DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment kl-5 and Dnah1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001015499.4 Gene:kl-5 / 26067054 FlyBaseID:FBgn0267433 Length:4559 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001028827.2 Gene:Dnah1 / 171339 RGDID:621795 Length:4250 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4325 Identity:1351/4325 - (31%)
Similarity:2170/4325 - (50%) Gaps:522/4325 - (12%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   550 VIVDDFEEEIMCVKKEFINFKNVFTALGLNELPTDDCFPKVSGAISFLKKLRHRIIGLHKEHELY 614
            ||.:||:|.:     |..:.......|...:.|.....|||......|.....|.|.:.:..:.|
  Rat   125 VIPEDFQERV-----EQQSIGTTTRLLTQTDFPLQSYEPKVQVPFQVLPGRCPRKIEIERRKQQY 184

  Fly   615 EYPLFDNERGGYVSDIFNIMVQEIDDFTKMLLDKWTVECWQGIQQD--------ITLTLIEKDEA 671
                       ...||..::..|..|..|::.....::..|.|:|.        :.|.:.:.:|.
  Rat   185 -----------LRLDIEQLLANEGIDSNKLMPRHPDLQQPQTIEQGRDPLFPIYLPLKVFDNEEF 238

  Fly   672 NELRVNFTERLIFAL-------KDIKVVRLLGCD--------VSVNLTKFFCREDEL-WQARVKL 720
             :.|.. ||.|...|       |.:....||..|        .|..|...:|....| :....||
  Rat   239 -DCRTP-TEWLNMGLEPDAQYRKPVPGKALLPTDDALGHEDPKSQELDYRWCEVGVLDYDEEKKL 301

  Fly   721 MRIAEWYNDTFERAHPTEKR-LIAAEMIL-------IEEQMKPLLDFIKW-------------NA 764
            ..:.:           |:|| |:..||.:       ..|...||||...|             ..
  Rat   302 YLVQK-----------TDKRGLVRDEMGMPIVNGGVTPEGRPPLLDTQYWVPRIQLLFCAEDPRV 355

  Fly   765 FSQRFI-----------VMIFKMVKYL-----HDRLVAAQENLEAIKESIRSWGKVPLFQRKDLN 813
            |:||.:           ::::.:  |:     ..:.|..:::|..||:    |.......||  .
  Rat   356 FTQRVVQANALRKNTEALLLYNL--YVDCMPTEGQRVINEQSLSKIKQ----WALSTPRMRK--G 412

  Fly   814 PALLLHTDPREPILSIRAANAADTQRLIDLLMYVNL-------KLFFD-----IPRRYS---LPP 863
            |::|.|                    |..|...|||       |:.||     .|..:|   || 
  Rat   413 PSVLEH--------------------LSSLAREVNLDYERSMNKINFDQIVSSKPETFSFVTLP- 456

  Fly   864 GEHGEEDEESDGIWPPIISLSVMTSVKFKKKREVIDEEDDLEEFEEEQSESEEEIITP------- 921
                |::||.    .|...|..:....|::::         |:|......:..|:||.       
  Rat   457 ----EKEEEK----VPNQGLVSVPEYPFREQK---------EDFTFVSLLTRSEVITALSKVRAE 504

  Fly   922 ---------FH----RYELLKGLSQEERALFREYEIYVDEIIAENLVDSVITSSTYLRMEVDNRY 973
                     ||    :|..|:...|.:...|.:.::::.:.....|..::.:|...:.....|.|
  Rat   505 CNKVTSMSLFHSNLSKYSRLEEFEQIQSQTFSQVQMFLKDSWISTLKVAMRSSLRDMSKGWYNLY 569

  Fly   974 ENNTPIFEI-----FMELQEPNVVY-----FRNLDTSSKTGFAFFIE-------TILDDMN---- 1017
            |.|..::.:     .|||    :.|     .|.|...|...||.||.       ..:|||:    
  Rat   570 ETNWEVYLMSKLRKLMEL----IKYMLQDTLRFLVQDSLGSFAQFIGDACCSVLECIDDMDWGED 630

