DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MED12 and med12

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_005111.2 Gene:MED12 / 9968 HGNCID:11957 Length:2177 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001428489.1 Gene:med12 / 566632 ZFINID:ZDB-GENE-060125-1 Length:2179 Species:Danio rerio


Alignment Length:2244 Identity:1632/2244 - (72%)
Similarity:1828/2244 - (81%) Gaps:137/2244 - (6%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAAFGILSYEHRPLKRPRLGPPDVYPQDPKQKEDELTALNVKQGFNNQPAVSGDEHGSAKNVSFN 65
            |||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||
Zfish     2 MAAFGVLSYEHRPLKRPRLGPPDVYPQDPKQKEDELTALNVKQGFNNQPAVSGDEHGSAKNVNFN 66

Human    66 PAKISSNFSSIIAEKLRCNTLPDTGRRKPQVNQKDNFWLVTARSQSAINTWFTDLAGTKPLTQLA 130
            .:||||||||||||||||||.||||:||||||||||||||||||||:||.|||||||||||||||
Zfish    67 SSKISSNFSSIIAEKLRCNTFPDTGKRKPQVNQKDNFWLVTARSQSSINNWFTDLAGTKPLTQLA 131

Human   131 KKVPIFSKKEEVFGYLAKYTVPVMRAAWLIKMTCAYYAAISETKVKKRHV-DPFMEWTQIITKYL 194
            |||||||||||||||||||:|||||:||:|||||||:|||:|.|:||||| ||.:||||||||||
Zfish   132 KKVPIFSKKEEVFGYLAKYSVPVMRSAWMIKMTCAYHAAITENKMKKRHVIDPCIEWTQIITKYL 196

Human   195 WEQLQKMAEYYRPGPAGSGGCGSTIGPLPHDVEVAIRQWDYTEKLAMFMFQDGMLDRHEFLTWVL 259
            ||||||:||:||..|  |.||||.:...|.:||.|::||:|.|||||||||||||||||||||||
Zfish   197 WEQLQKVAEFYRQSP--SQGCGSPLPAPPAEVETAMKQWEYNEKLAMFMFQDGMLDRHEFLTWVL 259

Human   260 ECFEKIRPGEDELLKLLLPLLLRYSGEFVQSAYLSRRLAYFCTRRLALQLD------GVSSHSSH 318
            ||||||||||||||:|||||||:|||||||||||||||||||||||.|.|.      |...|.:|
Zfish   260 ECFEKIRPGEDELLRLLLPLLLQYSGEFVQSAYLSRRLAYFCTRRLNLLLSDGSIGPGPGGHQAH 324

Human   319 VISAQSTSTLPTTPAPQPPTSSTPSTPFSDLLMCPQHRPLVFGLSCILQTILLCCPSALVWHYSL 383
            .||||..:.||.||..||...:.|.|||:|..:||||||:||||||:||:|:|||||||||||||
Zfish   325 GISAQQGNALPPTPTSQPAGGNQPQTPFTDFYICPQHRPVVFGLSCMLQSIVLCCPSALVWHYSL 389

Human   384 TDSRIKTGSPLDHLPIAPSNLPMPEGNSAFTQQVRAKLREIEQQIKERGQAVEVRWSFDKCQEAT 448
            ||||.|||||||.|||||||||||.|||.|.||||||:||||:||||||||||.|||||||||.|
Zfish   390 TDSRNKTGSPLDLLPIAPSNLPMPGGNSTFNQQVRAKVREIEEQIKERGQAVEFRWSFDKCQETT 454

Human   449 AGFTIGRVLHTLEVLDSHSFERSDFSNSLDSLCNRIFGLGPSKDGHEISSDDDAVVSLLCEWAVS 513
            |||||.||||||||||:||||:||||||||||.|||||.|.||||||:|.||||||:||||||||
Zfish   455 AGFTISRVLHTLEVLDNHSFEKSDFSNSLDSLYNRIFGSGQSKDGHEMSPDDDAVVTLLCEWAVS 519

