DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment kl-5 and Dnah2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001015499.4 Gene:kl-5 / 26067054 FlyBaseID:FBgn0267433 Length:4559 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001094146.1 Gene:Dnah2 / 303242 RGDID:1565087 Length:4508 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4756 Identity:1483/4756 - (31%)
Similarity:2434/4756 - (51%) Gaps:510/4756 - (10%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MADEKEKKEP---VDNRPEFFWNYLTKTMRLKL--DKWTKMITTNEFRDVIIE-FLNNPNKKRII 59
            :.:.:|.|||   .|.:|.|    |::.|...|  ..||..      .|.::| |..:|:...:.
  Rat    60 LEEPEEPKEPDLSTDVKPIF----LSRAMLTGLADSTWTAE------HDAVLEHFAQDPSVPVLT 114

  Fly    60 FTINSGGQLYPSYSFPVRPRYKVAYFIRYLTPLHLTDENMLNSLLIGDLLPNPLANLSILCDEVF 124
            ..::....|......||:.:.::.||||. .|:.:|.||...::..|.:....:..|..|...|:
  Rat   115 IFVDPVFGLKLELGMPVQTQNQIVYFIRQ-APVPITPENFEETVQYGTVRGAYIPALLRLLSGVY 178

  Fly   125 FP--LLNNTVNQVGWTNVIANDMKTESQEMRNGIAQMKGLVINRTIFPLP---ICMDEVMQAAPA 184
            .|  .:|.:     |...|.|...:........:...:..:...|:..:|   |.||      ||
  Rat   179 VPQIFMNKS-----WPESIRNHFVSHLHRFLASLTDTRYKLEGHTVLYIPAEAITMD------PA 232

  Fly   185 IAMGDISVVNPLMKHSLEFMVVKWLDSVEDLVNIKAGEKIYSKENF-PLPEAIFSFWESRLENLE 248
            :.:.|..:|     ..||..::.|...::::  :.|.|.:.:.||. ||.|  ..||.:|..:|.
  Rat   233 VVIKDKELV-----QRLETSMIHWTRQIKEV--LSAQESVDTGENLGPLEE--IEFWNNRCMDLS 288

  Fly   249 NLAEQLGDRRIKTIGFVLEKIQSIFEHSYRRIVELVLESLAEARDITKCLSPLK---RKMDKFET 310
            .:::||..:.:|.|..:|...:|.:...:|::.:.:.:...:|:.....||.|:   :::...:.
  Rat   289 GISKQLVKQGVKHIESILLLAKSSYLAPFRKLAQQIQDGSRQAQSNLTFLSILREPYQELAFMKP 353

  Fly   311 NDMDENRSDIRPLMLT-IGLVWGHSRYFHTLNNMTLFFNLFHNSLIDCVNRTVEPDSIFQGDVDE 374
            .|:    ||..|.::: |.::|.:|.:::|...:|..|....|.:|.....:|..|.||:|.|..
  Rat   354 KDI----SDKLPKLISLIRIIWVNSPHYNTRERLTGLFRKMSNEIIRLCCHSVSLDRIFEGYVSS 414

  Fly   375 AYKKLD--INMQHL--EYYKLIYNECRNSLKKFKIGTTFNSQDWTWHQDEIFGRLDKFLVRLEEL 435
            :.:.|.  |:..|.  |:|          |:..::.|.|:::.|...|..||.::|.|:.|.::|
  Rat   415 SKEDLQGCISCCHAWKEHY----------LRAVQMHTQFSNRGWVLDQTSIFAQVDAFVQRCKDL 469

  Fly   436 KDLFNTVRDFQKLEKIVMG------GLKGRQITFALEKILEEYNSIYREWTNIQYNPIDPDAENS 494
            .::.:....|.:......|      |.:|.|||..|.:|.:.::...:....::...:  |.:|:
  Rat   470 IEVCDCQYHFARWLDGTQGPLPCFFGAQGPQITRNLLEIEDIFHKNLQTLRAVRGGIL--DVKNT 532

  Fly   495 LFQRDRLSFKA---KTDVM-ERMVSFQFEKGLEDTHDLLLAGSL--------LLRPIIKKHVEPL 547
            .:..|...|:|   ..:|| :.:::..||...:..|.:||..:.        ::|...||.|:..
  Rat   533 SWHEDYNKFRAGIKDLEVMTQNLITSAFELVRDVEHGVLLLDTFHRLANREAIMRTYEKKAVDLY 597