  Fly  1018 ----------NMMSLLKRVAQDPTEVTNMNPYSFYD----ELQDKSELDKQRVEIMNKIKLALQA 1068
                      |.:.::..|. |.|.|....|...::    .|.||..|....|..:.  ||.::.
  Rat   631 LINSPYKPRKNPLFIVDLVL-DNTGVHYSTPLEQFEVILLNLFDKGILATHAVPQLE--KLVMED 692

  Fly  1069 VRVHGKGFMEFSSLWIWDKSTYLSE--VKKFGRNLTLDERDAEADLEGSSGVKLLGLEYPPLSVY 1131
            :.:.|...:|         |..|.|  |::...|:|.....|..                ||..|
  Rat   693 IFISGDPLLE---------SVGLHEPLVEELRANITNAMHKAMI----------------PLQAY 732

  Fly  1132 KEQLDKFIELQDQ-----IRTWETY--------EDFFVFLR-------------------LNMTG 1164
            .::..|::||.:.     ::|::|.        |.....|:                   :|:..
  Rat   733 AKEYRKYLELNNNDISTFLKTYQTQCPSAEEVREVVITHLKEKEILDNSLPSSIIIGPFYINVDN 797

  Fly  1165 FKVAVLSQVGQWISLFKLDLINRVKNSLKELQDFVDE-ANIVLKIELQKDDFEGLVKILSVLNQI 1228
            .|.: ||:..:.::...||::  .||...|:....:| .:|..||..:.:..|.|.::...:..|
  Rat   798 VKQS-LSKKRKALATSMLDIL--AKNLHNEVDSICEEFRSISRKIYEKPNSIEELAELRDWMKGI 859

  Fly  1229 NEKQCIYDSMFDPLKEIIDLLRQYNYEFKDTELAQINELPDAWMKVKRLAAT---TKQLIAPIQS 1290
            .||..|.:.....:....:::.::.|..      ..::..|.|      ||.   ||.|      
  Rat   860 PEKLVILEERIVKVMSDYEVMDEFFYNL------TTDDFNDKW------AANNWPTKIL------ 906

  Fly  1291 YQVDLIE----------KRILLCDNMANTYRKKFLSKKFFFVPCLSCYELIDESDL--ELVALEE 1343
            .|:|::.          ::|.|.|.  |.:::|....:.......:..|:....::  |:..:::
  Rat   907 GQIDMVRQQHVEDEEKFRKIQLMDQ--NNFQEKLEGLQLVVAGFSTHVEIARAHEIANEVRRVKK 969

  Fly  1344 RQRSLAESAVLF----ELQGPDPVKIELCRFDLKLVKIMWDFA--ITIQSTINDWKK-------T 1395
            :.:...:.|:|:    .:.|     :.:..:| ||.:::.:|.  :.:.:|.:||.:       .
  Rat   970 QLKDCQQLAMLYNNRERIFG-----LPITNYD-KLSRMVKEFQPYLDLWTTASDWLRWSESWMND 1028

  Fly  1396 PWKKIDIENMDQECKKFGRELRGLDKAMRTWEPF-------IFMEASLKNLMTSLRAVTELQNPA 1453
            |...||.|.::   |......:.:.|.::.::..       :.:.|.:......:..:..|:||.
  Rat  1029 PLSAIDAEQLE---KNVIESFKTMHKCVKQFKDIPACQDVALDIRARIDEFKPYIPLIQGLRNPG 1090

  Fly  1454 IRDRHWIELMQTTKVKFSMDDSTTLKDLIDLNLHEYEEEVKNIVDKSVKEMAMEKQLRDIATAWG 1518
            :|:|||..|.....:......:.|....:::||.:|.|.:..:.:.:.||.|:|:.|..:...|.
  Rat  1091 MRNRHWEVLSNEININVRPKANLTFARCLEMNLQDYIESISKVAEVAGKEYAIEQALDKMEKEWA 1155

