DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment kl-5 and Dnah5

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001015499.4 Gene:kl-5 / 26067054 FlyBaseID:FBgn0267433 Length:4559 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001406498.1 Gene:Dnah5 / 294854 RGDID:1560828 Length:4621 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4866 Identity:1396/4866 - (28%)
Similarity:2373/4866 - (48%) Gaps:580/4866 - (11%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MADEKE-KKEPVDNRPEFFWNYLTKTMRLKLDKWTKMITTNEFRDVIIEFLNNPNKKRIIFTI-- 62
            :.:||| |:..:|.|.::.:..:...  |.|:|       .|..|.::|. |...:...:|.:  
  Rat    22 LKEEKEAKRARLDGRHDYLFAIVASC--LDLNK-------PEVEDALLEG-NQIERIDQLFAVGG 76

  Fly    63 -------------------NSGGQLYPSYSFPVRPRYKV------------AYFIRYLTPLHLTD 96
                               .|.|.:.|:.....:|:..|            .:|.|......:|.
  Rat    77 LRHLMFYYQDVEGAEAGQFGSSGGVNPASGKMKKPKVFVTEGKDVALMGACVFFTRADPSKAITA 141

  Fly    97 ENM-----LNSLLIGDLLPNPLAN-LSILCDEVFFPLLNNTVNQVGWTNVIA-NDMKTESQEMRN 154
            ||:     .|:|   |.....|.| :..|..::|.|.|.  .:..||..:.. .|..:..||..:
  Rat   142 ENIHREVSFNTL---DTADGGLLNSVRRLLSDIFIPALR--ASSHGWGELEGLQDASSIQQEFLS 201

  Fly   155 GIAQMKGLV----------INRTIFPLPIC----MDEVMQAAPAIAMGDISVVNPLMKHSLEFMV 205
            .:....|::          :|     |..|    :..:.:....:|:..    ||.....:|..:
  Rat   202 SLEGFVGILSGAQNSLKEKVN-----LQKCDIVELKSLKEPMDYLALAS----NPETVEKVECCM 257

  Fly   206 VKWLDSVEDLVNIKAGEKIYSKENFPL--------PEAIFSFWESRLENLENLAEQLGDRRIKTI 262
            ..|:..:|.::          .||..|        |.|....|:.||.....|.:||....:|.:
  Rat   258 RVWIKQMEQIL----------AENNQLRKEADDVGPRAELEHWKKRLSKFNYLLDQLKSPDVKAV 312

  Fly   263 GFVLEKIQSIFEHSYRRIVELVLESLAEARDITKCLSPLKRKMDKFETNDMDENRSDIRPLMLTI 327
            ..:|...:|.....:|.....|.::..||:|..|.|..|::..|...::|.......|..|:..|
  Rat   313 LAMLAAAKSKLLKVWRDADIRVTDAANEAKDNVKYLYTLEKCCDPLYSSDPVTMVDAIPTLINAI 377

  Fly   328 GLVWGHSRYFHTLNNMTLFFNLFHNSLIDCVNRTVEPD---SIFQGDVDEAYKKLDINMQHLEYY 389
            .:::..|.|::|...:|..|....|.:|......:..:   :|:....|...:|:...::..:.|
  Rat   378 KMIYSISHYYNTSERITSLFVKVTNQMISACKAHITNNGTATIWSQPQDIVMQKIAAAIKLKQGY 442

  Fly   390 KLIYNECRNSLKKFKIGTTFNSQDWTWHQDEIFGRLDKFLVRLEELKDLFNTVRDFQKLEKIVMG 454
            :..:.|.:..||:     ..:.:.:.:.:..|||:.:.|..||.::.|:|.|.:.:..|:...:.
  Rat   443 QCCFQETKQKLKQ-----NPSEKQFDFSEMYIFGKFETFHQRLAKIMDIFTTFKTYSVLQDSKIE 502

  Fly   455 GLKGRQITFALEKILEEYNSIYREWTNIQYNPIDPDAENSLFQRDRLSFKAKTD----VMERMVS 515
            |         ||.::.:|..:.......:||.:|....:  |.:|...|..:|:    .::|.:.
  Rat   503 G---------LEDMVTKYQDVVAGIKKKEYNFLDQRKMD--FDQDYDEFCKQTNELHSELQRFMD 556

  Fly   516 FQFEKGLEDTHDLLLAGSLLLRPIIKKH---------VEPLMHVIVDDFEEEIMCVKKEFINFKN 571
            ..||| ::.|...|        ..:||.         :|....::..:|..:|..:.|.:...| 
  Rat   557 TTFEK-IQSTRQAL--------STLKKFERLNIPNLGIEAKYQIVFQNFGTDIDMISKLYTKQK- 611

