DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment r and rudimentary

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523377.1 Gene:r / 32640 FlyBaseID:FBgn0003189 Length:2224 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_061513808.1 Gene:rudimentary / 1271961 VectorBaseID:AGAMI1_003070 Length:2280 Species:Anopheles gambiae


Alignment Length:2274 Identity:1574/2274 - (69%)
Similarity:1834/2274 - (80%) Gaps:90/2274 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     8 LALEDGTVLPGYSFGYVPSENESKVGFGGEVVFQTGMVGYTEALTDRSYSGQILVLTYPLIGNYG 72
            |.|||||::.|:.||       :.:...||||||||||||.|::||.||.||:||||||||||||
Mosquito    32 LVLEDGTIMHGHPFG-------APLSVDGEVVFQTGMVGYPESMTDPSYHGQVLVLTYPLIGNYG 89

  Fly    73 VPAPDEDEHGLPLHFE-----WMKGVVQATALVVGEVAEEAFHWRKWKTLPDWLKQHKVPGIQDI 132
            :|..|.||.||..|||     |..|      |||||:.:|..|||...||.:|:.:|.||||..|
Mosquito    90 IPDADLDECGLMRHFESNNRIWTAG------LVVGEICDEPSHWRSKLTLSEWMARHGVPGISGI 148

  Fly   133 DTRALTKKLREQGSMLGKIVYEKPPVEGLPKSSFVDPNVRNLAKECSVKERQVYGNPNGKGPRIA 197
            ||||||||:||.|::|||||..:  |..:...:|.:.|:|||..|.|:.:.:.| ||.| .|||.
Mosquito   149 DTRALTKKIRENGTILGKIVQSR--VTSIAGFNFSNQNLRNLVAEVSLAQPRTY-NPTG-SPRIC 209

  Fly   198 ILDCGLKLNQLRCLLQRGASVTLLPWSARLEDEQFDALFLSNGPGNPESCDQIVQQVRKVI--EE 260
            .:||||||||:||.:.|||.:.::||:||.:..::|.||||||||:||:|.::|..:|.::  .:
Mosquito   210 AIDCGLKLNQVRCFVSRGARLDVVPWNARPDPAEYDGLFLSNGPGDPETCREVVDNLRALLLPTD 274

  Fly   261 GQ-KPVFGICLGHQLLAKAIGCSTYKMKYGNRGHNLPCLHRATGRCLMTSQNHGYAVDLEQLPDG 324
            |. ||:||||||||:|:.|.||.|:||:||||||||||:|..|.||.|||||||:|||..::|.|
Mosquito   275 GPVKPIFGICLGHQILSTAAGCRTFKMRYGNRGHNLPCMHLGTRRCYMTSQNHGFAVDSSEMPAG 339

  Fly   325 WSELFVNANDGTNEGIVHASKPYFSVQFHPEHHAGPQDTEFLFDVFMESIQ------QKDLTIPQ 383
            |.|||.|.||||||||||.::|||||||||||.|||.|.|.|||||:|.::      |..:....
Mosquito   340 WEELFTNLNDGTNEGIVHRTRPYFSVQFHPEHTAGPTDLEVLFDVFLEVVREYRGGVQAAIDAAP 404

  Fly   384 LIEQRLRPTTPAIDSAPV---MPRKVLILGSGGLSIGQAGEFDYSGSQAIKAMRESNIQTVLINP 445
            .:.:||......:...|:   .|:||||||||||||||||||||||||||||::|..||||||||
Mosquito   405 TVRERLNDRLRFVPPVPIELERPKKVLILGSGGLSIGQAGEFDYSGSQAIKALKEERIQTVLINP 469

  Fly   446 NIATVQTSKGMADKCYFLPLTPHYVEQVIKSERPNGVLLTFGGQTALNCGVQLERAGVFSKYNVR 510
            ||||||||||:|||.||||:|.||||||||:|||.||||||||||||||||::||||:|::|.||
Mosquito   470 NIATVQTSKGLADKVYFLPITSHYVEQVIKAERPGGVLLTFGGQTALNCGVEMERAGLFARYGVR 534

