DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment kl-5 and Dnah6

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001015499.4 Gene:kl-5 / 26067054 FlyBaseID:FBgn0267433 Length:4559 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038964640.1 Gene:Dnah6 / 117250 RGDID:621797 Length:4156 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4468 Identity:1365/4468 - (30%)
Similarity:2221/4468 - (49%) Gaps:656/4468 - (14%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   432 LEEL-KDLFNTVRDFQKLEKIVMGGLKGRQITFALEKILEEYNSIYRE----WTNIQYNPIDPDA 491
            :|.| ||.|.....||..|..:  .||..:.......:|...|.|..:    :.:::.|  :|:.
  Rat     1 MESLRKDGFRIRMAFQGTENEI--DLKSMENQEEENPVLTRLNKIRAKGVLNYASLKEN--EPEP 61

  Fly   492 ENSLFQRDRLSFKAKTDVMERMVSFQFEKGLEDTHDLLLAGSLLLRPIIK---KHVEPLMHVIVD 553
            :..:|   |.:.||:....:|....:.|.                .|::|   .|.:|  ..|.:
  Rat    62 QTLVF---RHTTKAQEKTRKRQQPVKLEP----------------LPVLKLYQDHKQP--EYIYE 105

  Fly   554 DFEEEIM----------CVKKEFINFKNVFTALGLNEL--PTDDCF-------PKVSGAISFLKK 599
            ...:::|          .:::..|.......||...::  |:.|.|       |:.|.....|..
  Rat   106 QNRQQLMSTGILKPSPSMIERSSIGSLEAQEALKRKQVLRPSADVFSLSPSKLPRTSIGRRGLFG 170

  Fly   600 LRH-----------------------RIIGLHKEHE----LYEYPLFDNERGGYVSDIFNIMVQE 637
            :|.                       :||.:..|:|    ||..|........|  |.:|:.|..
  Rat   171 MRSSTYPKYTFNDREEVVKANIRDPLQIIKIVHENEHLGFLYMIPAVPKSSIEY--DTYNLKVVS 233

  Fly   638 IDDFTKMLLDKWTVE---CWQGIQQDITLTLIEKDEANEL-RVNFTERLIFAL-----------K 687
            .::..|.  |.:|:.   .......||.....|:.|...| ....|:..||:|           |
  Rat   234 YENINKN--DYYTISKDAVTHVFNDDIEYIETERWEQEYLYHRELTKIPIFSLFRKWKAFSVWRK 296

  Fly   688 DIKVVRLLGCDVSVNLTKFFCREDELWQARVKLMRIAEW-YNDTF------ERAHP-TEKRLIAA 744
            :::..::.||..::....|....    ..|..|::|.:. |..:|      |:.|. |.:...||
  Rat   297 NVRSKKITGCRKALRKNLFIVNP----YLRPALLKINDMCYQLSFMGLCYIEKFHTYTLQEFKAA 357

  Fly   745 EMILIEEQMKPLLDFIKWNAFSQRFIVMIFKMVKYLHDRLVAAQENLEAIKESIRSWGKVPLFQR 809
            :::.::|..:.|..|        ||                   |..:.:::|.|          
  Rat   358 QVVRVQEVTERLEYF--------RF-------------------EAKDVVRKSCR---------- 385

  Fly   810 KDLNPALLLHTDPREPILSIRAANAADTQRLIDL---LMYVNLKLFFDIPRRYSLPPGEHGEED- 870
                             .::|||........::.   ...:|:..|.|.|.  .||  .:||.: 
  Rat   386 -----------------FALRAAGFIPDDCEVETHEDYFKINIASFIDAPS--DLP--TYGESEK 429

  Fly   871 ----EESDG-----------------IWPPIISLSVMT--------SVKFKK--KREVIDE---E 901
                |::..                 |...:..|:|.|        |.|.|:  ..:||.:   |
  Rat   430 MTYTEQASKRHHCMRLTCFIRLNDYLIQNTLHVLTVNTASSLLNYLSDKLKRTPSADVIQKWITE 494