  Fly   548 MHVIVDDFEEEIMCVKKEFINFKNVFTALGLNELPTDDCFPKVSGAISFLKKLRHRI-------I 605
            |.     |..|:..|.:| :|.|..:         .:....:.||...:::.||.||       .
  Rat   598 ML-----FNSELALVNRE-LNKKWPY---------LEPYMAQYSGQAHWVRILRRRIDRVMNCLS 647

  Fly   606 GLH-------KEHELYEYPLFDNERGGYVSDIFNIMVQEIDDFTKMLLDKWTV----ECWQGIQQ 659
            |.|       .|..::.|               ..|||.||:..:....:||.    :|.:.:  
  Rat   648 GAHFLPHIGTGEETVHTY---------------QQMVQAIDELVRKTFQEWTATLDKDCIRRL-- 695

  Fly   660 DITLTLIEKDEANELRVNFTERLIFALKDIKVVRLLGCDVSVNLTKFFCREDELWQARVKLMRIA 724
            |:.|..|.:::|..|.|||.:.|:....:|.....|..:....:.....|.::|...|..|:.:|
  Rat   696 DMPLLRISQEKAGMLDVNFDKTLLILFVEIDYWERLLFETPHYVMNVADRAEDLRILRENLLLVA 760

  Fly   725 EWYNDTFERAHPTEKRLIAAEMILIEEQMKPLLDFIKW-----NAFSQRFI----VMIFKMVKYL 780
            ..||.......|.|:.|....:..:::::.|.|..:.|     :||   ||    :...|:...:
  Rat   761 RDYNRIIAMLSPDEQALFKERIRFLDKKIHPGLKKLNWALKGASAF---FITECRIHASKVQMIV 822

  Fly   781 HDRLVAAQENLEAIKESIRSWGKVPLFQRKDLNPALLLHTDPREPILSIRAANAADTQRLIDLLM 845
            :|           .|.|..:.|    ::.::::..||:|...::....:....|....|:.....
  Rat   823 ND-----------FKASTLTIG----WKAQEMSELLLVHITGKQVYRDLEFEEAQREHRMAVQQK 872

  Fly   846 YVNLKLFFDIPRRYSLPPGEHGEEDEESDGIWPPIISLSVMTSVKFKKKREVIDEEDDLEEFEEE 910
            .|||                                            .::||:           
  Rat   873 LVNL--------------------------------------------HQDVIN----------- 882

  Fly   911 QSESEEEIITPFHRYELLKGLSQEERALFREYEIYVDEIIAENLVDSVITSSTYLRMEV--DNRY 973
                   |:|  :.:|:.|....|.:..:..|.|.:|.::.:.|..:|..|...|...:  |.:.
  Rat   883 -------ILT--NSFEVFKNDGPEIQQQWLLYTIRLDHMMEDALRLNVKWSLLELSKAINGDGKT 938

  Fly   974 ENNTPIFEIFMELQEPNVVYFRNLDT---SSKTGFAFFIETILDDMNNMMSLLKRVAQDPTEVTN 1035
            ..| |:|.:.:.||.         |.   .::..|:..::|:...:|::.|.|         .:.
  Rat   939 SPN-PLFRVLVILQS---------DVQGGGAQVEFSPTLQTLASVVNDIGSHL---------FST 984

  Fly  1036 MNPYSFYDELQDKSELDK-------QRVEIMNKIKLALQAVRVHGKGFMEFSSLWIWDKSTYLSE 1093
            ::.:....::..|.::.:       :|.|.:.||:..:.:...:....:: :.|..||....:.|
  Rat   985 ISVFRHLPDILTKRKMTREPIHVVVERDEDIRKIQAQISSGMTNNASLLQ-NYLKTWDMYREIWE 1048

  Fly  1094 VKKFGRNLTLDERDAEADLEGSSGVKLLGLEYPPLSVYKEQLDKFIELQDQIRTWETYEDFFVFL 1158
            :.|                  .|.::......||:|.:...:.::.|:.:.::..||..: ..|:
  Rat  1049 INK------------------DSFIRRYQRLNPPVSSFDADIARYTEVANNVQKEETVLN-IQFV 1094

