DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment r and ura1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523377.1 Gene:r / 32640 FlyBaseID:FBgn0003189 Length:2224 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_593055.1 Gene:ura1 / 2541544 PomBaseID:SPAC22G7.06C Length:2244 Species:Schizosaccharomyces pombe


Alignment Length:2261 Identity:1112/2261 - (49%)
Similarity:1482/2261 - (65%) Gaps:123/2261 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     8 LALEDGTVLPGYSFGYVPSENESKVGFGGEVVFQTGMVGYTEALTDRSYSGQILVLTYPLIGNYG 72
            |.|||.:||.|||||       :.....||:|||||||||.|:|||.||.|||||.|:|.:||||
pombe    61 LELEDKSVLQGYSFG-------ADHSVSGELVFQTGMVGYPESLTDPSYRGQILVFTFPTVGNYG 118

  Fly    73 VPAPDE---DE-HGLPLHFEWMKGVVQATALVVGEVAEEAFHWRKWKTLPDWLKQHKVPGIQDID 133
            |  ||.   || .|||.:||  ...:...|:::...::...|:....:|.:|||:..:|||..||
pombe   119 V--PDRRILDEISGLPKYFE--SNQIHVAAIIISSYSQNYSHFLAHSSLGEWLKEQGIPGIFGID 179

  Fly   134 TRALTKKLREQGSMLGKIVYEK-------PPVEGLPK---SSFVD-----PNVRNLAKECSVKER 183
            |||||||:|:||||||:::.:|       ..:.||.|   ::|.|     ||..||..:.|:||.
pombe   180 TRALTKKIRDQGSMLGRLLIQKDESPINPSSITGLGKDWSTAFEDIPWKNPNTENLTSQVSIKEP 244

  Fly   184 QVY--------GNPNGKGPRIAILDCGLKLNQLRCLLQRGASVTLLPWSARLEDEQFDALFLSNG 240
            ::|        ...:||..||.::|.|:|.||:||.|.||..:.::||......|.:|.||:|||
pombe   245 KLYEPHPTTAIKKADGKIIRILVIDVGMKYNQIRCFLNRGVELLVVPWDYDFTKETYDGLFISNG 309

  Fly   241 PGNPESCDQIVQQVRKVIEEGQKPVFGICLGHQLLAKAIGCSTYKMKYGNRGHNLPCLHRATGRC 305
            ||:|...|.:|.:|::|:|....||||||.|||::|:|.|.||.|||:||||||:||....:|||
pombe   310 PGDPSLMDLVVDRVKRVLESKTVPVFGICFGHQIMARAAGASTTKMKFGNRGHNIPCTCMISGRC 374

  Fly   306 LMTSQNHGYAVDLEQLPDGWSELFVNANDGTNEGIVHASKPYFSVQFHPEHHAGPQDTEFLFDVF 370
            .:||||||||||...|.:||.|||||||||:||||.:...|:||||||||...||:|||||||||
pombe   375 YITSQNHGYAVDASSLSNGWKELFVNANDGSNEGIYNTEYPFFSVQFHPESTPGPRDTEFLFDVF 439

  Fly   371 MESIQQ-------KDLTIPQLIEQRLRPTTPAIDSAPVMPRKVLILGSGGLSIGQAGEFDYSGSQ 428
            ::.:::       :...:|....:..|...|.:|:     ::|||||||||||||||||||||||
pombe   440 IDVVKRSADAKSLQPFKLPGGTIEENRSRHPLVDA-----KRVLILGSGGLSIGQAGEFDYSGSQ 499

  Fly   429 AIKAMRESNIQTVLINPNIATVQTSKGMADKCYFLPLTPHYVEQVIKSERPNGVLLTFGGQTALN 493
            ||||:||..|.|:||||||||:|||||:|||.||||:...:|.:|||.|||:.:.:|||||||||
pombe   500 AIKALREEGIYTILINPNIATIQTSKGLADKVYFLPVNADFVRKVIKQERPDSIYVTFGGQTALN 564

  Fly   494 CGVQLERAGVFSKYNVRILGTPIQSIIETEDRKLFAERVNEIGEQVAPSEAVYSVAQALDAASRL 558
            .|::|:  ..|.:..|::|||||.:||.||||:|||..::||.|:.|.|.:..|:.:|:..:..:
pombe   565 VGIELK--DEFEQLGVKVLGTPIDTIITTEDRELFARAMDEINEKCAKSASASSIEEAIKVSKDI 627

