DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ATXN2L and Atxn2l

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011544021.1 Gene:ATXN2L / 11273 HGNCID:31326 Length:1104 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_006507783.1 Gene:Atxn2l / 233871 MGIID:2446242 Length:1102 Species:Mus musculus


Alignment Length:1106 Identity:1047/1106 - (94%)
Similarity:1060/1106 - (95%) Gaps:6/1106 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MLKPQPLQQPSQPQQPPPTQQAVARRPPGGTSPPNGGLPGPLATSAAPPGPPAAASPCLGPVAAA 65
            ||||||.||.||||||||||||||||.|||||||||||||||..:|||||||||.||||||.|||
Mouse     1 MLKPQPPQQTSQPQQPPPTQQAVARRSPGGTSPPNGGLPGPLTATAAPPGPPAAVSPCLGPAAAA 65

Human    66 GSGLRRGAEGILAPQPPPPQQHQERPGAAAIGSARGQSTGKGPPQSPVFEGVYNNSRMLHFLTAV 130
            |||||||||.|||...||  ||||||||.||||.|||:|||||||||||||||||||||||||||
Mouse    66 GSGLRRGAESILAASAPP--QHQERPGAVAIGSVRGQTTGKGPPQSPVFEGVYNNSRMLHFLTAV 128

Human   131 VGSTCDVKVKNGTTYEGIFKTLSSKFELAVDAVHRKASEPAGGPRREDIVDTMVFKPSDVMLVHF 195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||
Mouse   129 VGSTCDVKVKNGTTYEGIFKTLSSKFELAVDAVHRKASEPAGGPRREDIVDTMVFKPSDVLLVHF 193

Human   196 RNVDFNYATKDKFTDSAIAMNSKVNGEHKEKVLQRWEGGDSNSDDYDLESDMSNGWDPNEMFKFN 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   194 RNVDFNYATKDKFTDSAIAMNSKVNGEHKEKVLQRWEGGDSNSDDYDLESDMSNGWDPNEMFKFN 258

Human   261 EENYGVKTTYDSSLSSYTVPLEKDNSEEFRQRELRAAQLAREIESSPQYRLRIAMENDDGRTEEE 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   259 EENYGVKTTYDSSLSSYTVPLEKDNSEEFRQRELRAAQLAREIESSPQYRLRIAMENDDGRTEEE 323

Human   326 KHSAVQRQGSGRESPSLASREGKYIPLPQRVREGPRGGVRCSSSRGGRPGLSSLPPRGPHHLDNS 390
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   324 KHSAVQRQGSGRESPSLVSREGKYIPLPQRVREGPRGGVRCSSSRGGRPGLSSLPPRGPHHLDNS 388

Human   391 SPGPGSEARGINGGPSRMSPKAQRPLRGAKTLSSPSNRPSGETSVPPPPAAPPFLPVGRMYPPRS 455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..||.|||||||||||||
Mouse   389 SPGPGSEARGINGGPSRMSPKAQRPLRGAKTLSSPSNRPSGEASVPPTSAALPFLPVGRMYPPRS 453

Human   456 PKSAAPAPISASCPEPPIGSAVPTSSASIPVTSSVSDPGVGSISPASPKISLAPTDVKELSTKEP 520
            ||||||||:||||||||||||| .|||||||||||.|||.|||||||||:||.|||||||.||||
Mouse   454 PKSAAPAPVSASCPEPPIGSAV-ASSASIPVTSSVVDPGAGSISPASPKLSLTPTDVKELPTKEP 517

Human   521 GRTLEPQELARIAGKVPGLQNEQKRFQLEELRKFGAQFKLQPSSSPENSLDPFPPRILKEEPKGK 585
            .|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||.||||||.|||
Mouse   518 SRNLEAQELARIAGKVPGLQNEQKRFQLEELRKFGAQFKLQPSSSPETGLDPFPSRILKEEAKGK 582

Human   586 EKEVDGLLTSEPMGSPVSSKTESVSDKEDKPPLAPSGGTEGPEQPPPPCPSQTGSPPVGLIKGED 650
            ||||||||||:||||||||||||:.|||||.|:|..||||||||.|.||||||||||||||||::
Mouse   583 EKEVDGLLTSDPMGSPVSSKTESILDKEDKVPMAGVGGTEGPEQLPAPCPSQTGSPPVGLIKGDE 647

Human   651 KDEGPVAEQVKKSTLNPNAKEFNPTKPLLSVNKSTSTPTSPGPRTHSTPSIPVLTAGQSGLYSPQ 715
            |:||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   648 KEEGPVTEQVKKSTLNPNAKEFNPTKPLLSVNKSTSTPTSPGPRTHSTPSIPVLTAGQSGLYSPQ 712

Human   716 YISYIPQIHMGPAVQAPQMYPYPVSNSVPGQQGKYRGAKGSLPPQRSDQHQPASAPPMMQ-AAAA 779
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Mouse   713 YISYIPQIHMGPAVQAPQMYPYPVSNSVPGQQGKYRGAKGSLPPQRSDQHQPASAPPMMQAAAAA 777

Human   780 AGPPLVAATPYSSYIPYNPQQFPGQPAMMQPMAHYPSQPVFAPMLQSNPRMLTSGSHPQAIVSSS 844
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   778 AGPPLVAATPYSSYIPYNPQQFPGQPAMMQPMAHYPSQPVFAPMLQSNPRMLTSGSHPQAIVSSS 842

Human   845 TPQYPSAEQPTPQALYATVHQSYPHHATQLHAHQPQPATTPTGSQPQSQHAAPSPVQQHQAGQAP 909
            |||||:|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||| ||||||||
Mouse   843 TPQYPAAEQPTPQALYATVHQSYPHHATQLHGHQPQPATTPTGSQPQSQHAAPSPV-QHQAGQAP 906

Human   910 HLGSGQPQQNLYHPGALTGTPPSLPPGPSAQSPQSSFPQPAAVYAIH-HQQLPHGFTNMAHVTQA 973
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Mouse   907 HLGSGQPQQNLYHPGALTGTPPSLPPGPSAQSPQSSFPQPAAVYAIHPHQQLPHGFTNMAHVTQA 971

Human   974 HVQTGITAAPPPHPGAPHPPQVMLLHPPQSHGGPPQGAVPQSGVPALSASTPSPYPYIGHPQGEQ 1038
            |||||:|||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Mouse   972 HVQTGVTAAPPPHPGAPHPPQVMLLHPPQGHGGPPQGAVPPSGVPALSASTPSPYPYIGHPQGEQ 1036

Human  1039 PGQAPGFPGGADDRILCRVGRSHSRRRQGLAPGSVLCFPPSSLSCDPAAPLPTASPALSDPDCLL 1103
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1037 PGQAPGFPGGADDRILCRVGRSHSRRRQGLAPGSVLCFPPSSLSCDPAAPLPTASPALSDPDCLL 1101

Human  1104 T 1104
            |
Mouse  1102 T 1102

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ATXN2LXP_011544021.1 SM-ATX 123..196 CDD:464173 71/72 (99%)
LsmAD 264..326 CDD:461998 61/61 (100%)
PHA03247 <336..949 CDD:223021 576/613 (94%)
PAT1 797..>1035 CDD:401645 231/238 (97%)
Atxn2lXP_006507783.1 SM-ATX 121..194 CDD:464173 71/72 (99%)
LsmAD 262..324 CDD:461998 61/61 (100%)
PHA03247 <401..946 CDD:223021 510/546 (93%)
PAT1 755..>974 CDD:401645 214/219 (98%)

Return to query results.
Submit another query.