DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment myo-2 and zip

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_510092.2 Gene:myo-2 / 181404 WormBaseID:WBGene00003514 Length:1947 Species:Caenorhabditis elegans
Sequence 2:NP_523860.2 Gene:zip / 38001 FlyBaseID:FBgn0287873 Length:2056 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1990 Identity:710/1990 - (35%)
Similarity:1121/1990 - (56%) Gaps:83/1990 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


 Worm     5 NDPGWKYLRRSREEMLQDQSRA-YDSKKNVWIPDSEDGYIEGVITKTAGDNVTVSIGQ-GAEKTV 67
            |||..|||...|.:.....::| :..|:.||:|....|::...|.:..||.|.|.:.: |....:
  Fly    53 NDPELKYLSVERNQFNDPATQAEWTQKRLVWVPHENQGFVAASIKREHGDEVEVELAETGKRVMI 117

 Worm    68 KKDVVQEMNPPKFEKTEDMSNLTFLNDASVLYNLKARYAAMLIYTYSGLFCVVINPYKRLPIYTD 132
            .:|.:|:||||||:|.|||:.||.||:||||:|:|.||.:.||||||||||||:||||:|||||:
  Fly   118 LRDDIQKMNPPKFDKVEDMAELTCLNEASVLHNIKDRYYSGLIYTYSGLFCVVVNPYKKLPIYTE 182

 Worm   133 SVARMFMGKRRTEMPPHLFAVSDEAYRNMLQNHENQSMLITGESGAGKTENTKKVISYFAAVGAA 197
            .:...:.|.:|.|:|||:||::|.||||||.:.|:||:|.||||||||||||||||.:.|.|.|:
  Fly   183 KIMERYKGIKRHEVPPHVFAITDSAYRNMLGDREDQSILCTGESGAGKTENTKKVIQFLAYVAAS 247

 Worm   198 QQETFGA--------------------KKAA---------------TEEDKNKKKVTLEDQIVQT 227
            :.:..||                    |..|               .|.:.|.::..||.|::|.
  Fly   248 KPKGSGAVPHPAVLINFSVNTNKYIKVKIMAQNQNQTIEVVNGLKMVEVNSNCQEGELEQQLLQA 312

 Worm   228 NPVLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKFIRIHFSKQGRVASCDIEHYLLEKSRVIRQAPGERCYHIFYQ 292
            ||:||||||||||:|:|||||||||||:|...|.::..:||.|||||||.||||..||.:|||||
  Fly   313 NPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKFIRINFDASGFISGANIETYLLEKSRAIRQAKDERTFHIFYQ 377

 Worm   293 VFSDYLPNLKKDLLLNKPVKDYWFIAQAELIIDGINDKEEHQLTDEAFDILKFTPTEKMECYRLV 357
            :.:...|..::..:|: .||.|.|::...|.:.|::|..|.|.|.::.:|:..|..:....:|:|
  Fly   378 LLAGATPEQREKFILD-DVKSYAFLSNGSLPVPGVDDYAEFQATVKSMNIMGMTSEDFNSIFRIV 441

 Worm   358 AAMMHMGNMKFKQRPREEQAE-PDGTDDAERAAKCFGIDSEEFLKALTRPRVKVGNEWVNKGQNI 421
            :|::..|:|||:|....:||. ||.| .|::.|...|:...:..:|...||:|||.::|.|.|..
  Fly   442 SAVLLFGSMKFRQERNNDQATLPDNT-VAQKIAHLLGLSVTDMTRAFLTPRIKVGRDFVTKAQTK 505

 Worm   422 EQVNWAVGAMAKGLYSRIFNWLVKKCNQTLDQKGISRDHFIGVLDIAGFEIFDFNSFEQLWINFV 486
            |||.:||.|:||..|.|:|.|||.:.|::||:.......|||:||:||||||:.||||||.||:.
  Fly   506 EQVEFAVEAIAKACYERMFKWLVNRINRSLDRTKRQGASFIGILDMAGFEIFELNSFEQLCINYT 570

 Worm   487 NEKLQQFFNHHMFVLEQEEYAREGIQWTFIDFGLDLQACIELIEKPLGIIAMLDEECIVPKATDL 551
            ||||||.|||.||:||||||.||||:|.|||||||||..|:||:||.||:|:|||||..|||||.
  Fly   571 NEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWKFIDFGLDLQPTIDLIDKPGGIMALLDEECWFPKATDK 635

 Worm   552 TLAQKLIDQHLGKHPNFEKPKPPKGKQAEAHFAMRHYAGTVRYNCLNWLEKNKDPLNDTVVTVMK 616
            |...||:..| ..||.|.|    ...:..|.||:.||||.|.|:...||.||.||||:.:|::::
  Fly   636 TFVDKLVSAH-SMHPKFMK----TDFRGVADFAIVHYAGRVDYSAAKWLMKNMDPLNENIVSLLQ 695

