Protein Alignment HTT and Htt

DIOPT Version :8

• Sequence 1: NP_002102.4
• Gene: HTT / 3064
• HGNCID: 4851
• Length: 3144
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_077333.2
• Gene: Htt / 29424
• RGDID: 68337
• Length: 3120
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 3148
• Identity: 2847/3149 (90%)
• Similarity: 2966/3149 (94%)
• Gaps: 32/3149 (1%)

Human     1 MATLEKLMKAFESLKSFQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPP--PPPPPPPPPQLPQPPPQAQPL 63
            |||||||||||||||||              ||||||||.||  ||||||||||.||||||.|
  Rat     1 MATLEKLMKAFESLKSF--------------QQQQQQQQPPPQAPPPPPPPPPQPPQPPPQGQ-- 49

Human    64 LPQPQPPPPPPPPPPGPAVAEEPLHRPKKELSATKKDRVNHCLTICENIVAQSVRNSPEFQKLLG 128
                   ||||||.|||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||
  Rat    50 -------PPPPPPLPGP--AEEPLHRPKKELSATKKDRVNHCLTICENIVAQSLRNSPEFQKLLG 105

Human   129 IAMELFLLCSDDAESDVRMVADECLNKVIKALMDSNLPRLQLELYKEIKKNGAPRSLRAALWRFA 193
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   106 IAMELFLLCSDDAESDVRMVADECLNKVIKALMDSNLPRLQLELYKEIKKNGAPRSLRAALWRFA 170

Human   194 ELAHLVRPQKCRPYLVNLLPCLTRTSKRPEESVQETLAAAVPKIMASFGNFANDNEIKVLLKAFI 258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   171 ELAHLVRPQKCRPYLVNLLPCLTRTSKRPEESVQETLAAAVPKIMASFGNFANDNEIKVLLKAFI 235

Human   259 ANLKSSSPTIRRTAAGSAVSICQHSRRTQYFYSWLLNVLLGLLVPVEDEHSTLLILGVLLTLRYL 323
            |||||||||:||||||||||||||||||||||:||||||||||||:|::|.||||||||||||.|
  Rat   236 ANLKSSSPTVRRTAAGSAVSICQHSRRTQYFYNWLLNVLLGLLVPMEEDHPTLLILGVLLTLRCL 300

Human   324 VPLLQQQVKDTSLKGSFGVTRKEMEVSPSAEQLVQVYELTLHHTQHQDHNVVTGALELLQQLFRT 388
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   301 VPLLQQQVKDTSLKGSFGVTRKEMEVSPSAEQLVQVYELTLHHTQHQDHNVVTGALELLQQLFRT 365

Human   389 PPPELLQTLTAVGGIGQLTAAKEESGGRSRSGSIVELIAGGGSSCSPVLSRKQKGKVLLGEEEAL 453
            |||||||.||..||:||||..:||:|||.||||||||:|||||||||||||||||||||||||||
  Rat   366 PPPELLQALTTPGGLGQLTLVREEAGGRGRSGSIVELLAGGGSSCSPVLSRKQKGKVLLGEEEAL 430

Human   454 EDDSESRSDVSSSALTASVKDEISGELAA-SSGVSTPGSAGHDIITEQPRSQHTLQADSVDLASC 517
            ||||||||||||||..||||.||.||||| |||||||||.||||||||||||||||||||||:.|
  Rat   431 EDDSESRSDVSSSAFAASVKSEIGGELAASSSGVSTPGSVGHDIITEQPRSQHTLQADSVDLSGC 495

Human   518 DLTSSATDGDEEDILSHSSSQVSAVPSDPAMDLNDGTQASSPISDSSQTTTEGPDSAVTPSDSSE 582
            ||||:||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   496 DLTSAATDGDEEDILSHSSSQFSAVPSDPAMDLNDGTQASSPISDSSQTTTEGPDSAVTPSDSSE 560

Human   583 IVLDGTDNQYLGLQIGQPQDED-EEATGILPDEASEAFRNSSMALQQAHLLKNMSHCRQPSDSSV 646
            |||||.|:||||:||||||:|| |||.|:|..|.|:.|||||:||||||||:.|.|.||||||||
  Rat   561 IVLDGADSQYLGVQIGQPQEEDEEEAAGVLSGEVSDVFRNSSLALQQAHLLERMGHSRQPSDSSV 625