  Fly   572 VFTALGLNELPTDDCFPKVSGAISFLKKLRHRI---IGLHKEHELYEYPLFDNERGGYVSDIFNI 633
                   .:.|.....|.::|.|.:.::|.||:   :.|.::|..    :........|...:|.
  Rat   612 -------YDPPLARDQPPIAGKILWARQLFHRLEQPMQLFQQHPF----VLRTVEAKPVIRSYNR 665

  Fly   634 MVQEIDDFTKMLLDKW---TVECWQGIQQDITLTLIEKDEANELRVNFTERLIFALKDIKVVRLL 695
            :.:.:.:|..:....|   ..|...|::..:   |::.....:|.|||..:::...::.:.:..:
  Rat   666 IAKVLLEFEVLYHRAWLQQIEEIHVGLEASL---LVKAPGTGQLFVNFDPQILILFRETQCMSQM 727

  Fly   696 GCDVSVNLTKFFCREDELWQ--ARVKLMRIAEWYNDTFERAHPTEKRLIAAEMILIEEQMKPLLD 758
            |..||......|.:.|...:  :.:|:| ::| |.....:..|..::|:...:..::|.::|.|.
  Rat   728 GLPVSPFAAALFEKRDMYKKNFSDMKMM-LSE-YQRVKLKMPPAIEQLMLPHLARVDEALQPGLA 790

  Fly   759 FIKW----------NAFSQRFIVMIFKMVKYLHDRLVAAQE-NLEAIKESIRSWGKVPLFQ---- 808
            .:.|          |||.:      .|.::.|.||:....| .:.||.|.:.|.....|.|    
  Rat   791 VLTWTSLNIGTYLENAFEK------IKDLELLLDRINDLIEFRIHAILEEMSSVALCQLPQDDPL 849

  Fly   809 --------RKDL--NPALLLHTDPREPILSIRAANAADTQRLIDLLMYVNLKLFFDIP------- 856
                    .|||  |.|..||.   :..|...|.|     .||::|:.|::     :|       
  Rat   850 TCEEFLQMTKDLCVNGAQKLHF---KSSLVEEAVN-----ELINMLLDVDV-----LPEEASEKV 901

  Fly   857 RRYSLPPGEHGEEDEESDGIWPPII--------SLSVMTSVKFKKKREVIDEEDDLEEFEEEQSE 913
            |..:..|  :|:.....:|....:.        ||.:.|..:.||:.||::|..:|..:...|:.
  Rat   902 RHENASP--NGDTSGGGEGCAEALASSFNAGTSSLPLTTIARKKKEMEVLEEARELLSYFNHQNT 964

  Fly   914 SEEEIITPFHRYELLKGLSQEERALFREYEIYVDEIIAENLVDSVITSSTYLRMEVDNRYENNTP 978
            .           .|||.......|:.|  .|:...:|  |..||...|..         .:|:.|
  Rat   965 D-----------ALLKVTRNTLEAIRR--RIHFSHMI--NFRDSKGASKV---------KQNHLP 1005

  Fly   979 IFEIFMELQEPNVVYFRNLDTSSKT-------------GFAFFIETIL----------------D 1014
            ||...:.|..||:.....|:...:|             |...:...:|                :
  Rat  1006 IFRASVTLAIPNISMTPALEDIQQTLNKAVECIISVPKGVRQWSSELLSKRKMRERKMAAVQSNE 1070

  Fly  1015 DMNNMMSLLKRVAQDPTEVTNMN------PYSFYDELQDKSELDKQRVEIMNKIKLALQAVRVHG 1073
            |.::...:.:...|:..|:.::|      ..::|..:.|..|:.|....:...|....:.|....
  Rat  1071 DSDSDTEVEESELQETLELASVNLPIPVQTQNYYKNISDNKEIVKLVSVLSTVISSTKKEVITSM 1135

  Fly  1074 KGFMEFSSLWIWDKS----TYLSEVKKFGRNLTLDERDAEADLEGSSGVKLLGLEYPPLSVYKEQ 1134
            ..|..::.:|..:|.    |:::                               :.|.||.::.:
  Rat  1136 DRFKCYNHIWQKEKEDTIMTFIA-------------------------------QNPLLSEFESR 1169

