Protein Alignment Alms1a and alms1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_572175.3
• Gene: Alms1a / 31393
• FlyBaseID: FBgn0025388
• Length: 1322
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001429403.1
• Gene: alms1 / 561882
• ZFINID: ZDB-GENE-030131-4837
• Length: 2124
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1623
• Identity: 331/1623 - (20%)
• Similarity: 552/1623 - (34%)
• Gaps: 537/1623 - (33%)

  Fly    44 LDRF------MALSSTASSGASGSTHS-----CALGSVPPPGCASMEHE-------SRPESGHRR 90
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Zfish   673 LGRFSDVSSSVNLSSTLSS-SQGSYHGEQSMRASVGAA--SSVVSLEVDNYAPYWTSRPTSPPHT 734

  Fly    91 RTKSSDHRSPDERGEAKEQLRELSVSPPPSKHKISQFT----------SPKSEVT---------- 135
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Zfish   735 REFNIEDRIP-------LYLLNLGIDQSPST-ILNPFTRRGPIREPEFSPTDLCTIKGSIGTPTK 791

  Fly   136 KTKPNEYTIIPIVLASSPSFRSVAVTQT---------MSQSAED-----IRTPTKSPQMQNKKTQ 186
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Zfish   792 STQPSEVDSLQKETFSSSSQHSTESSASVSHHLSVHELSQPATDSSVKVILTQADAAQLQS--TS 854

  Fly   187 TPESVLKSHKRLEWDPSADVGYCKRAMSMSNISTLERSVL---EDCSWRQPTQQ-------RPEA 241
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Zfish   855 HPSTTLQ---------QSDAAESERSFSLPVPESGPREVVKADDDSLVGSGTLHEIRRLLGRAES 910

  Fly   242 NLDGVQPLLAEEPSPMLDKPTPPLA--------------------CSTFVNRSERTKSLNSGMES 286
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Zfish   911 LVSGRSSLTSSPGSHRLSESDTSLVSLGRNARGYHTDTSLSAGGNLSLLLTRS----SSDSALKG 971

  Fly   287 SLSSNKGDPR------KKCQRKSRRQDSEVSSCQTDCRSSSQKESTQGSSEAKDIRG--NFTTEG 343
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Zfish   972 SLSSSQGPQHIDLTTVKPAALSLSREESLKA---RDLRVTPRRAEPEGCSAADPDKGKPTTTTSG 1033

  Fly   344 TQCSYNRNDTEIDSIMEEEESIDRRKKDDLRISSRVQDPQISSRRPSVS--SSRRESLSSYRRDD 406
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Zfish  1034 TQIN-------LPSI---AVSVPQNEED------TSEDAPIGSSENSLSHVSAEAESLS------ 1076

  Fly   407 SRLNSPNSSRLGSEVSSRVESSRSSSRRESQTNSVYGSLSASSFDYHMHMAQEVEVLKHNQRRQQ 471
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Zfish  1077 ---DSSSESSLAARVAKLLQS-------ESPVSMV--TSRPSTADPEDSRAREWILMKVSGRRCE 1129

  Fly   472 EMEV--EPKKQLEKEQHQNDMQQGEPKGRELKDKNHHS--GREQQEIQPLMRDQRKAEQRHEKDH 532
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Zfish  1130 SLELNTEDRKRIEEIKRELLLNTKYTKWSSDSEGSAQSSIGLESQQTKGYV-GLRNMENR--LSD 1191

  Fly   533 QLEREQQG----IQQLSKGQRKAKKRE---KEREQERQYTAAQFEKIRSNRRHVNKENQKPENPV 590
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Zfish  1192 QLQKAPSNPLSTVQDL-----EAKVHEIALREGFSTKPFTSI---TISTTRR-----TPSPQSPP 1243

  Fly   591 VNPSTGVTASTSTTSLDVGSGSR-PGGELDLG---------IDLLCSLVKSRSLSQGQKKKLVRD 645
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Zfish  1244 HSPVTGTLKIT-----NVGSANETPAGTKDSDREKETEGQHID-------EKKTTEDKQENTITD 1296

  Fly   646 IARRISCLE--LTESSTSSRS--------LSSSSKEQLK------------------VPTGS--- 679
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Zfish  1297 KAQRMSHIDYNVTSSTFNNKSHLSHIHVTLSPKPKNQIRFEKSTQNISQDVALQRPIVPSVADPQ 1361

  Fly   680 ------------------LQQVAATNTNQSNAR-------SSSKAERIAPPVPAPRKRAAIGSSS 719
                              .::|...||.:.:||       ||:.:.|:.........:.|.|:::
Zfish  1362 LEPMHRISTLNHVSSYEYRERVQGQNTGRVSARFPARHTQSSAPSNRLDMKSRTLSGQTAYGTAA 1426

