DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG34408 and hgap-2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001285078.1 Gene:CG34408 / 31953 FlyBaseID:FBgn0085437 Length:1728 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001368613.1 Gene:hgap-2 / 3564922 WormBaseID:WBGene00008430 Length:1750 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1921 Identity:471/1921 - (24%)
Similarity:783/1921 - (40%) Gaps:433/1921 - (22%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MYSEWASLSAQITANSCGAQCFSVLNKFPASAGREVVVSVVKQLGTNLGITQNAEPSHLVKDEEV 65
            ||.:|.:|... ..||      |:|:.|..:..:.|..|::.:| |.....:|.....|..:|.:
 Worm    66 MYEQWPTLEFS-DLNS------SILDLFTKATSQSVASSLLYEL-TRSDADENGGSIRLNNEEHL 122

  Fly    66 KWCMDVICFGLSLPL---QEHETIKDCVNVYCEWLTALHPQPRISVPKPICEDANLYARQIINHF 127
            ||||.|:...|:|..   :|:||:|..|.:|..||.||...|..::|.|:......|.|.||:..
 Worm   123 KWCMQVLNHSLTLSFATSREYETLKGAVRIYLHWLRALCDTPDNNIPTPLLATPEKYFRNIIDAL 187

  Fly   128 HNLFVPRQGEILPFLYQTTLGAD-----TIKRQAVLCHRVLRTLQQ-TAQISQLMDRQTWDTLLL 186
            ..:|..|:.:     :.||:|..     .|:||::....||.:|:. |...|:....:.|...:.
 Worm   188 RWIFCRREDD-----FDTTVGGQVPRGLAIERQSIEIDMVLDSLKYLTRNSSRKYQDEVWARSIS 247

  Fly   187 FLLAINEILLAPPTVKDDVGDQLCERVLSVLFEVWLLACVRS-FPSPSMWKTLQESCAMWRHRVA 250
            |||..::|||:.|...:::|.:.|.||...||::||.|.:.. .||.:.|.:|......|||.|.
 Worm   248 FLLNSSDILLSEPNATEEMGTRTCVRVADTLFDMWLNAVLNEHIPSLTYWSSLATLARRWRHNVP 312

  Fly   251 LVDQWNRVNLALTARLLEFSYGPAFPQLKNADED---GQLIPIGMSND-----CVAQTWYRFLRM 307
            :::.|.:..|.|:..:....||..|.::...||.   .:.:|:....|     .:.:||:..|.:
 Worm   313 IIECWAKKILGLSTLVCRKMYGDDFLKIDIVDESVLPFENVPMTAEEDENEVHLLYRTWFNMLCL 377

  Fly   308 IGNPTA---------LC----SPHIISKSSHFVQWALTHEKGAETHQHPCLQQLPQIFLNAMKGI 359
            ..:|..         ||    ||...:.|.....:.|.....|         |....||.|:. :
 Worm   378 FDSPAKILNHDATRNLCLNGNSPRRTTSSISMSNFELASSSAA---------QGVSFFLAAVT-L 432

  Fly   360 SSQVDAFLGVYQ--------PPPQQTDGVVTNLLEIRHSLNEATSSTLQQFIHSSSATNIANQQN 416
            ...||.|.|..:        |.|   ||        :.:.|..|:|.|..               
 Worm   433 QRMVDLFYGDSRVKIDLRNYPVP---DG--------KTAPNTRTASVLTD--------------- 471

  Fly   417 QPAHHHHHLHYPHLHLHGAGSFLRDNFMSNSASSALNAIMGHHGGHHGHHHQQQQQQQQQLQISA 481
               :|.||.:             |.:..:..:|..::.     ||..|             ||..
 Worm   472 ---NHSHHTN-------------RTSSTTGDSSRYVSL-----GGAVG-------------QIIV 502

  Fly   482 SPTSSLTTSGSSAVGSTS-AGGSHSAGVVGS-------ISFGATESPGPGQASASATPTPPLQRR 538
            .......:|||:|.|.|| |.|:.|...:.|       |......|..|...:.|.|.:..:..:
 Worm   503 DDHQVSMSSGSTASGKTSTATGTSSTHTISSEIRRDQRIMSVNDRSRDPSHRTVSVTDSVNISNQ 567

  Fly   539 LAKSFSVAPTITQQKG-LSKTSLIGLTGGGARNAISSSSTTTTNAGSTGGTGSG----DGSAPAP 598
            ...|...:.|:|.:.. :.:|:    ...|...:||...:.:|.:...||.|:.    .|..|:.
 Worm   568 SRYSEQTSSTLTYKSAPIPETA----NENGHGESISQLVSNSTVSAPVGGAGNDLTLKAGVHPSE 628

