Protein Alignment MED12 and Med12

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_005111.2
• Gene: MED12 / 9968
• HGNCID: 11957
• Length: 2177
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_001401664.1
• Gene: Med12 / 679693
• RGDID: 1585896
• Length: 2190
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 2190
• Identity: 2113/2190 - (96%)
• Similarity: 2143/2190 - (97%)
• Gaps: 13/2190 - (0%)

Human     1 MAAFGILSYEHRPLKRPRLGPPDVYPQDPKQKEDELTALNVKQGFNNQPAVSGDEHGSAKNVSFN 65
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||
  Rat     1 MAAFGILSYEHRPLKRLRLGPPDVYPQDPKQKEDELTALNVKQGFNNQPAVSGDEHGSAKNVNFN 65

Human    66 PAKISSNFSSIIAEKLRCNTLPDTGRRKPQVNQKDNFWLVTARSQSAINTWFTDLAGTKPLTQLA 130
            |||||||||||||||||||||.||||||..:|||||||||||||||||||||||||||||||.||
  Rat    66 PAKISSNFSSIIAEKLRCNTLSDTGRRKSLMNQKDNFWLVTARSQSAINTWFTDLAGTKPLTHLA 130

Human   131 KKVPIFSKKEEVFGYLAKYTVPVMRAAWLIKMTCAYYAAISETKVKKRH-VDPFMEWTQIITKYL 194
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||:: .|||.||||||||||
  Rat   131 KKVPIFSKKEEVFGYLAKYTVPVMRAAWLIKMTCAYYAAMSETKVKKKNTADPFTEWTQIITKYL 195

Human   195 WEQLQKMAEYYRPGPAGSGGCGSTIGPLPHDVEVAIRQWDYTEKLAMFMFQDGMLDRHEFLTWVL 259
            |||||||||||||||||||.|||.|||||||||:|||||||.||||:||||||||||||||||||
  Rat   196 WEQLQKMAEYYRPGPAGSGVCGSAIGPLPHDVEMAIRQWDYNEKLALFMFQDGMLDRHEFLTWVL 260

Human   260 ECFEKIRPGEDELLKLLLPLLLRYSGEFVQSAYLSRRLAYFCTRRLALQLDGVSSHSSHVISAQS 324
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||
  Rat   261 ECFEKIRPGEDELLKLLLPLLLRYSGEFVQSAYLSRRLAYFCTRRLALQLDGVNSHSSHVISAQS 325

Human   325 TSTLPTTPAPQPPTSSTPSTPFSDLLMCPQHRPLVFGLSCILQTILLCCPSALVWHYSLTDSRIK 389
            ||:||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 TSSLPTTPAPQPPTSNTPSTPFSDLLMCPQHRPLVFGLSCILQTILLCCPSALVWHYSLTDSRIK 390

Human   390 TGSPLDHLPIAPSNLPMPEGNSAFTQQVRAKLREIEQQIKERGQAVEVRWSFDKCQEATAGFTIG 454
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 TGSPLDHLPIAPSNLPMPEGNSAFTQQVRAKLREIEQQIKERGQAVEVRWSFDKCQEATAGFTIG 455

Human   455 RVLHTLEVLDSHSFERSDFSNSLDSLCNRIFGLGPSKDGHEISSDDDAVVSLLCEWAVSCKRSGR 519
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 RVLHTLEVLDSHSFERSDFSNSLDSLCNRIFGLGPSKDGHEISSDDDAVVSLLCEWAVSCKRSGR 520

Human   520 HRAMVVAKLLEKRQAEIEAERCGESEAADEKGSIASGSLSAPSAPIFQDVLLQFLDTQAPMLTDP 584
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 HRAMVVAKLLEKRQAEIEAERCGESEAADEKGSVASGSLSAPSAPIFQDVLLQFLDTQAPMLTDP 585

Human   585 RSESERVEFFNLVLLFCELIRHDVFSHNMYTCTLISRGDLAFGAPGPRPPSPFDDPADDPEHKEA 649
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||
  Rat   586 RSESERVEFFNLVLLFCELIRHDVFSHNMYTCTLISRGDLAFGTPGPRPPSPFDDPADDPERKEA 650

Human   650 EGSSSSKLEDPGLSESMDIDPSSSVLFEDMEKPDFSLFSPTMPCEGKGSPSPEKPDVEKEVKPPP 714
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||
  Rat   651 EGSSSSKLEDPGLSESMDIDPSSSVLFEDMEKPDFSLFSPTMPCEGKGSPSPEKPDVEKDVKPPP 715

