DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment kl-5 and Dnah3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001015499.4 Gene:kl-5 / 26067054 FlyBaseID:FBgn0267433 Length:4559 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001414569.1 Gene:Dnah3 / 117249 RGDID:1305855 Length:4069 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4171 Identity:1273/4171 - (30%)
Similarity:2033/4171 - (48%) Gaps:535/4171 - (12%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   785 VAAQENLEAIKESIRSWG-KVPLFQRKDLNPALLL-----HTDPREPILSIRAANAADTQRLIDL 843
            |:|.|....|.:::.|.. ..||.||.....|:..     |..|.:.|.:..:..|.| .:|.||
  Rat    34 VSANEEPSEIYKTVMSHSFYPPLMQRTSWTLAVPFKEQDQHRGPSDSIGNNYSLTARD-MKLKDL 97

  Fly   844 LMYVNLKLFFDIPRRYSLPPGEHGEEDEESDGIWPPIISLSVMTSVKFKKKREVIDEEDDL---- 904
            :. |...:...:||            |:.|.|:  |:.| ...|....||.:..|..:||.    
  Rat    98 VK-VYQPVTISVPR------------DKASQGL--PLAS-KTSTEPSKKKMKLCIKGKDDATGTP 146

  Fly   905 --------------------------------------EEFEEEQSESE-EEIITPFHRYELLKG 930
                                                  :|.|.|..|:: .|:....:.|.|..|
  Rat   147 LACKHSSSSNMKNATDSSLTYPESRPMSPEQQMDVMLQQEMEVESKENKPSELDLERYYYYLTNG 211

  Fly   931 L------SQEERALFREYEIYVDEIIAENLVDSVITSSTYLRMEVDNRYENNTPIFEIFMELQEP 989
            :      .::|..:.|.|::         :..:::|:.....::|..|.|..:..:...|:    
  Rat   212 IRKDMIAPEDEDVMVRIYKL---------IPKTLLTTPALEPLQVSLRSEKESDYYYSLMK---- 263

  Fly   990 NVVYFRNLDTSSKTGFAFFIETI-----------------------------LDDMNNMMSLLK- 1024
            ::|.:..:|...|.  ..||::|                             |..:|.||..|| 
  Rat   264 SIVDYILMDPLEKK--RLFIKSIPRLFPHRVIRAPVPWHNIYQSVKKWNEEHLHTVNPMMYTLKE 326

  Fly  1025 ------------RVAQDPTEVTNMNPYSFYDELQDKSELDKQRVEIMNKIKLALQAVRVHGKGFM 1077
                        |.|........:.|:.:.:|:| |..||.::|.:...|....|......:.::
  Rat   327 LWFSEFKDLRFIRTADLLAGKLPLLPHEYQEEIQ-KHCLDARQVLLSKWIPTCAQLFVTQKERWV 390

  Fly  1078 EFSSLWIWDKS----TYLSEVKKFGRNLTLDERDAEADLEGSSGVKLLGLEYPPLSVYK------ 1132
            .|:....:|.|    .|.:.|..|   ::|..|:..        :|.||.......::|      
  Rat   391 HFAPKNDYDSSRNIEEYFASVASF---MSLQLRELV--------IKSLGDLVSFFMIHKDGNDFN 444

  Fly  1133 ---EQLDKFI--------ELQDQI--------RTWETYEDFFVFLRLNMTGF-KV---------- 1167
               :::|.||        |:.|.:        ..|:..::.|:.:..|..|. ||          
  Rat   445 EPYQEMDFFIPQLITIKLEVDDPVIVFNPTFDDCWQLIKESFLEIIKNSNGIPKVESILFPDLKG 509

  Fly  1168 -------------AVLSQVGQWISLFKLDLI--NRVKNSLKELQDFVD-----EANIVLKIELQK 1212
                         .|...:.|.:.:|..:.:  ::..|..|:..|.:|     :.:..|..:...
  Rat   510 YNMILGTVDPEENLVADFLNQTLEVFNKNQVGPHKYLNVYKKYDDLLDNTAEQDISTFLNDKHDI 574

  Fly  1213 DDFEGLVKILSVLNQINEKQCIYD----SMF------------DPLKEIIDLLRQYNYEF-KDTE 1260
            |||  :..|.|:..:.||...::.    :||            :..:.:.|.|.||..:. ::|.
  Rat   575 DDF--VTSINSIKKRRNEIASMHITVPLAMFCLDAVLLNHDLCERAQNLKDRLIQYQVDVNRETN 637

