DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment kl-5 and Dnah8

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001015499.4 Gene:kl-5 / 26067054 FlyBaseID:FBgn0267433 Length:4559 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001414021.1 Gene:Dnah8 / 207117 RGDID:619986 Length:4727 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4827 Identity:1361/4827 - (28%)
Similarity:2314/4827 - (47%) Gaps:540/4827 - (11%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     7 KKEPVDNRPEFFWNYLTKTMRLKLDKWTKMITTNEFRDVIIEFLNNPNKK--------------- 56
            ::..:|...::.:..|.:.:.|.|....::|......|....|......|               
  Rat   160 RRMKIDPSYKYIFEILGEKLGLDLVSVEELILDCPSLDAFSSFFEKGGSKTLKFLYQEGDVPGLE 224

  Fly    57 --RIIFTINSGG---QLYPSYSFPVRPRYKVAYFIRYLTPLHLTDENMLNSLL--IGDLLPNPLA 114
              |.|..:..||   :||...:.|.:.:....:|:|....:.:..:.:...:|  :.|.....|.
  Rat   225 CGRTITGVPKGGKMMRLYIDNAAPEKLKELCLFFVRCRNDVAINSKTIYEDVLFTVLDASKGLLK 289

  Fly   115 NLSILCDEVFFPLLNNTVNQVGWTNVIANDMKTESQE-------------MRNGIAQMKGLVINR 166
            .:..:...:|.|.:..|.|   | ..:....:.||::             :......::|.|:.:
  Rat   290 GIKNMLKNIFLPAILATGN---W-GALNQSKQGESEKHIFTETINRYLLFLDGATISIEGTVMLK 350

  Fly   167 TI----FPLPICMDEVMQAAPAIAMGDISVVNPLMKHSLEFMVVKWLDSVEDLVNIKAGEKIYSK 227
            .:    |......:||..||.:..          |.|.||.:::.|...:|.::......:..:.
  Rat   351 KVDNIDFSKLHTFEEVTAAASSSE----------MVHQLEDVLMMWYKQIEQVLIESEQMRKEAD 405

  Fly   228 ENFPLPEAIFSFWESRLENLENLAEQLGDRRIKTIGFVLEKIQSIFEHSYRRIVELVLESLAEAR 292
            ::.||.|  ...|:........:.||:.....|.:..||....|....::|.:...:.::..|::
  Rat   406 DSGPLTE--LEHWKRMSAKFNYIIEQIKGPSCKAVINVLNVAHSKLLKNWRDLDARITDTANESK 468

  Fly   293 DITKCLSPLKRKMDKFETNDMDENRSDIRPLMLTIGLVWGHSRYFHTLNNMTLFFNLFHNSLIDC 357
            |..:.|..|::........|:......|:.|:..|.::...|||::|...||..|....|.::..
  Rat   469 DNVRYLYTLEKVCQPLYNYDLVSMAHGIQNLINAIRMIHSVSRYYNTSERMTSLFIKVTNQMVTA 533

  Fly   358 VNRTVE---PDSIFQGDVDEAYKKLDINMQHLEYYKLIYNECRNSL------KKFKIGTTFNSQD 413
            ....:.   .:.::..:.....||:...:...:.|:..:::.|..:      |.|::...:    
  Rat   534 CKAYITDGGTNHVWDQETPAVLKKIQDCIFLFKEYQASFHKTRKQILESSGEKSFEVSEMY---- 594

  Fly   414 WTWHQDEIFGRLDKFLVRLEELKDLFNTVRDFQKLEKIVMGGLKGRQITFALEKILEEYNSIYRE 478
                   |||:.:.|..|||::.::...|:.:..|....:.|:....|.|         .:||:.
  Rat   595 -------IFGKFEAFCKRLEKITEMITIVQTYSALSNSTIEGIDILGIKF---------KNIYQG 643

  Fly   479 WTNIQYNPIDPDAENSLFQRDRLSFKAKTDVME----RMVSFQFEKGL--EDTHDLLLAGSLLLR 537
            ....||:.:||  ..:.|..|...|..|.:.:|    ..::..|.|.|  :....||.....|..
  Rat   644 IKKNQYDILDP--RRTEFDTDFSDFMGKINTLEIQIQAFMNITFGKILSSQQALQLLQRFQKLNM 706