  Fly  1135 LDKFIELQDQIRTWETYEDFFV---FLRLNMTGFKVAVLSQVGQWISLFKLDLINRVKNSLKELQ 1196
            :..|..|:.:|..    |..::   .:.|.....|.::.::...|:.:.......:.::.::.:.
  Rat  1170 ILYFQSLEQEINA----EPEYICVGSIALYTADLKFSLTAETKAWMMVLGRHCNRKYRSEMENIF 1230

  Fly  1197 DFVDEANIVLKIELQKDDFEGLVKILSVLNQINEKQCIYDSMFDPLKEIIDLLRQYNYEFKDTEL 1261
            ..|:|  ...|:.....|.:.:...::.|.:|.|:|...|....|::|...||.:|.......|:
  Rat  1231 TVVEE--FQKKLNRPIKDLDDIRIAMAALKEIREQQISTDFQVGPIEESYALLNKYGLLVAKEEM 1293

  Fly  1262 AQINELPDAWMKVKRLAATTKQLIAPIQSYQVDLIEKRILLCDNMANTYRKKFLSK-KFFFVPCL 1325
            .:::.|..||.|:...|:..:..:..:|.                  ::||:.:|. :.|...|.
  Rat  1294 DKVDTLRYAWEKLLARASDVQNELGALQP------------------SFRKELISTVEVFLQDCQ 1340

  Fly  1326 SCYELIDESDLELVALEERQRSLAESAVLFELQ-------------GPD---------PVKIELC 1368
            ..|...|.:...:..|:.::.|  :..::|:.|             |.:         |..:|: 
  Rat  1341 QFYLDYDLNGPMVSGLKPQEAS--DRLIIFQNQFDNIYRKYITYTGGEELFGLPVTQYPQLLEI- 1402

  Fly  1369 RFDLKLVKIMWDFAITIQSTINDWKKTPWKKIDIENMDQECKKFGRELRGLDKAMRTWEPFIFME 1433
            :..|.|::.::.....:..|:|.::.|.|.:::||.::.|..:|....|.|.:|::.|:.|:.|:
  Rat  1403 KKQLNLLQKIYSLYNNVIETVNSYQDTLWSEVNIEKINSELLEFQNRCRKLPRALKDWQAFLDMK 1467

  Fly  1434 ASLKNLMTSLRAVTELQNPAIRDRHWIELMQTTKVKFSMD---DSTTLKDLIDLNLHEYEEEVKN 1495
            .::.:.......:..:.:.|:.:|||..:  ||....|:|   ::..|::::::.|.:|:||:::
  Rat  1468 KTIDDFSECCPLLEYMASNAMVERHWQRI--TTLTGHSLDVGNETFKLRNIMEVPLLKYKEEIED 1530

  Fly  1496 IVDKSVKEMAMEKQLRDIATAWG--TMEFGTDIHDRTSIKLL---KASEELIETLEDHQGQLQNM 1555
            |...:|||..:|::|:.:...|.  |:.|.:   .:|..:||   .::.|:|.::||....|.::
  Rat  1531 ICISAVKERDIEQKLKQVINEWDNKTLTFSS---FKTRGELLLRGDSTSEVIASMEDSLMLLGSL 1592

  Fly  1556 ASSKYIAFFEHEVRLWQNRLSNADQIIGSWFEVQRKWQYLESIFIGSEDIRSQLPEDSRRFDYID 1620
            .|::|...|:.:::.|...|||:..||.:|..||..|.|||::|:|. ||..|||::::||..||
  Rat  1593 LSNRYNMPFKAQIQNWVQCLSNSTDIIENWMTVQNLWIYLEAVFVGG-DIAKQLPKEAKRFSNID 1656

  Fly  1621 KEFKALLAQMNADRNVVRST--NRSGSKLYEHLEILLKMLLLCEKALNDYLETKRLSYPRFYFVS 1683
            |.:..::.:.:...|||:..  :.:..:|..|   ||..|.:|:|:|..|||.|||.:|||:|||
  Rat  1657 KSWVKIMTRAHEIPNVVQCCVGDETMGQLLPH---LLDQLEICQKSLTGYLEKKRLCFPRFFFVS 1718

  Fly  1684 SADLLDILSNGNNPALVARHLTKLYDSMGKL--------NLISGSKNAAGMVAKELEEYVPFLEN 1740
            ...||:||...::...:..||..::|::..:        .::|.|......:  ||::.|.    
  Rat  1719 DPALLEILGQASDSHTIQAHLLNVFDNIKTVKFHDKIYDRILSISSREGETI--ELDKPVM---- 1777