  Fly   559 GYPVMARAAFSLGGLGSGFANNEEELQSLAQQALAHSSQLIVDKSLKGWKEVEYEVVRDAYNNCI 623
            .:||:.|||::|||||||||:||.||..|...|.|.|.|:::::|:|||||:||||||||::|||
pombe   628 SFPVIVRAAYALGGLGSGFADNEAELIDLCTLAFATSPQVLIERSMKGWKEIEYEVVRDAFDNCI 692

  Fly   624 TVCNMENFDPLGIHTGESIVVAPSQTLSDREYQMLRSTALKVIRHFGVVGECNIQYALCPHSEQY 688
            ||||||||||||||||:||||||||||:|.:|.|||:||:.||||.||||||||||||.|.:::|
pombe   693 TVCNMENFDPLGIHTGDSIVVAPSQTLTDEDYNMLRTTAVNVIRHLGVVGECNIQYALNPFTKEY 757

  Fly   689 YIIEVNARLSRSSALASKATGYPLAYVAAKLALGLPLPDIKNSVTGNTTACFEPSLDYCVVKIPR 753
            .||||||||||||||||||||||||:.||||.|.:||.::|||||..|.|||||||||.||||||
pombe   758 CIIEVNARLSRSSALASKATGYPLAFTAAKLGLNIPLNEVKNSVTKVTCACFEPSLDYVVVKIPR 822

  Fly   754 WDLAKFVRVSKHIGSSMKSVGEVMAIGRNFEEAFQKALRMVDSDVLGFDPDVVPLNKEQLAE--- 815
            |||.||.|||..:.|:||||||||:|||.||||.|||:|.:|....||:.      |:.|..   
pombe   823 WDLKKFTRVSTQLSSAMKSVGEVMSIGRTFEEAIQKAIRAIDYSNTGFNV------KDALMSIDT 881

  Fly   816 QLSEPTDRRPFVIAAALQLGMSLRELHQLTNIDYWFLEKLERIILLQSLLTRNG-SRTDAALLLK 879
            :|..|:|:|.|.||.|:..|.|:..:.:||.||.||||||..:|....|::::. |....:||..
pombe   882 ELQTPSDQRLFAIANAMASGYSVDRIWELTRIDKWFLEKLMGLIRTSQLISKHDISSLPISLLKT 946

  Fly   880 AKRFGFSDKQIAKYIKSTELAVRHQRQEFGIRPHVKQIDTVAGEWPASTNYLYHTYNGSEHDVDF 944
            ||:.||:|.|||.::.|||||||..|.|.||||.||||||||.|:||.|||||.|||..|||:.|
pombe   947 AKQLGFADVQIAAFMNSTELAVRRIRTEAGIRPFVKQIDTVAAEFPAFTNYLYTTYNAVEHDIHF 1011

  Fly   945 PGGHTIVVGSGVYRIGSSVEFDWCAVGCLRELRKLQRPTIMINYNPETVSTDYDMCDRLYFEEIS 1009
            .....:|:||||||||||||||||||..:|.||.....|||:||||||||||||..||||||.|.
pombe  1012 NDKGVMVLGSGVYRIGSSVEFDWCAVRAVRTLRDRGVKTIMVNYNPETVSTDYDEADRLYFENIG 1076

  Fly  1010 FEVVMDIYEMENSEGIILSMGGQLPNNIAMDLHRQQAKVLGTSPESIDCAENRFKFSRMLDRKGI 1074
            .|.|:||||.|:|.|||::||||..||||:.|||:..|:||||||.||.||||||||||||..|:
pombe  1077 LETVLDIYEQESSSGIIIAMGGQTANNIALPLHRENVKILGTSPEMIDGAENRFKFSRMLDDIGV 1141

  Fly  1075 LQPRWKELTNLQSAIEFCEEVGYPCLVRPSYVLSGAAMNVAYSNQDLETYLNAASEVSREHPVVI 1139
            .||:|||||:...|.:||:.||||.||||||||||||||..||..||.:||..|..::::|||||
pombe  1142 DQPKWKELTSFDEADKFCDTVGYPVLVRPSYVLSGAAMNTVYSQSDLHSYLQQAVAINKDHPVVI 1206