  Fly  1261 LAQINELPDAWMKVKRLAATTKQLIAPIQSYQ---------------------------VDLIEK 1298
            .:..|:......||....|.|.:|:|.|:..:                           .||..:
  Rat   638 TSICNQYSTIADKVSETPANTAELVALIEYLKKSSDVTVFKLRRQLRDASERLEFLMDYADLPNE 702

  Fly  1299 RILLCDNM----------ANTYRKKFLSKKFFFVPCLSCYELIDESDLELV-------------- 1339
            .|.|..|:          ....|...|||:             |:::::|:              
  Rat   703 DIKLNSNLFLWPDQIEDVFENSRNLLLSKR-------------DQAEMDLIKRCSEFETRLEGYS 754

  Fly  1340 ----------------------ALEERQRSLAESAVLFELQGPDPVKIELCRFDLKLVKI----- 1377
                                  .|.:..::|..:...|||...:...:|..:....|:::     
  Rat   755 KELEMFRKREVMTTEEMKNNVEKLNDLSKNLDLALTEFELINKEEELLEKEKSSFPLLQVLMVNK 819

  Fly  1378 -----MWDFAITIQSTINDWKKTPWKKI-------DIENMDQECKKFGRELRGLDKAMRTWEPFI 1430
                 :|..|....:...:|...|...:       ||.||.:...|..:.|..:....|..|.  
  Rat   820 IPYEQLWVTAYEFSTKSEEWMNGPLFLLNAEEIAEDIGNMWRTTYKLTKTLIDVPAPRRLAEN-- 882

  Fly  1431 FMEASLKNLMTSLRAVTELQNPAIRDRHWIELMQTTKVKFSMDDSTTLKDLIDLNLHEYEEEVKN 1495
             ::..::.....:..:|...||.::||||.::......:....::|.|.::::....::.::::.
  Rat   883 -VKLKIEKFRQHIPVLTIACNPGMKDRHWQQISDIVGYEIKPTETTCLANMLEFGFSKFVDKLEP 946

  Fly  1496 IVDKSVKEMAMEKQLRDIATAWGTMEFGTDIHDRTSIKLLKASEELIETLEDHQGQLQNMASSKY 1560
            |...:.||.::||.|..:.:.|..|.|....:..|...:|.|.:::...|:||..:.|.|..|.:
  Rat   947 IGAAASKEYSLEKNLEKMKSDWVNMCFSFVKYRDTDTSILCAVDDIQLLLDDHVIKTQTMCGSVF 1011

  Fly  1561 IAFFEHEVRLWQNRLSNADQIIGSWFEVQRKWQYLESIFIGSEDIRSQLPEDSRRFDYIDKEFKA 1625
            |...|.|.|.|:.:|....:.:.:|.:.|..|.|||.|| .||||.:|:||:.::|..:|..:|:
  Rat  1012 IKPIEAECRKWEEKLVRVQENLDAWLKCQATWLYLEPIF-SSEDIIAQMPEEGKKFGIVDSYWKS 1075

  Fly  1626 LLAQMNADRNVVRSTN--RSGSKLYEHLEILLKMLLLCEKALNDYLETKRLSYPRFYFVSSADLL 1688
            |:||...|..|:.:.:  |...||.| ..:||:.:   ::.||||||.|||.:|||:|:|:.:||
  Rat  1076 LMAQAVNDTRVLVAADQPRMTEKLQE-ANVLLEDI---QRGLNDYLEKKRLFFPRFFFLSNDELL 1136

  Fly  1689 DILSNGNNPALVARHLTKLYDSMGKLNLISGSKNAAGMVAKELEEYVPFLEN---CDCSGKVEVW 1750
            :|||...:|..|..||.|.::.:.||. .:.:....||::.| :|.|||::.   ....|.||.|
  Rat  1137 EILSETKDPLRVQPHLKKCFEGIAKLE-FTDNLEIKGMISSE-KEIVPFIQTIYPVKAKGMVEKW 1199