  Fly   902 DDLEEFEEE-----QSESEEEIITPFHRYELLKGLSQEERALFREYEIYVDEIIAENLVDSVITS 961
            |..|..|::     :.:.|:|.:.|....||:..:   :..||        |...|:.:|.:   
  Rat   495 DKPEVIEKKGAPMMEKQEEDESLIPMFLTELILTV---QSLLF--------EPSLEDFLDGI--- 545

  Fly   962 STYLRMEVDNRYENNTPIFEIFMELQEPNVV---YFR-------NLDTSSKT-GFAFFIETILDD 1015
                 ..:.|.:||..        |..||:|   ||.       |.....|| |....:..:.:|
  Rat   546 -----SGIINHFENTV--------LSVPNLVPDSYFNAFTSPFINKKVEEKTCGPGPSLSAVFED 597

  Fly  1016 MNNMMSLLKRVAQDPTEVTNMNPYSFYDELQ-DKSELDKQRVEIMNKIKLALQAVRVHGKGFMEF 1079
            ..|.:::::::.:        ..:|.:|..: ..:..:|.::.......|.|:|::........|
  Rat   598 DRNFLTIIQQIKE--------TIHSAFDSARLYAATFEKFQIFFKENESLDLEALKEEEPDVEFF 654

  Fly  1080 SS-LWIWDKSTYLSEVKKFGRN---LTLDERDAEADLEGS--SGVKLLGLEYPPLSVYKEQLDKF 1138
            || |..:.|....|...|..||   |.:|.:..:..|..|  ..:::|.|..|.||  |:::|..
  Rat   655 SSQLEKYHKQHKDSVALKPTRNVGLLLIDTKQLKEKLIPSPLRCLEVLNLMLPRLS--KKKVDAI 717

  Fly  1139 I----------------------------ELQDQIRTWETY--------------------EDFF 1155
            |                            |:|::|.|.|..                    |||.
  Rat   718 ISEAQDAEYKLEFVPTTTIEYVNSLVFLDEIQERIETLEEEGNTVVQMYKLIEQYQVLTPPEDFA 782

  Fly  1156 VF--LRLNMTGFKVAVLSQVGQWISLFKLDLINRVKNSLKELQDFVDEANIVLKIELQKDDFEGL 1218
            ||  ::.::|..:.|:...||        |..:.:|.....|...:::.|               
  Rat   783 VFATMKPSITAVRNAIDKSVG--------DRESSIKQFCLHLGRDLEDLN--------------- 824

  Fly  1219 VKILSVLNQINEKQCIYDSMFDPLKEIIDLLRQYNYEFKDTELAQINELPDAWMKVKRLAATTKQ 1283
                   |::||               :.||.|      |.::..|:..|:   |:       |.
  Rat   825 -------NEVNE---------------VKLLAQ------DPQILDISADPE---KI-------KT 851

  Fly  1284 LIAPIQSYQVDLIEKRILLCDNMANTYRKKFLSKKFFFVPCLSCYELIDESDLELVALEERQRSL 1348
            :::.:||. :|.::||..    ...:|:|.|                                  
  Rat   852 MLSDLQSV-LDDLQKRAF----QYKSYQKNF---------------------------------- 877

  Fly  1349 AESAVLFELQGPDPVKIELCRFD--------LKLVKIMWDFAITIQSTINDWKKTPWKKIDIENM 1405
                           |:|:.:||        |:|.:::||..........:|.|:.:..:|.|.:
  Rat   878 ---------------KVEVSKFDALEEVCAELRLKQLLWDSLSEWDKLQQEWLKSKFDCLDPEVL 927

  Fly  1406 DQECKKFGRELRGLDKAMRTWEPFIFMEASLKNLMTSLRAVTELQNPAIRDRHWIELMQTT-KVK 1469
            :.:..|:.:.:..|:|.:........::..::.:...|..:.:|:||.::.|||..:.||. .:.
  Rat   928 NGQVTKYAKFVTQLEKGLPPNSVVPQLKQKVERMKEKLPVINDLRNPTLKPRHWSAIEQTVDALL 992