  Fly  1519 TMEFGTDIHDRTSIKLLKASEELIETLEDHQGQLQNMASSKYIAFFEHEVRLWQNRLSNADQIIG 1583
            ::.|....:..|...:||:.:|..:.|:||....|:|:.|.|...||..:..|:.:|....:::.
  Rat  1156 SILFNVLPYKETDTYILKSPDEASQLLDDHIVMTQSMSFSPYKKPFEQRINSWETKLKLTQEVLE 1220

  Fly  1584 SWFEVQRKWQYLESIFIGSEDIRSQLPEDSRRFDYIDKEFKALLAQMNADRNVVRSTNRSGSKLY 1648
            .|...||.|.|||.|| .||||..|||.:|:|:..:::.::.::.....:|.|:...  |..:|.
  Rat  1221 EWLNCQRSWLYLEPIF-SSEDITRQLPVESKRYQTMERIWRKIMKNAYENREVINVC--SDQRLL 1282

  Fly  1649 EHLEILLKMLLLCEKALNDYLETKRLSYPRFYFVSSADLLDILSNGNNPALVARHLTKLYDSMGK 1713
            :.|....|:|.|.:|.|::||||||.::|||||:|..:||:|||...:|..|..||.|.::::.:
  Rat  1283 DSLRDCNKLLDLVQKGLSEYLETKRTAFPRFYFLSDDELLEILSQTKDPTAVQPHLRKCFENIAR 1347

  Fly  1714 LNLISGSKNAAGMVAKELEEYVPFLENCDCSGKVEVWLNRITDKMRDTLRDQLKRSLTFYDHKPR 1778
            | |.........|.:.|.|| |....:...|..||.||..:...|:.::.|.::.::..|....|
  Rat  1348 L-LFQEDLEITHMYSAEGEE-VKLSFSIYPSSNVEDWLLEVERSMKASVHDIIEMAIKAYPTMLR 1410

  Fly  1779 HVWIFEWPAQPALVGTQIMWTTETNDAFAKVQQRYE-NALKDYNKKQIT-QLNNLIILLLGDLTA 1841
            ..|:..||.|..:.|.|..||.|       |.|..| :::......|:: ||::|:.|:.|.|:.
  Rat  1411 TEWVLSWPGQVTIAGCQTYWTLE-------VAQALEASSISSSLFPQLSKQLSDLVALVRGKLSR 1468

  Fly  1842 AERQKIMTICTIDVHSRDVVGTIIAKKVEVQTAFQWQSQLRHRWDPKIDDCFANICDAQFRYDYE 1906
            .:|..:..:..|:||::|||..:|.:.|.....|:|.||||:.|..  :|.:....:|:|.|.||
  Rat  1469 MQRMVLSALIVIEVHAKDVVSKLIDENVVSVHDFEWISQLRYYWTN--NDLYIRAVNAEFIYGYE 1531

  Fly  1907 YLGNTPRLVITPLTDRCYITLTQSLHLVMGGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALGMMVYVFNCSEQM 1971
            ||||:.||||||||||||:|||.:|||..||||||||||||||||||||:||.:...|||||:|:
  Rat  1532 YLGNSGRLVITPLTDRCYLTLTGALHLKFGGAPAGPAGTGKTETTKDLGKALAIQTVVFNCSDQL 1596

  Fly  1972 DYKSIGDIHKGLAQTGAWGCFDEFNRISVEVLSVVAVQVKCIQDAIKSKKQTFSFLGEHIALRTT 2036
            |:.::|...||||..|||.||||||||.:|||||||.|:..||.|.:.:.:.|.|.|..|.|..:
  Rat  1597 DFMAMGKFFKGLASAGAWACFDEFNRIDIEVLSVVAQQITTIQKAQQQRVERFMFEGVEIPLVPS 1661