  Fly  1159 RLNMTGFKVAVLSQVGQWISLFKLDLINRVKNSLKELQDFV-DEANIVLKIELQKDDFEGLVKIL 1222
            .|:.:..|.:::....:|.:.|...|.......|.:|..:: |.|.   ||.......|.|...|
  Rat  1095 MLDCSHLKFSLVQHCNEWQNKFTTLLKEMAAGRLMDLHTYLKDNAE---KISRPPQTLEELGVSL 1156

  Fly  1223 SVLNQINEKQCIYDSMFDPLKEIIDLLRQYNYEFKDTELAQINELPDAWMKVKRLAATTKQLIAP 1287
            .:::.:.......::...|:.|...:|.:|.....||.|..:..|...|:..:::...::|::..
  Rat  1157 QLMDTLQHDLPNLETQIPPIHEQFTILEKYEVPVPDTVLEMLESLNGEWLTFQQILLDSEQMLKK 1221

  Fly  1288 -IQSYQVDLIEKRILLCDNMANTYRKKFLSKKFFFVPCLSCYELIDESDLE-------------- 1337
             .:.::..||        :.|:.::||             .:.|:::.:|:              
  Rat  1222 HKEKFKTGLI--------HAADDFKKK-------------AHNLLEDFELKGPFTSNVGHTAALD 1265

  Fly  1338 --------LVALEERQRSLAESAVLFELQGPDPVKIELCRFDLKLVKIMWDFAITIQSTINDWKK 1394
                    |:|:.|.:.:|..:..:|:::.|....::....:|..::.:|:.....:.:.|.||.
  Rat  1266 QIAQVRAMLMAMREEESNLRSNLGIFKIEQPISKDLQNLEKELDALQQVWEITRDWEESWNQWKT 1330

  Fly  1395 TPWKKIDIENMDQECKKFGRELRGLDKAM--RTWEPFIFMEASLKNLMTSLRAVTELQNPAIRDR 1457
            ..:..:..|.|:.......|.|..|.|..  |.||......|.::....::..:::|:|||:|:|
  Rat  1331 GCFLTLQTEAMESMAHGLFRRLTRLAKEYKDRNWEVIETTRAKIEQFKRTMPLISDLRNPALRER 1395

  Fly  1458 HWIELMQTTKVKFSMD-DSTTLKDLIDLNLHEYEEEVKNIVDKSVKEMAMEKQLRDIATAWGTME 1521
            ||.::.:..:.:|..: :|.||:.::.|.:.::.|::..|...:.||:|:|..|::||..|.:.:
  Rat  1396 HWDQVKEEIQREFDQESESFTLEQIVKLGMDQHVEKIAEISASATKELAIEVGLQNIAKTWDSTQ 1460

  Fly  1522 FGTDI-------HDRTSIKLLKASEELIETLEDHQGQLQNMASSKYIAFFEHEVRLWQNRLSNAD 1579
            .  ||       |.|     |:.:||:.:.|||:|..|..|.:|:::..||.:|..|:..||...
  Rat  1461 L--DIVPYKDKGHHR-----LRGTEEVFQALEDNQVALSTMKASRFVKAFEKDVDHWERCLSLIL 1518

  Fly  1580 QIIGSWFEVQRKWQYLESIFIGSEDIRSQLPEDSRRFDYIDKEFKALLAQMNADRNVVRSTNRSG 1644
            ::|.....|||:|.|||:||:| ||||.|||.:|..||.::..:|.::.:||.|.|.:|||:..|
  Rat  1519 EVIEMVLTVQRQWMYLENIFLG-EDIRKQLPNESALFDQVNNNWKGIMDRMNKDNNALRSTHYPG 1582

  Fly  1645 SKLYEHLEILLKMLLLCE---KALNDYLETKRLSYPRFYFVSSADLLDILSNGNNPALVARHLTK 1706
            .     ||.|::|..:.|   |:|:.||||||..:|||||:|:.|||:||....||..|..||.|
  Rat  1583 L-----LETLIEMNTILEDIQKSLDMYLETKRHMFPRFYFLSNDDLLEILGQSRNPEAVQPHLKK 1642

  Fly  1707 LYDSMG--KLNLISGSKN---AAGMVAKELEEYVPFLENCDCSGKVEVWLNRITDKMRDTLRDQL 1766
            .:|::.  |:..:.||.:   |.||.:.: .||:.||......|.||.||..:...||.||||.|
  Rat  1643 CFDNIKLLKIQKVGGSSSKWEAVGMFSGD-GEYIDFLHPVLLEGAVESWLGDVERAMRMTLRDLL 1706