  Fly  1470 FSMDDSTTLKDLIDLNLHEYEEEVKNIVDKSVKEMAMEKQLRDIATAWGTMEFGTDIH-DRTSIK 1533
            ..::...||:.|.:|::.::.:|:::|..::..|.|:|..|:.:..:|.|.||....| |...:.
  Rat   993 VDIEIPLTLERLSELHVFDFAQEIQDISGQASGEAALEIILKKVEDSWKTTEFVILPHRDSKDVF 1057

  Fly  1534 LLKASEELIETLEDHQGQLQNMASSKYIAFFEHEVRLWQNRLSNADQIIGSWFEVQRKWQYLESI 1598
            :|..::::...|:|....:..:|||:|:...:..|..||.:||..:|.:..|...||.|.|||||
  Rat  1058 ILGGTDDIQVLLDDSTINVATIASSRYVGPLKTRVDDWQKQLSLFNQTLEEWLNCQRNWLYLESI 1122

  Fly  1599 FIGSEDIRSQLPEDSRRFDYIDKEFKALLAQMNADRNVVRSTNRSG-SKLYEHLEILLKMLLLCE 1662
            | .:.||:.|||.:::.|..:||.:|.::.::|...|.:|:..:.| .:.:::...||..:   :
  Rat  1123 F-NAPDIQRQLPAEAKMFLQVDKSWKEIMRKVNRLPNALRAATQPGLLETFQNNNALLDQI---Q 1183

  Fly  1663 KALNDYLETKRLSYPRFYFVSSADLLDILSNGNNPALVARHLTKLYDSMGKLNL---------IS 1718
            |.|..|||:||:.:|||||:|:.:||:||:...||..|..||.|.:||:.||..         |.
  Rat  1184 KCLEAYLESKRVIFPRFYFLSNDELLEILAQTRNPQAVQPHLRKCFDSISKLEFALMPPTEGKIP 1248

  Fly  1719 G---------SKNAAGMVAKELEEYVPFLENCDCSGKVEVWLNRITDKMRDTLRDQLKRSLTFYD 1774
            |         :.:...|::.| .|.|...:.....|.||.||.::.:.|..:||...|.::..|.
  Rat  1249 GIDTEPEKVFTNDILAMLSPE-GERVGLGKGLKARGNVEEWLGKVEEAMFSSLRRLCKAAIADYQ 1312

  Fly  1775 HKPRHVWIFE-WPAQPALVGTQIMWTTETNDAFAKVQQRYENALKDYNKKQITQLNNLIILLLGD 1838
            .|.|..|:.. .|:|..|..:||||..:..::. :.:..:..||:.:.:....:||.|..::.|.
  Rat  1313 GKLRTEWVIAGHPSQVILTISQIMWCRDLTESL-ECEDNHLEALEKFEQVNFERLNALAAIVRGS 1376

  Fly  1839 LTAAERQKIMTICTIDVHSRDVVGTIIAKKVEVQTAFQWQSQLRHRWDPKIDDCFANICDAQFRY 1903
            |....|..|..:.|||||:||:|..::..||:...:|.||.|||:.||..:|:|.|.:..:|:.|
  Rat  1377 LPKLHRNIITALITIDVHARDIVSELVQSKVDSAESFDWQRQLRYYWDVDLDNCVARMALSQYTY 1441

  Fly  1904 DYEYLGNTPRLVITPLTDRCYITLTQSLHLVMGGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALGMMVYVFNCS 1968
            .|||||..|||||||||||||:.|..:|.|.:|||||||||||||||||||.:||.:...|||||
  Rat  1442 AYEYLGACPRLVITPLTDRCYLCLMGALQLDLGGAPAGPAGTGKTETTKDLAKALAIQCVVFNCS 1506

  Fly  1969 EQMDYKSIGDIHKGLAQTGAWGCFDEFNRISVEVLSVVAVQVKCIQDAIKSKKQTFSFLGEHIAL 2033
            :.:|||.:|....||||:|||.||||||||.:|||||:|.|:..|::|..:|...|.|.|..|.|
  Rat  1507 DGLDYKMMGRFFSGLAQSGAWCCFDEFNRIDIEVLSVIAQQLITIRNAKAAKLSRFMFEGREIKL 1571