 Worm   617 ASKEHALIVEVWQDYTTQEEAAAAAAKGTAGAKKKGKSGSFMTVSMLYRESLNKLMTMLHSTHPH 681
            .|:: ..:|.:|:|......|..|......||:.  :.|.|.|||.||:|.|.|||..|.:|:|:
  Fly   696 GSQD-PFVVNIWKDAEIVGMAQQALTDTQFGART--RKGMFRTVSHLYKEQLAKLMDTLRNTNPN 757

 Worm   682 FIRCIIPNEKKASGVIDAGLVLNQLTCNGVLEGIRICRKGFPNRTLHPDFVQRYALLAADESIIG 746
            |:||||||.:|.:|.|||.|||:||.||||||||||||:|||||....:|.|||.||..:....|
  Fly   758 FVRCIIPNHEKRAGKIDAPLVLDQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRIPFQEFRQRYELLTPNVIPKG 822

 Worm   747 KTDAKKGSALMLARLVKEKKLEEENFRVGLTKVFFKAGIVAHLEDLRDQSLAQLITGLQAQIRWY 811
            ..|.||....|:..|    :|:...:|||.:|:||:||::||||:.||..::.||...||..|.:
  Fly   823 FMDGKKACEKMIQAL----ELDSNLYRVGQSKIFFRAGVLAHLEEERDFKISDLIVNFQAFCRGF 883

 Worm   812 YQTIERKRRVEKITALKIIQRNIRSWAELRTWVWFKLYGKVKPLVNSGKIEAQYEKLQETVATLK 876
            ......::|::::.|::|||||..::.:||.|.|::||.|||||:   ::..|.|||        
  Fly   884 LARRNYQKRLQQLNAIRIIQRNCAAYLKLRNWQWWRLYTKVKPLL---EVTKQEEKL-------- 937

 Worm   877 DTVVQEEEKKRQLQEGAERLNKETAD--------------LLAQLEASKGSTREVEERMTAMNEQ 927
               ||:|::.:|::|..:.|.|.|.:              |..||:|......|.||..:.:..:
  Fly   938 ---VQKEDELKQVREKLDTLAKNTQEYERKYQQALVEKTTLAEQLQAEIELCAEAEESRSRLMAR 999

 Worm   928 KVALEGKLADASKKLEVEEARAVEINKQKKLVEAECADLKKNCQDVDLSLRKVEAEKNAKEHQIR 992
            |..||..:.:...::|.||.|.:.:..:||.:|....||::..::.:.:.:|::.||...:.:|:
  Fly  1000 KQELEDMMQELETRIEEEEERVLALGGEKKKLELNIQDLEEQLEEEEAARQKLQLEKVQLDAKIK 1064

 Worm   993 ALQDEMRQQDENISKLNKERKNQEEQNKKLTEDLQAAEEQNLAANKLKAKLMQSLEDSEQTMERE 1057
            ..::::...|:...||.||:|..||:...|::.|...||:.....|||||...::.:.|:.:.::
  Fly  1065 KYEEDLALTDDQNQKLLKEKKLLEERANDLSQTLAEEEEKAKHLAKLKAKHEATISELEERLHKD 1129

 Worm  1058 KRNRADMDKNKRKAEGELKIAQETLEELNKSKSDAENALRRKETELHTLGMKLEDEQAAVAKLQK 1122
            ::.|.:.|::|||.|.|:...:|.|.|......:.:..|.::|.||....:::::|.|..|..||
  Fly  1130 QQQRQESDRSKRKIETEVADLKEQLNERRVQVDEMQAQLAKREEELTQTLLRIDEESATKATAQK 1194

 Worm  1123 GIQQDEARVKDLHDQLADEKDARQRADRSRADQQAEYDELTEQLEDQARATAAQIELGKKKDAEL 1187
            ..::.|:::.::.:.|..||.||.:|::.|.|...|.:.|..:|.|....||||.||..|::.||
  Fly  1195 AQRELESQLAEIQEDLEAEKAARAKAEKVRRDLSEELEALKNELLDSLDTTAAQQELRSKREQEL 1259

 Worm  1188 TKLRRDLEESGLKFGEQLTVLKKKGSDAIQELSDQIEQLQKQKGRIEKEKGHMQREFDESSAALD 1252
            ..|::.|||..:.....|..::.|.|..:..::||:|.|:|.|..:||.||.::.|..:.:..|.
  Fly  1260 ATLKKSLEEETVNHEGVLADMRHKHSQELNSINDQLENLRKAKTVLEKAKGTLEAENADLATELR 1324

 Worm  1253 QEAKLRADQERIAKGYEVRLLELRLKADEQSRQLQDFVSSKGRLNSENSDLARQVEELEAKIQAA 1317
            .....|.:.:|..|..|.::.||::|..|..|...:......:|..|..::..|:||.|.|..||
  Fly  1325 SVNSSRQENDRRRKQAESQIAELQVKLAEIERARSELQEKCTKLQQEAENITNQLEEAELKASAA 1389