  Fly  1741 CDCSGKVEVWLNRITDKMRDTLRDQLKRSLTFYDHKPRHV--WIFEWPAQPALVGTQIMWTTETN 1803
              ..|.||||||.:.::.:.:|...::::..........:  ::..:|||..|:|.|::||.::.
  Rat  1778 --AEGNVEVWLNSLLEESQSSLHLVIRQAAANIQESGFQLIEFLSSFPAQVGLLGIQMLWTRDSE 1840

  Fly  1804 DAF--AKVQQRYENALKDYNKKQITQLNNLIILLLGDLTAAERQKIMTICTIDVHSRDVVGTIIA 1866
            :|.  ||..::   .::..|:..:..||.||.:...||::.||.|..|:.||.||.||:...:..
  Rat  1841 EALQNAKFDKK---IMQKTNQSFLELLNMLIEMTTKDLSSMERVKYETLITIHVHQRDIFDDLCH 1902

  Fly  1867 KKVEVQTAFQWQSQLRHRWDPKIDDCFANICDAQFRYDYEYLGNTPRLVITPLTDRCYITLTQSL 1931
            ..|:..|.|:|..|.|..:....|....:|.|..|.|..|:||.|.|||||||||||||||.|:|
  Rat  1903 MHVKSPTDFEWLKQCRFYFKEDSDKTMIHITDVAFTYQNEFLGCTDRLVITPLTDRCYITLAQAL 1967

  Fly  1932 HLVMGGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALGMMVYVFNCSEQMDYKSIGDIHKGLAQTGAWGCFDEFN 1996
            .:.|||||||||||||||||||:||.||..|.|||||:|||::.:|.|.|||||:|:||||||||
  Rat  1968 GMSMGGAPAGPAGTGKTETTKDMGRCLGKYVVVFNCSDQMDFRGLGRIFKGLAQSGSWGCFDEFN 2032

  Fly  1997 RISVEVLSVVAVQVKCIQDAIKSKKQTFSFL-GEHIALRTTVGVFITMNPGYAGRAELPENLKAL 2060
            ||.:.||||.|.|:..|....|..|::|.|. |:::.:....|:|:|||||||||.|||||||..
  Rat  2033 RIDLPVLSVAAQQISIILTCKKEHKKSFIFTDGDNVTMNPEFGLFLTMNPGYAGRQELPENLKIN 2097

  Fly  2061 YRPCAMVVPDFALISEIMLVAEGFQEARLLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVA 2125
            :|..||:|||..:|..:.|.:.||.:..:|||||.|||.||:|.||||.|||:|||.|.|||...
  Rat  2098 FRSVAMMVPDRQIIIRVKLASCGFIDNVVLARKFFTLYQLCEEQLSKQVHYDFGLRNILSVLRTL 2162

  Fly  2126 GALRRDDRQRPEDQVLMRALRDFNIPKIVTDDVPVFMGLIGDLFPALDVPRKRNPEFEAVIKRSA 2190
            ||.:|......|..::||.|||.|:.|::.:|.|:|:.||.||||.:.:.:...||.|..|.:..
  Rat  2163 GAAKRASHTDTESTIVMRVLRDMNLSKLIDEDEPLFLSLIEDLFPNILLDKAGYPELETAISKQV 2227

  Fly  2191 LDLKLQPEDGFILKIVQLEELFAVRHSVFIIGFAGTGKSEVWKTLNKTYQNQKRKPHYN-DLNPK 2254
            .:..|.....:.||::||.|...|||.:..:|.:|:||:....||.|. .....|||.. .:|||
  Rat  2228 EEAGLINHPPWKLKVIQLFETQRVRHGMMTLGPSGSGKTSCIHTLMKA-MTDCGKPHREMRMNPK 2291

  Fly  2255 AVTNDELFGIVNPSTREWKDGLFSILMRDQANLGGTGPKWIVLDGDIDPMWIESLNTVMDDNKVL 2319
            |:|..::||.::.:|.:|.||:||.|.|...........||||||.:|.:|||:||:|:||||.|
  Rat  2292 AITAPQMFGRLDVATNDWTDGIFSTLWRKTLKAKKGEHIWIVLDGPVDAIWIENLNSVLDDNKTL 2356

  Fly  2320 TLASNERIALTKEMRLLFEIASLRTATPATVSRAGILYINPQDLGWTPFIQSWLGTRTNSSEVSM 2384
            |||:.:||.:....:::||..::..|:||||||.|:::::...|.|:|.::.:| .|.:..|..:
  Rat  2357 TLANGDRIPMAPNCKIVFEPHNIDNASPATVSRNGMVFMSSSVLDWSPILEGFL-KRRSPQEAEI 2420