  Fly   538 PIIKKHVEPLMHVIVDDFEEEIMCVKKEFINFKNVFTALGLNELPTDDCFPKVSGAISFLKKLRH 602
            |.::..:...:..|:..:..|:...||.:.:.|        ::.|.....|.::|.|.::::|..
  Rat   707 PCLQLEINHTIERILQCYVAELEATKKLYHSQK--------DDPPLARNMPPIAGKILWVRQLYR 763

  Fly   603 RIIGLHKEHELYEYPLFDNERGGYVSDIFN-----IMVQEIDDFTKMLLD-------KWTVECWQ 655
            ||      :|...| .|.|      |||.:     .::::.:..:.:|::       .|..|..|
  Rat   764 RI------NEPINY-FFKN------SDILSSIEGKAVIRQYNKISYVLVEFEVVYHTAWVKEISQ 815

  Fly   656 GIQQDITLTL-IEKDEANELRVNFTERLIFALKDIKVVRLLGCDVSVNLTKFFCREDELWQARVK 719
             :|..:..|| :...|..:|.|||..:::..:::.|.:..:..||.....|....|.:|...::.
  Rat   816 -LQYALQATLFVRHPETGKLLVNFDPKILEVVRETKCMIKMKLDVPEQAKKLLKLESKLKADKLY 879

  Fly   720 LMRIAEWYNDTFERAHPTEKRLIAAEMILIEEQMKPLLDFIKWNAFS--------QRFIVMIFKM 776
            |..:.::|:|..:........|:..:|..:|..::..|..:.|::..        :..:.|..::
  Rat   880 LQGLLQYYDDLCQEVPSVFVNLMTPKMKKVESVLRQGLTVLTWSSLMLESFFKEVESVLDMFNQL 944

  Fly   777 VKYLHDRLVAAQENLEAIKESIRSWGKVPLFQRKDLNPALLLHTDPREPILSIRAANAADTQRLI 841
            :|.::|   ..:.:::.:.:.|   .|..|....|.....:      |.:|::   |...|:...
  Rat   945 LKKVND---LCEMHIDTVLKEI---AKTLLISLSDSGATRV------EDMLTL---NETYTKEWA 994

  Fly   842 DLLMYVN---------LKLFFD--IPRRYSLPPGE----------HGEEDEESDGI-WPPIISLS 884
            |:|.:.:         |.|.|:  ...:|:..|.:          .|.|.:|.:.: :.|     
  Rat   995 DILNHKSRHVEEAVKELILIFEQIYEVKYTGKPAKPVPEQRKHVVFGSEADEGESLEYDP----- 1054

  Fly   885 VMTSVKFKKKREVIDEEDDLEEFEEEQSESEEEIITPFHRYELLKGLSQEERALF--REYEIYVD 947
                   ......:|..|..:||::|..|     :..|..::||..|.:..|...  .:..|:|.
  Rat  1055 -------DSTARDVDNNDKEDEFKKECKE-----VYAFFSHQLLDSLQKATRLSLDTMKKRIFVG 1107

  Fly   948 EIIAENLVDSVITSSTYLRMEVDNRYENNTPIFEIFMELQEPNVVYFRNLD-------------- 998
            ....:...|.|    ::::.||               .|..||||...:||              
  Rat  1108 NQGRKRSEDVV----SFIKTEV---------------HLAIPNVVMVPSLDDIQQAINRMIQLTL 1153

  Fly   999 ---------------------TSSKTGFAFFIETILDDMNNMMSLLKRVAQDPTE-VTNMNPYSF 1041
                                 |||:..         |..:.|...||:..:...| :......:|
  Rat  1154 EVSRGVAHWGQQQVRRTKSPQTSSRGS---------DQPSIMGKALKKEERSFEESIPARKLKNF 1209

  Fly  1042 YDELQDKSELDKQRVEIMNKIKLALQAVRVHGKGFMEFSSLWIWDKSTYLSEVKKF-GRNLTLDE 1105
            |..:.:..::.|..:.:.:.:....:|.....:.|.::.:||..|:..   :||:| ..|.:|.|
  Rat  1210 YPGVAEHKDISKLVLLLSSSVNSLRKAATEALQDFQKYKTLWTEDRDV---KVKEFLANNPSLTE 1271

  Fly  1106 RDAEADLEGSSGVKLLGLEYPPLSVYKEQLDKFIELQDQIRTWETYEDFFVFLRLNMTGFKVAVL 1170
            ..:|.            |.|.......|:|...|::.              .|.|:....|:|:.
  Rat  1272 IRSEI------------LHYATFEQEIEELKPIIDVG--------------ALELHTEPMKLALS 1310