  Fly  2037 VGVFITMNPGYAGRAELPENLKALYRPCAMVVPDFALISEIMLVAEGFQEARLLARKFITLYTLC 2101
            ..||||||||||||.|||:|||||:||.||:|||:|:|:||.|.:.||.||.:||:|..|.:.|.
  Rat  1662 CAVFITMNPGYAGRTELPDNLKALFRPVAMMVPDYAMIAEISLYSFGFNEANVLAKKITTTFKLS 1726

  Fly  2102 KELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGALRRDDRQRPEDQVLMRALRDFNIPKIVTDDVPVFMGLIG 2166
            .|.||.|||||:|:||:|:|:..||.|:|::....|:.:.:||:||.|:||.:.:|:.:|.|::.
  Rat  1727 SEQLSSQDHYDFGMRAVKTVISAAGNLKRENPTMNEELICLRAIRDVNVPKFLQEDLKLFSGIVS 1791

  Fly  2167 DLFPALDVPRKRNPEFEAVIKRSALDLKLQPEDGFILKIVQLEELFAVRHSVFIIGFAGTGKSEV 2231
            ||||............:..|:::.....|:..:||::|.:||.|...|||.:.::|..|:|||..
  Rat  1792 DLFPTTKEEETDYGILDQAIRKACEKNNLKDVEGFLIKCIQLYETTVVRHGLMLVGPTGSGKSNC 1856

  Fly  2232 WKTLNKTYQNQKRKP----------HYNDLNPKAVTNDELFGIVNPSTREWKDGLFSILMRDQAN 2286
            ::.|.....:.|.||          :|..||||::|..:|:|..:..|.||.||:|..|:|..|.
  Rat  1857 YRILAAAMTSLKGKPSISGGVYEAVNYYVLNPKSITMGQLYGEFDLLTHEWTDGIFPSLIRAGAI 1921

  Fly  2287 LGGTGPKWIVLDGDIDPMWIESLNTVMDDNKVLTLASNERIALTKEMRLLFEIASLRTATPATVS 2351
            ...|..||.:.||.:|.:|||::|||:||||.|.|:|.|.|.||:.|.::||:..|..|:|||||
  Rat  1922 ASDTNKKWYMFDGPVDAVWIENMNTVLDDNKKLCLSSGEIIKLTEAMTMMFEVQDLAVASPATVS 1986

  Fly  2352 RAGILYINPQDLGWTPFIQSWLGTRTN--SSEVSMLNVLFDKYVPPLLDIFRTRLRSITPISDIA 2414
            |.|::|:.|..||..||::.||....:  .........||.|::...:...||.::.:...::..
  Rat  1987 RCGMVYLEPSILGLMPFVECWLKHLPSIIKPYEEQFKTLFVKFLESSIAFVRTTVKEVVASTNSN 2051

  Fly  2415 RLQMTCYLLDSMLTP-------QNVPND----CPKDWYEIYFVFCIVWGFGSSLFQDQIIDWSN- 2467
            .......|||....|       :.:|::    .| :..|.:|:|.:||..|::      .|.|: 
  Rat  2052 LTMSLLKLLDCFFKPFLPREGLKKIPSEKLSHIP-ELIEPWFIFSLVWSVGAT------GDHSSR 2109

  Fly  2468 -EFSKW----FLNEYKAVKFPLSGTIFSFYI--------------DHETKK--FFPWTNLVPQFE 2511
             .||:|    .:.|...:.||..|.::.:.:              |.|:|:  :..|.:....|.
  Rat  2110 LNFSQWLKIKMVFEQIKLAFPEEGLVYDYRLDDAGISSTEDDDEDDEESKQVAWVKWMDYSVPFT 2174

  Fly  2512 LDMDLPLQSNLVNTAETTRLRFFMDTLIEADHPLMLIGPSGSGKTILMNAK-LSALPSDKYSVTN 2575
            :..|....:.:|.|.:|.::.:.:..||....|::.|||:|:|||:.::.| |..||.: |....
  Rat  2175 MMPDTNYCNIIVPTMDTMQMSYLLGMLITNHKPVLCIGPTGTGKTLTVSNKLLKNLPLE-YISHF 2238