Human   514 CKRSGRHRAMVVAKLLEKRQAEIEAERCGESEAADEKGSIASGSLSAPSAPIFQDVLLQFLDTQA 578
            |||||.||||||||||||||.|||||||||||..|||||::||||||.:.|:|||||||||||||
Zfish   520 CKRSGPHRAMVVAKLLEKRQTEIEAERCGESEVVDEKGSVSSGSLSAATLPVFQDVLLQFLDTQA 584

Human   579 PMLTDPRSESERVEFFNLVLLFCELIRHDVFSHNMYTCTLISRGDLAFGAPGPRPPSPFDDPADD 643
            |:||:|.:|||||||.||||||.|||||||||||:|.||||||||||..:..|||.||.|:|:|:
Zfish   585 PVLTEPGNESERVEFSNLVLLFYELIRHDVFSHNIYMCTLISRGDLASNSHLPRPRSPSDEPSDE 649

Human   644 PEHKEAEGSSSSKLEDPGLSESMDIDPSSSVLFEDMEKPDFSLFSPTMPCEGKGSPSPEKPDVEK 708
            .|.|:.:..||.|:||.|:||||:||.:||..|::      .:|||.|.||.||||||||...|:
Zfish   650 SERKDQDAGSSVKMEDTGMSESMEIDHNSSANFDE------QMFSPPMHCESKGSPSPEKQAQEQ 708

Human   709 EVKPPPKEK-IEGTLGVLYDQPRHVQYATHFPIPQEESCSHECNQRLVVLFGVGKQRDDARHAIK 772
            |.|...|:| ::....::|:||||:|||||||||||||.|||||||||||:|||||||:||||||
Zfish   709 ESKSTAKDKGMDPAFPLVYEQPRHIQYATHFPIPQEESASHECNQRLVVLYGVGKQRDEARHAIK 773

Human   773 KITKDILKVLNRKGTAETDQLAPIVPLNPGDLTFLGGEDGQKRRRNRPEAFPTAEDIFAKFQHLS 837
            |||||||||||||.||||                 |||:||||:|::|||||||||||:||||||
Zfish   774 KITKDILKVLNRKSTAET-----------------GGEEGQKRKRSKPEAFPTAEDIFSKFQHLS 821

Human   838 HYDQHQVTAQVSRNVLEQITSFALGMSYHLPLVQHVQFIFDLMEYSLSISGLIDFAIQLLNELSV 902
            |:||||||:||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||:||||||||||||||||:
Zfish   822 HFDQHQVTSQVSRNVLEQITSFALGMSYHLPLVQHIQFIFDLMEYSLNISGLIDFAIQLLNELSL 886

Human   903 VEAELLLKSSDLVGSYTTSLCLCIVAVLRHYHACLILNQDQMAQVFEGLCGVVKHGMNRSDGSSA 967
            ||||||||||:|.|||||.||||||||||.||:|||||.||.||||:||..|||.|:|.:|.|||
Zfish   887 VEAELLLKSSNLAGSYTTGLCLCIVAVLRRYHSCLILNPDQTAQVFDGLRIVVKSGVNPADCSSA 951

Human   968 ERCILAYLYDLYTSCSHLKNKFGELFSDFCSKVKNTIYCNVEPSESNMRWAPEFMIDTLENPAAH 1032
            |||||||||||||||||||:||||:||:|||||||:||.|::||:|||.|...||||.:.||.||
Zfish   952 ERCILAYLYDLYTSCSHLKSKFGEIFSEFCSKVKNSIYYNIDPSDSNMLWDQMFMIDAITNPTAH 1016

Human  1033 TFTYTGLGK---SLSENPANRYSFVCNALMHVCVGHHDPDRVNDIAILCAELTGYCKSLSAEWLG 1094
            ...::.|||   .|:::||||||||||.||.|||.|.||:|||||.|||||||.||:||||||||
Zfish  1017 NLNHSMLGKITNELNDSPANRYSFVCNVLMDVCVDHRDPERVNDIGILCAELTAYCRSLSAEWLG 1081

Human  1095 VLKALCCSSNNGTCGFNDLLCNVDVSDLSFHDSLATFVAILIARQCLLLEDLIRCAAIPSLLNAA 1159
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||.|||||||||
Zfish  1082 VLKALCCSSNNGNCGFNDLLCNVDVSDLSFHDSLATFVAILIARQCLLLEDLVRCVAIPSLLNAA 1146