  Fly  2034 RTTVGVFITMNPGYAGRAELPENLKALYRPCAMVVPDFALISEIMLVAEGFQEARLLARKFITLY 2098
            ..|...|||||||||||.|||:|||||:||.||:||::|||:|::|.:|||:.:::||||...:|
  Rat  1572 VMTCAAFITMNPGYAGRTELPDNLKALFRPMAMMVPNYALIAEVILYSEGFESSKILARKMTQMY 1636

  Fly  2099 TLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGALRRDDRQRPEDQVLMRALRDFNIPKIVTDDVPVFMG 2163
            .||.|.||:|||||:|:||:|||||:||:|:|::....||.||:|||||.|:||.:|||..:|.|
  Rat  1637 KLCSEQLSQQDHYDFGMRAVKSVLVMAGSLKRENPDLSEDVVLIRALRDSNLPKFLTDDALLFSG 1701

  Fly  2164 LIGDLFPALDVPRKRNPEFEAVIKRSALDLKLQPEDGFILKIVQLEELFAVRHSVFIIGFAGTGK 2228
            :|.||||.:.:|........:.|....:...||||...:.|::||.|...|||.|.::|..|.||
  Rat  1702 IISDLFPGVQIPEHDYGILHSTIVDVMISQNLQPEICMVKKVIQLYETMLVRHGVMLVGPTGGGK 1766

  Fly  2229 SEVWKTLNKTYQNQKR----KPHYND-----LNPKAVTNDELFGIVNPSTREWKDGLFSILMRDQ 2284
            :.|::.|.:|..|.::    .|.|..     ||||::|..||:|.||..|.||||||.::.:|..
  Rat  1767 TTVYQVLAETLGNLEKLNTGNPFYQPVKTFVLNPKSITMGELYGEVNNVTLEWKDGLMALSVRAA 1831

  Fly  2285 ANLGGTGPKWIVLDGDIDPMWIESLNTVMDDNKVLTLASNERIALTKEMRLLFEIASLRTATPAT 2349
            .|......|||:.||.:|.:|||::|||:||||:|.||::|||.||.::.:|||:..|:.|:|||
  Rat  1832 VNDTSEDHKWIISDGPVDALWIENMNTVLDDNKMLCLANSERIKLTPQVHMLFEVQDLKVASPAT 1896

  Fly  2350 VSRAGILYINPQDLGWTPFIQSWLGTRTN--SSEVS--MLNVLFDKYVPPLLDIFRTRLRSITPI 2410
            |||.|:::::|::|.|.|::::|:.|.:.  |.|:.  :|| ||::||...|.....:.....|.
  Rat  1897 VSRCGMVFVDPEELKWMPYVKTWMSTLSKKLSEEIREYLLN-LFNRYVDDGLRFVNKKCTQAIPQ 1960

  Fly  2411 SDIARLQMTCYLLDSMLTPQNVPNDCPKDWYEI------YFVFCIVWGFGSSLFQDQIIDWS--N 2467
            .||:::...|.||:|:|..:: .|....:..::      .||||.:|..|.:|.::.   |.  :
  Rat  1961 VDISKVTTLCCLLESLLLSKD-GNILSLEQMKLNTVVCQTFVFCYLWSLGGNLTENH---WDSFD 2021

  Fly  2468 EFSKWFLNEYKAVKFPLSGTIFSFYIDHETKKFFPWTNLVPQFELDMDLPLQSNLVNTAETTRLR 2532
            .|.:...::....:.|.||.::|.::|.:||:..||..::|.|:...::|....||.||:|.|..
  Rat  2022 TFIRTQFDDNPDARLPSSGDLWSIHVDFDTKRLDPWERIIPTFKYSREVPFFEMLVPTADTVRYG 2086