  Fly  2576 VPFNFYTTSEMLQRILEKPLEKKAGRNYGPIGNKRMIYFVDDMNMPEVDKYFTVQPHTLIRQFMD 2640
            :.|:..|::...|.:::..|:|:....:||...:..|:|:||:|||.::.|....|..|:||:||
  Rat  2239 LTFSARTSANQTQDLIDSKLDKRRKGVFGPPLGRNFIFFIDDLNMPALETYGAQPPIELLRQWMD 2303

  Fly  2641 YHHWYDRQKM-TLRDIHKCNIVACMN-PSAGSFTIDPRLQRHF--CSF-AVNPPSQDALFHILNS 2700
            :..||||:.: ..:::...|.|..|. |..|...|.|||.|||  .|| .::..|:..:|.|   
  Rat  2304 HGGWYDRKIIGAFKNLVDINFVCAMGPPGGGRNAITPRLTRHFNYLSFIEMDEVSKKRIFSI--- 2365

  Fly  2701 ILSQHMD---------NPIQKFDKAVIKLCENMVTTAITLHLKVVSSFLPTAIKFHYNFNLRDIA 2756
            ||...||         .|:..... ::.:.|.:|...|:::..:.|..|||..|.||.|||||::
  Rat  2366 ILGCWMDGLLGEKSYREPVPGAPN-IVHMTEPLVNATISIYAIITSQLLPTPAKSHYTFNLRDLS 2429

  Fly  2757 NIFTGVLYSNSETCPNSNQMIRLWIHECYRVYGDKLVDYTDINSFKKIVSDIVRKGIEGVNDDVV 2821
            .:|.|:|.:......:..|::|||.||..||:.|:||:..|...|..:: ::..:.:....:.|.
  Rat  2430 KVFQGILMAEPAKVEDKVQLLRLWYHENCRVFRDRLVNEEDRGWFDGLL-EMKMEDLGVAFNKVC 2493

  Fly  2822 YAQPLIYCHFAKGLTDIK-YMPISGWDRLKSLLDEAQDRYNDYIGA-MNLVLFDDAMSHVCRISR 2884
            ..||::|..|....:|:| |..|:..:::..:::|..:.||....| :.||||.|||||:|||||
  Rat  2494 PFQPILYGDFMSPGSDVKSYELITSENKMMQVIEEYMEDYNQINTAKLKLVLFVDAMSHICRISR 2558

  Fly  2885 ILESSRGYALLIGVGGSGKQSLTRLASFISSLDVFQIQLTKDYSVSDLKANIATLYMKAGVKTSA 2949
            .|..:.|.|||:||||||:.|||||||.::..:.||::|:|:|.:|:.:.::..:.:|||::...
  Rat  2559 TLRQALGNALLLGVGGSGRSSLTRLASHMAEYECFQVELSKNYGMSEWREDVKKILLKAGMQNLP 2623

  Fly  2950 CCFLMTDSEVAREQFLVLVNDLLASGDIHELFPDDEVENIVNAVRNEVKQLGIVDNRENCWKYFI 3014
            ..||.:|:::..|.||..:|::|.||||..|:..||.:.|||.:|..:::.|:...:.|....:.
  Rat  2624 ITFLFSDTQIKNESFLEDINNILNSGDIPNLYSADEQDQIVNTMRPYIQEQGLQPTKANLMAAYT 2688

  Fly  3015 EKVRSLLKVVLCFSPVGATLRVRSRKFPALVNCTTIDWFHEWPQQALESVSLRFLSEITVL--PK 3077
            .:||:.:.:|||.||:|...|.|.|:||:||||.|||||:|||.:||:||:.|||.||..|  ..
  Rat  2689 GRVRNNIHMVLCMSPIGEVFRARLRQFPSLVNCCTIDWFNEWPAEALQSVATRFLHEIPELECSS 2753