  Fly  1171 SQVGQWISLFKLDLINRVKNSLKELQDFVDEANIVLKIELQKDDFEGLVKILSVLNQINEKQCIY 1235
            .:...|..|....|....|..:.::..|::|  .:.|:.....|.:.:...:..|:.|.:.:...
  Rat  1311 IEAKAWKMLLCRYLNEEYKKKMSDMIVFINE--YLKKLSRPIRDLDDVRFAMEALSCIRDNEIQM 1373

  Fly  1236 DSMFDPLKEIIDLLRQYNYEFKDTELAQINELPDAWMKVKRLAATTKQLIAPIQS-------YQV 1293
            |....|::|...:|.::..|....|...::.|..::.|::..|.:.:..:..:|.       ..|
  Rat  1374 DMTLGPIEEAYGILNRFEVEVTKEESEGVDTLRYSFNKLQSKAVSVQDELVQVQPKFKSSLLESV 1438

  Fly  1294 DLIEKRILLCDNMANTYRKKFLSKKFFFVPCLSCYELIDESDLELVALEERQRSLAESAV---LF 1355
            |:..:.::   |....|..:..     .||.:...|..:...:.....::..|.....:.   ||
  Rat  1439 DVFREDVI---NFTEAYETEGP-----MVPNIPPQEASNRLQIFQANFDDLWRKFVTYSAGEQLF 1495

  Fly  1356 ELQGPDPVKIELCRFDLKLVKIMWDFAITIQSTINDWKKTPWKKIDIENMDQECKKFGRELRGLD 1420
            .|...|...:...|.:|.|::.::....|:..:|:.:.:..|..:|||.::.|..:|....|.|.
  Rat  1496 GLPVTDYEVLHKTRKELNLLQKLYGLYDTVMGSISGYYEILWGDVDIEKINAELLEFQNRCRKLP 1560

  Fly  1421 KAMRTWEPFIFMEASLKNLMTSLRAVTELQNPAIRDRHWIELMQTTKVKFSMD-DSTTLKDLIDL 1484
            |.::.|:.::.::..:.:...|...:..:.|.|::.|||..:.:.|...|.:: |:..|:::::.
  Rat  1561 KGLKDWQAYLDLKKRIDDFSESCPLLEMMTNKAMKQRHWDRISELTGTPFDVESDTFCLRNIMEA 1625

  Fly  1485 NLHEYEEEVKNIVDKSVKEMAMEKQLRDIATAWGTMEFGTDIHDRTSIKLLKASE--ELIETLED 1547
            .|.:.::::::|...::||..:|.::..:...|................|||.:|  |:|..:||
  Rat  1626 PLLKNKDDIEDICISAIKEKDIEAKMTQVIENWTNQNLSFSAFKGKGELLLKGTESGEIITLMED 1690

  Fly  1548 HQGQLQNMASSKYIAFFEHEVRLWQNRLSNADQIIGSWFEVQRKWQYLESIFIGSEDIRSQLPED 1612
            ....|.::.|::|...|:..::.|..:||.:..||..|..||..|.|||::|:|. ||..|||::
  Rat  1691 SLMVLGSLLSNRYNTPFKKTIQNWVYKLSTSSDIIEEWLVVQNLWVYLEAVFVGG-DIAKQLPQE 1754

  Fly  1613 SRRFDYIDKEFKALLAQMNADRNVVRST--NRSGSKLYEHLEILLKMLLLCEKALNDYLETKRLS 1675
            ::||..|||.:..::.:.:.:.||:...  :.:..:|..||.   :.|.:|:|:|..|||.|||.
  Rat  1755 AKRFQNIDKSWVKIMQRAHENPNVISCCVGDETMGQLLPHLH---EQLEVCQKSLTGYLEKKRLL 1816

  Fly  1676 YPRFYFVSSADLLDILSNGNNPALVARHLTKLYDSMGKLNL-ISGSKNAAGMVAKELEEYV---P 1736
            :|||:|||...||:||...::...:..||..:.|::.::.. .........::::|.|:.:   |
  Rat  1817 FPRFFFVSDPVLLEILGQASDSHTIQPHLPAVSDNINEVTFHPKDYDRMTAVISREGEKIMLDTP 1881