  Fly   599 LPTTPTS---------------TSGPPSASSSINSLPLTSMGAGVELAVARPKCNSILHVFHEWL 648
            :....:|               ||...||...:.:....:......:...|||.:.:|::..:||
 Worm   629 MKIGRSSGVIGSAQHNNFYADTTSPYRSAQRFVTNFLTANQATMPYVGGKRPKTDRMLNLVGDWL 693

  Fly   649 F-------EAAHIGGDTWRQNRKKQACEASKRPSSMIMEH------------------------- 681
            |       .:..:.|:....:.||.....|....|.:..|                         
 Worm   694 FAIVNSPTNSPRVTGNDHSGHHKKNNDGVSDDVISGLSLHSVDLDDIPDAMSPMMGRSDSNAVLS 758

  Fly   682 -------RKGSISLSQPNSLNDPQSLPPTLT--------------IDKYESGRAEAIGTLCKIFC 725
                   |:.|:..|..:...:...:..|.|              :|...:|||.|:.:|.:|..
 Worm   759 GGHNAVGRRKSVGSSCSSVAGESDVMSSTSTAGGHSQKHPEDYQQVDGVTAGRAAALASLIRIIT 823

  Fly   726 AKKTGEEILPVYLARFYMALQQCLKITESRECDETLASILLHSSDLFRLDLDGINVLLPGFIAAL 790
            :|.:.|:|....|:.||..:.||| :.:.|   ..|.::..:..:||||.|.||..|||.|:.||
 Worm   824 SKSSNEKIPNSQLSNFYATVFQCL-VEKER---VMLCTLFYYGRNLFRLGLPGIESLLPHFLFAL 884

  Fly   791 EIVLPDKDLKLKTQSMVFNRTELRRSAINILLSIMVLPLHYQTLPIRDLTCESSEK--MFTFIQL 853
            :||:.:.. ||:....: :..|:||:.:..|.|::..|..:....|..:...::.|  ..|::.|
 Worm   885 DIVMIESS-KLRLHPSI-SEVEVRRACLRALSSVICWPTTFGMSKIPQIAEAANLKSNAATYLHL 947

  Fly   854 KSRLMNILMNALQVETDAQNTHMLLGGLLLCVQDAVTFEET---ELGGGNANLSQNSSGVQHHDA 915
            :||:...||.:::.|||..|.|:.|.   ||   ||..||:   :||     |::          
 Worm   948 RSRIFKTLMFSVRNETDPTNLHIALS---LC---AVLVEESCQFDLG-----LNE---------- 991

  Fly   916 NLLSSACSERSASLVS-AGTASLGGQTTATMGAGSGSIRDTASAHDYPSLTISDDMSFEFGQELE 979
                    |::..::. :.|||..||  ...|..:..:|...||       |.|    :||:   
 Worm   992 --------EQTKEMIRISTTASSSGQ--PEKGLCASIVRGVLSA-------ICD----KFGR--- 1032

  Fly   980 GVTTYDNAHALFVRATYLVCHRLISSWKTDLNVSLAALELLSGLARLH----IRETDALECKRAV 1040
             :.|.|::.|                        ||.:::|:.::.:|    ....|.......:
 Worm  1033 -IETIDHSTA------------------------LAIIDVLNCISHVHHTVLFNNMDVSTGTLVI 1072

  Fly  1041 KWICDYICYQCSRPPPAHSKDLHSTIVAAFQCTAAWLMQHPYLLQDKDCLQTVLEVVELGISGTK 1105
            ..:|.:|..|.::|||.||||||||:|||:...|.||...|.|.:....|.||.:|::||::|:|
 Worm  1073 ASLCRFIEQQLNKPPPMHSKDLHSTVVAAYNAVAVWLTASPLLAECVGVLGTVCDVIQLGVTGSK 1137

  Fly  1106 SQSKGTDIPKFKDEKELKP--ASMRVRDAAENLLTIILEQVGYFPSECGPESISSLLDELALM-K 1167
            :   ..|:.|.:.| .:||  ||.||.:|||.|:..:...||..|   ||     |.||..|: |
 Worm  1138 T---SPDLQKSRGE-TVKPKAASQRVLEAAEALMYTLFCVVGRKP---GP-----LRDEKRLVHK 1190