  Fly  2385 LNVLFDKYVPPLLDIFRTRLRSI---TPISDIARLQMTCYLLDSMLTPQNVPNDCPKDWYEIYFV 2446
            |..|:.:..|   |::|..::::   ..|.:...:..:.::|..::..:....|...:.....||
  Rat  2421 LRQLYAETFP---DLYRFSIQNLEFKMEILEAFVITQSTHMLQGLIPTKEQAGDVDPEHLGRLFV 2482

  Fly  2447 FCIVWGFGSSLFQDQIIDWSNEFSKWFLN-EYKAVKFPL----SGTIFSFYIDHETKKFFPWTNL 2506
            |.::|..|:.|    .::.......|..: |...:..|.    ..|:|.:|:..: ..:..|:..
  Rat  2483 FAMMWSVGAVL----ELEGRRRMELWLRSREGPTLHLPQLTDPGDTMFDYYVAPD-GTWRHWSMC 2542

  Fly  2507 VPQFELDMDLPLQ--SNLVNTAETTRLRFFMDTLIEADHPLMLIGPSGSGKTILMNAKLSALPSD 2569
            :|::....|...:  |.||...:..|..|.:.|:.:....::|||..|:.||:::...:|....:
  Rat  2543 IPEYVYPPDTTPEYGSILVPNVDNVRTDFLIKTIAKQGKAVLLIGEQGTAKTVIIKGFMSKFDPE 2607

  Fly  2570 KYSVTNVPFNFYTTSEMLQRILEKPLEKKAGRNYGPIGNKRMIYFVDDMNMPEVDKYFTVQPHTL 2634
            .::|.|:.|:..||..|.||.:|..::|:.|..|||...|:|..|:||:|||.::::.....:.:
  Rat  2608 SHTVKNLNFSSATTPLMFQRTIESYVDKRMGTTYGPPAGKKMAVFIDDLNMPVINEWGDQVTNEI 2672

  Fly  2635 IRQFMDYHHWYDRQK----MTLRDIHKCNIVACMNPSAGSFTIDPRLQRHFCSFAVNPP---SQD 2692
            :||.|:.:.:|:.:|    .::.||.  .:.|.::|..|...|..||:|.|..|....|   |.|
  Rat  2673 VRQLMEQNGFYNLEKPGEFTSIVDIQ--FLAAMIHPGGGRNDIPQRLKRQFSIFNCTLPSDASMD 2735

  Fly  2693 ALFHILNS---ILSQHMDNPIQKFDKAVIKLCENMVTTAITLHLKVVS--SFLPTAIKFHYNFNL 2752
            .:|.::..   ...:.....:|   .|||||      ..:|..|..::  ..|||..||||.|||
  Rat  2736 KIFGVIGEGYYCAQRGFSKEVQ---DAVIKL------VPLTRRLWQMTKLKMLPTPAKFHYVFNL 2791

  Fly  2753 RDIANIFTGVLYSNSETCPNSNQMIRLWIHECYRVYGDKLVDYTDINSFKKIVSDIVRK--GIEG 2815
            ||::.|:.|:|...||...::::::|||.|||.||..|:....:|:..|.|.|..:|.:  |.| 
  Rat  2792 RDLSRIWQGMLNITSEVIKDTDELLRLWKHECKRVIADRFSMSSDVTWFDKAVVSLVEEEFGEE- 2855

  Fly  2816 VNDDVVYAQPLIYC----HFAKGLTDIK-----------------YMPISGWDRLKSLLDEAQDR 2859
                   ..|::.|    :|...|.|..                 |.||:..:.|:..|......
  Rat  2856 -------KTPVVDCGVDAYFVDFLRDAPEATGETPEETDAEMPKLYEPIASLNHLQERLSVFLQL 2913

  Fly  2860 YNDYI--GAMNLVLFDDAMSHVCRISRILESSRGYALLIGVGGSGKQSLTRLASFISSLDVFQIQ 2922
            ||:.|  ..|::|.|.|||.|:.:|||::.:.||.|||:|||||||||||||||||:....|||.
  Rat  2914 YNESIRGTGMDMVFFRDAMVHLVKISRVIRTPRGNALLVGVGGSGKQSLTRLASFIAGYTSFQIT 2978