Human   647 DKFVLRDEATEPGDQENKPCRIKGDIGQSTDDDSAPLVHCVRLLSASFLLTGGKNVLVPDRDVRV 711
            ||||.:||..|.||.|:|||||||||||..||||||||||||||||||||||.|..|||||||||
  Rat   626 DKFVSKDEVAEAGDPESKPCRIKGDIGQPNDDDSAPLVHCVRLLSASFLLTGEKKALVPDRDVRV 690

Human   712 SVKALALSCVGAAVALHPESFFSKLYKVPLDTTEYPEEQYVSDILNYIDHGDPQVRGATAILCGT 776
            |||||||||:||||||||||||||||||||.|.|..|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   691 SVKALALSCIGAAVALHPESFFSKLYKVPLSTMESTEEQYVSDILNYIDHGDPQVRGATAILCGT 755

Human   777 LICSILSRSRFHVGDWMGTIRTLTGNTFSLADCIPLLRKTLKDESSVTCKLACTAVRNCVMSLCS 841
            |:.|||||||..||||:||||.||||||||.||||||:|||||||||||||||||||:||:||||
  Rat   756 LVYSILSRSRLRVGDWLGTIRALTGNTFSLVDCIPLLQKTLKDESSVTCKLACTAVRHCVLSLCS 820

Human   842 SSYSELGLQLIIDVLTLRNSSYWLVRTELLETLAEIDFRLVSFLEAKAENLHRGAHHYTGLLKLQ 906
            ||||:|||||:||:|.|:|||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||.||||
  Rat   821 SSYSDLGLQLLIDMLPLKNSSYWLVRTELLETLAEIDFRLVSFLEAKAESLHRGAHHYTGFLKLQ 885

Human   907 ERVLNNVVIHLLGDEDPRVRHVAAASLIRLVPKLFYKCDQGQADPVVAVARDQSSVYLKLLMHET 971
            |||||||||:||||||||||||||.:|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   886 ERVLNNVVIYLLGDEDPRVRHVAATTLTRLVPKLFYKCDQGQADPVVAVARDQSSVYLKLLMHET 950

Human   972 QPPSHFSVSTITRIYRGYNLLPSITDVTMENNLSRVIAAVSHELITSTTRALTFGCCEALCLLST 1036
            ||||||||||||||||||:||||:||||||||||||:||||||||||||||||||||||||:||.
  Rat   951 QPPSHFSVSTITRIYRGYSLLPSVTDVTMENNLSRVVAAVSHELITSTTRALTFGCCEALCVLSA 1015

Human  1037 AFPVCIWSLGWHCGVPPLSASDESRKSCTVGMATMILTLLSSAWFPLDLSAHQDALILAGNLLAA 1101
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1016 AFPVCTWSLGWHCGVPPLSASDESRKSCTVGMASMILTLLSSAWFPLDLSAHQDALILAGNLLAA 1080

Human  1102 SAPKSLRSSWASEEEANPAATKQEEVWPALGDRALVPMVEQLFSHLLKVINICAHVLDDVAPGPA 1166
            |||||||||||||||.:.|||:|||:|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
  Rat  1081 SAPKSLRSSWASEEEGSSAATRQEEIWPALGDRTLVPMVEQLFSHLLKVINICAHVLDDVTPGPA 1145

Human  1167 IKAALPSLTNPPSLSPIRRKGKEKEPGEQASVPLSPKKGSEASAASRQSDTSGPVTTSKSSSLGS 1231
            |||||||||||||||||||||||||||||.|.|:|||||.|||.||||||||||||.||||||||
  Rat  1146 IKAALPSLTNPPSLSPIRRKGKEKEPGEQTSTPMSPKKGGEASTASRQSDTSGPVTASKSSSLGS 1210

Human  1232 FYHLPSYLKLHDVLKATHANYKVTLDLQNSTEKFGGFLRSALDVLSQILELATLQDIGKCVEEIL 1296
            ||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
  Rat  1211 FYHLPSYLRLHDVLKATHANYKVTLDLQNSTEKFGGFLRSALDVLSQILELATLQDIGKCVEEVL 1275

Human  1297 GYLKSCFSREPMMATVCVQQLLKTLFGTNLASQFDGLSSNPSKSQGRAQRLGSSSVRPGLYHYCF 1361
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
  Rat  1276 GYLKSCFSREPMMATVCVQQLLKTLFGTNLASQFDGLSSNPSKSQCRAQRLGSSSVRPGLYHYCF 1340