  Fly  1737 FLENCDCSGKVEVWLNRITDKMRDTLRDQLKRS-----------LTFYDHKPRHVWIFEWPAQPA 1790
            .:    ..|.||:||..:......:|.:.::.:           |.|.:|         :|||..
  Rat  1882 VM----AKGPVEIWLLDLLKVQMSSLHNIIRSAFYQISDSGFLLLPFLNH---------FPAQVG 1933

  Fly  1791 LVGTQIMWTTETNDAFAKVQQRYENALKD-------YNKKQITQLNNLIILLLGDLTAAERQKIM 1848
            |:|.|::||.::.:|.        |:.||       .|:|.:..||.||.....|||..:|.|..
  Rat  1934 LLGIQMLWTHDSEEAL--------NSAKDDRKIMHITNQKFLDILNTLISQTTHDLTKFDRVKFE 1990

  Fly  1849 TICTIDVHSRDVVGTIIAKKVEVQTAFQWQSQLRHRWDPKIDDCFANICDAQFRYDYEYLGNTPR 1913
            |:.||.||.||:...::...::..|.|:|..|.|..:...:|....:|.|..|.|..|:||.|.|
  Rat  1991 TLITIHVHQRDIFDDLVKMHIKSVTDFEWLKQSRFYFKEDLDQTVVSITDVDFNYQNEFLGCTDR 2055

  Fly  1914 LVITPLTDRCYITLTQSLHLVMGGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALGMMVYVFNCSEQMDYKSIGD 1978
            ||||||||||||||.|:|.:.|||||||||||||||||||:||.||..|.|||||:|||::.:|.
  Rat  2056 LVITPLTDRCYITLAQALGMNMGGAPAGPAGTGKTETTKDMGRCLGKYVVVFNCSDQMDFRGLGR 2120

  Fly  1979 IHKGLAQTGAWGCFDEFNRISVEVLSVVAVQVKCIQDAIKSKKQTFSFL-GEHIALRTTVGVFIT 2042
            |.|||||:|:||||||||||.:.||||.|.|:..:..|.|.:|:.|.|. |:.:.|....|:|:|
  Rat  2121 IFKGLAQSGSWGCFDEFNRIELPVLSVAAQQIYIVLTARKERKKQFIFSDGDCVDLNPEFGIFLT 2185

  Fly  2043 MNPGYAGRAELPENLKALYRPCAMVVPDFALISEIMLVAEGFQEARLLARKFITLYTLCKELLSK 2107
            ||||||||.|||||||..:|..||:|||..:|..:.|.:.||.|..:||:||..||.||:|.|:|
  Rat  2186 MNPGYAGRQELPENLKIQFRTVAMMVPDRQIIMRVKLASCGFLENVILAQKFYVLYKLCEEQLTK 2250

  Fly  2108 QDHYDWGLRAIKSVLVVAGALRRDDRQRPEDQVL---MRALRDFNIPKIVTDDVPVFMGLIGDLF 2169
            |.|||:|||.|.|||...|:.:   |.||||..|   ||.|||.|:.|:|.:|.|:|:.||.|||
  Rat  2251 QVHYDFGLRNILSVLRTLGSQK---RARPEDSELSTVMRGLRDMNLSKLVDEDEPLFLSLINDLF 2312

  Fly  2170 PALDVPRKRNPEFEAVIKRSALDLKLQPEDGFI------LKIVQLEELFAVRHSVFIIGFAGTGK 2228
            |.|.:......|.:|     |:|.::..| |.|      ||:|||.|...|||.:..:|.:|:||
  Rat  2313 PGLQLDSNTYAELQA-----AVDNQVNLE-GLINHPPWNLKLVQLYETSLVRHGLMTLGPSGSGK 2371

  Fly  2229 SEVWKTLNKTYQNQKRKPHYNDLNPKAVTNDELFGIVNPSTREWKDGLFSILMRDQANLGGTGPK 2293
            :.|...|.|:.....|......:||||:|..::||.::.:|.:|.||:||.|.|...........
  Rat  2372 TTVITILMKSLTECGRPHREMRMNPKAITAPQMFGRLDTATNDWTDGIFSTLWRKTLKAKKGENI 2436