  Fly   511 ILGTPIQSIIETEDRKLFAERVNEIGEQVAPSEAVYSVAQALDAASRLGYPVMARAAFSLGGLGS 575
            |:||||:|||||||||||||||.|||||||||.||||:.:||:||.|:|||||||||||||||||
Mosquito   535 IMGTPIRSIIETEDRKLFAERVGEIGEQVAPSAAVYSIQEALEAAERIGYPVMARAAFSLGGLGS 599

  Fly   576 GFANNEEELQSLAQQALAHSSQLIVDKSLKGWKEVEYEVVRDAYNNCITVCNMENFDPLGIHTGE 640
            |||::.:||::||.||||||:|||:|||||||||||||||||||:||||||||||.|||||||||
Mosquito   600 GFASSADELRALASQALAHSNQLIIDKSLKGWKEVEYEVVRDAYDNCITVCNMENVDPLGIHTGE 664

  Fly   641 SIVVAPSQTLSDREYQMLRSTALKVIRHFGVVGECNIQYALCPHSEQYYIIEVNARLSRSSALAS 705
            |||||||||||:|||.||||||::|||||||||||||||||.|.||:||||||||||||||||||
Mosquito   665 SIVVAPSQTLSNREYNMLRSTAIRVIRHFGVVGECNIQYALNPESEEYYIIEVNARLSRSSALAS 729

  Fly   706 KATGYPLAYVAAKLALGLPLPDIKNSVTGNTTACFEPSLDYCVVKIPRWDLAKFVRVSKHIGSSM 770
            ||||||||||||||||.:|||||:|||||.|||||||||||||||:||||||||.||||:|||||
Mosquito   730 KATGYPLAYVAAKLALAIPLPDIRNSVTGVTTACFEPSLDYCVVKMPRWDLAKFARVSKNIGSSM 794

  Fly   771 KSVGEVMAIGRNFEEAFQKALRMVDSDVLGFDPDVVPLNKEQLAEQLSEPTDRRPFVIAAALQLG 835
            |||||||||||.|||||||||||||| |.||||.:.|:|:    ::|.:|||:|.||:||||:.|
Mosquito   795 KSVGEVMAIGRTFEEAFQKALRMVDS-VSGFDPYLKPVNE----QELEQPTDKRMFVLAAALKAG 854

  Fly   836 MSLRELHQLTNIDYWFLEKLERII----LLQSLLTRNGSRTDAALLLKAKRFGFSDKQIAKYIKS 896
            .|:.::::||.||.|||.|::.||    .|:.|  .:|...:||:|.:|||.||||:.||:.:||
Mosquito   855 YSVEQIYELTKIDRWFLRKMKGIIDFTVELEGL--EHGCVPEAAMLREAKRLGFSDRMIAQCVKS 917

  Fly   897 TELAVRHQRQEFGIRPHVKQIDTVAGEWPASTNYLYHTYNGSEHDVDFPGGHTIVVGSGVYRIGS 961
            ||||||.||:|.|:.|:|||||||||||||||||||.||:.:|.||:|||.:|:|:|||||||||
Mosquito   918 TELAVRMQRKEHGVLPYVKQIDTVAGEWPASTNYLYLTYSATESDVEFPGQYTMVIGSGVYRIGS 982

  Fly   962 SVEFDWCAVGCLRELRKLQRPTIMINYNPETVSTDYDMCDRLYFEEISFEVVMDIYEMENSEGII 1026
            ||||||||||||:|||:|...|||:|||||||||||||||||||||||||||||||:.|...|||
Mosquito   983 SVEFDWCAVGCLKELRRLNHKTIMVNYNPETVSTDYDMCDRLYFEEISFEVVMDIYDAEQPTGII 1047

  Fly  1027 LSMGGQLPNNIAMDLHRQQAKVLGTSPESIDCAENRFKFSRMLDRKGILQPRWKELTNLQSAIEF 1091
            ||||||||||||||||||||::|||||||:|.|||||||||.|||||||||||||||||:|||||
Mosquito  1048 LSMGGQLPNNIAMDLHRQQARILGTSPESVDSAENRFKFSRKLDRKGILQPRWKELTNLESAIEF 1112