  Fly  1767 KR---SLTFYDHKPRHVWIFEWPAQPALVGTQIMWTTETNDAFAKVQQRYE-NALKDYNKKQITQ 1827
            :.   :|..:.:| |..|:.:|..|..:..:||.||.:........::|.: ..||...|||::.
  Rat  1707 RNCRMALKKFLNK-RDKWVKDWAGQMVITASQIQWTADVTKCLMTAKERSDKKILKVMKKKQVSI 1770

  Fly  1828 LNNLIILLLGDLTAAERQKIMTICTIDVHSRDVVGTIIAKKVEVQTAFQWQSQLRHRWDPKIDDC 1892
            ||.....:.|:||...|.||:.:.||::|:|||:..:....:....||.|.||||..|:..:|||
  Rat  1771 LNKYSEAIRGNLTKIMRLKIVALVTIEIHARDVLEKLYKGGLMDVNAFDWLSQLRFYWEKDVDDC 1835

  Fly  1893 FANICDAQFRYDYEYLGNTPRLVITPLTDRCYITLTQSLHLVMGGAPAGPAGTGKTETTKDLGRA 1957
            .....:.||:|.||||||:.||||||||||||:|||.:|||..||:|.||||||||||.||||:|
  Rat  1836 IIRQTNTQFQYGYEYLGNSGRLVITPLTDRCYMTLTTALHLHRGGSPKGPAGTGKTETVKDLGKA 1900

  Fly  1958 LGMMVYVFNCSEQMDYKSIGDIHKGLAQTGAWGCFDEFNRISVEVLSVVAVQVKCIQDAIKSKKQ 2022
            ||..|.|.||||.:||||:|.::.|||||||||||||||||::|||||||.|:..|..|:.:...
  Rat  1901 LGTYVIVVNCSEGLDYKSMGRMYSGLAQTGAWGCFDEFNRINIEVLSVVAQQILSILSALTANLT 1965

  Fly  2023 TFSFLGEHIALRTTVGVFITMNPGYAGRAELPENLKALYRPCAMVVPDFALISEIMLVAEGFQEA 2087
            .|.|.|..|.|..:.|:|||||||||||.|||||||:::||.||||||..||:||:|..|||...
  Rat  1966 RFYFEGFEINLVWSCGIFITMNPGYAGRTELPENLKSMFRPIAMVVPDSTLIAEIILFGEGFGNC 2030

  Fly  2088 RLLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGALRRDDRQRPEDQVLMRALRDFNIPK 2152
            ::||:|..|||:|..:.||:|||||:||||:.|:|..||..||......:::||:.::||.||.|
  Rat  2031 KILAKKVYTLYSLAVQQLSRQDHYDFGLRALTSLLRYAGKKRRLQPDLTDEEVLLLSMRDMNIAK 2095

  Fly  2153 IVTDDVPVFMGLIGDLFPALDVPRKRNPEFEAVIKRSALDLKLQPEDGFILKIVQLEELFAVRHS 2217
            :.:.|||:|..::.||||.:::|.....:....|::...::.||.....:.|::||.|....|||
  Rat  2096 LTSVDVPLFNAIVQDLFPNIELPVIDYGKLRDTIEQEIREMGLQITPFTLTKVLQLYETKNSRHS 2160

  Fly  2218 VFIIGFAGTGKSEVWKTLNKTYQNQKR--KPHYN-----DLNPKAVTNDELFGIVNPSTREWKDG 2275
            ..|:|..|:.|:..|:.|..:..:..|  :|::|     .|||||::..||:|..:.:|.||.||
  Rat  2161 TMIVGGTGSSKTTSWRILQASLTSLCRAGEPNFNIVKEFPLNPKALSLGELYGEYDLNTNEWTDG 2225

  Fly  2276 LFSILMRDQANLGGTGPKWIVLDGDIDPMWIESLNTVMDDNKVLTLASNERIALTKEMRLLFEIA 2340
            :.|.:||..........|||:.||.:|.:||||:|:||||||||||.:.||||:.:::.||||:.
  Rat  2226 ILSSVMRAACADEKPDEKWILFDGPVDTLWIESMNSVMDDNKVLTLINGERIAMPEQVSLLFEVE 2290