  Fly  2294 WIVLDGDIDPMWIESLNTVMDDNKVLTLASNERIALTKEMRLLFEIASLRTATPATVSRAGILYI 2358
            :::|||.:|.:|||:||:|:||||.||||:.:||.:....:||||:.::..|:||||||.|::||
  Rat  2437 FLILDGPVDAIWIENLNSVLDDNKTLTLANGDRIPMAPTCKLLFEVHNIENASPATVSRMGMVYI 2501

  Fly  2359 NPQDLGWTPFIQSWLGTRTNSSEVSMLNVLFDKYVPPLLDIFRTRLRSITPISDIARLQMTCYLL 2423
            :...|.|.|.:|:||..||.....:.|: |:||.........:..|.....:.:...:..:..||
  Rat  2502 SSSALSWRPILQAWLKRRTQQEATAFLS-LYDKVFEDAYTYMKLNLIPKMQLLECNYITQSLNLL 2565

  Fly  2424 DSMLTPQNVPNDCPKDWYEIYFVFCIVWGFGSSLFQDQIIDWSNEFSKWFLNEYKA-VKFP---- 2483
            :.::..:........|.....|||.::|..|:.|..:     |.|..:.||..::: :..|    
  Rat  2566 EGLIPSKEEGGVSSVDHLHKLFVFGLMWSLGALLELE-----SREKLEVFLRGHESKLNLPEIAK 2625

  Fly  2484 -LSGTIFSFYI------DHETKKFFPW---TNLVPQFELDMDLPLQSNLVNTAETTRLRFFMDTL 2538
             ...|::.||:      :|..|:..|:   |:.:|::        .|.||...:..|..|.:||:
  Rat  2626 DSHHTMYEFYVTDYGDWEHWNKRLQPYFYPTDSIPEY--------SSILVPNVDNIRTNFLIDTI 2682

  Fly  2539 IEADHPLMLIGPSGSGKTILMNAKLSALPSDKYSVTNVPFNFYTTSEMLQRILEKPLEKKAGRNY 2603
            .:....::|.|..|:.||:::.|.|.....:.....::.|:..|...|.||.:|..::|:.|..|
  Rat  2683 AKQHKAVLLTGEQGTAKTVMVKAYLKKYDPEVQLSKSLNFSSATEPMMFQRTIESYVDKRMGSTY 2747

  Fly  2604 GPIGNKRMIYFVDDMNMPEVDKYFTVQPHTLIRQFMDYHHWYDRQK----MTLRDIHKCNIVACM 2664
            ||.|.::|..|:||:|||.::::.....:.::||.|:....|...|    .|:.|:..  |.|.:
  Rat  2748 GPPGGRKMTVFIDDINMPVINEWGDQITNEIVRQMMEMEGMYSLDKPGDFTTIVDVQL--IAAMI 2810

  Fly  2665 NPSAGSFTIDPRLQRHFCSFAVNPPSQDALFHILNSILSQHMDNPIQKFDKAVIKLCENMVTTAI 2729
            :|..|...|..||:|.|..|....||..::..|...|...:.| |.:||...:..:..|:|:...
  Rat  2811 HPGGGRNDIPQRLKRQFTVFNCTLPSNTSIDKIFGIIGCGYFD-PCRKFRPEICDMIGNLVSVGR 2874

  Fly  2730 TLHLKVVSSFLPTAIKFHYNFNLRDIANIFTGVLYSNSETCPNSNQMIRLWIHECYRVYGDKLVD 2794
            .|........|||..||||.|||||::.|:.|:|...:|.|.....::.|:.|||.||..|:.:.
  Rat  2875 VLWQWTKVKMLPTPSKFHYIFNLRDLSRIWQGMLTIKAEECKTIPILMALFKHECNRVIADRFIT 2939

  Fly  2795 YTDINSFKKIVSDIVRKGIEGVNDDV---VYAQPLIYCHFAKGLTDIK----------------- 2839
            ..|...|.   :.::|...|.::.:|   :..:|    :|...|.|:.                 
  Rat  2940 PDDEQWFN---TQLIRAVEENISPEVAASINPEP----YFVDFLRDMPEPTGDEPEDTMFEVPKI 2997

  Fly  2840 YMPISGWDRLKSLLDEAQDRYNDYI--GAMNLVLFDDAMSHVCRISRILESSRGYALLIGVGGSG 2902
            |..:..::.|...|...|.::|:.|  .:::||.|.|||:|:.:||||:.:|.|.|||:||||||
  Rat  2998 YELVPSFEFLCEKLQFYQKQFNEIIRGTSLDLVFFKDAMTHLIKISRIIRTSCGNALLVGVGGSG 3062