  Fly  3078 ELALPVSNFMAFVHKTVNDISKLYLANAKRYNYTTPKSFLELIALYSKLLHEKVKANLDRRLRLE 3142
            |:...:.:...::|::|......|||...|:||.||||:|||:.::|.|:.:|.......:.|::
  Rat  2754 EVIEGLIHVCVYIHQSVAKKCVEYLAELARHNYVTPKSYLELLNIFSILIGQKKMELKTAKHRMK 2818

  Fly  3143 NGLIKLASCTKEVDALQDVLKVQEVELKIKNQEA--DNLIIVVGTENEKVSKERAFASKEEKNVR 3205
            :||.||...:::|..:|:.|::....|    :||  |.|:.:     :::..:.|.|.:..|:| 
  Rat  2819 SGLDKLLRTSEDVAKMQEELEIMRPLL----EEAAKDTLLTM-----DQIKVDTAIAEETRKSV- 2873

  Fly  3206 QIEE----DVTAKAKLCEEDFLK----AQPALIAAQEALNTLNKNNLTELKSFGSPPDAVVSVCG 3262
            |.||    :..:||:...:|..|    |.|||.||..:|..||||::||:::...||..|..|..
  Rat  2874 QAEEIKANEKASKAQAIADDAQKDLDEALPALDAALASLRNLNKNDVTEVRAMQRPPPGVKLVIE 2938

  Fly  3263 AVLVLFSSKGKIPK-----------DRSWKACRAFMGNVDKFLDNLINYDKKHIHPDVIKALQPY 3316
            ||.::   ||..||           |..|:..:..:.:..:||::|..:||.:|...||||:|||
  Rat  2939 AVCIM---KGIKPKKVPGEKPGSKVDDYWEPGKGLLQDPGRFLESLFKFDKDNIGEAVIKAIQPY 3000

  Fly  3317 ILDAEFSPEKILAKSSAAAGLCSWVININRFYDVYLVVEPKERALLESEKEVKDARDKLTALNLR 3381
            |.:.||.|..|...|.|...:|.||..:::::.|...||||.:||.|::.:::..:..|......
  Rat  3001 IDNEEFQPAAIAKVSKACTSICQWVRAMHKYHFVAKAVEPKRQALREAQDDLEVTQRILEEAKHH 3065

  Fly  3382 LTELEEQLNALQMEYDEALAKKQKCQDEASKTAFTIDIANRLIGGLATEKIRWMESVKVLTFGIQ 3446
            |.|:|:.::.||.:|.|.:.||::.:.:..:....:..|::||.|||.||:||.::|:.|...:.
  Rat  3066 LREVEDGISTLQAKYRECVTKKEELEMKCEQCEQRLGRADKLINGLADEKVRWQDTVENLENMLD 3130

  Fly  3447 QLPGDILIISCFISYVGCFTRAYRQELQEKLWMPAF------KNSQPPIPSTDGVDPFEMICDDA 3505
            .:.||:|:.:.|::|:|.||..||..|.| .|:...      ..|:|.:.||.|        :..
  Rat  3131 NIFGDVLVAAGFVAYLGPFTGQYRAALYE-YWVNQLTVYGVPHTSKPTLISTLG--------NPV 3186

  Fly  3506 QIAEWNNQGLPSDRMSAENAAILVQSERYPLMIDPQLQGIKWVKT-KYGTGLVVLRLSQRNYLDQ 3569
            :|..|...|||:|.:|.||..|...|:|:...||||.|..||:|. :..:||.|.:||.|::|..
  Rat  3187 KIRSWQIAGLPNDTLSVENGVINQFSQRWTHFIDPQGQANKWIKNMEKESGLDVFKLSDRDFLRS 3251

  Fly  3570 VERAVSNGSVLLIENIGENIDPVLNPLLGRQLIKK--GTVLKIGDREIDFNSRFRLILHTKLANP 3632
            :|.|:..|...|:||:||.:||.|.|:|.:|..|:  .||||:||..|.::..||:.:.|||.||
  Rat  3252 MENAIRFGKPCLLENVGEELDPALEPVLLKQTYKQQGNTVLKLGDTVIPYHEDFRMYITTKLPNP 3316