  Fly  2341 SLRTATPATVSRAGILYINPQDLGWTPFIQSWLGTRTNSSEVSMLNVLFDKYVPPLLDIFRTRLR 2405
            :|..|:||||||.|::|.:..||||||::||||..|. .:|:..|..:|:|::..:|...:....
  Rat  2291 NLAVASPATVSRCGMVYTDYVDLGWTPYVQSWLEKRP-KAEIEPLQRMFEKFINKILTFKKDNCN 2354

  Fly  2406 SITPISDIARLQMTCYLLDSMLTPQNVPNDCPKD------WYEIYFVFCIVWGFGSSLFQD--QI 2462
            .:.|:::.:.:...|.|...:.||:|..|  |.|      ..|:.|||.::|...:|:.:|  :.
  Rat  2355 ELVPVTEYSGIISLCKLYTVLATPENGVN--PADTENHAFMVEMTFVFSMIWSVCASVDEDGRKK 2417

  Fly  2463 IDWSNEFSKWFLNEYKAVKFPLSGTIFSFYIDHETKKFFPWTNLVPQ-FELDMDLPLQSNLVNTA 2526
            ||       .:|.|.:. .||...|::.:|::.:.:.:..:...:|: :....:.|....:|.|.
  Rat  2418 ID-------SYLREIEG-SFPNKDTVYEYYVNPKMRTWSSFEEQLPKSWRYPPNAPFYKIMVPTV 2474

  Fly  2527 ETTRLRFFMDTLIEADHPLMLIGPSGSGKTILMNAKLSALPSDKYSVTNVPFNFYTTSEMLQRIL 2591
            :|.|..:.:.||:...:|::|:||.|:|||.:..:.|.:|||.::||..|..:..|||..:|.|:
  Rat  2475 DTVRYNYLVSTLVANQNPVLLVGPVGTGKTSIAQSVLQSLPSSQWSVLVVNMSAQTTSNNVQSII 2539

  Fly  2592 EKPLEKKAGRNYGPIGNKRMIYFVDDMNMPEVDKYFTVQPHTLIRQFMDYHHWYDRQKMTLRDIH 2656
            |..:||:....|.|.|.|.||.|:||:|||..|.:.:..|..|||.::||..||||.|.|::.|.
  Rat  2540 ESRVEKRTKGVYVPFGGKSMITFMDDLNMPAKDMFGSQPPLELIRLWIDYGFWYDRVKQTIKHIR 2604

  Fly  2657 KCNIVACMNPSAGSFT-IDPRLQRHFCSFAVNPPSQDALFHILNSILSQHMDNPIQKFDKAVIKL 2720
            ...::|.|.|..|..| |.||||..|....:..|::..:..|..::::|    .:|.|::.| |.
  Rat  2605 DMFLMAAMGPPGGGRTVISPRLQSRFNIINMTFPTESQIIRIFGTMINQ----KLQDFEEEV-KP 2664

  Fly  2721 CENMVTTA-ITLHLKVVSSFLPTAIKFHYNFNLRDIANIFTGVLYSNSETCPNSNQMIRLWIHEC 2784
            ..|:||.| :.::..||..||||..|.||.||||||:.:|.|:|.:|.:.......:.|||||||
  Rat  2665 IGNVVTEATLDVYNTVVQRFLPTPAKIHYLFNLRDISKVFQGMLRANKDFHDTKASITRLWIHEC 2729

  Fly  2785 YRVYGDKLVDYTDINSFKKIVSDIVRKGIEGVNDDVVY------AQPLIYCHFAK------GLTD 2837
            :||:.|:|||.||:.:|..|:||.:     |...|:.:      .:|.|:..|.|      .|.|
  Rat  2730 FRVFSDRLVDTTDMEAFIGILSDKL-----GTFFDLTFHHLCPNKRPPIFGDFLKEPKVYEDLVD 2789

  Fly  2838 IKYMPISGWDRLKSLLDEAQDRYN--DYIGAMNLVLFDDAMSHVCRISRILESSRGYALLIGVGG 2900
            :..        ||:.::.|.:.||  ..:..|.||||.:|:.|:.||.|::...||..||:|:||
  Rat  2790 LSV--------LKTAMETALNEYNLSPSVVQMQLVLFREAIEHITRIVRVIGQPRGNMLLVGIGG 2846

  Fly  2901 SGKQSLTRLASFISSLDVFQIQLTKDYSVSDLKANIATLYMKAGVKTSACCFLMTDSEVAREQFL 2965
            ||:|||.||||.|...:.|||::||.|...:.:.:|..||.:|||:..|..||..|:::|.|.||
  Rat  2847 SGRQSLARLASSICEYNTFQIEVTKHYRKQEFRDDIKRLYRQAGVELQATSFLFVDTQIADESFL 2911

