CDD:443337	186/620 (30%)