  Fly  2533 FFMDTLIEADHPLMLIGPSGSGKTILMNAKLSAL-PSDKYSVTNVPFNFYTTSEMLQRILEKPLE 2596
            :.|:.|:...|.::..|.:|.||:::....|:.: .|..|....:.|:..|:|...|.|:|..||
  Rat  2087 YLMEKLLAVRHSVLFTGTTGVGKSVIAKGLLNRIQESAGYVPVYLNFSAQTSSARTQEIIESKLE 2151

  Fly  2597 KKAGRNYGPIGNKRMIYFVDDMNMPEVDKYFTVQPHTLIRQFMDYHHWYDRQKMTLRDIHKCNIV 2661
            :|.....|..|||:::.||||:|||.:|:|.:..|..|:||:.|:..:|||.|:..::|....||
  Rat  2152 RKRKNILGAPGNKQVVIFVDDLNMPRLDRYGSQPPIELLRQYQDFGGFYDRNKLFWKEIQDVTIV 2216

  Fly  2662 -ACMNPSAGSFTIDPRLQRHFCSFAVNPPSQDALFHILNSILSQHMDNPIQKFDKAVIKLCENMV 2725
             ||..|..|...:.||..|||....:..||:.:|..|..:||:..:.:    |.:||.:...|:|
  Rat  2217 SACAPPGGGRNPVTPRFIRHFSMLCLPMPSEHSLKQIFQAILNGFLAD----FTEAVKQTSSNIV 2277

  Fly  2726 TTAITLHLKVVSSFLPTAIKFHYNFNLRDIANIFTGVLYSNSETCPNSNQMIRLWIHECYRVYGD 2790
            ..|:.::.::....|||..|.||.|||||::....|:|..:..|.....|:.||:.|||.||:.|
  Rat  2278 EAAVEIYNRMSVDLLPTPAKSHYVFNLRDLSKCVQGILQCDPGTIREEMQIFRLFCHECQRVFHD 2342

  Fly  2791 KLVDYTDINSFKKIVSDIVRKGIEGVNDDVVY--AQPLIYCHFAK---GLTDIKYMPISGWDRLK 2850
            :|::..|.:.|..|::::..|.. |:..|:.|  ::|:|:..|.|   ...|..|..:...::::
  Rat  2343 RLINNEDKHYFHVILTEMANKHF-GIAIDLEYFLSKPIIFGDFIKFGADKADRIYDDLPDIEKIE 2406

  Fly  2851 SLLDEAQDRYN-DYIGAMNLVLFDDAMSHVCRISRILESSRGYALLIGVGGSGKQSLTRLASFIS 2914
            ::|.:..|.|| .....:.||.|.||:.||.||:|::...||.|||:||||:|||||||||:.|.
  Rat  2407 NVLQDYLDDYNLTNPKEVKLVFFQDAIEHVSRIARMIRQERGNALLVGVGGTGKQSLTRLAAHIC 2471

  Fly  2915 SLDVFQIQLTKDYSVSDLKANIATLYMKAGVKTSACCFLMTDSEVAREQFLVLVNDLLASGDIHE 2979
            .....||:|::.|:......::..||..|||:.....||.||:::..|:||..:|::|.||::..
  Rat  2472 GYKCLQIELSRGYNYDSFHEDLRKLYKMAGVEDKNMVFLFTDTQIVVEEFLEDINNILNSGEVPN 2536

  Fly  2980 LFPDDEVENIVNAVRNEVKQLGIVD-NRENCWKYFIEKVRSLLKVVLCFSPVGATLRVRSRKFPA 3043
            ||..||:|.::.|.|.:.|::||.: ||:..::|||.:||..|.:|||.||||...|.|.|.||:
  Rat  2537 LFEKDELEQVLAATRPKAKEVGISEGNRDEVFQYFISRVRQKLHIVLCMSPVGEAFRSRCRMFPS 2601

  Fly  3044 LVNCTTIDWFHEWPQQALESVSLRFLSEITVLPKELALPVSNFMAFVHKTVNDISKLYLANAKRY 3108
            ||||.|||||.:||::||.|||..|.|.:....:||...:|.....||.:|:.::..|.:..:|.
  Rat  2602 LVNCCTIDWFVQWPREALLSVSKSFFSVVDTGNEELKEKLSLMCVNVHLSVSHMADRYYSELRRR 2666