  Fly  1168 HCNSMVPAAAASSEQAIAKFKYFVTENSTILALLEEPLGND-QDPQPTVTLLIRGPF-GRHAWTM 1230
            :..:.:..         :||.:.:....|:|:|.|....:| .....:|..:.|.|. |.:....
 Worm  1191 YGPNRINT---------SKFLHVLVNGDTLLSLHEASHIDDIPSDSASVVYVRRSPMQGANTGIA 1246

  Fly  1231 QLRHLPRSKSGIKYH---AINPGRPIPMNDVTQRLDSEQKNFPDGVDKVQPCVAD-YSIPTIEQM 1291
            :||..|.:     ||   .|.|..|:.....|:..  |..|.|    |||..:.: :.||.    
 Worm  1247 RLRPKPEN-----YHPEVGIPPMTPMSAASTTEGF--EGPNTP----KVQKSIGEQFVIPP---- 1296

  Fly  1292 REQYGTA-----VIRELESLLENQSIHEKLAWAEADTSA------------DSLSHAQECVPPT- 1338
             |.|..:     ..|.|||..|.::|.|::....:....            :.:...:..|.|: 
 Worm  1297 -EFYKNSCKLDNAFRNLESTTETEAIAEEMKQQNSQNGRSFFDESRRNNVFERMRPEERIVAPSK 1360

  Fly  1339 ---VCHEFHAARLFLSHFGFLGFETRNPQNPAEALGNPPQRPLIVLDTK-SAAFAADL-DRLDKL 1398
               .|   .:.|:.|..||.:.         ....|:    .:::||:. |..|..|| :.:|..
 Worm  1361 PLDTC---SSIRMMLYDFGLIN---------ERIFGS----EIVLLDSSMSEKFYRDLHETVDCA 1409

  Fly  1399 SARTHDSVYVFYVKSGQTSAQQIIAN-MGEESSASHDPHFASMLQTLGWPVQVSEHSGWTGFAHN 1462
            .|||..:.::||||.||..|..|:.| :..::|.|   .|...|..||..:::..|..|||    
 Worm  1410 PARTQLTAHIFYVKEGQRIAVDILENALNVQNSCS---DFCMFLANLGEGIEIGVHDTWTG---- 1467

  Fly  1463 SWSLKGTPEEQLKSTANELNY---NGSQRVLYWAD---VSSEIAFVVPTTWNLRYNSDTCDSGSI 1521
            .||...:.|.:|:..|:.:::   :|.|..|:|.|   .:||:||::||..::|.......|.:.
 Worm  1468 HWSTAYSTERKLQEEADGVDHYIVDGIQHALWWCDEQGSNSELAFLMPTERSVRMFKQNITSPAS 1532

  Fly  1522 SSTDQIGSSNVWTRGEADSAAGLAKSKS-----RNLSLELDTNRRDVKEPVPPTRR--------- 1572
            ||          .||..::.:.::..||     .:..:.|:..|...|.|...:.|         
 Worm  1533 SS----------RRGSNNNRSIVSDDKSFDSTHTDNGMMLNARRLGEKSPSNLSDRDFRPYAGGG 1587

  Fly  1573 ----KGNVTKPTLLAQAPAKIFLVWLESYEDYLNFPLEDLLAYTRTGEEL-----QTQQLPRASD 1628
                .|:|.:.|    ...||.|||||..||..:||:.:|:.....|.:|     |..::..|::
 Worm  1588 SSMGHGSVGRRT----GALKIMLVWLERPEDMTSFPIYELIGTCDDGTDLLNGGAQKPEIGGATN 1648

  Fly  1629 C----HVIFVHSLLSGLLRVKLQGPPGRMSFATPLVDGMVLSRRVVGNLVRQTALNISRRRRLDN 1689
            .    |:||:|.:..|:::::.:|...|...|.|||||:|:|...:.:.:|.|.||.|||...:.
 Worm  1649 SQVAHHIIFIHLVEPGIVQIRTRGTVNRFGEAGPLVDGVVVSLANLPSFIRNTILNTSRRDVAEI 1713

  Fly  1690 DNYQPPHVRRRLKVQDIVQKYKMDLSEADLLAHLFQ 1725
            :||..||.||:..:.:..:||....|..:.|.::.|
 Worm  1714 ENYTFPHTRRKQAIVEFAKKYAAKTSYEEFLVNVIQ 1749

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG34408NP_001285078.1 RALGAPB_N 152..273 CDD:466561 37/122 (30%)
hgap-2NP_001368613.1 RALGAPB_N 222..334 CDD:466561 33/111 (30%)

Return to query results.
Submit another query.