  Fly  2903 KQSLTRLASFISSLDVFQIQLTKDYSVSDLKANIATLYMKAGVKTSACCFLMTDSEVAREQFLVL 2967
            ||||:||||||:...:|||.||:.|:||:|..::..||..||.......|:.||:|:..|.||..
  Rat  3063 KQSLSRLASFIAGYQIFQITLTRSYNVSNLIDDLKNLYKVAGADGKGITFIFTDNEIKDEAFLEY 3127

  Fly  2968 VNDLLASGDIHELFPDDEVENIVNAVRNEVKQLGIVDNRE---------NCWKYFIEKVRSLLKV 3023
            :|:||:||:|..||..||::.|...:.:.:|       ||         |.::|||.:.|..|.|
  Rat  3128 LNNLLSSGEISNLFARDELDEITQGLISVMK-------RELPRHPPTFDNLYEYFISRSRRNLHV 3185

  Fly  3024 VLCFSPVGATLRVRSRKFPALVNCTTIDWFHEWPQQALESVSLRFLSEITVL-PKELALPVSNFM 3087
            ||||||||...|.||.|||.|::..|:|||..||::||.:|:..|||:..:: ..|:...|...|
  Rat  3186 VLCFSPVGEKFRARSLKFPGLISGCTMDWFSRWPKEALIAVASYFLSDYNIVCSMEIKRHVVEAM 3250

  Fly  3088 AFVHKTVNDISKLYLANAKRYNYTTPKSFLELIALYSKLLHEKVKANLDRRLRLENGLIKLASCT 3152
            ...|..|::..:.|....:|..:.||||:|..|..|..:..||||...::..|:..||.||...:
  Rat  3251 GLFHDMVSESCENYFQRYRRRAHVTPKSYLSFINGYKNIYTEKVKYINEQAERMNIGLDKLMEAS 3315

  Fly  3153 KEVDALQDVLKVQEVELKIKNQEADNL---IIVVGTENEKVSKE-RAFASKEEKNVRQIE-EDVT 3212
            :.|..|...|.|:|.||.:.:.:||.:   :.|....:.||..| :....|.:|.|.:|: |.|.
  Rat  3316 ESVAKLSQDLAVKEKELAVASVKADEVLAEVTVSAQASAKVKNEVQEVKDKAQKIVDEIDSEKVK 3380

  Fly  3213 AKAKLCEEDFLKAQPALIAAQEALNTLNKNNLTELKSFGSPPDAVVSVCGAVLVLFSSK-GKIPK 3276
            |::||     ..|:|||..|:.||||:..|::..::....||..::.:...||:||..| ..:..
  Rat  3381 AESKL-----EAAKPALEEAEAALNTIKPNDIATVRKLAKPPHLIMRIMDCVLLLFQKKIDPVTM 3440

  Fly  3277 DRSWKACRAFMGNVDK------FLDNLINYDKKHIHPDVIKALQPYILDAEFSPEKILAKSSAAA 3335
            |.....|:...|...|      ||.:|..:.|..|:.:.::.||||....:::.|.........|
  Rat  3441 DPEKPCCKPSWGESLKLMSATGFLFSLQQFPKDTINEETVELLQPYFNMDDYTYESAKKVCGNVA 3505

  Fly  3336 GLCSWVININRFYDVYLVVEPKERALLESEKEVKDARDKLTALNLRLTELEEQLNALQMEYDEAL 3400
            ||.||.:.:..||.:...|.|.:..|.:.|..:..|..:|......|.|.:.:|:.:|.::|.|:
  Rat  3506 GLLSWTLAMAIFYGINREVLPLKANLAKQEGRLAVANAELGKAQALLDEKQAELDKVQAKFDAAM 3570

  Fly  3401 AKKQKCQDEASKTAFTIDIANRLIGGLATEKIRWMESVKVLTFGIQQLPGDILIISCFISYVGCF 3465
            .:|....::|......:..|:.||.||:.||:||.:..|.....|.:|.||:|:.:.|:||:|.|
  Rat  3571 NEKMDLLNDADMCRKKMQAASTLIDGLSGEKVRWTQQSKEFKAQINRLVGDVLLCTGFLSYLGPF 3635