  Fly  3109 NYTTPKSFLELIALYSKLLHEKVKANLDRRLRLENGLIKLASCTKEVD-------ALQDVL--KV 3164
            .||||.|:||||.||..:|.||.|..:..|.|:.|||.||......||       ||:.||  |.
  Rat  2667 YYTTPTSYLELINLYLTMLTEKRKQLVSARDRVTNGLTKLLETNILVDKMKLDLSALEPVLFQKS 2731

  Fly  3165 QEVE-----LKIKNQEADNLIIVVGTENEKVSKERAFASKEEKNVRQIEEDVTAKAKLCEEDFLK 3224
            |:||     |.:..:.||.:..|| .|:|.::|.:|             |:..|.|...:.|..:
  Rat  2732 QDVEALMEKLVVDQESADQVRNVV-QEDEAIAKVKA-------------EETQAIADDAQRDLEE 2782

  Fly  3225 AQPALIAAQEALNTLNKNNLTELKSFGSPPDAVVSVCGAVLVLFSSKGKIPKDRSWKACRAFMGN 3289
            |.|||.||.:||::|:|.:::|::.|..|||.|::|..|:.:|.::|      ..|...:..:|:
  Rat  2783 ALPALEAANKALDSLDKADISEIRVFTKPPDLVMTVMEAISILLNAK------PDWPTAKQLLGD 2841

  Fly  3290 VDKFLDNLINYDKKHIHPDVIKALQPYILDAEFSPEKILAKSSAAAGLCSWVININRFYDVYLVV 3354
             ..||..|:.|||::|.|.::..||.||.:.:|.|||:...|.|...:|.||..::.:..|...|
  Rat  2842 -SNFLRRLLEYDKENIKPQILSKLQRYINNPDFVPEKVEKVSKACKSMCMWVRAMDLYSRVVKEV 2905

  Fly  3355 EPKERALLESEKEVKDARDKLTALNLRLTELEEQLNALQMEYDEALAKKQKCQDEASKTAFTIDI 3419
            |||.:.|..::.|:......|......|.::|||:.|||.|||:.:.:|:......:.|...:..
  Rat  2906 EPKRQKLRAAQAELDATITTLKEKQALLKQVEEQIRALQEEYDKGVNEKESLAKTMALTKARLVR 2970

  Fly  3420 ANRLIGGLATEKIRWMESVKVLTFGIQQLPGDILIISCFISYVGCFTRAYRQELQEKLWMPAFKN 3484
            |.:|...|..|::||.||::.....|..:.|::.|.:..::|.|.||..|||.|.| .|:.:...
  Rat  2971 AGKLTAALGDEQVRWEESIEKFQEEIANIVGNVFIAAACVAYYGAFTAQYRQLLIE-CWIDSCLA 3034

  Fly  3485 SQPPI-PSTDGV----DPFEMICDDAQIAEWNNQGLPSDRMSAENAAILVQSERYPLMIDPQLQG 3544
            ...|| ||...:    ||:|       |.:||..|||.|.:|.||..::.|..|:|||||||.|.
  Rat  3035 LDIPIDPSFSLINTLGDPYE-------IRQWNADGLPRDLISTENGILVTQGRRWPLMIDPQDQA 3092

  Fly  3545 IKWVKTKYG-TGLVVLRLSQRNYLDQVERAVSNGSVLLIENIGENIDPVLNPLLGRQLIKKG--T 3606
            .:|::.|.. :||.|::|:..|:|..:|.::..|..:|:|.:.|.:||.|.|:|.:|....|  .
  Rat  3093 NRWIRNKESKSGLKVIKLTDTNFLRILENSIRLGLPVLLEELREVLDPALEPILLKQTFMSGGRL 3157