 Worm  1318 NRLKLQFSNELDHAKRQAEEESRERQNLSNLSKNLARELEQLKESIEDEVAGKNEASRQLSKASV 1382
            .:......::|..|::..|||:|::..||:..:.:..|.|.|:|.:|::...|....|:|::.:.
  Fly  1390 VKSASNMESQLTEAQQLLEEETRQKLGLSSKLRQIESEKEALQEQLEEDDEAKRNYERKLAEVTT 1454

 Worm  1383 ELDQWRTKFETEGLIGADEFDEVKKRQNQKTSEIQDALDACNAKIVALENARSRLTAEADANRLE 1447
            ::.:.:.|.|.:..: |.|.:|.|||.|:....::..:....|:...|:.::.::.:|.:...:|
  Fly  1455 QMQEIKKKAEEDADL-AKELEEGKKRLNKDIEALERQVKELIAQNDRLDKSKKKIQSELEDATIE 1518

 Worm  1448 AEHHAQAVSSLEKKQKAFDKVIDEWKKKVDDLYLELDGAQRDARQLSGEAHKLRGQHDTLADQVE 1512
            .|.....|..||||||.|||::.|.|...:.:..|.|.|:|:||:...:...:..:.|...|::|
  Fly  1519 LEAQRTKVLELEKKQKNFDKILAEEKAISEQIAQERDTAEREAREKETKVLSVSRELDEAFDKIE 1583

 Worm  1513 GLRRENKSLSDETRDLTESLSEGGRATHALSKNLRRLEMEKEELQRGLDEAEAALESEESKALRC 1577
            .|..:.|:|.:|..||..:.....:..|.|.|..|.||.:..||:...:|.|..|:..|...||.
  Fly  1584 DLENKRKTLQNELDDLANTQGTADKNVHELEKAKRALESQLAELKAQNEELEDDLQLTEDAKLRL 1648

 Worm  1578 QIEVSQIRAEIEKRIAEKEEEFENHRKVHQQTIDSIQATLDSETKAKSELFRVKKKLEADINELE 1642
            ::.:..:|::.|:.:..|||..|..|:...:.:..::..||.|.|.::.....|||||.|:.|:|
  Fly  1649 EVNMQALRSQFERDLLAKEEGAEEKRRGLVKQLRDLETELDEERKQRTAAVASKKKLEGDLKEIE 1713

 Worm  1643 IALDHANKANEDAQKNIRRYLDQIRELQQTVDEEQKRREEFREHLLAAERKLAVAKQEQEELIVK 1707
            ..::..||..|||.|:.::...|:::..:..:|.:..:||.:.....||||:...:.|..:|...
  Fly  1714 TTMEMHNKVKEDALKHAKKLQAQVKDALRDAEEAKAAKEELQALSKEAERKVKALEAEVLQLTED 1778

 Worm  1708 LEALERARRVVESSVKE-HQEHNNELNSQNVALAAAKSQLDNEIALLNSDIAEAHTELSASEDRG 1771
            |.:.|||||..|:...| .:|..|..|..:: :...|.:|:..||.|..::.|..:......||.
  Fly  1779 LASSERARRAAETERDELAEEIANNANKGSL-MIDEKRRLEARIATLEEELEEEQSNSEVLLDRS 1842

 Worm  1772 RRAASDAAKLAEDLRHEQEQSQQLERFKKQLESAVKDLQERADAAEAAVMKGGAKAIQKAEQRLK 1836
            |:|.....:|..:|.:|:..||:.|..:..||...|:|:.:....|.|........|...|.::.
  Fly  1843 RKAQLQIEQLTTELANEKSNSQKNENGRALLERQNKELKAKLAEIETAQRTKVKATIATLEAKIA 1907

 Worm  1837 AFQSDLETESRRAGEASKTLARADRKVREFEFQVAEDKKNYDKLQELVEKLTAKLKLQKKQLEEA 1901
            ..:..||.|.:......|...:.|:|::|....:.:::::.|:.:|.::||.:::||.|:.|:|.
  Fly  1908 NLEEQLENEGKERLLQQKANRKMDKKIKELTMNIEDERRHVDQHKEQMDKLNSRIKLLKRNLDET 1972

 Worm  1902 EEQANSHLSKYRTVQLSLETAEERADSAEQCLVRIRSRTR 1941
            ||:.....::.|..|...|...|..::..:.:..::::.|
  Fly  1973 EEELQKEKTQKRKYQRECEDMIESQEAMNREINSLKTKLR 2012

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
myo-2NP_510092.2 COG5022 27..1478 CDD:227355 580/1501 (39%)
MYSc_class_II 95..782 CDD:276951 348/722 (48%)
SMC_prok_B 1097..1936 CDD:274008 230/839 (27%)
zipNP_523860.2 Myosin_N 79..122 CDD:460670 12/42 (29%)
MYSc_Myh2_insects_mollusks 145..854 CDD:276876 348/722 (48%)
Myosin_tail_1 931..2011 CDD:460256 294/1092 (27%)

Return to query results.
Submit another query.