Human   715 KEKIEGTLGVLYDQPRHVQYATHFPIPQEESCSHECNQRLVVLFGVGKQRDDARHAIKKITKDIL 779
            |||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   716 KEKIEGTLGILYDQPRHVQYATHFPIPQEESCSHECNQRLVVLFGVGKQRDDARHAIKKITKDIL 780

Human   780 KVLNRKGTAETDQLAPIVPLNPGDLTFLGGEDGQKRRRNRPEAFPTAEDIFAKFQHLSHYDQHQV 844
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   781 KVLNRKGTAETDQLAPIVPLNPGDLTFLGGEDGQKRRRNRPEAFPTAEDIFAKFQHLSHYDQHQV 845

Human   845 TAQVSRNVLEQITSFALGMSYHLPLVQHVQFIFDLMEYSLSISGLIDFAIQLLNELSVVEAELLL 909
            |||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 TAQVSRNVLEQITSFALGMSYHLPLVQHVQFVFDLMEYSLSISGLIDFAIQLLNELSVVEAELLL 910

Human   910 KSSDLVGSYTTSLCLCIVAVLRHYHACLILNQDQMAQVFEGLCGVVKHGMNRSDGSSAERCILAY 974
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   911 KSSDLVGSYTTSLCLCIVAVLRHYHACLILNQDQMAQVFEGLCGVVKHGMNRSDGSSAERCILAY 975

Human   975 LYDLYTSCSHLKNKFGELFSDFCSKVKNTIYCNVEPSESNMRWAPEFMIDTLENPAAHTFTYTGL 1039
            ||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   976 LYDLYTSCSHLKSKFGELFSDFCSKVKNTIYCNVEPSESNMRWAPEFMIDTLENPAAHTFTYTGL 1040

Human  1040 GKSLSENPANRYSFVCNALMHVCVGHHDPDRVNDIAILCAELTGYCKSLSAEWLGVLKALCCSSN 1104
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1041 GKSLSENPANRYSFVCNALMHVCVGHHDPDRVNDIAILCAELTGYCKSLSAEWLGVLKALCCSSN 1105

Human  1105 NGTCGFNDLLCNVDVSDLSFHDSLATFVAILIARQCLLLEDLIRCAAIPSLLNAACSEQDSEPGA 1169
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1106 NGTCGFNDLLCNVDVSDLSFHDSLATFVAILIARQCLLLEDLIRCAAIPSLLNAACSEQDSEPGA 1170

Human  1170 RLTCRILLHLFKTPQLNPCQSDGNKPTVGIRSSCDRHLLAASQNRIVDGAVFAVLKAVFVLGDAE 1234
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1171 RLTCRILLHLFKTPQLNPCQSDGNKPTVGIRSSCDRHLLAASQNRIVDGAVFAVLKAVFVLGDAE 1235

Human  1235 LKGSGFTVTGGTEELPEEEGGGGSGGRRQGGRNISVETASLDVYAKYVLRSICQQEWVGERCLKS 1299
            ||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1236 LKGSGFTVPGGTEELPEEEGGGGSSGRRQGGRNISVETASLDVYAKYVLRSICQQEWVGERCLKS 1300

Human  1300 LCEDSNDLQDPVLSSAQAQRLMQLICYPHRLLDNEDGENPQRQRIKRILQNLDQWTMRQSSLELQ 1364
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||:|||||||||||||||
  Rat  1301 LCEDSNDLQDPVLSSAQAQRLMQLICYPHRLLDSEDGENPQRQRIKRILKNLDQWTMRQSSLELQ 1365

Human  1365 LMIKQTPNNEMNSLLENIAKATIEVFQQSAETGSSSGSTASNMPSSSKTKPVLSSLERSGVWLVA 1429
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
  Rat  1366 LMIKQTPNTEMNSLLENIAKATIEVFQQSAETGSSSGSTASNMPSSSKAKPVLSSLERSGVWLVA 1430

Human  1430 PLIAKLPTSVQGHVLKAAGEELEKGQHLGSSSRKERDRQKQKSMSLLSQQPFLSLVLTCLKGQDE 1494
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1431 PLIAKLPTSVQGHVLKAAGEELEKGQHLGSSSRKERDRQKQKSMSLLSQQPFLSLVLTCLKGQDE 1495

Human  1495 QREGLLTSLYSQVHQIVNNWRDDQYLDDCKPKQLMHEALKLRLNLVGGMFDTVQRSTQQTTEWAM 1559
            ||||||.||:|||||||.|||::|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
  Rat  1496 QREGLLASLHSQVHQIVINWRENQYLDDCKPKQLMHEALKLRLNLVGGMFDTVQRSTQQTTEWAQ 1560