  Fly  2966 VLVNDLLASGDIHELFPDDEVENIVNAVRNEVKQLGIVDNRENCWKYFIEKVRSLLKVVLCFSPV 3030
            ..:|::|:||::..|:..||.|.|.|.:.::.:...|.::.::.:.|.||:||:.|.:|||.|||
  Rat  2912 EDINNILSSGEVPNLYKADEFEEIQNQIIDQARAEQISESSDSLFAYLIERVRNNLHIVLCLSPV 2976

  Fly  3031 GATLRVRSRKFPALVNCTTIDWFHEWPQQALESVSLRFLSEITVLPKE-LALPVSNFMAFVHKTV 3094
            |...|...|::|||||||||:||.|||::||..|:.::|..:.:..:| :...|:.....:|.:|
  Rat  2977 GDPFRNWIRQYPALVNCTTINWFSEWPREALLEVAEKYLVGVDLGTQENIHRKVAQIFVTMHWSV 3041

  Fly  3095 NDISKLYLANAKRYNYTTPKSFLELIALYSKLLHEKVKANLDRRLRLENGLIKLASCTKEVDALQ 3159
            ...|:..|...:|:||.||.::|||::.|.|||.||.:..||:..:|..||.|:....::|:.:.
  Rat  3042 AQYSQKMLLELRRHNYVTPTNYLELVSGYKKLLGEKRQELLDQANKLRTGLFKIDETREKVEVMS 3106

  Fly  3160 DVLKVQEVELKI---KNQEADNLIIVVGTENEKVSKERAFASKEEKNVRQIEE-DVTAKAKLCEE 3220
              |::::.:.|:   :.|..:.|:|:|..:.|...:::|..:..||..  ||| ...|.|...::
  Rat  3107 --LELEDAKKKVAEFQKQCEEYLVIIVQQKREADEQQKAVTANSEKIA--IEEVKCQALADNAQK 3167

  Fly  3221 DFLKAQPALIAAQEALNTLNKNNLTELKSFGSPPDAVVSVCGAVLVLFSSKGKIPKDRSWKACRA 3285
            |..:|.|||..|..||.:|||.::.|:||:|.||..|..|..||::|   :|..|   :|...:.
  Rat  3168 DLEEALPALEEAMRALESLNKKDIGEIKSYGRPPAQVEIVMQAVMIL---RGNEP---TWAEAKR 3226

  Fly  3286 FMGNVDKFLDNLINYDKKHIHPDVIKALQPYILDAEFSPEKILAKSSAAAGLCSWVININRFYDV 3350
            .:|. ..|:.:||.:||.:|...|:|.:..|....:|.|:.|...|.||..||.||..:..:..:
  Rat  3227 QLGE-QNFIKSLIYFDKDNISDKVLKKIGAYCAQPDFQPDIIGRVSLAAKSLCMWVRAMELYGRL 3290

  Fly  3351 YLVVEPKERALLESEKEVKDARDKLTALNLRLTELEEQLNALQMEYDEALAKKQKCQDEASKTAF 3415
            |.|||||...:..:..::::.:..|.....:|.|:.|:|..|:.:|||.||:|::.:.::.:...
  Rat  3291 YRVVEPKRIRMNAAIAQLQEKQAALAEAQEKLREVAEKLEMLKKQYDEKLAQKEELRKKSEEMEL 3355

  Fly  3416 TIDIANRLIGGLATEKIRWMESVKVLTFGIQQLPGDILIISCFISYVGCFTRAYRQELQEKLWMP 3480
            .::.|..|:.|||.||.||.|:|:.|...:..|.||.||.:.|:||:|.|...||.|:..::|:.
  Rat  3356 KLERAGMLVSGLAGEKARWEETVQGLEEDLGYLVGDCLIAAAFLSYMGPFLTNYRDEIVNQIWIK 3420

  Fly  3481 AFKNSQPPIPSTDGVDPFEMICDDAQIAEWNNQGLPSDRMSAENAAILVQSERYPLMIDPQLQGI 3545
            .....|.|......:|.|  :.:..::.:||.||||||..|.||..|:.:..|:.||||||.|.:
  Rat  3421 KIWELQVPCSPRFAIDNF--LTNPTKVRDWNIQGLPSDSFSTENGIIVTRGNRWALMIDPQAQAL 3483