  Fly  2923 LTKDYSVSDLKANIATLYMKAGVKTSACCFLMTDSEVAREQFLVLVNDLLASGDIHELFPDDEVE 2987
            ||:.|:.|:|..::..||..||.:.....|:.||:|:..|.||..:|::|:||::..||..||::
  Rat  2979 LTRSYNTSNLMEDLKVLYRTAGQQGKGITFIFTDNEIKEESFLEYMNNVLSSGEVSNLFARDEID 3043

  Fly  2988 NIVNAVRNEVKQLGIVDN------RENCWKYFIEKVRSLLKVVLCFSPVGATLRVRSRKFPALVN 3046
            .|.:.:.:.:|:    ::      .:|.::||:.:||..|.:||||||||...|.|:.|||||::
  Rat  3044 EINSDLTSIMKK----EHPKRPPTNDNLYEYFMSRVRGNLHIVLCFSPVGEKFRNRALKFPALIS 3104

  Fly  3047 CTTIDWFHEWPQQALESVSLRFLSEITV-----LPKELALPVSNFMAFVHKTVNDISKLYLANAK 3106
            ..|||||..||:.||.:||..|||...:     :.|||...:.:|...|.:...|    |....:
  Rat  3105 GCTIDWFSRWPKDALVAVSEHFLSSYNIDCTAEIKKELVQCMGSFQDGVAEKCAD----YFQRFR 3165

  Fly  3107 RYNYTTPKSFLELIALYSKLLHEKVKANLDRRLRLENGLIKLASCTKEVDALQDVLKVQEVELKI 3171
            |..:.||||:|..|..|..:..||.........|:..||.||...::.|.||...|.|:|.||::
  Rat  3166 RSTHVTPKSYLSFIQGYKFIYEEKHVEVQSLANRMNTGLEKLKEASESVAALSQELAVKEKELQV 3230

  Fly  3172 KNQEADNLIIVVGTENEKVSKERAFASKEEKNVRQIEEDVTAKAKLCEEDFLKAQPALIAAQEAL 3236
            .|::||.::..|..:.:...|.:|...|.:...:.|.:.::....:.||....|:|||..|:.||
  Rat  3231 ANEKADMVLKEVTMKAQAAEKVKAEVQKVKDKAQAIVDSISKDKAIAEEKLEAAKPALEEAEAAL 3295

  Fly  3237 NTLNKNNLTELKSFGSPPDAVVSVCGAVLVLFSSK---GKIPKDR-----SWKACRAFM--GNVD 3291
            .|:..:::..:::.|.||..::.:...||:||..:   .||..|:     ||:.....|  ||  
  Rat  3296 QTIKPSDIATVRTLGRPPHLIMRIMDCVLLLFHRRVNAVKIDLDKSCTVPSWQESLKLMTAGN-- 3358

  Fly  3292 KFLDNLINYDKKHIHPDVIKALQPYILDAEFSPEKILAKSSAAAGLCSWVININRFYDVYLVVEP 3356
             ||.||..:.|..|:.:||:.|.||...::::.|.........||||||...:..|:.:...|.|
  Rat  3359 -FLQNLQQFPKDTINEEVIEFLSPYFEMSDYNIETAKRVCGNVAGLCSWTKAMASFFSINKEVLP 3422

  Fly  3357 KERALLESEKEVKDARDKLTALNLRLTELEEQLNALQMEYDEALAKKQKCQDEASKTAFTIDIAN 3421
            .:..|:..|.....|...|......|.:.:.:|:.:|.||::|:.:||...::|.:....:..|:
  Rat  3423 LKANLIVQENRHALAMQDLQKAQAELDDKQAELDVVQAEYEQAMTEKQTLLEDADRCRHKMQTAS 3487

  Fly  3422 RLIGGLATEKIRWMESVKVLTFGIQQLPGDILIISCFISYVGCFTRAYRQELQEKLWMPAFKNSQ 3486
            .||.|||.||.||.|..|.....|::|.||:|:.:.|:||.|.|.:.:|..|... |....|..:
  Rat  3488 TLISGLAGEKERWTEQSKEFAAQIKRLVGDVLLATAFLSYSGPFNQEFRDLLLND-WKKEMKARK 3551

  Fly  3487 PPIPSTDGVDPFEMICDDAQIAEWNNQGLPSDRMSAENAAILVQSERYPLMIDPQLQGIKWVKTK 3551
              ||..:.::..||:.|...|:|||.||||:|.:|.:|..|:.::.|.||:||||.||..|::.|
  Rat  3552 --IPFGNDLNLNEMLIDAPTISEWNLQGLPNDDLSIQNGIIVTKASRSPLLIDPQTQGKIWIRNK 3614