Human  1362 MAPYTHFTQALADASLRNMVQAEQENDTSGWFDVLQKVSTQLKTNLTSVTKNRADKNAIHNHIRL 1426
            ||||||||||||||||||||||:||:|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
  Rat  1341 MAPYTHFTQALADASLRNMVQADQEHDASGWFDVLQKVSAQLKTNLTSVTKNRADKNAIHNHIRL 1405

Human  1427 FEPLVIKALKQYTTTTCVQLQKQVLDLLAQLVQLRVNYCLLDSDQVFIGFVLKQFEYIEVGQFRE 1491
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1406 FEPLVIKALKQYTTTTSVQLQKQVLDLLAQLVQLRVNYCLLDSDQVFIGFVLKQFEYIEVGQFRE 1470

Human  1492 SEAIIPNIFFFLVLLSYERYHSKQIIGIPKIIQLCDGIMASGRKAVTHAIPALQPIVHDLFVLRG 1556
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1471 SEAIIPNIFFFLVLLSYERYHSKQIIGIPKIIQLCDGIMASGRKAVTHAIPALQPIVHDLFVLRG 1535

Human  1557 TNKADAGKELETQKEVVVSMLLRLIQYHQVLEMFILVLQQCHKENEDKWKRLSRQIADIILPMLA 1621
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||
  Rat  1536 TNKADAGKELETQKEVVVSMLLRLIQYHQVLEMFILVLQQCHKENEDKWKRLSRQVADIILPMLA 1600

Human  1622 KQQMHIDSHEALGVLNTLFEILAPSSLRPVDMLLRSMFVTPNTMASVSTVQLWISGILAILRVLI 1686
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||:|||||||||||||||||||||||
  Rat  1601 KQQMHIDSHEALGVLNTLFEILAPSSLRPVDMLLRSMFITPSTMASVSTVQLWISGILAILRVLI 1665

Human  1687 SQSTEDIVLSRIQELSFSPYLISCTVINRLRDGDSTSTLEEHSEGKQIKNLPEETFSRFLLQLVG 1751
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||..||.|.|||||:|||||:|||||||||||
  Rat  1666 SQSTEDIVLSRIQELSFSPYLISCPVINRLRDGDSNPTLGERSEGKQVKNLPEDTFSRFLLQLVG 1730

Human  1752 ILLEDIVTKQLKVEMSEQQHTFYCQELGTLLMCLIHIFKSGMFRRITAAATRLFRSDGCGGSFYT 1816
            |||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||
  Rat  1731 ILLEDIVTKQLKVDMSEQQHTFYCQELGTLLMCLIHIFKSGMFRRITAAATRLFTSDGCEGSFYT 1795

Human  1817 LDSLNLRARSMITTHPALVLLWCQILLLVNHTDYRWWAEVQQTPKRHSLSSTKLLSPQMSGEEED 1881
            |||||.|.|:|:.|||||||||||||||:||||:||||||||||||||||.||.|:||:|. |||
  Rat  1796 LDSLNARVRAMVPTHPALVLLWCQILLLINHTDHRWWAEVQQTPKRHSLSCTKSLNPQISA-EED 1859

Human  1882 SDLAAKLGMCNREIVRRGALILFCDYVCQNLHDSEHLTWLIVNHIQDLISLSHEPPVQDFISAVH 1946
            |..||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
  Rat  1860 SGSAAQLGMCNREIVRRGALILFCDYVCQNLHDSEHLTWLIVNHIQDLISLSHEPPVQDFISAIH 1924

Human  1947 RNSAASGLFIQAIQSRCENLSTPTMLKKTLQCLEGIHLSQSGAVLTLYVDRLLCTPFRVLARMVD 2011
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||
  Rat  1925 RNSAASGLFIQAIQSRCENLSTPTTLKKTLQCLEGIHLSQSGAVLTLYVDRLLGTPFRALARMVD 1989

Human  2012 ILACRRVEMLLAANLQSSMAQLPMEELNRIQEYLQSSGLAQRHQRLYSLLDRFRLSTMQDSLSPS 2076
            .||||||||||||||||||||||.||||||||:||::||||||||||||||||||||:||||||.
  Rat  1990 TLACRRVEMLLAANLQSSMAQLPEEELNRIQEHLQNTGLAQRHQRLYSLLDRFRLSTVQDSLSPL 2054

Human  2077 PPVSSHPLDGDGHVSLETVSPDKDWYVHLVKSQCWTRSDSALLEGAELVNRIPAEDMNAFMMNSE 2141
            |||:|||||||||.|||||:||||||:.||:||||||||||||||||||||||||||:.|||:||
  Rat  2055 PPVTSHPLDGDGHTSLETVNPDKDWYLQLVRSQCWTRSDSALLEGAELVNRIPAEDMSDFMMSSE 2119