  Fly  3607 VLKIGDREIDFNSRFRLILHTKLANPHYKPEMQAQTTLINFTVTRDGLEDQLLAEVVKVERPDLE 3671
            ::::||.:||::..||..:.||:.||||.||:..:.|:||||||:.|||||||::||::|:|:||
  Rat  3158 LIRLGDSDIDYDKSFRFYMTTKMPNPHYLPEVCIKVTIINFTVTKSGLEDQLLSDVVRLEKPELE 3222

  Fly  3672 AMRTRLTQQQNHFKITLKFLEDDLLARLSSAGDNVLEDVTLVMNLEKTKKTADEIEVKVAEAKIT 3736
            ..|.:|..:.|..|..||.:||.:|..|.::..|:|::..|:..|:.:|.|:..|:.::.||:.|
  Rat  3223 GQRVQLIVRINSDKNQLKSIEDKILKLLFTSEGNILDNEELIDTLQDSKITSGAIKTRLKEAEST 3287

  Fly  3737 GVQIDSAREAYRPAAERASIIYFILNDLFKINPIYQFSLKAFTVVFNNAMLKAMAAEKLKDRVEN 3801
            .:.|:.|||.|||.|.:.|::||::..|.:|:|:||:|||.|..:||..:..:..::.|::|:..
  Rat  3288 ELMINIARERYRPVATQGSVMYFVIASLSEIDPMYQYSLKYFKQLFNTTIETSEKSDSLQERLAI 3352

  Fly  3802 LIDSITFCSFVYTSRGLFEQDKLIFLTQLCIQILVNLGEVEPTELDFLLR--------FPYMPNQ 3858
            |:......::...|||||||.|||:...||:.|:....::...|.:|.||        .|..|..
  Rat  3353 LLQQTLLTAYTNVSRGLFEQHKLIYSFMLCVDIMRQQEQLTEAEWNFFLRGSAGMEKERPPKPEA 3417

  Fly  3859 TSNFTWLTHVGWGGIRALNNQ-AVFKGLEKDI--------EGSHKRWKKFVDSESPENEKFPGE- 3913
                .||....|.....|... .:|:||.:.|        .||   ::.:::.:|.|.  :|.: 
  Rat  3418 ----PWLPIQMWFSCCDLEEWFPIFEGLTRHILLHPISISLGS---FETYINPQSWEG--YPKQR 3473

  Fly  3914 --------WKGK-SAIQRLCIMRCIRPDRMSYAMRSFIEEKLGSKYIDARSMEFSRTFEESSPET 3969
                    |... |:..:|.:::|.:.:::.:|:..|:.|.||.::|:...::.:..:::.|..|
  Rat  3474 HEEEKEHVWGSNFSSFHKLILVKCCKEEKVVFALTDFVIENLGKQFIETPPVDLATLYQDMSSST 3538

  Fly  3970 HIFFVLSPGVDPLKDVEKLGKSLGFSFDHENFHSVSLGQGQEIVAENAIEIASQYGHWVILQNIH 4034
            .:.|:||.|.||:...::..:..|::   |...|:||||||..:||..|:.|::.|:||.|||.|
  Rat  3539 PLVFILSTGSDPMGAFQRFARESGYA---ERVQSISLGQGQGPIAEKMIKDATKSGNWVFLQNCH 3600

  Fly  4035 LVARWLPSLE---KKMESSLSNVHTSYRLFLSAEPAGDPAAHILPQGILESAIKITNEPPTGMMA 4096
            |...|:.::|   |.......::..::|||||:.|..     ..|..:|::::|:|||||.|:.|
  Rat  3601 LAVSWMLAMEELIKTFTDPNQSIKDTFRLFLSSMPCS-----TFPVTVLQNSVKVTNEPPKGLRA 3660

  Fly  4097 NIHKALDNFSDETLEMCSKETEFKAILFSLCYFHAVVAERRKFGPQGWNRSYPFNVGDLTISVYV 4161
            ||.:|....:....|......:::.::|.:|:|||::.||:||||.|||..|.||..|...::..
  Rat  3661 NIRRAFTEMTPSFFEENILGMKWRKLIFGICFFHAIIQERKKFGPLGWNICYEFNDSDRECALLN 3725