  Fly  1092 CEEVGYPCLVRPSYVLSGAAMNVAYSNQDLETYLNAASEVSREHPVVISKFLTEAKEIDVDAVAS 1156
            ||||||||||||||||||||||||||||||:|||..||:||:||||||||||.|||||||||||:
Mosquito  1113 CEEVGYPCLVRPSYVLSGAAMNVAYSNQDLKTYLKHASDVSKEHPVVISKFLIEAKEIDVDAVAA 1177

  Fly  1157 DGRILCMAVSEHVENAGVHSGDATLVTPPQDLNAETLEAIKRITCDLASVLDVTGPFNMQLIAKN 1221
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.|..|:|.:|||||||||||||||
Mosquito  1178 DGVILCMAVSEHVENAGVHSGDATLVTPPQDLNRETLERIKEIARDIADLLDVTGPFNMQLIAKN 1242

  Fly  1222 NELKVIECNVRVSRSFPFVSKTLDHDFVATATRAIVG-LDVEPLDVLHGVGKVGVKVPQFSFSRL 1285
            ||||||||||||||||||||||||.||||.|||.||| .|:||::|:||.|.|||||||||||||
Mosquito  1243 NELKVIECNVRVSRSFPFVSKTLDFDFVALATRVIVGHTDIEPVEVMHGRGLVGVKVPQFSFSRL 1307

  Fly  1286 AGADVQLGVEMASTGEVACFGDNRYEAYLKAMMSTGFQIPKNAVLLSIGSFKHKMELLPSIRDLA 1350
            |||||.|||||||||||||||:||||||||||||||||:||.::||||||:|||||||||||.|.
Mosquito  1308 AGADVMLGVEMASTGEVACFGENRYEAYLKAMMSTGFQMPKKSILLSIGSYKHKMELLPSIRILE 1372

  Fly  1351 KMGYKLYASMGTGDFYAEHGVNVESVQWTFDKTTPDDING--------ELRHLAEFLANKQFDLV 1407
            ||||||||||||||||.||||.|||||||||.....:.:|        |||||||:|||||||||
Mosquito  1373 KMGYKLYASMGTGDFYTEHGVEVESVQWTFDSLAASEGDGGGNGGAGSELRHLAEYLANKQFDLV 1437

  Fly  1408 INLPMSGGGARRVSSFMTHGYRTRRLAVDYSIPLVTDVKCTKLLVESMRMNGGKPPMKTHTDCMT 1472
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||.:|:..||.|.||||.|||:
Mosquito  1438 INPPMSGGGARRVSCFMTHGYRTRRLAVDYSIPLVTDVKCAKLLVAAMQRIGGVPAMKTHIDCMS 1502

  Fly  1473 SRRIVKLPGFIDVHVHLREPGATHKEDFASGTAAALAGGVTLVCAMPNTNPSIVDRETFTQFQEL 1537
            ||.:||||||||||||||||||.|||.||:|||||||||:|:|.|||||.|:||||..|.|..||
Mosquito  1503 SRLMVKLPGFIDVHVHLREPGAPHKETFATGTAAALAGGITMVLAMPNTQPAIVDRAAFQQASEL 1567

  Fly  1538 AKAGARCDYALYVGASDDNWAQVNELASHACGLKMYLNDTFGTLKLSDMTSWQRHLSHWPKRSPI 1602
            |:.|||||||||||||..|:..|:|||:.|.|||:|||:||.||:|:.::.||.||:.||||:|:
Mosquito  1568 AQKGARCDYALYVGASSTNYGTVHELAAQAAGLKLYLNETFTTLRLNGLSVWQAHLASWPKRAPL 1632

  Fly  1603 VCHAERQSTAAVIMLAHLLDRSVHICHVARKEEIQLIRSAKEKGVKVTCEVCPHHLFLSTKDVER 1667
            ..||||::.|||::||.|.||.:|:|||||||||.||::|||:|:|||||||||||||||.|::|
Mosquito  1633 CVHAERETMAAVLLLASLTDRPIHVCHVARKEEILLIKAAKERGLKVTCEVCPHHLFLSTADLDR 1697

  Fly  1668 LGHGMSEVRPLLCSPEDQEALWENIDYIDVFATDHAPHTLAEKRSERPPPGFPGVETILPLLLQA 1732
            :|.|..||||:|||||||:|||:|:|.:||||||||||...||.|:.|||||||:||||||||.|
Mosquito  1698 IGAGRGEVRPVLCSPEDQQALWDNLDVVDVFATDHAPHAREEKESDNPPPGFPGLETILPLLLTA 1762