  Fly  1751 LNRITDKMRDTLRDQLKRSLTFYDHKPRHVWIFEWPAQPALVGTQIMWTTETNDAFAKVQQRYEN 1815
            |.::...|..::|..::..:..|...||:.|:.:||.|..:..:.|.||.|.::|..      |.
  Rat  1200 LQQVEQVMVASMRQVIEDGIEAYLKVPRNAWVLQWPGQVVICVSSIFWTREVSEALV------EY 1258

  Fly  1816 ALKDYNKKQITQLNNLIILLLGDLTAAERQKIMTICTIDVHSRDVVGTIIAKKVEVQTAFQWQSQ 1880
            .|.|:.||...|:..::.|:.|.|::..|..:..:..||||:||||..:....:.....|||.||
  Rat  1259 TLTDFLKKSNDQIAQIVELVRGKLSSGARLTLGALTVIDVHARDVVAKLEQDNINSLNDFQWISQ 1323

  Fly  1881 LRHRW-DPKIDDCFANICDAQFRYDYEYLGNTPRLVITPLTDRCYITLTQSLHLVMGGAPAGPAG 1944
            ||:.| :..:.   ..:...|..|.||||||:|||||||||||||.||..:|.|.:||||.||||
  Rat  1324 LRYYWVESNVQ---VQMITTQALYGYEYLGNSPRLVITPLTDRCYRTLMGALKLNLGGAPEGPAG 1385

  Fly  1945 TGKTETTKDLGRALGMMVYVFNCSEQMDYKSIGDIHKGLAQTGAWGCFDEFNRISVEVLSVVAVQ 2009
            ||||||||||.:||.....|||||:.:|||::|...|||||.|||.||||||||.||||||||.|
  Rat  1386 TGKTETTKDLAKALAKQCVVFNCSDGLDYKAMGKFFKGLAQAGAWACFDEFNRIEVEVLSVVAQQ 1450

  Fly  2010 VKCIQDAIKSKKQTFSFLGEHIALRTTVGVFITMNPGYAGRAELPENLKALYRPCAMVVPDFALI 2074
            :..||.||..|.:.|.|.|..::|..|..||||||||||||||||:|||||:|..||:|||:|||
  Rat  1451 ILSIQQAIIRKLKMFIFEGTELSLNPTCAVFITMNPGYAGRAELPDNLKALFRTVAMMVPDYALI 1515

  Fly  2075 SEIMLVAEGFQEARLLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGALRRDDRQRPEDQ 2139
            .||.|.:.||.::|.||:|.:..|.||.|.||.|.|||:|:||:||||..||.|:....:..|..
  Rat  1516 GEISLYSMGFLDSRSLAQKIVATYRLCSEQLSSQHHYDYGMRAVKSVLTAAGNLKLKYPEENESV 1580

  Fly  2140 VLMRALRDFNIPKIVTDDVPVFMGLIGDLFPALDVPRKRNPEFEA---VIKRSALDLKLQPEDGF 2201
            :|:|||.|.|:.|.:..|||:|.|:|.||||.:.:|:   |::|.   .:..:..::||||...|
  Rat  1581 LLLRALLDVNLAKFLAQDVPLFQGIISDLFPGVVLPK---PDYEVFLEALNNNIRNMKLQPVPWF 1642

  Fly  2202 ILKIVQLEELFAVRHSVFIIGFAGTGKSEVWKT-------LNKTYQNQKRKPHYNDLNPKAVTND 2259
            |.||:|:.|:..|||...|:|....||:..:|.       |:...|.::....:..:||||:|..
  Rat  1643 IGKIIQIYEMMLVRHGYMIVGDPMGGKTSAYKVLAAALGDLHAANQMEEFAVEFKIINPKAITMG 1707

  Fly  2260 ELFGIVNPSTREWKDGLFSILMRDQANLGGTGPKWIVLDGDIDPMWIESLNTVMDDNKVLTLASN 2324
            :|:|..:..:.||.||:.:...|:||:......|||:.||.:|.:|||::|||:||||.|.|.|.
  Rat  1708 QLYGYFDAVSHEWTDGVLANAFREQASSVTDERKWIIFDGPVDAVWIENMNTVLDDNKKLCLMSG 1772

  Fly  2325 ERIALTKEMRLLFEIASLRTATPATVSRAGILYINPQDLGWTPFIQSWLGTR---TNSSEVSMLN 2386
            |.|.::.:|.|:||.|.|..|:||||||.|::|:.|..|||.|...|::.|.   .|.....::.
  Rat  1773 EIIQMSSKMSLIFEPADLEQASPATVSRCGMIYMEPHQLGWKPLKDSYMDTLPPCLNKEHTELVE 1837