  Fly  3466 TRAYRQELQEKLW---MPAFKNSQPPIPSTDGVDPFEMICDDAQIAEWNNQGLPSDRMSAENAAI 3527
            .:.:|..|.:..|   |.|.|     ||.|:.::...|:.|...|.||..||||.|.:|.:|..|
  Rat  3636 NQIFRNYLLKDQWELEMKARK-----IPFTENLNLIAMLVDPPTIGEWGLQGLPGDDLSIQNGII 3695

  Fly  3528 LVQSERYPLMIDPQLQGIKWVKTK-YGTGLVVLRLSQRNYLDQVERAVSNGSVLLIENIGENIDP 3591
            :.::.||||:||||.||..|:|:| ....|.|..|:.:.:...:|.::|.|..||||:|.|.:||
  Rat  3696 VTKATRYPLLIDPQTQGKTWIKSKEKENDLQVTSLNHKYFRTHLEDSLSLGRPLLIEDIREELDP 3760

  Fly  3592 VLNPLLGRQLIKKGTV--LKIGDREIDFNSRFRLILHTKLANPHYKPEMQAQTTLINFTVTRDGL 3654
            .|:.:|.:..||.||.  :|:||:|.|....|:|.:.|||.||.:.||:.|:|::|:||||..||
  Rat  3761 ALDNVLEKNFIKSGTAFKVKVGDKECDIMDTFKLYITTKLPNPAFTPEINAKTSVIDFTVTMKGL 3825

  Fly  3655 EDQLLAEVVKVERPDLEAMRTRLTQQQNHFKITLKFLEDDLLARLSSAGDNVLEDVTLVMNLEKT 3719
            |:|||..|:..|:.:||:.|.:|.:.....|..:|.|||:||.:||:...::::|.:|:..|..|
  Rat  3826 ENQLLRRVILTEKQELESERVKLLEDVTFNKRKMKELEDNLLYKLSTTQGSLVDDESLIGVLRIT 3890

  Fly  3720 KKTADEIEVKVAEAKITGVQIDSAREAYRPAAERASIIYFILNDLFKINPIYQFSLKAFTVVFNN 3784
            |:||.|:..|:..|..|.::|::|:|.:||||.|.||:||::.::..:|.:||.||..|..:|:.
  Rat  3891 KQTAAEVSEKLHVAAETEIKINTAQEEFRPAATRGSILYFLITEMSMVNIMYQTSLAQFLKLFDQ 3955

  Fly  3785 AMLKAMAAEKLKDRVENLIDSITFCSFVYTSRGLFEQDKLIFLTQLCIQILVNLGEVEPTELDFL 3849
            :|.::..:...:.|:.|:|:.:|:..|.|:.|||:|..|.:|...:.::|.:..|.|:..|...|
  Rat  3956 SMARSEKSPLPQKRITNIIEYLTYEVFTYSVRGLYENHKFLFALLMTLKIDLQRGTVKHKEFQAL 4020

  Fly  3850 LR---------FPYMPNQTSNFTWLTHVGWGGIRALNNQAVFKGLEKDIEGSHKRWKKFVDSESP 3905
            ::         .|..|     |.|:..:.|..:..|:....|..:...|..:.|.||.:.|.::|
  Rat  4021 IKGGAALDLKACPPKP-----FRWILDMTWLNLVELSKLPQFAEIMNQISRNEKGWKNWFDKDAP 4080

  Fly  3906 ENEKFPGEWKGK-SAIQRLCIMRCIRPDRMSYAMRSFIEEKLGSKYIDARSMEFSRTFEESSPET 3969
            |.|..|..:... ...::|.::|...|||..:..|.:|.:.|..||.:...:...:|:|||...|
  Rat  4081 EEEIIPDGYNDSLDTCRKLLLIRSWCPDRTVFQARKYIADSLEEKYTEPVILNLEKTWEESDTHT 4145

  Fly  3970 HIFFVLSPGVDPLKDVEKLGKSLGFSFDHENFHSVSLGQGQEIVAENAIEIASQYGHWVILQNIH 4034
            .:...||.|.||...::.|.|.|..     ...::|:|||||:.|...::::.|.|.||:|||.|
  Rat  4146 PLICFLSMGSDPTIQIDALAKKLKL-----ECRTISMGQGQEVHARKLVQLSMQQGGWVLLQNCH 4205