  Fly  3552 YGTG-LVVLRLSQRNYLDQVERAVSNGSVLLIENIGENIDPVLNPLLGRQLIKKGTV--LKIGDR 3613
            .... |.:..|:.:.:.:.:|.::|.|..||||::||.:||.|:.:|.:..||.|:.  :|:||:
  Rat  3615 ESQNELQITSLNHKYFRNHLEDSLSLGRPLLIEDVGEELDPALDNVLEKNFIKTGSTFKVKVGDK 3679

  Fly  3614 EIDFNSRFRLILHTKLANPHYKPEMQAQTTLINFTVTRDGLEDQLLAEVVKVERPDLEAMRTRLT 3678
            |:|....|:|.:.|||.||.|.||:.|:|.:|:||||..|||||||..|:..|:.:||..||.|.
  Rat  3680 EVDVMDGFKLYITTKLPNPAYTPEISARTAIIDFTVTVKGLEDQLLGRVILTEKQELEKERTHLL 3744

  Fly  3679 QQQNHFKITLKFLEDDLLARLSSAGDNVLEDVTLVMNLEKTKKTADEIEVKVAEAKITGVQIDSA 3743
            ::....|...|.|||:||.||:|...:::||.:|::.|..|||||:|:..|:..:..|.:||:||
  Rat  3745 EEVTANKRRTKELEDNLLYRLTSTQGSLVEDESLIVVLSNTKKTAEEVTQKLEISGETEIQINSA 3809

  Fly  3744 REAYRPAAERASIIYFILNDLFKINPIYQFSLKAFTVVFNNAMLKAMAAEKLKDRVENLIDSITF 3808
            ||.|||.|.|.||:||::.::..:|.:||.||:.|..:|:.::.:::.:.....|:.|:|:.:|:
  Rat  3810 REEYRPVATRGSILYFLITEMRLVNEMYQTSLRQFLGLFDLSLARSVKSPITSKRIGNIIEHMTY 3874

  Fly  3809 CSFVYTSRGLFEQDKLIFLTQLCIQILVNLGEVEPTELDFLLR---------FPYMPNQTSNFTW 3864
            ..|.|..:||:|:.|.:|...|.::|.:....|:..|...|::         .|:.|::     |
  Rat  3875 EVFKYAVQGLYEEHKFLFTLLLTLKIDIQRNLVKHEEFLTLIKGGASLDLKACPHKPSK-----W 3934

  Fly  3865 LTHVGWGGIRALNNQAVFKGLEKDIEGSHKRWKKFVDSESPENEKFPGEW-KGKSAIQRLCIMRC 3928
            :..:.|..:..|:....|..:...|..:.|.|:.:.|.|:||.|..|..: |.....:||.::|.
  Rat  3935 ILDMTWLNLVELSKLKQFSDILDQISRNEKLWRIWFDKENPEEEPLPNAYDKSLDCFRRLLLIRS 3999

  Fly  3929 IRPDRMSYAMRSFIEEKLGSKYIDARSMEFSRTFEESSPETHIFFVLSPGVDPLKDVEKLGKSLG 3993
            ..|||.....|.:|.:.:|..|.:...::..:|:|||.|.|.:..:||.|.||...:..|||.|.
  Rat  4000 WCPDRTIAQARKYIMDSMGENYAEGVILDLEKTWEESDPRTPLICLLSMGSDPTDSIIALGKRLK 4064

  Fly  3994 FSFDHENFHSVSLGQGQEIVAENAIEIASQYGHWVILQNIHLVARWLPSLEKKME--SSLSNVHT 4056
            ....:     ||:|||||:.|...:......|.||:|||.||   .|..|::.|:  :....||.
  Rat  4065 IETRY-----VSMGQGQEVHARKLLHQTMANGGWVLLQNCHL---GLDFLDELMDVVTETETVHD 4121

  Fly  4057 SYRLFLSAEPAGDPAAH-ILPQGILESAIKITNEPPTGMMANIHKALDNFSDETLEMCSKETEFK 4120
            ::||:::.|      .| ..|..:|:.:||..||||.|:.|.:.:.....|.:.|:: |...::|
  Rat  4122 TFRLWITTE------VHKQFPITLLQMSIKFANEPPQGLRAGLRRTYGGVSQDLLDV-SVGAQWK 4179