  Fly  2387 VLFDKYVPPLLDIFRTRLRSITPISDI----ARLQMTCYLLDSMLTPQNVPNDCPKD-------- 2439
            .:|...|.|.||..|...:.:...|.|    :.:::...|||.:...|....:..:.        
  Rat  1838 DMFTWLVQPCLDFNRLHSKFVVQTSPIHLAFSMMRLYSSLLDELWAIQEEEMEIYEGLSSQQIFL 1902

  Fly  2440 WYEIYFVFCIVWGFGSSLFQDQIIDWSNEFSKWFLN----------EYKAVK------FPLSGTI 2488
            |.:..|:|.:||....::..:.    ..:|..:|.|          ..|:||      ||..|:|
  Rat  1903 WLQGLFLFSLVWTVAGTINAES----RKKFDVFFRNLIMGMDDHNPRPKSVKLTKNNIFPERGSI 1963

  Fly  2489 FSFY-IDHETKKFFPWTNLVPQFE--LDMDLPLQSNLVNTAETTRLRFFMDTLIEADHPLMLIGP 2550
            :.|| :......:..||..:.:.|  :..:..:...::.|.||.|..||:.|.::.:.|::.:||
  Rat  1964 YDFYFLKQGGGHWNAWTEYITKEEETIPANAKVSDLIIPTMETARQTFFLKTYLDHEIPILFVGP 2028

  Fly  2551 SGSGKTILMNAKLSALPSDKYSVTNVPFNFYTTSEMLQRILEKPLEKKAGRNYGPIGNKRMIYFV 2615
            :|:||:.:.|..|..||.:.|....:.|:..|::...|.|:...|:::....:||...|:.:.||
  Rat  2029 TGTGKSAITNNFLLHLPKNVYQPNFINFSARTSANQTQDIIMSKLDRRRKGLFGPPIGKKAVVFV 2093

  Fly  2616 DDMNMPEVDKYFTVQPHTLIRQFMDYHHWYDRQKMTLRDIHKCNIVACMNPSAGSFT-IDPRLQR 2679
            ||:|||..:.|....|..|:||::|:.:|:|::.....||....:|..|.|..|... |..|..|
  Rat  2094 DDLNMPAKEVYGAQPPIELLRQWIDHGYWFDKKDTNRLDIVDVLLVTAMGPPGGGRNDITGRFTR 2158

  Fly  2680 HFCSFAVNPPSQDALFHILNSILSQHMDNPIQKFDKAVIKLCENMVTTAITLHLKVVSSFLPTAI 2744
            |....::|....:.|..|.:||...|..   :.||...::....:|.....::...|.:||||..
  Rat  2159 HLNLLSINAFEDEILTKIFSSIADWHFG---KGFDVMFLRYGRMLVQATQIIYRAAVENFLPTPS 2220

  Fly  2745 KFHYNFNLRDIANIFTGVLYSNSETCPNSN-----QMIRLWIHECYRVYGDKLVDYTDINSF--- 2801
            |.||.|||||.:.:..|||     .||:::     :.|||||||.|||:.|:|:|..|..:|   
  Rat  2221 KSHYVFNLRDFSRVIQGVL-----LCPHTHLQDLEKFIRLWIHEVYRVFYDRLIDNDDRQTFFNL 2280

  Fly  2802 -KKIVSDIVRKGIEGVNDDVVYAQP-----------LIYCHFAKGLTDIK-YMPISGWDRLKSLL 2853
             |:..|:..::.:|.|   :::..|           |.:..|.|..:|.| |..|.....|..::
  Rat  2281 VKETTSNCFKQTVEKV---LIHLSPTGKITDENIRSLFFGDFLKPESDQKIYDEIIDLRNLTVVM 2342

  Fly  2854 DEAQDRYNDYIGA-MNLVLFDDAMSHVCRISRILESSRGYALLIGVGGSGKQSLTRLASFISSLD 2917
            :...|.:|....| |:||:|..|:.|:.||.|:|:.::|:.||:|:||||:||.|:|::|::|.:
  Rat  2343 EYYLDEFNSVSKAPMSLVMFKFAIEHISRICRVLKQNKGHLLLVGIGGSGRQSATKLSTFMNSYE 2407

