Protein Alignment Ptp4E and dep-1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_525076.2
• Gene: Ptp4E / 31425
• FlyBaseID: FBgn0004368
• Length: 1767
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001254192.1
• Gene: dep-1 / 174437
• WormBaseID: WBGene00009717
• Length: 1367
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 1356
• Identity: 372/1356 - (27%)
• Similarity: 574/1356 - (42%)
• Gaps: 285/1356 - (21%)

  Fly   479 VPAPFPV----AAESQ-ITTNLTEYTLDS------------------LLAGRRYLIAVQALSKGV 520
            :|...|:    ||:.| :|.|:::...||                  |.||.||.||:.....|.
 Worm    55 LPRRHPLYQSFAAKIQDVTENISDEVRDSNKTFVSSDDAPYSIRIHALRAGHRYSIAIHGQKDGS 119

  Fly   521 ASNASDITRYTRPAAPLIQELRSIDQGLM-----LSWRSDVNSR--QDRYEVHY-QRNGTREERT 577
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 Worm   120 TSLIKEESVVMDPRAP---DFRSMDSDIQVAEHNITMRTIKNDSYLQDSFSIEYRQINPDKKFPV 181

  Fly   578 M----ATNETSLTIHYLHPGSGYEVKVHAISH--GVRSEPHSYFQAVFPKPPQNLTLQTVHTNLV 636
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 Worm   182 LQILDIPEQKNLEFYLGNLNSGFDYSVRVIAHKDGMSSRPWISTLTTKPSPLKEVNINQNAGSCV 246

  Fly   637 VLHWQAPE--GSDFSEYVVRYRTDASPWQRIS-GLHENEARIK---DMHYGERYLVQVNTVSFGV 695
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 Worm   247 EVSWQNDEFSGADF--YTIQYSLQSTPNNSTNMTIPSTESSISICDSMLQGEAYQI-IATVQKGG 308

  Fly   696 ESPHPLELNVTMPPQPVSNVVPLVDSR----------NLTLEWPRPDGHVDFYTLKWWPTDEEDR 750
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 Worm   309 QVSEPLITKFQLRP------LPPIDFRVRADLKRGKYKLLAELP-TSSKIDKCQITVAGDEAERS 366

  Fly   751 VEFKNVTQLEDLSSPSVRIPIEDLSPGRQYRFEVQASSNGIRSGTTHLSTRTMPLIQSDVFIANA 815
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 Worm   367 VNYANIEQTK--SGHKICWFNFALSPGERFDFSISSMANESASQKLQKSIVLTPAFDFNAFGLTL 429

  Fly   816 GHEQGQDETITLSYTPTPADSTRF-DIYRFSMGDPTIKDKEKLAN----------DTERKLSF-- 867
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 Worm   430 QESNG---GIELIWPKSEVFMTRVKDIWNKVVG------AESLLNMRITPIGNNDETDKTLKFET 485

  Fly   868 ----------SGLTPGKLYNVTVWTV--SGGVASLPVQRLYRLHPLPISDLKAIQVAAREIT--- 917
                      ..|..|..|.|.::||  :|.::........|:      ...|:.|:...:|
 Worm   486 SPKNIDPVFAKNLVKGACYRVQLFTVTKTGIISETRHNETIRM------SSPAVNVSLESVTRSS 544

  Fly   918 --------LHWTAPAGEYTDFELQYLSADEEAPQLLQNVTKNTEIT--------LQGLRPYHNYT 966
                    .|..:.:  .::.::..:..|.....:..   |..::|        |.||.|:|.||
 Worm   545 ATLRIVFSTHHDSTS--ISNCQMHIVVRDMNGKSVFD---KRMQLTATFAPLLNLDGLSPFHKYT 604

  Fly   967 FT--VVVRSGSIQGTDFADVSVSTLMRSSAPISASYQTLTAPPGKVDYFQPSDVQPGEVTFEWSL 1029
            ..  ::..|||.: |.....:..|:.:      .|:.|....|..|...:...:....|...| |
 Worm   605 VNTQIICGSGSSE-TPQCPAATRTMRQ------LSFSTRQDKPAAVQDLKVEPLNSYSVMLTW-L 661

  Fly  1030 EPAEQHGPIDYF--RITCQNADDAADVS---SYEFPVNATQGKIDGLVPGNHYIFRIQAKSALGY 1089
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 Worm   662 PPALPNGILTHYAVNVTKIGSDETRTIDVGVSSNRSDHTVQVVIDELFGGHTYSFSVRAVTEAGF 726