Human  1560 LLLEIIISGTVDMQSNNELFTTVLDMLSVLINGTLAADMSSISQGSMEENKRAYMNLAKKLQKEL 1624
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||:|
  Rat  1561 LLLEIIISGTVDMQSNNELFTTVLDMLSVLINGTLAADMSSISQGSMEENKRAYMNLVKKLQKDL 1625

Human  1625 GERQSDSLEKVRQLLPLPKQTRDVITCEPQGSLIDTKGNKIAGFDSIFKKEGLQVSTKQKISPWD 1689
            |||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:
  Rat  1626 GERQSDSLEKVHQLLPLPKQNRDVITCEPQGSLIDTKGNKIAGFDSIFKKEGLQVSTKQKISPWE 1690

Human  1690 LFEGLKPS-APLSWGWFGTVRVDRRVARGEEQQRLLLYHTHLRPRPRAYYLEPLPLPPEDEEPPA 1753
            |||||||| |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1691 LFEGLKPSTAPLSWAWFGTVRVDRRVARGEEQQRLLLYHTHLRPRPRAYYLEPLPLPPEDEEPPA 1755

Human  1754 PTLLEPEKKAPEPPKTDKPGAAPPSTEERKKKSTKGKKRSQPATKTEDYGMGPGRSGPYGVTVPP 1818
            |.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||
  Rat  1756 PALLEPEKKAPEPPKTDKPGTAPPSTEERKKKSTKGKKRSQPATKSEDYGMGPGRSGPYGVTVPP 1820

Human  1819 DLLHHPNPGSITHLNYRQGSIGLYTQNQPLPAGGPRVDPYRPVRLPMQKLPTRPTYPGVLPTTMT 1883
            |||||.|||||:||:|||.|:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1821 DLLHHANPGSISHLSYRQSSMGLYTQNQPLPAGGPRVDPYRPVRLPMQKLPTRPTYPGVLPTTMT 1885

Human  1884 GVMGLEPSSYKTSVYRQQQPAVPQGQRLRQQLQ---QSQGMLGQSSVHQMTPSSSYGLQTSQGYT 1945
            .|||||||||||||||||||.||||||||||||   |||||||||||||||||||||||:|||||
  Rat  1886 TVMGLEPSSYKTSVYRQQQPTVPQGQRLRQQLQAKIQSQGMLGQSSVHQMTPSSSYGLQSSQGYT 1950

Human  1946 PYVSHVGLQQHTGPAGTMVPPSYSSQPYQSTHPSTNPTLVDPTRHLQQRPSGYVHQQAPTYGHGL 2010
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1951 SYVSHVGLQQHTGPAGTMVPPSYSSQPYQSTHPSTNPTLVDPTRHLQQRPSGYVHQQAPTYGHGL 2015

Human  2011 TSTQRFSHQTLQQTPMISTMTPMSAQGVQAGVRSTAILPE------QQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 2069
            ||||||||||||||||:.||||:||||||||||||:||||      |||||||||||||||||||
  Rat  2016 TSTQRFSHQTLQQTPMMGTMTPLSAQGVQAGVRSTSILPEQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 2080

Human  2070 QQQQQQQYHIR-QQQQQQILRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ-QQQHQQQQQQQAAPPQPQPQ 2132
            ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||...||||||||||||||
  Rat  2081 QQQQQQQYHIRQQQQQQQILRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPQQQQPHQQQQQAAPPQPQPQ 2145

Human  2133 SQPQFQRQGLQQTQQQQQTAALVRQLQQQLSNTQPQPSTNIFGRY 2177
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2146 SQPQFQRQGLQQTQQQQQTAALVRQLQQQLSNTQPQPSTNIFGRY 2190

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
MED12	NP_005111.2	Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	12..35		21/22 (95%)
		Med12	106..161	CDD:462818	53/54 (98%)
		Med12-LCEWAV	286..757	CDD:463472	462/470 (98%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	323..344		18/20 (90%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	627..669		39/41 (95%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	690..717		25/26 (96%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1241..1266		22/24 (92%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1394..1415		19/20 (95%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1450..1474		23/23 (100%)
		Interaction with CTNNB1 and GLI3. /evidence=ECO:0000269|PubMed:17000779	1616..2051		413/444 (93%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1738..1829		86/90 (96%)
		Med12-PQL	1819..2022	CDD:463471	193/205 (94%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1919..1938		18/18 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1967..1989		21/21 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	2115..2149		30/33 (91%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	2158..2177		18/18 (100%)
Med12	NP_001401664.1	Med12	106..161	CDD:462818	53/54 (98%)
		Med12-LCEWAV	287..758	CDD:463472	462/470 (98%)
		Med12-PQL	1821..2027	CDD:463471	193/205 (94%)