  Fly  2918 VFQIQLTKDYSVSDLKANIATLYMKAGVKTSACCFLMTDSEVAREQFLVLVNDLLASGDIHELFP 2982
            ::||::||:|:.:|.:.::..:.:::||.|.:..||..|:::..|.|:..:|.||.:||:..:||
  Rat  2408 LYQIEITKNYTGNDWREDLKKIMLQSGVATKSTVFLFADNQIKDESFVEDINMLLNTGDVPNIFP 2472

  Fly  2983 DDE----VENIVNAVRN-----EVKQLGIVDNRENCWKYFIEKVRSLLKVVLCFSPVGATLRVRS 3038
            .||    ||.:..|.|.     ||..|.:       :.:|||:||..|.:||..||:|...|.|.
  Rat  2473 ADEKADLVEKMQTAARTGGEKIEVTPLSM-------YNFFIERVRKNLHIVLAMSPIGDAFRTRL 2530

  Fly  3039 RKFPALVNCTTIDWFHEWPQQALESVSLRFLSEITVLPKELALPVSNFMAFVHKTVNDISKLYLA 3103
            |.||:|:||.|||||..||..|||.|:.:||.::. |...:...|.:...:..::...:|..|..
  Rat  2531 RMFPSLINCCTIDWFQSWPTDALELVANKFLEDVE-LDDNIRAEVVSMCKYFQESAKKLSVDYYN 2594

  Fly  3104 NAKRYNYTTPKSFLELIALYSKLLHEKVKANLD-RRLRLENGLIKLASCTKEVDALQDVLKVQEV 3167
            ...|:||.||.|:||||..:..||:.| :..:| .|.|...||.||...:.:|..:|..|...:.
  Rat  2595 TLLRHNYVTPTSYLELILTFKTLLNSK-RHEVDLMRNRYLAGLQKLEFASSQVAVMQVELTALQP 2658

  Fly  3168 ELKIKNQEADNLIIVVGTENEKVSKERAFASKEEKNVRQIEEDVTAKAKLCEEDFLKAQPALIAA 3232
            :|...::....:::.:..|.::...::.....:||..........|....||.|..:|.|||.||
  Rat  2659 QLIQTSENTAMMMVKIEMETKEADAKKLLVQADEKEANAAAAVAQAIKNECEGDLAEAMPALEAA 2723

  Fly  3233 QEALNTLNKNNLTELKSFGSPPDAVVSVCGAVLVLF----------SSKGKIPKDRSWKACRAFM 3287
            ..||:|||..::|.:||..:||..|..|..::.|:.          |..||:.:| .|...|..:
  Rat  2724 LAALDTLNPADITLVKSMQNPPGPVKLVMESICVMKGLKPERKPDPSGSGKMIED-YWGVSRKIL 2787

  Fly  3288 GNVDKFLDNLINYDKKHIHPDVIKALQPYILD-AEFSPEKILAKSSAAAGLCSWVININRFYDVY 3351
            |:: |||::|..|||.:|.|.::|.::...:| .:|.|..|...|||..|||.||..:..:..|.
  Rat  2788 GDL-KFLESLKTYDKDNISPVIMKRIRERFIDHPDFQPAVIKNVSSACEGLCKWVRAMEVYDRVA 2851

  Fly  3352 LVVEPKERALLESEKEVKDARDKLTALNLRLTELEEQLNALQMEYDEALAKKQKCQDEASKTAFT 3416
            .||.||...|.|:|.:::....||......|..:|::|.||..|::...:||...::.....:..
  Rat  2852 KVVAPKRERLREAEGKLEIQMHKLNQKRAELKLVEDRLQALNDEFELMNSKKNMLEENIEICSQK 2916

  Fly  3417 IDIANRLIGGLATEKIRWMESVKVLTFGIQQLPGDILIISCFISYVGCFTRAYRQELQEKLWMPA 3481
            :..|.:||.||..||.||.|:.::|......|.||:|:.|..::|:|.||..||.:.|.: |:.:
  Rat  2917 LIRAEKLISGLGGEKDRWTEAARLLGIRYDNLTGDVLLSSGTVAYLGAFTVDYRAQCQTE-WLIS 2980