  Fly  1733 VHEGRLTMEDIKRKFHRNPKIIFNLPDQAQTYVEVDLDEEWTITGNEMKSKSGWTPFEGTKVKGR 1797
            |.:|||||:::..|||.||:.|||||:|..||||:||.|||.|......||:.||||.|.:|||.
Mosquito  1763 VTDGRLTMDELVSKFHHNPRRIFNLPEQPNTYVEIDLSEEWIIPDRPQHSKAHWTPFSGRRVKGC 1827

  Fly  1798 VHRVVLRGEVAFVDGQVLVQPGFGQNVRP---KQSPLASEAS----------------------Q 1837
            |||||||||.|:|||.|||.||:|||||.   .:.||....|                      .
Mosquito  1828 VHRVVLRGETAYVDGLVLVGPGYGQNVREWHGGKPPLLGAGSIERIDALNHSAGSGSGVGGLRPA 1892

  Fly  1838 DLLPSDNDANDTFTRLLTSEGPGGGVHGISTKVHFVDGANFLRPNSPSP-RIRLDSASNTTLR-- 1899
            ||.| |...|:.|.:||:.:|....|..:.  |||....:.|||.||.| |:|.||..|.::.  
Mosquito  1893 DLEP-DLQTNEAFYQLLSPDGTNAHVKQLG--VHFAGEQSALRPVSPLPARVRCDSTGNQSVAGG 1954

  Fly  1900 -----EYLQRTTNSNPVAHSLMGKHILAVDMFNKDHLNDIFNLAQLLKLRGTKDRPVDELLPGKI 1959
                 |.|...|........|:|:|:|.||||.|:|||:||:|||.:|.|..|:|.:|:||.||:
Mosquito  1955 SGRPLEPLGIHTAGLVRDRQLVGRHVLTVDMFTKEHLNEIFHLAQTMKGRVAKERALDDLLRGKV 2019

  Fly  1960 MASVFYEVSTRTQCSFAAAMLRLGGRVISMDNITSSVKKGESLEDSIKVVSSYADVVVLRHPSPG 2024
            |||:|||.||||.|||||||.||||||:.:|..:||..|||:|||||:|::.||||||||||.||
Mosquito  2020 MASIFYEASTRTSCSFAAAMQRLGGRVVHVDETSSSAVKGETLEDSIQVMAGYADVVVLRHPLPG 2084

  Fly  2025 AVARAATFSRKPLINAGDGVGEHPTQALLDIFTIREEFGTVNGLTITMVGDLKNGRTVHSLARLL 2089
            ||.|||...||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||:|||||||||||
Mosquito  2085 AVTRAAQHCRKPLINAGDGVGEHPTQALLDIFTIREEIGTVNGLTITMAGDLKHGRTVHSLARLL 2149

  Fly  2090 TLYNVNLQYVAPNSLQMPDEVVQFVHQRGVKQLFARDLKNVLPDTDVLYMTRIQRERFDNVEDYE 2154
            |:||||::||.|..|:||..:.::|.::|:.|.....|::.:.|||||||||||||||::.::||
Mosquito  2150 TMYNVNVRYVCPPGLEMPAHIREYVDRKGISQRQFDTLESAIADTDVLYMTRIQRERFESEQEYE 2214

  Fly  2155 KCCGHLVLTPEHMMRAKKRSIVLHPLPRLNEISREIDSDPRAAYFRQAEYGMYIRMALLAMVVG 2218
            ||||.|:|||:.|..||:|.||:|||||:.|||.|||||||||||||||||||:||||||||:|
Mosquito  2215 KCCGQLILTPQIMTLAKRRMIVMHPLPRVFEISVEIDSDPRAAYFRQAEYGMYVRMALLAMVLG 2278

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
rNP_523377.1 CPSaseIIsmall 7..376 CDD:273580 212/381 (56%)
CPSaseII_lrg 403..1455 CDD:273581 862/1064 (81%)
CAD_DHOase 1475..1821 CDD:238641 235/345 (68%)
PyrB 1913..2221 CDD:440306 213/306 (70%)
rudimentaryXP_061513808.1 None

Return to query results.
Submit another query.