  Fly  4121 AILFSLCYFHAVVAERRKFGPQGWNRSYPFNVGDLTISVYVLYNYL---EANTRVPWEDLRYLFG 4182
            .:|:::.:.|:.|.|||||||.|||..|.||..|...:|..:.|:|   :....|.|..:||:.|
  Rat  4180 PMLYAVAFLHSTVQERRKFGPLGWNIPYEFNQADFNATVQFIQNHLDDMDIKKGVSWTTVRYMIG 4244

  Fly  4183 EIMYGGHITDDWDRRLCRTYLEEFMQPELIDGELEYCQGFPAPGILKYTGYHNYIDDNLPS-ESP 4246
            ||.|||.:|||:|:||..|:.:.:....:...:..:.||:..|......||..|| .:||: :||
  Rat  4245 EIQYGGRVTDDYDKRLLNTFAKVWFSENMFGPDFTFYQGYNIPKCSTVDGYLQYI-QSLPAYDSP 4308

  Fly  4247 SLYGLHSNAEIGFLTTVSERLFRIVFELQPRMTGGSSGGETVSQEDIIKNIIEDILDKTP---TP 4308
            .::|||.||:|.:.:.:::.:...:..:||:   .||||...::|.::..:.:|:|:|.|   :|
  Rat  4309 EVFGLHPNADITYQSKLAKDVLDTILGIQPK---DSSGGGDETREAVVARLADDMLEKLPEDYSP 4370

  Fly  4309 FNILELMGRVEDRSPYIIVAFQECERMNNLMTELKRSLNELDLGLKGELTISSVMEDLMVCLYMD 4373
            |.:.|.:.::....|..|...||.:||..:::.::.:|.||.|.:.|.:.:|..:.|.:.|::..
  Rat  4371 FEVKERLQKMGPFQPMNIFLRQEIDRMQRVLSLVRSTLTELKLAVDGTIIMSDNLRDALDCMFDA 4435

  Fly  4374 QVPEQWTKLAY-PSMLGLQSWFSDLMLRLRELEGWVADFRMPSSIWLAGFFNPQSLLTAIMQQTA 4437
            ::|.:|.|.:: .|.||.  ||::|:.|..:...||::.| |...|:.||||||..|||:.|:..
  Rat  4436 RIPARWKKASWVSSTLGF--WFTELLERNCQFTSWVSNGR-PHCFWMTGFFNPQGFLTAMRQEIT 4497

  Fly  4438 RKNE-WPLDRMCLNCDVTKKWKEELTTAPREGAYINGLFMEGARWDMKMGTIADAFLKELFPAMP 4501
            |.|: |.||.|.|..:|||..|::::..|.||.|:.||::|||.||.:...:.::..|.||..||
  Rat  4498 RANKGWALDNMVLCNEVTKFMKDDISAPPTEGVYVYGLYLEGAGWDKRNMKLIESKPKVLFELMP 4562

  Fly  4502 VLYIKAVTQDKQDIKNVYECPVYKIRLRGP-TFVWTFNLKSRERASKWTLAGVCLL 4556
            |:.|.|.....:| ..:|.||:||..:|.. .::...:||:.:....|.|.||.||
  Rat  4563 VIRIFAENNTARD-PRLYCCPIYKKPVRTDLNYIAAVDLKTAQAPEHWILRGVALL 4617

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
kl-5NP_001015499.4 DHC_N1 198..763 CDD:462457 113/606 (19%)
DHC_N2 1365..1769 CDD:462462 118/421 (28%)
DYN1 1591..4206 CDD:227570 941/2717 (35%)
AAA_6 1903..2229 CDD:463697 173/326 (53%)
MT 3140..3480 CDD:463699 105/349 (30%)
AAA_9 3508..3726 CDD:463702 95/220 (43%)
Dynein_C 4261..4557 CDD:465677 98/302 (32%)
Dnah5NP_001406498.1 Stem. /evidence=ECO:0000250 1..1938 436/2114 (21%)
DHC_N1 250..802 CDD:462457 113/603 (19%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 899..918 3/20 (15%)
DHC_N2 1399..1804 CDD:462462 118/422 (28%)
DYN1 <1640..4282 CDD:227570 935/2718 (34%)
AAA_6 1939..2266 CDD:463697 173/326 (53%)
AAA 1. /evidence=ECO:0000250 1939..2161 137/221 (62%)
AAA 2. /evidence=ECO:0000250 2221..2440 79/223 (35%)
AAA 3. /evidence=ECO:0000250 2547..2800 77/263 (29%)
AAA 4. /evidence=ECO:0000250 2913..3167 106/261 (41%)
Dynein_C 4326..4618 CDD:465677 98/299 (33%)

Return to query results.
Submit another query.