  Fly  3633 HYKPEMQAQTTLINFTVTRDGLEDQLLAEVVKVERPDLEAMRTRLTQQQNHFKITLKFLEDDLLA 3697
            ||.||:..:.||||||::..|||||||.:||..||||||..:.:|.......:..||.:||.:|.
  Rat  3317 HYSPEVSTKLTLINFTLSPSGLEDQLLGQVVAEERPDLEEAKNQLIISNAKMRQELKDIEDQILY 3381

  Fly  3698 RLSSAGDNVLEDVTLVMNLEKTKKTADEIEVKVAEAKITGVQIDSAREAYRPAAERASIIYFILN 3762
            ||||:..|.::||.|:..||.:|..|.||:.||..|:.|...||..|..|.|.|.|..|::|.::
  Rat  3382 RLSSSEGNPVDDVELIKVLEASKMKAAEIQAKVRIAEQTEKDIDLTRMEYIPVAVRTQILFFCVS 3446

  Fly  3763 DLFKINPIYQFSLKAFTVVFNNAMLKAMAAEKLKDRVENLIDSITFCSFVYTSRGLFEQDKLIFL 3827
            ||..::|:||:||:.|..:|.:.:..:..|:.||.|:.|:...:||..:....|.|||:.||:|.
  Rat  3447 DLANVDPMYQYSLEWFLNIFLSGIANSERADNLKKRIVNINRYLTFSLYSNVCRSLFEKHKLMFA 3511

  Fly  3828 TQLCIQILVNLGEVEPTELDFLLRFPYMPNQTSNFT--WLTHVGWGGIRALNNQAVFKGLEKDIE 3890
            ..||::|::|.|::...|..:||....:...:.|..  ||:...|..|.||:|...|.....|..
  Rat  3512 FLLCVRIMMNEGKINQGEWRYLLSGGSIQTMSENPAPHWLSDRAWRDILALSNLPAFSTFSTDFV 3576

  Fly  3891 GSHKRWKKFVDSESPENEKFPGEWKG-KSAIQRLCIMRCIRPDRMSYAMRSFIEEKLGSKYIDAR 3954
            ....:::...||..|..|..||.|.. ....|:|.|:||:|.|:::.||:.|:...|..::|:.:
  Rat  3577 QHLPKFQAIFDSAEPHREPLPGIWNTYLDEFQKLLILRCLRGDKVTNAMQDFVANHLEPRFIEPQ 3641

  Fly  3955 SMEFSRTFEESSPETHIFFVLSPGVDPLKDVEKLGKSLGFSFDHENFHSVSLGQGQEIVAENAIE 4019
            :...|..|:||:..|.:.||||||.||..|:.|..:.:.||   :...::||||||...||..:.
  Rat  3642 TANLSAVFKESNSTTPLIFVLSPGTDPAADLYKFAEEMKFS---KKLSAISLGQGQGPRAEAMMR 3703

  Fly  4020 IASQYGHWVILQNIHLVARWLPSLEKKMES-SLSNVHTSYRLFLSAEPAGDPAAHILPQGILESA 4083
            .:.:.|.||..||.||...|:|:||:.:|. :...||..:||:|::.|:..     .|..||::.
  Rat  3704 NSIERGKWVFFQNCHLAPSWMPALERLIEHINPDKVHRDFRLWLTSLPSNK-----FPVSILQNG 3763

  Fly  4084 IKITNEPPTGMMANIHKALDNFSDETLEMCSKETEFKAILFSLCYFHAVVAERRKFGPQGWNRSY 4148
            .|:|.|||.|:.||:.|:.::.||:.|..|.|..|||::|.|||.||....|||||||.|:|..|
  Rat  3764 SKMTIEPPRGVKANLLKSYNSLSDDFLHSCQKVVEFKSLLLSLCLFHGNALERRKFGPLGFNIPY 3828