  Fly  4035 LVARWLPSLEKKMESSL--SNVHTSYRLFLSAEPAGDPAAHILPQGILESAIKITNEPPTGMMAN 4097
            |   .|..:|:.:|:.:  .....|:|::::.||...     .|..:|::::|.|||||.|:.|.
  Rat  4206 L---GLEFMEELLETLMVTETTEDSFRVWITTEPHDR-----FPITLLQTSLKFTNEPPQGVRAG 4262

  Fly  4098 IHKALDNFSDETLEMCSKETEFKAILFSLCYFHAVVAERRKFGPQGWNRSYPFNVGDLTISVYVL 4162
            :.:.....:.:.|:: |....:|.:|:::.:.|:.|.|||||||.|||..|.||..|.:.||..:
  Rat  4263 LKRTFAGINQDLLDI-SNLPMWKPMLYTVAFLHSTVQERRKFGPLGWNIPYEFNSADFSASVQFI 4326

  Fly  4163 YNYL---EANTRVPWEDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRLCRTYLEEFMQPELIDGELEYCQGFPA 4224
            .|:|   :....|.|..:||:.||:.|||.:|||:|:||...:...:...::.:....:..|:..
  Rat  4327 QNHLDECDIKKGVSWSTVRYMIGEVQYGGRVTDDFDKRLLNCFARVWFSEKMFEPSFCFYTGYKI 4391

  Fly  4225 PGILKYTGYHNYIDDNLPS-ESPSLYGLHSNAEIGFLTTVSERLFRIVFELQPRMTGGSSGGETV 4288
            |.......|..|| .:||| ::|.::|||.||:|.:.:..:..:...:..:||:.:||.. ||| 
  Rat  4392 PVCKTLDQYFEYI-QSLPSLDNPEVFGLHPNADITYQSNTASDVLETITNIQPKESGGGM-GET- 4453

  Fly  4289 SQEDIIKNIIEDILDKTPTPFNILEL------MGRVEDRSPYIIVAFQECERMNNLMTELKRSLN 4347
             :|.|:..:.||:|.|.|..:...|:      ||.:...:   |...||.:||..:::.|:.|||
  Rat  4454 -REAIVYRLSEDMLSKLPPNYVAHEVKARLMKMGHLNSMN---IFLRQEIDRMQRVISLLRNSLN 4514

  Fly  4348 ELDLGLKGELTISSVMEDLMVCLYMDQVPEQWTKLAY-PSMLGLQSWFSDLMLRLRELEGWVADF 4411
            :|.|.::|.:.:|..:.|.:..:|..::|:.|.:::: .|.||.  ||::|:.|..:...|:.:.
  Rat  4515 DLKLAIEGTIIMSENLRDALDNMYDARIPQLWKRVSWDSSTLGF--WFTELLERNAQFSTWIFEG 4577

  Fly  4412 RMPSSIWLAGFFNPQSLLTAIMQQTARKNE-WPLDRMCLNCDVTKKWKEELTTAPREGAYINGLF 4475
            | |:..|:.||||||..|||:.|:..|.:: |.||.:.::.:|.::.|||:.|.|.||.||.||:
  Rat  4578 R-PNVFWMTGFFNPQGFLTAMRQEVTRAHKGWALDSVTIHNEVLRQTKEEIITPPVEGVYIYGLY 4641

  Fly  4476 MEGARWDMKMGTIADAFLKELFPAMPVLYIKAVTQDKQDIKNVYECPVY-KIRLRGPTFVWTFNL 4539
            |:||.||.:.|.:.::..|.||..:|||:|.|:.........:|.||:| |.|....||:....|
  Rat  4642 MDGASWDRRNGKLTESTPKVLFMQLPVLHIYAINSTAPKDPKLYVCPIYKKPRRTDLTFITVVYL 4706

  Fly  4540 KSRERASKWTLAGVCLL 4556
            ::......|.|.||.||
  Rat  4707 RTVLSPDHWILRGVALL 4723

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
kl-5NP_001015499.4 DHC_N1 198..763 CDD:462457 112/592 (19%)
DHC_N2 1365..1769 CDD:462462 104/412 (25%)
DYN1 1591..4206 CDD:227570 937/2732 (34%)
AAA_6 1903..2229 CDD:463697 180/335 (54%)
MT 3140..3480 CDD:463699 102/354 (29%)
AAA_9 3508..3726 CDD:463702 92/220 (42%)
Dynein_C 4261..4557 CDD:465677 100/305 (33%)
Dnah8NP_001414021.1 None

Return to query results.
Submit another query.