Human  1160 CSEQDSEPGARLTCRILLHLFKTPQLNPCQSDG---NKPTVGIRSSCDRHLLAASQNRIVDGAVF 1221
            |||||||||||||||||||||:|||.|||..||   :|..|||||||||||||||||.||.||||
Zfish  1147 CSEQDSEPGARLTCRILLHLFRTPQRNPCPQDGTKSDKSIVGIRSSCDRHLLAASQNSIVVGAVF 1211

Human  1222 AVLKAVFVLGDAELKGSGFTVTGGTEELPEEEGGGGSGGRRQGGRNISVETASLDVYAKYVLRSI 1286
            |||||||:|||||||||||:...|.:::.|::    .|.::.||||:|:|||||.|||||||:||
Zfish  1212 AVLKAVFMLGDAELKGSGFSHPAGLDDIGEDD----MGSKKSGGRNVSIETASLVVYAKYVLKSI 1272

Human  1287 CQQEWVGERCLKSLCEDSNDLQDPVLSSAQAQRLMQLICYPHRLLDNEDGENPQRQRIKRILQNL 1351
            |.||||||||||||.|||:.||||||.:.|||||:||||||||.||:|:|:|||||||||||||:
Zfish  1273 CHQEWVGERCLKSLSEDSSALQDPVLVNIQAQRLLQLICYPHRQLDSEEGDNPQRQRIKRILQNM 1337

Human  1352 DQWTMRQSSLELQLMIKQTPNNEMNSLLENIAKATIEVFQQSAETGSS---------SGSTASNM 1407
            ||||||||||||||||||:.|||:.|||||||||||||||:|||..||         |||:.||.
Zfish  1338 DQWTMRQSSLELQLMIKQSSNNELYSLLENIAKATIEVFQKSAEMNSSNPSWNGSAVSGSSVSNS 1402

Human  1408 PSSSKTKPVLSSLERSGVWLVAPLIAKLPTSVQGHVLKAAGEELEKGQHLGSSSRKERDRQKQKS 1472
            .|:||.||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Zfish  1403 NSASKLKPVLSSSERSGVWLVAPLIGKLPTSVQGHVLKAAGEELEKGQHLGPSSRKERDRQKQKS 1467

Human  1473 MSLLSQQPFLSLVLTCLKGQDEQREGLLTSLYSQVHQIVNNWRDDQYLDDCKPKQLMHEALKLRL 1537
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||:|||.||||.||:|||||||||
Zfish  1468 MSLLSQQPFLSLVLTCLKGQDEQREGLLTSLYSQVQQIVTNWREDQYQDDCKAKQMMHEALKLRL 1532

Human  1538 NLVGGMFDTVQRSTQQTTEWAMLLLEIIISGTVDMQSNNELFTTVLDMLSVLINGTLAADMSSIS 1602
            |||||||||||||||||||||:|||:||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish  1533 NLVGGMFDTVQRSTQQTTEWAVLLLDIISSGTVDMQSNNELFTTVLDMLSVLINGTLAADMSSIS 1597

Human  1603 QGSMEENKRAYMNLAKKLQKELGERQSDSLEKVRQLLPLPKQTRDVITCEPQGSLIDTKGNKIAG 1667
            ||||||||||||||.|||:||||:|||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish  1598 QGSMEENKRAYMNLVKKLRKELGDRQSESLEKVRQLLPLPKQTRDVITCEPQGSLIDTKGNKIAG 1662

Human  1668 FDSIFKKEGLQVSTKQKISPWDLFEGLKPSAPLSWGWFGTVRVDRRVARGEEQQRLLLYHTHLRP 1732
            |:    ||||||||||||||||:|||||.|||||||||||:||||:|.:.||||||||||||::|
Zfish  1663 FE----KEGLQVSTKQKISPWDVFEGLKHSAPLSWGWFGTIRVDRKVTKFEEQQRLLLYHTHIKP 1723