  Fly  4149 PFNVGDLTISVYVLYNYLEANTRVPWEDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRLCRTYLEEFMQPELID 4213
            .|..|||.|.:..|..:|:....:|::.|:|..|||.|||.:|||||||.....||:|..|.::.
  Rat  3829 EFTDGDLRICISQLKMFLDEYEDIPYKVLKYTAGEINYGGRVTDDWDRRCVMNILEDFYNPAVLS 3893

  Fly  4214 GELEYCQG---FPAPGILKYTGYHNYIDDNLP-SESPSLYGLHSNAEIGFLTTVSERLFRIVFEL 4274
            .|..|.:.   ...|......||.:|| .:|| ::.|.::|||.||.|.|....:..||..:.:|
  Rat  3894 PEHRYSKSGIYHQIPPTYDLNGYLSYI-KSLPLNDMPEIFGLHDNANITFAQNETFALFGAILQL 3957

  Fly  4275 QPRMTGGSSGGETVSQEDIIKNIIEDILDKTPTPFNILELMGR----VEDRSPYIIVAFQECERM 4335
            ||:  ..|.||:  |:|::::::.||||.:.|.|.::.|::.:    .|:....::|  ||..|.
  Rat  3958 QPK--SSSMGGQ--SREELVEDVAEDILVQVPKPVDLEEVVNKYPVLYEESMNTVLV--QEVIRY 4016

  Fly  4336 NNLMTELKRSLNELDLGLKGELTISSVMEDLMVCLYMDQVPEQWTKLAYPSMLGLQSWFSDLMLR 4400
            |.|:..:.::|:::...:||.:.:|..:|.:...||.:.|||.|...||||:..|.||..||:.|
  Rat  4017 NKLLMVITQTLSDMLKAIKGLVVMSLELELMSTSLYNNAVPELWKSKAYPSLKPLASWIMDLLQR 4081

  Fly  4401 LRELEGWVADFRMPSSIWLAGFFNPQSLLTAIMQQTARKNEWPLDRMCLNCDVTKKWKEELTTAP 4465
            |..|..|:.: .:||..|::|||.||:.||..:|..|||....:|.:..:..|......|:...|
  Rat  4082 LNFLHSWIKN-GIPSVFWISGFFFPQAFLTGTLQNFARKFVISIDTITFDFKVLSYASSEIAERP 4145

  Fly  4466 REGAYINGLFMEGARWDMKMGTIADAFLKELFPAMPVLYIKAVTQDKQDIKNVYECPVYKIRLRG 4530
            ..|.||.|||:||||||.....:|::..|||:..|.|:::..|...|...::.|.||:||...|.
  Rat  4146 STGCYIYGLFLEGARWDPFDFQLAESRPKELYTEMAVIWLLPVANRKVQNQDFYLCPIYKTLTRA 4210

  Fly  4531 PT---------FVWTFNLKSRERASKWTLAGVCLL 4556
            .|         :|....:.|.:....|...||.|:
  Rat  4211 GTLSTTGHSTNYVIAVEIPSNQPQRHWIKRGVALI 4245

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
kl-5NP_001015499.4 DHC_N1 198..763 CDD:462457 52/257 (20%)
DHC_N2 1365..1769 CDD:462462 113/419 (27%)
DYN1 1591..4206 CDD:227570 995/2714 (37%)
AAA_6 1903..2229 CDD:463697 173/325 (53%)
MT 3140..3480 CDD:463699 115/360 (32%)
AAA_9 3508..3726 CDD:463702 98/220 (45%)
Dynein_C 4261..4557 CDD:465677 99/309 (32%)
Dnah1NP_001028827.2 DHC_N2 998..1401 CDD:462462 111/410 (27%)
DYN1 <1237..3883 CDD:227570 987/2701 (37%)
AAA_6 1528..1854 CDD:463697 173/325 (53%)
Dynein_C 3944..4246 CDD:465677 99/309 (32%)

Return to query results.
Submit another query.