  Fly   720 PLPESVSYSGSTSGSGEVI----TQKTNIPNRNASTDADIEPLDLQDWLNPMTLSEIEFEERLKG 780
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Zfish  1427 -VPTLLPY--KPHGSSELFYMPQVDPELSPGRSDTTVESSHP-DSDDAVPP------HFNKDILG 1481

  Fly   781 GTDSE-------RRRQLHWVKTEINRMQEFKNLLENISLPSKSQKKANTESATAAQI-PSSMRCM 837
            ..:.|       .:..::..:|.:|:          :|......|.|:|..:||.:: ..:|..:
Zfish  1482 SREQEDNTITPKHKEGIYSKRTNMNK----------VSSGDCPPKSASTFVSTAPEVSKKNMETV 1536

  Fly   838 GDQKERPDKE-YLLRQEMSAEAESKEMENSETTTTPPPPVRIESVGVNVTNSDPSTLPAPPPTQP 901
            |...|..||| :.:...|.|: .|.:..:...:||..|.:                     |.:|
Zfish  1537 GIDAEYNDKEDHFVPLNMEAD-NSMDHVHFHNSTTQEPKI---------------------PREP 1579

  Fly   902 PPPPPHLNQRNLQNRKKMATPLLVSGSSTSGGGRSESVCSFVQQRQRQFREHYQNQQQQQFVLLQ 966
            .......|:|..:..||        |...:....|..:.|.:.|..|:|.|.:..::
Zfish  1580 HYSSSQPNRRPYRGNKK--------GKDRTPHDVSLEITSSLDQLWRRFNEKWSTEE-------- 1628

  Fly   967 QQKLYQLQKQLNQQKDILIQRQQHCGQCAQCGHQRT----CIHQQNCP-------RRQQEAEEQ- 1019
                   .:.:|..:..|:.|.:...:..   |..|    .:.|.:..       .|.||.|||
Zfish  1629 -------SRSINDGETSLLDRLERLSRLI---HNTTPTDHSVQQSSDSGNGEYDRMRNQEEEEQR 1683

  Fly  1020 -------------------------PDEREQYMQ---------MQYAQAAGSAYATPHQSGSSGA 1050
                                     |.||::.::         .:..|.|..|:....:...|
Zfish  1684 ERVQLKAPPKHAWVQDEGQGKVHLCPAERDESVETSSSVSTVDTERLQRAFGAHRVAREGMKS-- 1746

  Fly  1051 DKNEAIYYQVVNSQGVASYVQAT---MVSTETQNEASATGGAGGSAI------------------ 1094
            |.:....|..:|::..:....:|   .||..|.|...:|..||..:.
Zfish  1747 DGSLLRLYNSINAKKTSRRKPSTKDAAVSVTTDNTDDSTVSAGSLSSSSTSFHHSQRGVYSLKTK 1811

  Fly  1095 --------------------------TRSTTTTTNSSSSMMCISSDMSVPMGMMN-----TCETT 1128
                                      ||...|...|..:...:||......|:.|     |..|.
Zfish  1812 KSKVKLVSKSVQAGDLEIVINGTRKHTRDVGTVFPSPGAFKNVSSSNKFGSGLQNGIPIPTASTA 1876

  Fly  1129 TTTTTHQYDDVACQRVRR------------------GHKETTMNAES------------------ 1157
            ....|....|.:.:.||.                  |.||.....||
Zfish  1877 KPIQTALKRDSSNKSVRTRYPHGVSWFVSADELKFDGRKENQPQNESEPSISQAWFEPYSRTRPW 1941

  Fly  1158 --------MQRQTLQVRPRAISYVIQFTPTG-SSEVIEKPP-----SLQDQLQLARPEFCANAKQ 1208
                    .:||..|.:.|...     |.|. .:::.:|..     |||:.|:|.||||.:.:::
Zfish  1942 RESSREPLRERQNQQEQERQTE-----TRTAMETDISDKTSALVRLSLQEALELHRPEFVSRSRE 2001

  Fly  1209 RKAIL------NEMQMIRNARRQELDNVLSQSTSMEALNRHLEQLPPPANTRVRLFTTREM---- 1263
            |...|      ..:|.|.|..|:||.|       ..|.:|.|...|.|   |.|:...:||
Zfish  2002 RMKRLGLLVEERRLQAIFNREREELFN-------FPAPSRPLRAAPVP---RKRVVPRKEMVQRS 2056

  Fly  1264 -----KAITSKRC----------KNLPEVLAAQSRQEEEQRR---RSNRLMRDVFNKRLKSRV 1308
                 |...|:|.          ..||||   |.|:|||:||   ||.||...:|||::.:||
Zfish  2057 RDWVGKKSHSQRIDRTDRLRRKYAKLPEV---QKRREEEKRRAEYRSYRLTAQLFNKKVTNRV 2116

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Alms1a	NP_572175.3	PTZ00121	<457..587	CDD:173412	29/140 (21%)
		ALMS_motif	1190..1312	CDD:464634	50/147 (34%)
alms1	NP_001429403.1	None