  Fly  3546 KWVKTKYGT-GLVVLRLSQRNYLDQVERAVSNGSVLLIENIGENIDPVLNPLLGRQLIKKG--TV 3607
            ||:|...|. ||.::.|...:||..:|.|:..|..:|::|:.|.:||.|||:|.:.:.:.|  .:
  Rat  3484 KWIKNMEGNQGLKIIDLQMHDYLRVLEHAIQFGFPVLLQNVQEYLDPSLNPVLNKSVARIGGRML 3548

  Fly  3608 LKIGDREIDFNSRFRLILHTKLANPHYKPEMQAQTTLINFTVTRDGLEDQLLAEVVKVERPDLEA 3672
            ::|.|:|:::|..||..|.|||:||||.||..|:||::||.|...|||.|||..||:.|||:||.
  Rat  3549 MRIADKEVEYNPNFRFYLTTKLSNPHYSPETSAKTTIVNFAVKEQGLEAQLLGIVVRKERPELEE 3613

  Fly  3673 MRTRLTQQQNHFKITLKFLEDDLLARLSSAGDNVLEDVTLVMNLEKTKKTADEIEVKVAEAKITG 3737
            .:..|.......|..||.|||::|..|:.|..::|:||.||..|:.:|.||.|:..::..::.|.
  Rat  3614 QKDSLVINIAAGKRKLKELEDEILRLLNEATGSLLDDVQLVNTLQTSKITATEVTEQLETSETTE 3678

  Fly  3738 VQIDSAREAYRPAAERASIIYFILNDLFKINPIYQFSLKAFTVVFNNAMLKAMAAEKLKDRVENL 3802
            :.||.|||||||.|:|||:::|:|||:.:|:|:|||||.|:..:|..::.|:..:.||:||:|.|
  Rat  3679 INIDLAREAYRPCAQRASVLFFVLNDMGRIDPMYQFSLDAYISLFILSIDKSHRSNKLEDRIEYL 3743

  Fly  3803 IDSITFCSFVYTSRGLFEQDKLIFLTQLCIQILVNLGEVEPTELDFLLRFPYMPNQTSNF----- 3862
            .|..|:..:.||.|.|||:.||:|...:|.:||...|::...|.:|.||...:.::....     
  Rat  3744 NDYHTYAVYRYTCRTLFERHKLLFSFHMCAKILETSGKLNMDEYNFFLRGGVVLDREGQMDNPCT 3808

  Fly  3863 TWLTHVGWGGIRALNNQAVFKGLEKDIEGSHKRWKKFVDSESPENEKFPGEWKGK-SAIQRLCIM 3926
            :||....|..|..|:....|.||....|...:.|..:..:.:||....||||:.. :.:||:.|:
  Rat  3809 SWLADAYWDNITELDKLTNFHGLMNSFEQYPRDWHLWYTNSNPEKAMLPGEWENACNEMQRMLIV 3873

  Fly  3927 RCIRPDRMSYAMRSFIEEKLGSKYIDARSMEFSRTFEESSPETHIFFVLSPGVDPLKDVEKLGKS 3991
            |.:|.||:::.:.|||...|||::|:...:......|:|:|.:.:.|:|||||||...:.:|.:.
  Rat  3874 RSLRQDRVAFCVTSFIVSNLGSRFIEPPVLNMKLVMEDSTPRSPLVFILSPGVDPTSALLQLAEH 3938

  Fly  3992 LGFSFDHENFHSVSLGQGQEIVAENAIEIASQYGHWVILQNIHLVARWLPSLEKKMES-SLSNVH 4055
            .|.:   ..||::||||||..:|...:......||||.|.|.||...|:|:|:|.:|. .:.:.|
  Rat  3939 TGMA---HRFHALSLGQGQAPIAARLLREGVNQGHWVFLANCHLSLSWMPNLDKLVEQLQVEDPH 4000

  Fly  4056 TSYRLFLSAEPAGDPAAHILPQGILESAIKITNEPPTGMMANIHKALDNFSDETLEMCSKETEFK 4120
            .|:||:||:.|..|     .|..||:::||:|.|||.|:.||:.:.....::.....|||.|::|
  Rat  4001 PSFRLWLSSSPHPD-----FPISILQASIKMTTEPPKGLKANMTRLYQLMTEAQFTHCSKPTKYK 4060