Human  2142 FNLSLLAPCLSLGMSEISGGQKSALFEAAREVTLARVSGTVQQLPAVHHVFQPELPAEPAAYWSK 2206
            |||||||||||||||||:.||||.||||||.|||.||:..||||||||.||||.||.||.|||||
  Rat  2120 FNLSLLAPCLSLGMSEIANGQKSPLFEAARRVTLDRVTNVVQQLPAVHQVFQPFLPTEPTAYWSK 2184

Human  2207 LNDLFGDAALYQSLPTLARALAQYLVVVSKLPSHLHLPPEKEKDIVKFVVATLEALSWHLIHEQI 2271
            |||||||...||||.||||||||||||:||:|:.||||||||...|||||.||||||||||||||
  Rat  2185 LNDLFGDTTSYQSLTTLARALAQYLVVLSKVPAPLHLPPEKEGHTVKFVVMTLEALSWHLIHEQI 2249

Human  2272 PLSLDLQAGLDCCCLALQLPGLWSVVSSTEFVTHACSLIYCVHFILEAVAVQPGEQLLSPERRTN 2336
            ||||||||||||||||||:||||.|:||.|:|||.||||:||.|||||:|||||:|||.||.|::
  Rat  2250 PLSLDLQAGLDCCCLALQVPGLWGVLSSPEYVTHTCSLIHCVRFILEAIAVQPGDQLLGPESRSH 2314

Human  2337 TPKAISEEEEEVDPNTQNPKYITAACEMVAEMVESLQSVLALGHKRNSGVPAFLTPLLRNIIISL 2401
            ||:|:  .:||||.:.||..:||:||||||:|||||||||||||||||.:|:|||.:|:||::||
  Rat  2315 TPRAV--RKEEVDSDIQNLSHITSACEMVADMVESLQSVLALGHKRNSTLPSFLTAVLKNIVVSL 2377

Human  2402 ARLPLVNSYTRVPPLVWKLGWSPKPGGDFGTAFPEIPVEFLQEKEVFKEFIYRINTLGWTSRTQF 2466
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
  Rat  2378 ARLPLVNSYTRVPPLVWKLGWSPKPGGDFGTVFPEIPVEFLQEKEVLKEFIYRINTLGWTSRTQF 2442

Human  2467 EETWATLLGVLVTQPLVMEQEESPPEEDTERTQINVLAVQAITSLVLSAMTVPVAGNPAVSCLEQ 2531
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||.||||||||||||||
  Rat  2443 EETWATLLGVLVTQPLVMEQEESPPEEDTERTQIHVLAVQAITSLVLSAMAVPVAGNPAVSCLEQ 2507

Human  2532 QPRNKPLKALDTRFGRKLSIIRGIVEQEIQAMVSKRENIATHHLYQAWDPVPSLSPATTGALISH 2596
            |||||||||||||||||||:||||||||||.|||:|||.||||.:|||||||||.||||||||||
  Rat  2508 QPRNKPLKALDTRFGRKLSMIRGIVEQEIQEMVSQRENTATHHSHQAWDPVPSLLPATTGALISH 2572

Human  2597 EKLLLQINPERELGSMSYKLGQVSIHSVWLGNSITPLREEEWDEEEEEEADAPAPSSPPTSPVNS 2661
            :|||||||.|||.|:|||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||:|||.|||||
  Rat  2573 DKLLLQINSEREPGNMSYKLGQVSIHSVWLGNNITPLREEEWDEEEEEEADAPAPTSPPVSPVNS 2637

Human  2662 RKHRAGVDIHSCSQFLLELYSRWILPSSSARRTPAILISEVVRSLLVVSDLFTERNQFELMYVTL 2726
            ||||||||||||||||||||||||||||:|||||.||||||||||||||||||||.|||:||:||
  Rat  2638 RKHRAGVDIHSCSQFLLELYSRWILPSSAARRTPVILISEVVRSLLVVSDLFTERTQFEMMYLTL 2702

Human  2727 TELRRVHPSEDEILAQYLVPATCKAAAVLGMDKAVAEPVSRLLESTLRSSHLPSRVGALHGVLYV 2791
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||:||||::|||||:|||
  Rat  2703 TELRRVHPSEDEILIQYLVPATCKAAAVLGMDKTVAEPVSRLLESTLRSTHLPSQIGALHGILYV 2767