  Fly  1140 SKFLTEAKEIDVDAVASDGRILCMAVSEHVENAGVHSGDATLVTPPQDLNAETLEAIKRITCDLA 1204
            ||::..||||::||||.:|:::...:|||||||||||||||||.|||||...|:|.|......:.
pombe  1207 SKYIENAKEIELDAVAREGKMVMHVISEHVENAGVHSGDATLVLPPQDLAPTTIERIVDAAAKIG 1271

  Fly  1205 SVLDVTGPFNMQLIAKNNELKVIECNVRVSRSFPFVSKTLDHDFVATATRAIVGLDVEPL-DVLH 1268
            ..|::|||:|:|.|||:||:||||||||.|||||||||.:..|.::.||..|:|..::|. ||..
pombe  1272 EALNITGPYNIQFIAKDNEIKVIECNVRASRSFPFVSKVIGVDMISMATDVIMGNPIQPYPDVDL 1336

  Fly  1269 GVGKVGVKVPQFSFSRLAGADVQLGVEMASTGEVACFGDNRYEAYLKAMMSTGFQIPKNAVLLSI 1333
            ....|.|||||||||||:|||..|||||||||||||||.|::|||||||:||||::||..:|:||
pombe  1337 PRDYVAVKVPQFSFSRLSGADPVLGVEMASTGEVACFGHNKFEAYLKAMISTGFRLPKKNILISI 1401

  Fly  1334 GSFKHKMELLPSIRDLAKMGYKLYASMGTGDFYAEHGVNVESVQWTFDKTTPDDINGELRHLAEF 1398
            ||:|.|.||||.::.|.:..|.::|:.||.|::.|.||..:.:.    ....::.|.|. .|:..
pombe  1402 GSYKEKAELLPYVKKLYENNYNIFATAGTSDYFMESGVPCKYLA----DLPAEEANNEY-SLSAH 1461

  Fly  1399 LANKQFDLVINLPMSGGGARRVSSFMTHGYRTRRLAVDYSIPLVTDVKCTKLLVESMRMNGGKPP 1463
            |||...|:.|||| |....||.:::::.||::||||:|||:||||:|||.||::|::..|  ...
pombe  1462 LANNMIDMYINLP-SNNRYRRPANYISSGYKSRRLAIDYSVPLVTNVKCAKLMIEAICRN--LDF 1523

  Fly  1464 MKTHTDCMTSRRIVKLPGFIDVHVHLREPGATHKEDFASGTAAALAGGVTLVCAMP-NTNPSIVD 1527
            ..:..|..:|.:...|||.|::...|.|..:....|:   |...:|.|.|:...:| :|:.::.|
pombe  1524 SLSTVDFQSSFQTANLPGLINISAFLPEFTSEAVSDY---TKECIASGFTMARFLPFSTSSTLAD 1585

  Fly  1528 RETFTQFQELAKAGARCDYALYVGASDDNWAQVNELASHA-CGLKMYLNDTFGTLKLSDMTSWQR 1591
            :::.:..::||...|.|||...|.||..|...::||.|.: |....:..|..|   :..:|:...
pombe  1586 KDSLSAVKKLALDHAHCDYNFSVIASSTNEVTISELTSESGCLFFHFEKDDSG---IDHVTAVAS 1647

  Fly  1592 HLSHWPKRSPIVCHAERQSTAAVIMLAHLLDRSVHICHVARKEEIQLIRSAKEKGVKVTCEVCPH 1656
            |.:.||....::..|:..:.|::::||.|.:|.:||.:|:.|:::.||..||::.:.||.:|..:
pombe  1648 HFNVWPDTQTVMTDAKSTTLASLLLLASLHNRRIHITNVSSKDDLNLIVLAKQRSLPVTFDVSVY 1712

  Fly  1657 HLFLSTKDVERLGHGMSEVRPLLCSPEDQEALWENIDYIDVFATDHAPHTLAEKRSERPPPGFPG 1721
            .|||:..|..    |.:    .|.:.:||..:|..:.|||.|:....|..||:........|| |
pombe  1713 SLFLNQNDYP----GAT----FLPTADDQVEIWNKLSYIDCFSIGSIPSRLAKFVGNTAFTGF-G 1768