Human  1733 RPRAYYLEPLPLPPEDEEPPAPTLLEPEKKAPEPPKTDKPGAAPPSTEERKKKSTKGKKRSQPAT 1797
            :.|:|||.||.||.|:|||..|...||:||. :..|.:|..::.|:    |||    ||:.....
Zfish  1724 KQRSYYLAPLNLPQEEEEPLTPVPPEPDKKL-DTAKVEKSVSSVPT----KKK----KKKPASTV 1779

Human  1798 KTEDY-------GMGPGRSGPYGVTVPPDLLHHPNPGSITHLNYRQG---SIGLYTQNQPLPAGG 1852
            |.|||       ...||        :.|||   |.....|:::||.|   .:.:|.||||||.||
Zfish  1780 KQEDYKPHNTVMQYAPG--------MTPDL---PLSMGQTNMSYRMGYQAPMNMYAQNQPLPPGG 1833

Human  1853 PRVD-PYRPVRLPMQKLPTRPTY--PGVLPTTMTGVMGLEPS---SYKTSVYRQQQPAVPQGQRL 1911
            |.:: |:|| |:||.|:|.||.|  |.:....|..:||:|..   :||      ..|.:.|||.|
Zfish  1834 PGLEPPFRP-RVPMNKMPPRPNYTMPNMQTAGMGNLMGMEKQYQMNYK------PMPNMAQGQML 1891

Human  1912 RQQLQQSQG---MLGQSSVHQMTPSSSY-GLQTS----QGYTPYVSHVGLQQHTGPAGTMVPPSY 1968
            |.|||...|   ::|| .:.|:||:..| .:|.:    ||||.|.||:|:|.|......|||.||
Zfish  1892 RHQLQVRLGHNHLIGQ-QIRQVTPNPQYSSMQPAQNIPQGYTSYGSHMGMQPHPSQTPGMVPNSY 1955

Human  1969 SSQPYQSTHPSTNPTLVDPTRHLQQRPSGYVHQQAP-TYGHGLTSTQRFSHQTLQQTPMIS--TM 2030
            .:|.:|:.||:||||:||..|.:|||| |||||||| .|||.:.|||||.||::|||||:.  ..
Zfish  1956 GNQGFQTGHPATNPTMVDSIRQMQQRP-GYVHQQAPAAYGHTIQSTQRFPHQSMQQTPMMHGLAQ 2019

Human  2031 TPMSAQGVQAGVRSTAILPEQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ--QQQYHIRQ------QQQQQI 2087
            :.:..||:...:|     |.|..:|||||||||||||||||||  |||.||||      |||||:
Zfish  2020 SHLGVQGIHPNMR-----PNQMMEQQQQQQQQQQQQQQQQQQQVHQQQQHIRQGPVFRPQQQQQV 2079

Human  2088 LRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ---QQQQQQQHQQQQQQQAAPPQPQ---------PQSQPQFQRQ 2140
            .:|.|||.||||.||||.|||   ||.||||.|||||||.:..||.         |..||.||||
Zfish  2080 QQQVQQQVQQQQVQQQQVQQQVQPQQVQQQQVQQQQQQQVSAAQPPAQALGMQALPPQQPMFQRQ 2144

Human  2141 GLQQTQQQQQTAALVRQLQQQLSNTQPQPSTNIF 2174
            |:|||||||||||||||||||||:|||..:.:.:
Zfish  2145 GMQQTQQQQQTAALVRQLQQQLSSTQPAQNNSSY 2178

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MED12NP_005111.2 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 12..35 22/22 (100%)
Med12 106..161 CDD:462818 49/54 (91%)
Med12-LCEWAV 286..757 CDD:463472 345/477 (72%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 323..344 8/20 (40%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 627..669 20/41 (49%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 690..717 15/26 (58%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1241..1266 4/24 (17%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1394..1415 12/29 (41%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1450..1474 22/23 (96%)
Interaction with CTNNB1 and GLI3. /evidence=ECO:0000269|PubMed:17000779 1616..2051 240/461 (52%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1738..1829 33/97 (34%)
Med12-PQL 1819..2022 CDD:463471 100/220 (45%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1919..1938 7/22 (32%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1967..1989 12/21 (57%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2115..2149 23/42 (55%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2158..2177 9/17 (53%)
med12NP_001428489.1 None

Return to query results.
Submit another query.