  Fly  3482 FKNSQPPIPSTDGVDPFEMICDDAQIAEWNNQGLPSDRMSAENAAILVQSERYPLMIDPQLQGIK 3546
            .|:.  .||.:........:.|..:|..|...|||.|..|.:|..|:..|.|:|||||||.|..|
  Rat  2981 CKDK--VIPGSVDFSLSNTLGDPIKIRAWQIAGLPVDSFSVDNGIIVSNSRRWPLMIDPQGQANK 3043

  Fly  3547 WVKTKYGTG-LVVLRLSQRNYLDQVERAVSNGSVLLIENIGENIDPVLNPLLGRQLIKKGTV--L 3608
            |||....|. |.|::.|..||:..:|.|:..|:.:|:||:||.:|..:.|:|.:...|:..|  :
  Rat  3044 WVKNMEKTNKLSVIKFSDTNYVRTLENALQFGTPVLLENVGEELDAFIEPILLKATFKQQGVEYM 3108

  Fly  3609 KIGDREIDFNSRFRLILHTKLANPHYKPEMQAQTTLINFTVTRDGLEDQLLAEVVKVERPDLEAM 3673
            ::|:..|:::..|:..:.|:|.||||.||:..:..|:||.:|..||:||||..|...|:|:||..
  Rat  3109 RLGENIIEYSREFKFYITTRLRNPHYLPEVAVKVCLLNFMITPLGLQDQLLGIVAAKEKPELEEK 3173

  Fly  3674 RTRLTQQQNHFKITLKFLEDDLLARLSSAGDNVLEDVTLVMNLEKTKKTADEIEVKVAEAKITGV 3738
            :.:|..:....|..||.:||.:|..||.:..|:|||.|.:..|..:|..::||..|...|.:|..
  Rat  3174 KNKLILESAENKKQLKEIEDKILEVLSLSEGNILEDETAIKVLSSSKILSEEISEKQEIASVTET 3238

  Fly  3739 QIDSAREAYRPAAERASIIYFILNDLFKINPIYQFSLKAFTVVFNNAMLKAMAAEKLKDRVENLI 3803
            |||..|..|:|.|..::.|:|.::||..|.|:||:||..|..::..::..:..:::|..|:|.:|
  Rat  3239 QIDETRMGYKPVAIHSAAIFFCISDLAHIEPMYQYSLTWFINLYVLSLANSNKSDELDLRIEYII 3303

  Fly  3804 DSITFCSFVYTSRGLFEQDKLIFLTQLCIQILVNLGEVEPTELDFLLR------FPYMPNQTSNF 3862
            :..|...:....|.|||:|||:|...|.|.:|.....::.....|||.      .|: ||.... 
  Rat  3304 EHFTLSIYNNVCRSLFEKDKLLFSLLLTIGLLKEKKAIDEEVWYFLLTGGVALDNPF-PNPAPE- 3366

  Fly  3863 TWLTHVGWGGIRALNNQAVFKGLEKDIEGSHKRWKKFVDSESPENEKFPGEWKGKSAIQRLCIMR 3927
             ||:...||.|...::....|||..|:..:...||...||..|::|..|..|....|::::.|:|
  Rat  3367 -WLSEKSWGEIVRASSLPKLKGLMDDLSRNLTEWKAIYDSAWPQDESLPSPWVFLQALEKMAILR 3430

  Fly  3928 CIRPDRMSYAMRSFIEEKLGSKYIDARSMEFSRTFEESSPETHIFFVLSPGVDPLKDVEKLGKSL 3992
            |:|||::..|::.||.|.:|..:|:|.:.:...::.:||....:.|:||||.||:..:.|....|
  Rat  3431 CLRPDKIVPAIQDFISETMGKVFIEAPTFDLQGSYNDSSCCAPLIFILSPGADPMAGLLKFADDL 3495

  Fly  3993 GFSFDHENFHSVSLGQGQEIVAENAIEIASQYGHWVILQNIHLVARWLPSLEKKMESSL--SNVH 4055
            |..  .....::||||||..:|...|..|...|.||:|||.||...|:|:|||..|..:  .|.:
  Rat  3496 GMG--GTKTQTISLGQGQGPIAAKMIHKAIHEGTWVVLQNCHLATSWMPALEKICEEVIIPENTN 3558

