Protein Alignment Chc and Chc

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_477042.1
• Gene: Chc / 32537
• FlyBaseID: FBgn0000319
• Length: 1678
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_311856.4
• Gene: Chc / 1272931
• VectorBaseID: AGAMI1_004641
• Length: 1677
• Species: Anopheles gambiae
• Alignment Length: 1663
• Identity: 1493/1663 - (89%)
• Similarity: 1585/1663 - (95%)
• Gaps: 3/1663 - (0%)

  Fly     1 MTQPLPIRFQEHLQLTNVGINANSFSFSTLTMESDKFICVREKVNDTAQVVIIDMNDATNPTRRP 65
            |:|.|||||||||||||:.|||:|.||:.|||||||||||||||.:||||||||||||.||.|||
Mosquito     1 MSQQLPIRFQEHLQLTNININASSISFTNLTMESDKFICVREKVGETAQVVIIDMNDAQNPIRRP 65

  Fly    66 ISADSAIMNPASKVIALKAQKTLQIFNIEMKSKMKAHTMNEDVVFWKWISLNTLALVTETSVFHW 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|:|||||||:||||:|||||||:||
Mosquito    66 ISADSAIMNPASKVIALKAQKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTEEVVFWKWITLNTLSLVTETSVYHW 130

  Fly   131 SMEGDSMPQKMFDRHSSLNGCQIINYRCNASQQWLLLVGISALPSRVAGAMQLYSVERKVSQAIE 195
            ||||||.|.|||:||||||||||||||.:..|.|||||||||..:||.|||||||||||||||||
Mosquito   131 SMEGDSTPIKMFERHSSLNGCQIINYRTDPKQAWLLLVGISAQQNRVIGAMQLYSVERKVSQAIE 195

  Fly   196 GHAASFATFKIDANKEPTTLFCFAVRTATGGKLHIIEVGAPPNGNQPFAKKAVDVFFPPEAQNDF 260
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Mosquito   196 GHAASFATFKMEENKELSTLFCFAVRSQTAAKLHIIEVGTPPAGNVAFTKKAVDVFFPPEAQSDF 260

  Fly   261 PVAMQVSAKYDTIYLITKYGYIHLYDMETATCIYMNRISADTIFVTAPHEASGGIIGVNRKGQVL 325
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Mosquito   261 PVAMQVSPRYDVIYLITKYGYIHMYDIETATCIYMNRISGDTIFVTAPHESSGGIIGVNRKGQVL 325

  Fly   326 SVTVDEEQIIPYINTVLQNPDLALRMAVRNNLAGAEDLFVRKFNKLFTAGQYAEAAKVAALAPKA 390
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Mosquito   326 SVTVDEEQIIPYINTVLQNPDLALRMAVRNNLSGAEDLFVRKFNQLFQNGQFAEAAKVAAIAPKG 390

  Fly   391 ILRTPQTIQRFQQVQTPAGSTTPPLLQYFGILLDQGKLNKFESLELCRPVLLQGKKQLCEKWLKE 455
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Mosquito   391 ILRTPQTIQKFQQVPAQPGTNSPPLLQYFGILLDQGKLNKYESLELCRPVLAQGRKQLCEKWLKE 455

  Fly   456 EKLECSEELGDLVKASDLTLALSIYLRANVPNKVIQCFAETGQFQKIVLYAKKVNYTPDYVFLLR 520
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Mosquito   456 EKLECSEELGDLVKPSDPTLALSIYLRSNVPNKVIQCFAETGQFQKIVLYAKKVNYSPDYVFLLR 520

  Fly   521 SVMRSNPEQGAGFASMLVAEEEPLADINQIVDIFMEHSMVQQCTAFLLDALKHNRPAEGALQTRL 585
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Mosquito   521 SVMRTNPEQGSGFASMLVADEEPLADINQIVDIFMEQNMVQQCTAFLLDALKNNRPAEGALQTRL 585

  Fly   586 LEMNLMSAPQVADAILGNAMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHYTDLYDIKRAVVHTHMLNAE 650
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Mosquito   586 LEMNLMSAPQVADAILGNAMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHYTDLYDIKRAVVHTQLLNGD 650

  Fly   651 WLVSFFGTLSVEDSLECLKAMLTANLRQNLQICVQIATKYHEQLTNKALIDLFEGFKSYDGLFYF 715
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Mosquito   651 WLVGFFGTLSVEDSLECLKAMLTANIRQNLQICVQIATKYHEQLTTKALIDLFESFKSYEGLFYF 715

  Fly   716 LSSIVNFSQDPEVHFKYIQAACKTNQIKEVERICRESNCYNPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCD 780
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Mosquito   716 LGSIVNFSQDPEVHFKYIQAACKTNQIKEVERICRESNCYNAERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCD 780

  Fly   781 RFDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVVGGLLDVDCSEDIIKNLILVVKGQFSTDE 845
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Mosquito   781 RFDFVHDLVLYLYRNSLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVVGGLLDVDCSEDIIKNLILVVKGQFSTDE 845

  Fly   846 LVEEVEKRNRLKLLLPWLESRVHEGCVEPATHNALAKIYIDSNNNPERYLKENQYYDSRVVGRYC 910
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Mosquito   846 LVEEVEKRNRLKLLLPWLESRVHEGCVEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLKENQFYDSRVVGRYC 910

  Fly   911 EKRDPHLACVAYERGLCDRELIAVCNENSLFKSEARYLVGRRDAELWAEVLSESNPYKRQLIDQV 975
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Mosquito   911 EKRDPHLACVAYERGQCDRELIAVCNENSLFKSEARYLVRRRDAELWAEVLSEANPYKRQLIDQV 975

  Fly   976 VQTALSETQDPDDISVTVKAFMTADLPNELIELLEKIILDSSVFSDHRNLQNLLILTAIKADRTR 1040
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Mosquito   976 VQTALSETQDPDDISVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDSSVFSDHRNLQNLLILTAIKADRSR 1040

  Fly  1041 VMDYINRLENYDAPDIANIAISNQLYEEAFAIFKKFDVNTSAIQVLIDQVNNLERANEFAERCNE 1105
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Mosquito  1041 VMDYINRLDNYDAPDIANIAINNELYEEAFAIFKKFDVNTSAIQVLIEQVNNLERANEFAERCNE 1105

  Fly  1106 PAVWSQLAKAQLQQGLVKEAIDSYIKADDPSAYVDVVDVASKVESWDDLVRYLQMARKKARESYI 1170
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Mosquito  1106 PAVWSQLARAQLQQGLVKEAIDSYIKADDPSAYIDVVETASKNDSWEDLVRYLQMARKKARESYI 1170

  Fly  1171 ESELIYAYARTGRLADLEEFISGPNHADIQKIGNRCFSDGMYDAAKLLYNNVSNFARLAITLVYL 1235
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Mosquito  1171 ESELIYAYARTGRLADLEEFVSGPNHADIQKIGDRCFNDRMYEAAKLLYNNVSNFARLAITLVHL 1235

  Fly  1236 KEFQGAVDSARKANSTRTWKEVCFACVDAEEFRLAQMCGLHIVVHADELEDLINYYQNRGYFDEL 1300
            :|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||:||
Mosquito  1236 REFQGAVDGARKANSTRTWKEVCFACVDAEEFRLAQMCGLHIVVHADELEDLINYYQDRGYFEEL 1300

  Fly  1301 IALLESALGLERAHMGMFTELAILYSKFKPSKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAESAHLWSELVFL 1365
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Mosquito  1301 IGLLEAALGLERAHMGMFTELAILYSKYKPAKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWSELVFL 1365

  Fly  1366 YDKYEEYDNAVLAMMAHPTEAWREGHFKDIITKVANIELYYKAIEFYLDFKPLLLNDMLLVLAPR 1430
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Mosquito  1366 YDKYEEYDNAVLAMMAHPSEAWREGHFKDIITKVANIELYYKAIQFYLDYKPLLLNDMLLVLAPR 1430

  Fly  1431 MDHTRAVSYFSKTGYLPLVKPYLRSVQSLNNKAINEALNGLLIDEEDYQGLRNSIDGFDNFDNIA 1495
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Mosquito  1431 MDHTRAVSFFTKQGHLQLVKTYLRSVQSLNNKAINEALNGLLIDEEDYQGLRTSIDAFDNFDNIA 1495

  Fly  1496 LAQKLEKHELTEFRRIAAYLYKGNNRWKQSVELCKKDKLYKDAMEYAAESCKQDIAEELLGWFLE 1560
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Mosquito  1496 LAQKLEKHELTEFRRIAAYLYKGNNRWKQSVELCKKDRLFKDAMEYAAESHQGELAEELLGWFLE 1560

  Fly  1561 RDAYDCFAACLYQCYDLLRPDVILELAWKHKIVDFAMPYLIQVLREYTTKVDKLELNEAQREKED 1625
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Mosquito  1561 RGAYDCFAACLFQCYDLLRPDVILELAWRHNIMDFAMPYIIQVTREYTSKVDKLEASDAERQKEG 1625

  Fly  1626 DSTEHKNIIQMEPQLMITAGPAMGIP---PQYAQNYPP 1660
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Mosquito  1626 ESTEHKSIIMPEPQLMLTAGPGIGMPQYAPQYAGAYVP 1663

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Chc	NP_477042.1	Clathrin_propel	19..56	CDD:460192	29/36 (81%)
		Clathrin_propel	148..187	CDD:460192	29/38 (76%)
		Clathrin_propel	198..234	CDD:460192	26/35 (74%)
		Clathrin_propel	256..288	CDD:460192	26/31 (84%)
		Clathrin_propel	296..330	CDD:460192	31/33 (94%)
		Clathrin-link	331..354	CDD:462732	22/22 (100%)
		Clathrin_H_link	356..422	CDD:463995	50/65 (77%)
		CLH	542..672	CDD:128594	121/129 (94%)
		CLH	687..825	CDD:128594	131/137 (96%)
		CLH	834..969	CDD:128594	129/134 (96%)
		CLH	980..1118	CDD:128594	130/137 (95%)
		Clathrin	1129..1268	CDD:459884	124/138 (90%)
		CLH	1275..1417	CDD:128594	131/141 (93%)
		Clathrin	1429..1562	CDD:459884	117/132 (89%)
Chc	XP_311856.4	None