  Fly  1722 VETILPLLLQAVHEGRLTMEDIKRKFHRNPKIIFNLPDQAQTYVEVDLDE--EWTITGNEMKSKS 1784
            |...:||||.||:|||||::|:..:|:.|||.||.|.||..:.|::::|.  .|        |..
pombe  1769 VREAIPLLLTAVNEGRLTLKDVVDRFYSNPKAIFRLHDQDDSGVQLEVDRSVSW--------SSK 1825

  Fly  1785 GWTPFEGTKVKGRVHRVVLRGEVAFVDGQVLVQPGFGQNVRPKQSPLASEASQDLLPSDNDANDT 1849
            .||||.|.|:.|.:..|...|...|.||::..:..:|::.        |.||   |...:.|...
pombe  1826 DWTPFNGKKLYGSIQSVQFDGHDVFFDGELNFEHTYGRDY--------SSAS---LADKSKATRK 1879

  Fly  1850 FTRLLTSEGPGGGVHGISTKVHFVDGANFLRPNSPSPRIRLDSASNTTLREYLQRTTNSNPVAHS 1914
            .:.|::...|    |...:   ..:.......|...|.|.|:...|......|.:..||:|    
pombe  1880 VSALMSPGLP----HAAPS---LAEAFGQAPENKAHPDISLNMTPNFKPSHELVQLINSSP---- 1933

  Fly  1915 LMGKHILAVDMFNKDHLNDIFNLAQLLKLRGTKDRPVDELLPGKIMASVFYEVSTRTQCSFAAAM 1979
            ...|||::|....:..|:.:|.:|..:::...:...:| |..||::.::|:|.||||..||.|||
pombe  1934 FYRKHIISVHQVTRSDLHVLFAIAHQMRIIVERQGVID-LCYGKLLCTMFFEPSTRTSSSFDAAM 1997

  Fly  1980 LRLGGRVISMDNITSSVKKGESLEDSIKVVSSYADVVVLRHPSPGAVARAATFSRKPLINAGDGV 2044
            .||||:|:::....|||.|||||.|:|:.:..|.|.:||||||..:...||.||..|:||.|:|.
pombe  1998 QRLGGKVVAVTASASSVNKGESLADTIRTLGCYGDAIVLRHPSIESARIAANFSPVPIINGGNGS 2062

  Fly  2045 GEHPTQALLDIFTIREEFGTVNGLTITMVGDLKNGRTVHSLARLLTLYNVNLQYVAPNSLQMPDE 2109
            .||||||.||::|||||.|:|||||||.:||||.|||||||||||..::|.|..|:|..|.:||:
pombe  2063 KEHPTQAFLDLYTIREELGSVNGLTITFIGDLKYGRTVHSLARLLAFWHVELHLVSPEQLALPDD 2127

  Fly  2110 VVQFVHQRGVKQLFARDL-KNVLPDTDVLYMTRIQRERFDNVEDYEKCCGHLVLTPEHMMRAKKR 2173
            |...:...|:..:..|:| |.|:..:||||.||:|:|||.:|::|||.....::....:..||..
pombe  2128 VKDDIRANGLNFIEHRELTKEVVAQSDVLYCTRVQKERFASVDEYEKLKDSFIVDNSVLASAKSH 2192

  Fly  2174 SIVLHPLPRLNEISREIDSDP-RAAYFRQAEYGMYIRMALLAMVVGGRNTA 2223
            .||:|||||..|||.|:|.|. |||||||..||:||||||||.|:|....|
pombe  2193 CIVMHPLPRNREISEEVDFDQRRAAYFRQMRYGLYIRMALLACVMGATEVA 2243

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
rNP_523377.1 CPSaseIIsmall 7..376 CDD:273580 193/394 (49%)
CPSaseII_lrg 403..1455 CDD:273581 634/1056 (60%)
CAD_DHOase 1475..1821 CDD:238641 108/349 (31%)
PyrB 1913..2221 CDD:440306 151/309 (49%)
ura1NP_593055.1 CPSaseIIsmall 61..445 CDD:273580 193/394 (49%)
CPSaseII_lrg 473..1517 CDD:273581 635/1062 (60%)
CAD_DHOase 1535..1862 CDD:238641 108/349 (31%)
PyrB 1933..2241 CDD:440306 152/312 (49%)

Return to query results.
Submit another query.