Human  2792 LECDLLDDTAKQLIPVISDYLLSNLKGIAHCVNIHSQQHVLVMCATAFYLIENYPLDVGPEFSAS 2856
            |||||||||.||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||
  Rat  2768 LECDLLDDTVKQLIPVVSDYLLSNLKGIAHCVNIHSQQHVLVMCATAFYLMENYPLDVGPEFSAS 2832

Human  2857 IIQMCGVMLSGSEESTPSIIYHCALRGLERLLLSEQLSRLDAESLVKLSVDRVNVHSPHRAMAAL 2921
            :||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||
  Rat  2833 VIQMCGVMLSGSEESTPSIIYHCALRGLERLLLSEQLSRLDTESLVKLSVDRVNVQSPHRAMAAL 2897

Human  2922 GLMLTCMYTGKEKVSPGRTSDPNPAAPDSESVIVAMERVSVLFDRIRKGFPCEARVVARILPQFL 2986
            |||||||||||||.||||.|||:||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2898 GLMLTCMYTGKEKASPGRASDPSPATPDSESVIVAMERVSVLFDRIRKGFPCEARVVARILPQFL 2962

Human  2987 DDFFPPQDIMNKVIGEFLSNQQPYPQFMATVVYKVFQTLHSTGQSSMVRDWVMLSLSNFTQRAPV 3051
            ||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||
  Rat  2963 DDFFPPQDVMNKVIGEFLSNQQPYPQFMATVVYKVFQTLHSAGQSSMVRDWVMLSLSNFTQRTPV 3027

Human  3052 AMATWSLSCFFVSASTSPWVAAILPHVISRMGKLEQVDVNLFCLVATDFYRHQIEEELDRRAFQS 3116
            |||.||||||.|||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
  Rat  3028 AMAMWSLSCFLVSASTSPWVSAILPHVISRMGKLEQVDVNLFCLVATDFYRHQIEEEFDRRAFQS 3092

Human  3117 VLEVVAAPGSPYHRLLTCLRNVHKVTTC 3144
            |.||||||||||||||.||:||||||.|
  Rat  3093 VFEVVAAPGSPYHRLLACLQNVHKVTAC 3120

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
HTT	NP_002102.4	Sufficient for interaction with TPR. {ECO:0000269|PubMed:15654337}	3..13		10/10 (100%)
		CAG repeat region	18..40		8/22 (36%)
		HEAT repeat	94..119	CDD:293787	24/25 (96%)
		HEAT repeat	133..155	CDD:293787	22/22 (100%)
		HEAT repeat	169..197	CDD:293787	28/28 (100%)
		HEAT 1	206..243		37/37 (100%)
		HEAT repeat	210..240	CDD:293787	30/30 (100%)
		HEAT 2	248..285		36/37 (97%)
		HEAT repeat	249..278	CDD:293787	28/29 (97%)
		HEAT 3	318..362		43/44 (98%)
		Interaction with ZDHHC17. {ECO:0000269|PubMed:28757145}	493..504		11/11 (100%)
		HEAT 4	804..841		33/37 (89%)
		HEAT 5	904..942		34/38 (89%)
		DUF3652	1527..1553	CDD:289166	26/26 (100%)
		Nuclear export signal. {ECO:0000250}	2397..2406		7/9 (78%)
Htt	NP_077333.2	HEAT repeat	71..96	CDD:293787	24/25 (96%)
		HEAT repeat	110..132	CDD:293787	22/22 (100%)
		HEAT repeat	146..174	CDD:293787	28/28 (100%)
		HEAT repeat	187..217	CDD:293787	30/30 (100%)
		HEAT repeat	226..255	CDD:293787	28/29 (97%)
		DUF3652	1506..1532	CDD:289166	26/26 (100%)

Information from Original Tools

Tool	Simple Score	Weighted Score	Original Tool Information
			BLAST Result	Score	Score Type	Cluster ID
Compara	1	0.930				C353247264
eggNOG	1	0.900				E1_28IQ9
HGNC	1	1.500
Hieranoid	1	1.000
Homologene	1	1.000				H1593
Inparanoid	1	1.050	5563	1.000	Inparanoid score	I73
OMA	1	1.010
OrthoDB	1	1.010				D1408at9347
OrthoFinder	1	1.000				FOG0005433
OrthoInspector	1	1.000				T2470900
orthoMCL	0	0.000	Not matched by this tool.
Panther	1	1.100			LDO	PTHR10170
Phylome	1	0.910		0.667	Consistency score
TreeFam	1	0.960
	13	13.370