  Fly  4056 TSYRLFLSAEPAGDPAAHILPQGILESAIKITNEPPTGMMANIHKAL--DNFSDET-LEMCSKET 4117
            ..:||:|::.|     :...|..||::.||:|||||.|:.||:.::.  |..||.. .:.|:|..
  Rat  3559 RDFRLWLTSYP-----SEKFPVSILQNGIKMTNEPPKGLRANLLRSYLNDPISDPVFFQSCTKPV 3618

  Fly  4118 EFKAILFSLCYFHAVVAERRKFGPQGWNRSYPFNVGDLTISVYVLYNYLEANTRVPWEDLRYLFG 4182
            .::.:||.||:|||:|.|||.:|..|||..|.||..||.||:..:..:|.....||:|.|.||.|
  Rat  3619 IWQKLLFGLCFFHAIVQERRNYGALGWNIPYEFNESDLRISMRQIQMFLNDYKEVPFEALTYLTG 3683

  Fly  4183 EIMYGGHITDDWDRRLCRTYLEEFMQPELIDGELEYCQG------FPAPG----ILKYTGYHNYI 4237
            |..|||.:|||.||||..:.|..|           ||:.      :.|||    |..:..|.:||
  Rat  3684 ECNYGGRVTDDKDRRLLLSLLSTF-----------YCKEIETDHYYIAPGQPYFIPPHGSYQSYI 3737

  Fly  4238 D--DNLP-SESPSLYGLHSNAEIGFLTTVSERLFRIVFELQPRMTGGSSGGETVSQEDIIKNIIE 4299
            :  ..|| :..|.::|||.||:|......:.:||:.|....||.:|||.    .|.:::::.:.:
  Rat  3738 EYLRTLPITAHPGVFGLHENADITKDNQETNQLFQGVLLTLPRQSGGSG----KSPQEVVEELAQ 3798

  Fly  4300 DILDKTPTPFNILELMGR---VEDRSPYIIVAFQECERMNNLMTELKRSLNELDLGLKGELTISS 4361
            |||.|.|..||:.|:|..   |.:.|...::. ||..|.|.|...::|||.:|...:||::.:||
  Rat  3799 DILSKLPKDFNLEEVMKLYPVVYEESMNTVLR-QELIRFNRLTKVVRRSLIDLGRAIKGQVLMSS 3862

  Fly  4362 VMEDLMVCLYMDQVPEQWTKLAYPSMLGLQSWFSDLMLRLRELEGWVADFRMPSSIWLAGFFNPQ 4426
            .:|::...:.:.:||..|...:|||:..|..:.:||:.||...:.|: :...|...|::||:..|
  Rat  3863 ELEEVFNSMIVGKVPAMWAAKSYPSLKPLGGYVADLLARLAFFQEWI-NKGPPVVFWISGFYFTQ 3926

  Fly  4427 SLLTAIMQQTARKNEWPLDRMCLNCDVTKKWKEELTTAPREGAYINGLFMEGARWDMKMGTIADA 4491
            |.||.:.|..|||...|:|.:....:||.| :..:...|.:||||.|||:||||||..:..|.::
  Rat  3927 SFLTGVSQNYARKYTIPIDHIGFEFEVTSK-ETTMENIPEDGAYIKGLFLEGARWDRTIRQIGES 3990

  Fly  4492 FLKELFPAMPVLYIKAVTQDKQDIKNVYECPVYKIRLRGPT---------FVWTFNLKSRERASK 4547
            ..|.|:..:|::::|.........:::|.|||||...|..|         :|.:..|.:......
  Rat  3991 LPKILYDPLPIIWLKPGESASFLHQDIYVCPVYKTSARRGTLSTTGHSTNYVLSIELPTDMPQKH 4055

  Fly  4548 WTLAGVCLLLQ 4558
            |...||..|.|
  Rat  4056 WINRGVASLCQ 4066

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
kl-5NP_001015499.4 DHC_N1 198..763 CDD:462457
DHC_N2 1365..1769 CDD:462462 116/425 (27%)
DYN1 1591..4206 CDD:227570 968/2722 (36%)
AAA_6 1903..2229 CDD:463697 184/328 (56%)
MT 3140..3480 CDD:463699 106/350 (30%)
AAA_9 3508..3726 CDD:463702 83/220 (38%)
Dynein_C 4261..4557 CDD:465677 95/307 (31%)
Dnah3NP_001414569.1 None
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.

Return to query results.
Submit another query.