  Fly  1090 GAEREHIQT--MPILAPPVPEPSVTPLEVSRTSSTIEISFRQGYFSNAHGMVRSYTIIIAEDVGK 1152
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 Worm   727 GENSPVVPTVSMPLMAPPVPTVAPMIMKESVGSHNMIVRFPTTMFDNRNGEIKQFAIIVSETTAD 791

  Fly  1153 NASGLEMPS------WQDVQAYTVWLPY----QAIEPYN-----PFLTSNGSRKSSLEAEHFTIG 1202
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 Worm   792 ESINRWIESDNGTYTWQQVQRFDVWPSYVAKLQDIQKVKQDVDVSIFEELGEDETCLEVRADRI- 855

  Fly  1203 TANCDKHQAGYCNGPLRAGTTYRIKIRAFTDEDKFTDTVYSSPITTERSDTVIVAATVSAVLLV- 1266
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 Worm   856 -----------CNGPLRSASKYRVRIRLFTSPTLFTDSPPSQVMTTGSATPAIPLLTVVAVLIVI 909

  Fly  1267 AMVLVV----VYCQHRCQLIRRAS----------------KLARMQDELAA-------------- 1297
            |.|.:|    ::..:|.:..|.|:                .|..|..|.||
 Worm   910 AFVGIVGTIFLFFWNRTKKARLAAAAFKNGPSKEKESQWEALKMMMAERAADCLAKLGLDATTPP 974

  Fly  1298 ----------------------------------------------------LPEGYI--TP--- 1305
                                                                |..|.:  ||
 Worm   975 PSSTTSSNSPTSTSTTMTDCGSNPHLGAPNAGGHRRTRSLRERTGVEHRLERLSSGPVHRTPLYT 1039

  Fly  1306 ---------NRPVHVKDFSEHYRIMSADSDFRFSEEFEELKHVGRDQACSFANLPCNRPKNRFTN 1361
                     :|||.::||::|.|:||||||||||||::.:::||..|:.:.:.||.|||||||||
 Worm  1040 VVTGANTNKSRPVRIEDFADHVRLMSADSDFRFSEEYDMMRNVGVGQSVAASELPINRPKNRFTN 1104

  Fly  1362 ILPYDHSRFKLQPVDDDDGSDYINANYMPGHNSPREFIVTQGPLHSTREEFWRMCWESNSRAIVM 1426
            |..|||||.||...::.:|.|||||||:||.:|.||||..||||.:||:.||:|.||....||:.
 Worm  1105 IPSYDHSRVKLSNPNNIEGGDYINANYVPGFSSRREFIAAQGPLPTTRDHFWQMTWEQQCPAIIA 1169

  Fly  1427 LTRCFEKGREKCDQYWP-VDRVAMFYGDIKVQLIIDTHYHDWSISEFMVSRNCE----SRIMRHF 1486
            ||:|.||||:||.|||| .:.|.:.||||:|.::.:..:.::.|.:..:.::..    :|.:||:
 Worm  1170 LTKCVEKGRDKCHQYWPDHENVPVLYGDIEVTIVAEKEFDEFVIRDIRLEKSGPDGRVTRFVRHW 1234

  Fly  1487 HFTTWPDFGVPEPPQSLVRFVRAFRDVI--GTDMRPIIVHCSAGVGRSGTFIALDRILQHIHKSD 1549
            |:..|||||.|..|..:::|.|.||..:  .....|.|||||||||||||||::||:||.....|
 Worm  1235 HYMAWPDFGAPSHPNGIIQFSRMFRHHLPHSPHNAPTIVHCSAGVGRSGTFISIDRLLQSSSFGD 1299

  Fly  1550 YVDIFGIVFAMRKERVFMVQTEQQYVCIHQCLLAVLEGKE-HLLADSLELHANDGY 1604
            .:|:||.|..||.||..|||.||||:.||.|:|.||:|.. ...:.|...|.|.|:
 Worm  1300 PIDVFGTVCEMRYERCQMVQNEQQYIFIHYCILQVLQGSSPSPTSTSTGAHHNAGF 1355

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ptp4E	NP_525076.2	FN3	<94..>334	CDD:442628
		fn3	247..328	CDD:394996
		FN3	319..>749	CDD:442628	71/322 (22%)
		fn3	708..796	CDD:394996	20/97 (21%)
		fn3	902..978	CDD:394996	17/96 (18%)
		fn3	1013..1092	CDD:394996	19/83 (23%)
		PTP_tm	1127..1247	CDD:465889	37/134 (28%)
		R3-PTPc	1358..1579	CDD:350396	112/227 (49%)
dep-1	NP_001254192.1	FN3	640..736	CDD:238020	21/96 (22%)
		PTP_tm	770..>875	CDD:465889	31/116 (27%)
		PTPc	1072..1333	CDD:214550	128/260 (49%)