  Fly  4162 LYNYLEANTRVPWEDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRLCRTYLEEFMQPELIDGELEYCQG--FPA 4224
            |..|.... ::||:.|.|:.|||.|||.:||.||:|..||.|:.|..||.::.|..|.:.  :.|
  Rat  3726 LNLYCHEG-KIPWDALIYITGEITYGGRVTDTWDQRCLRTVLKRFFSPETLEDEYTYSESGIYFA 3789

  Fly  4225 PGILKYTGYHNYIDDNLPSESPSLYGLHSNAEIGFLTTVSERLFRIVFELQPRMTGGSSGGETVS 4289
            |.......:.:||:|....:.|.::|:|.||.:.|....:..|...:.|:|||   .|||||..|
  Rat  3790 PLADSLQEFKDYIEDLPLIDDPEIFGMHENANLVFQYKETNTLITTILEVQPR---SSSGGEGKS 3851

  Fly  4290 QEDIIKNIIEDILDKTPTPFN---------ILELMGRVEDRSPYIIVAFQECERMNNLMTELKRS 4345
            .::|::.::..|..:.|....         :.:..||:...:   .|..||.:|.|||:..:..|
  Rat  3852 NDEIVQELVASIRTRVPESLQMEGASETLFVKDPQGRLNSLT---TVLGQEVDRFNNLLKLIHIS 3913

  Fly  4346 LNELDLGLKGELTISSVMEDLMVCLYMDQVPEQWTKLAYPSMLGLQSWFSDLMLRLRELEGWVAD 4410
            |..|:..:.|.:.:|..||.:......:|||..|:..||||:..|.||..||:||...::.|:..
  Rat  3914 LETLNKAIAGLVVMSEEMEKVYQSFLNNQVPSLWSNTAYPSLKPLGSWVKDLILRTAFVDLWLKR 3978

  Fly  4411 FRMPSSIWLAGFFNPQSLLTAIMQQTARKNEWPLDRMCLNCDVTKKWKE---------------- 4459
             ..|.|.|::|||.||..||..:|..|||...|:|.:....::...:::                
  Rat  3979 -GQPKSFWISGFFFPQGFLTGTLQNHARKYNLPIDELSFKYNMIPVYRDQALVIEAAKDIQFGTE 4042

  Fly  4460 -----ELTTAPREGAYINGLFMEGARWDMKMGTIADAFLKELFPAMPVLYIKAVTQDKQDIKNVY 4519
                 ||.| |.:|..::|:||:.:|||.|...|.||...::.|.:||::.:. .|:.:.|:.:|
  Rat  4043 LPMDKELPT-PEDGVLVHGMFMDASRWDDKDMIIEDALPGQMNPMLPVVHFEP-QQNYEPIQTLY 4105

  Fly  4520 ECPVYKIRLRGPT---------FVWTFNLKSRERASKWTLAGVCLLLQ 4558
            ..|:||...|..|         ||.|..|.|:..:..|...|..||.|
  Rat  4106 HSPLYKTGARAGTLSTTGHSTNFVVTVLLPSKRPSDYWIAKGSALLCQ 4153

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
kl-5NP_001015499.4 DHC_N1 198..763 CDD:462457 77/407 (19%)
DHC_N2 1365..1769 CDD:462462 119/432 (28%)
DYN1 1591..4206 CDD:227570 999/2716 (37%)
AAA_6 1903..2229 CDD:463697 182/325 (56%)
MT 3140..3480 CDD:463699 113/353 (32%)
AAA_9 3508..3726 CDD:463702 89/220 (40%)
Dynein_C 4261..4557 CDD:465677 96/334 (29%)
Dnah6XP_038964640.1 DHC_N2 887..1307 CDD:462462 116/424 (27%)
DYN1 <1127..3774 CDD:227570 994/2708 (37%)
AAA_6 1441..1767 CDD:463697 182/325 (56%)
Dynein_C 3827..4152 CDD:465677 96/333 (29%)

Return to query results.
Submit another query.