Protein Alignment dor and vps18

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_477286.2
• Gene: dor / 31118
• FlyBaseID: FBgn0000482
• Length: 1002
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001121454.1
• Gene: vps18 / 100158548
• XenbaseID: XB-GENE-1007587
• Length: 968
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 994
• Identity: 328/994 - (32%)
• Similarity: 541/994 - (54%)
• Gaps: 94/994 - (9%)

  Fly    39 DDEDEIFSRHKMVLRVPSNCTGDLMHLAVSRNWLVCLLGTPERTTLLRFFLPRAIPPGEAVLEKY 103
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 Frog    37 EKEMPIFNKQRIDFTPPEN----INSLFVCSNQLCMSLG---KDSILRIDLMKADQPNQVDLGR- 93

  Fly   104 LSGSGYKITRMFLDPTGHHIIIALVPKSATAGVSPDFLYIHCLESPQAQQLKVRRIEKFKDHEIT 168
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 Frog    94 --KDDFRVHKIFLDPTGSHLLISV--------SSSECLYL----NRNAQ--KVRTLSRWRGHLVE 142

  Fly   169 AVAFNPYHGNESSTGPILLGTSRGLIFETELNPAADGHVQR------KQLYDLGLGRPKYPITGL 227
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 Frog   143 SIGWNKLLGNETSTGPILVGTAQGLIFEAEISASEGGLFSTNPDQYFRNIHTLEEETGPVPVCCL 207

  Fly   228 KLLRVPNSSRYIIVVTSPECIYTFQETLK--AEERSLQAIFAGYVSGVQEPHCEERKTDLTFSQL 290
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 Frog   208 EINR-GYENRFSVIATTPKRLFQFAAKIPEGTEQQGFTPLFNQPVDDL--PSIQEFPGSLGYSEI 269

  Fly   291 RFFAPPNSKYPKQWAWLCGEGIRVGELSIEANSAATLIGNTLINLDFEKTMHL-------SYGER 348
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 Frog   270 AFYTQKLRSIPSSFAWMMGNGVLYG------------------NLDFSRPDSILTDVQVWEY-PS 315

  Fly   349 RLNTPKAFVLTEYHAVLLYADHVRAICLLNQEQVYQEAFDEARVGKPLSIERDELTGSIYVYTVK 413
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 Frog   316 SVEKPMSIVLTQFHFLLLLPDRIKAICILNGQVVFEDVFTE-KFGPLKKMLKDPSIGQIWIHTER 379

  Fly   414 TVFNLRVTREERNVWRIYLDKGQYELATAHAAEDPEHLQLVLCQRADAAFADGSYQVAADYYAET 478
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 Frog   380 AVFRYHVEREPRDVWKMYMSMGKFDLAKEFCRDRPECMDTVLASEAEHCFQSKKYIESAKCYALT 444

  Fly   479 DKSFEEVCLKFMVLPDKRPIINYVKKRLSRVTTKPMETDELDEDKMNIIKALVIWLIDLYLIQIN 543
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 Frog   445 QKYFEEVALKFIEAKQEEALMEYLQKKLSNLKS---------SEKIQ-VTLLTTWLTELYLNHLG 499

  Fly   544 MPDKDEEWRSSW---QTEYDEFMMEAHVLSCTRQNRETVRQLIAEHADPRNMAQFAIAIGDYDEV 605
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 Frog   500 ILESDTSKRSFYLKARDEFRAFLSSPRNKECLFNNRTSIHDLLASHGDTEHMVYFAVLMQDYERV 564

  Fly   606 VAQQLKAECYAEALQTLINQRNPELFYKYAPELITRLPKPTVDALMAQGSRLEVEKLVPTLIIME 670
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 Frog   565 VAHHCQHDDYNEALNVLSKHKDEKLFYKFSPVLMQHIPTKVVDAWIAMGKKLDPKNLIPALV--- 626

  Fly   671 NREQREQTQ-----RYLEFAIYKLNTTNDAIHNFLLHLYAEHEPKLLMKYLEIQGRDESLVHYDI 730
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 Frog   627 NYSQSAGTQINEAIRYMEYCVYMMKETEQAIHNYLLSLYAQFRPDSLLSYLEKAGTNANRIHYDL 691

  Fly   731 YYAHKVCTDLDVKEARVFLECMLRKWISAVDLALTFDMKLAKETASRP-SDSKIRRKLWLRIAYH 794
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 Frog   692 KYALRLCAEHGHNRACVHVYKVMELYEEAVDLALMVDVDLAKSCADLPVDDEELQKKLWLKIARH 756

  Fly   795 DIKGTNDVKKALNLLKECDLLRIEDLLPFFADFEKIDNFKEAICDALRDYNQRIQELQREMAETT 859
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 Frog   757 VVQEEKDVKKAMVCLSSCHLLKIEDILPFFPDFVTIDHFKEAICNSLEDYNKHIEELKREMEDAT 821

  Fly   860 EQTDRVTAELQQLRQHSLTVESQDTCEICEMMLLVKPFFIFICGHKFHSDCLEKHVVPLLTKEQC 924
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 Frog   822 LSAKRIREDMQEMRNKYGLVDPQDKCTFCDFPLLNRPFYLFLCGHMFHFDCLMQVVVPNLPSYKQ 886

  Fly   925 RRLGTLKQQLEAEVQTQAQPQSGALSKQQAM----ELQRKRAALKTEIEDILAADCLFCG-LLIS 984
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 Frog   887 VKLEDLQQKLAAAVQ---PPKSRSQAKEEDAINLGKIQQNREQIKADIDDIVAAECAYCGELMIR 948

  Fly   985 TIDQPFVD--DWEQVNVEW 1001
            |||:||:|  .:::..:.|
 Frog   949 TIDKPFIDPQKYKEEMLSW 967

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
dor	NP_477286.2	Pep3_Vps18	311..464	CDD:461557	45/159 (28%)
		Clathrin	650..783	CDD:459884	51/138 (37%)
		RING_Ubox	883..981	CDD:473075	41/102 (40%)
vps18	NP_001121454.1	Pep3_Vps18	290..430	CDD:461557	45/159 (28%)
		Clathrin	615..>723	CDD:459884	38/110 (35%)
		RING-H2_Vps18	845..944	CDD:438350	40/101 (40%)