  Fly  4121 AILFSLCYFHAVVAERRKFGPQGWNRSYPFNVGDLTISVYVLYNYLEANTRVPWEDLRYLFGEIM 4185
            .:||:||:||:::.||:||...|||..|.||..|..:|..:|..||:.....||:.|:||...:.
  Rat  4061 KLLFALCFFHSILLERKKFLQLGWNIIYGFNDSDFEVSENLLSLYLDEYEETPWDALKYLIAGVN 4125

  Fly  4186 YGGHITDDWDRRLCRTYLEEFMQPELIDGELEYCQ----------------GFPAPGILKYTGYH 4234
            ||||:||||||||..||:.::           :|.                ..|..|.|  ..|.
  Rat  4126 YGGHVTDDWDRRLLTTYINDY-----------FCDLSLTTPSYRLSVLDTYYIPKDGSL--ASYK 4177

  Fly  4235 NYIDDNLPS-ESPSLYGLHSNAEIGFLTTVSERLFRIVFELQPRMTGGSSGGETVSQEDIIKNII 4298
            .|| ..||| :.|..:|.|.||::....|.:..||..:..|||::|....||:  |:|:.:..:.
  Rat  4178 EYI-SLLPSMDPPEAFGQHPNADVASQITEARTLFETLLSLQPQITPTRIGGQ--SREEKVLELA 4239

  Fly  4299 EDILDKTPTPFN------ILELMGRVEDRSPYIIVAFQECERMNNLMTELKRSLNELDLGLKGEL 4357
            .|:..|.|...:      :|.|     |.||..:|..||.:|.|.||..:..||.:|:.|::|.:
  Rat  4240 ADVKQKIPEMIDYEGTRKLLAL-----DPSPLNVVLLQEIQRYNKLMKTILFSLTDLEKGIQGLI 4299

  Fly  4358 TISSVMEDLMVCLYMDQVPEQWTKLAYPSMLGLQSWFSDLMLRLRELEGWVADFRMPSSIWLAGF 4422
            .:|:.:|::..|::...||..|.|: |||...|.||..||.:|:.:.|.|......|...||:||
  Rat  4300 VMSTSLEEIFNCIFDAHVPPLWGKV-YPSQKPLASWTRDLAVRVEQFETWANRAHPPVLFWLSGF 4363

  Fly  4423 FNPQSLLTAIMQQTARKNEWPLDRMCLNCDVTKKWKEELTTAPREGAYINGLFMEGARWDMKMGT 4487
            ..|...|||::|..||:|...:|.:.....|:......|...|::|.::.||::|||.||.|...
  Rat  4364 TFPTGFLTAVLQSAARQNNISVDSLSWEFIVSTVDDSNLVYPPKDGVWVRGLYLEGAGWDRKNSC 4428

  Fly  4488 IADAFLKELFPAMPVLYIKAVTQDKQDIKNVYECPVYKIRLRG-----PTFVWTFNLKSRERAS- 4546
            :.:|...:|...||.::.:.....|:..|.:|.||.|....|.     .:||...:|:|....| 
  Rat  4429 LVEAEPMQLVCLMPTIHFRPAESRKKSAKGMYSCPCYYYPNRAGSADRASFVIGIDLRSGAMTSD 4493

  Fly  4547 KWTLAGVCLLL 4557
            .|...|..||:
  Rat  4494 HWIKRGTALLM 4504

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
kl-5NP_001015499.4 DHC_N1 198..763 CDD:462457 133/614 (22%)
DHC_N2 1365..1769 CDD:462462 141/424 (33%)
DYN1 1591..4206 CDD:227570 1035/2673 (39%)
AAA_6 1903..2229 CDD:463697 176/325 (54%)
MT 3140..3480 CDD:463699 109/343 (32%)
AAA_9 3508..3726 CDD:463702 96/220 (44%)
Dynein_C 4261..4557 CDD:465677 94/307 (31%)
Dnah2NP_001094146.1 DHC_N1 241..798 CDD:462457 133/613 (22%)
DHC_N2 1301..1709 CDD:462462 141/421 (33%)
DYN1 1368..4189 CDD:227570 1093/2899 (38%)
AAA_6 1846..2172 CDD:463697 176/325 (54%)
Dynein_C 4204..4504 CDD:465677 94/307 (31%)

Return to query results.
Submit another query.