Protein Alignment Abcd3 and Abcd4

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_608354.1
• Gene: Abcd3 / 32992
• FlyBaseID: FBgn0031069
• Length: 665
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_063117807.1
• Gene: Abcd4 / 299196
• RGDID: 1307273
• Length: 615
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 623
• Identity: 176/623 - (28%)
• Similarity: 301/623 - (48%)
• Gaps: 66/623 - (10%)

  Fly    63 VNSVFFKQLRQLLPILIPGFWSVETGLLF--LVAAALIGRSVSDIWMIQNATVVESTIIHMNRTK 125
            :..|||..            ||.:..|:|  |:..||:.:.|     |....::.|....:...|
  Rat    27 IQKVFFPS------------WSSQNVLMFMTLLCVALLEQLV-----IYQVGLIPSQYYGVLGNK 74

  Fly   126 ----FKTALLKYLTALPAISVVTNVLK----WSLGELKLRFRTNLTHHLYSQYLNGYTYYKMSNL 182
                ||.  |.:|..  |:.|:.:.||    ::...|.:.:|.:||.||:..|.....||.::.|
  Rat    75 DLDGFKA--LTFLAV--ALIVLNSTLKSFDQFTCNLLYVSWRKDLTEHLHQLYFRARVYYTLNVL 135

  Fly   183 DNRIANADQLLTTDIDKFCESATDLYSNISKPVLDIFIYVYRLTVNLGGKTPSILMLYLLFAGVF 247
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  Rat   136 RDDIDNPDQRISQDVERFCRQLSSVTSKLIISPFTLAYYTYQCFQSTGWLGPVSIFGYFILGTMV 200

  Fly   248 LTRLRRPTGRLTVEEQKLEGEFRYVNSRLITNSEEVAFYQGNVREKLTLLASYSKLRSHLRKFLE 312
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  Rat   201 NKTLMGPIVTKLVQQEKLEGDFRFKHMQIRVNAEPAAFYRAGLVEHMRTDRRLQRLLQTQRELMS 265

  Fly   313 FRVSMGIIDNIIGKYFASIVGFYAVSIPFFSENHPLLSGENSGQRLQAYYTYGRML-VKLAEAIG 376
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  Rat   266 RELWLYIGINTF-DYLGSILSYVVIAIPIFRG----VYGDLSPTELSTLVSKNAFVCIYLISCFT 325

  Fly   377 RLVLAGREMSRLAGFTARMTELIKVLSDLNKGTYERTMVNGNNLAQNAVGSASSNFGPNKGIMCF 441
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  Rat   326 QLIDLSTTLSDVAGYTHRIGELQEALLDMSRKSHD----------CETLGESEWDLDKAPGWPTT 380

  Fly   442 E--DNIIRFEKVPLVTPNGD-VLLQELSFEVKSGTNVLVCGPNGCGKSSLFRILGELWPTWGGKV 503
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  Rat   381 EPSDTAFLLDRVSILAPSSDKPLIKDLSLKICEGQSLLITGNTGTGKTSLLRVLGGLWESMKGSV 445

  Fly   504 TKPS----RGKLFYVPQRPYMTLGTLRDQIIYP-------HTRDDMRRLGHS--DEDLMHYLDIV 555
            ...:    .|.|| :||:|:.|.||||:|:|||       ..|...||...|  ||.::.:|::.
  Rat   446 QMLADFGPHGVLF-LPQKPFFTDGTLREQVIYPLKEIYPDSERHPWRREAGSADDERIVRFLELA 509

  Fly   556 QLTYLEQRENGLDSIED--WIDVLSGGEKQRIAMARLFYHKPQFAILDECTSAVSVDVEGKMYSY 618
            .|:.|..|..|||...|  |.||||.||.||::.|||||.:|::|:|||.|||::.:.|.::|..
  Rat   510 GLSSLVARTGGLDQQVDWNWYDVLSPGEMQRLSFARLFYLQPKYAVLDEATSALTEEAESELYRI 574

  Fly   619 CREVGITLFTVSHRKSLWAHHDYYLQFDGRGSYEFATI 656
            .:::|:|..:|.||.||...|.:.|:..|.||:|...|
  Rat   575 GQQLGMTFISVGHRPSLEKFHSWVLRLHGGGSWELTRI 612

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Abcd3	NP_608354.1	3a01203	3..653	CDD:273360	174/618 (28%)
Abcd4	XP_063117807.1	None