DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment FIG4 and Fig4

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_055660.1 Gene:FIG4 / 9896 HGNCID:16873 Length:907 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001040561.1 Gene:Fig4 / 309855 RGDID:1311375 Length:907 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:907 Identity:852/907 - (93%)
Similarity:887/907 - (97%) Gaps:0/907 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MPTAAAPIISSVQKLVLYETRARYFLVGSNNAETKYRVLKIDRTEPKDLVIIDDRHVYTQQEVRE 65
            ||||||||||||||||||||||||||||||:||||:||||||||||||||:||||||||||||||
  Rat     1 MPTAAAPIISSVQKLVLYETRARYFLVGSNHAETKFRVLKIDRTEPKDLVVIDDRHVYTQQEVRE 65

Human    66 LLGRLDLGNRTKMGQKGSSGLFRAVSAFGVVGFVRFLEGYYIVLITKRRKMADIGGHAIYKVEDT 130
            ||||||||||||:.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||
  Rat    66 LLGRLDLGNRTKLSQKGSSGLFRAVSAFGVVGFVRFLEGYYIVLITKRRKMADIGGHAIYKIEDT 130

Human   131 NMIYIPNDSVRVTHPDEARYLRIFQNVDLSSNFYFSYSYDLSHSLQYNLTVLRMPLEMLKSEMTQ 195
            :||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.::
  Rat   131 SMIYIPNDSVRITHPDEARYLRIFQNVDLSSNFYFSYSYDLSHSLQYNLTVLRMPLEMLKSETSK 195

Human   196 NRQESFDIFEDEGLITQGGSGVFGICSEPYMKYVWNGELLDIIKSTVHRDWLLYIIHGFCGQSKL 260
            ..||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||::|||||||||||||||||||
  Rat   196 TCQESFDIFEDEGLTTQGGSGVFGISSEPYMKYVWNGELLDIIKNSVHRDWLLYIIHGFCGQSKL 260

Human   261 LIYGRPVYVTLIARRSSKFAGTRFLKRGANCEGDVANEVETEQILCDASVMSFTAGSYSSYVQVR 325
            |||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 LIYGRPVYVTLIARRSSRFAGTRFLKRGANCEGDVANEVETEQILCDASVMSFTAGSYSSYVQVR 325

Human   326 GSVPLYWSQDISTMMPKPPITLDQADPFAHVAALHFDQMFQRFGSPIIILNLVKEREKRKHERIL 390
            |||||:||||||||||||||||||||||||:||||||||.|||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 GSVPLFWSQDISTMMPKPPITLDQADPFAHIAALHFDQMLQRFGSPIIILNLVKEREKRKHERIL 390

Human   391 SEELVAAVTYLNQFLPPEHTIVYIPWDMAKYTKSKLCNVLDRLNVIAESVVKKTGFFVNRPDSYC 455
            |||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 SEELVAAVTYLNQFLPPEHSIVYIPWDMAKYTKSKLCNVLDRLNVIAESVVKKTGFFVNRPDSYC 455

Human   456 SILRPDEKWNELGGCVIPTGRLQTGILRTNCVDCLDRTNTAQFMVGKCALAYQLYSLGLIDKPNL 520
            |:||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 SVLRPDEKWNELGGRVIPTGRLQTGILRTNCVDCLDRTNTAQFMVGKCALAYQLYSLGLIDKPNL 520

Human   521 QFDTDAVRLFEELYEDHGDTLSLQYGGSQLVHRVKTYRKIAPWTQHSKDIMQTLSRYYSNAFSDA 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 QFDTDAVRLFEELYEDHGDTLSLQYGGSQLVHRVKTYRKIAPWTQHSKDIMQTLSRYYSNAFSDA 585

Human   586 DRQDSINLFLGVFHPTEGKPHLWELPTDFYLHHKNTMRLLPTRRSYTYWWTPEVIKHLPLPYDEV 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.:||||:||||||:||||||||||
  Rat   586 DRQDSINLFLGVFHPTEGKPHLWELPTDFYLHHKNTMSLLPPKRSYTHWWTPEVVKHLPLPYDEV 650

Human   651 ICAVNLKKLIVKKFHKYEEEIDIHNEFFRPYELSSFDDTFCLAMTSSARDFMPKTVGIDPSPFTV 715
            |||.|||||.|||||::||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||
  Rat   651 ICAANLKKLTVKKFHRWEEEIDIHNEFFRPYELSSFDDTFCLAMTSSARDFMPKTIGIDPSPFTV 715

Human   716 RKPDETGKSVLGNKSNREEAVLQRKTAASAPPPPSEEAVSSSSEDDSGTDREEEGSVSQRSTPVK 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||:||||||||
  Rat   716 RKPDETGKSVLGNKSNREEAVLQRKTAASAPPPPSEEAVSSSSEDDSGTDREDEGSISQRSTPVK 780

Human   781 MTDAGDSAKVTENVVQPMKELYGINLSDGLSEEDFSIYSRFVQLGQSQHKQDKNSQQPCSRCSDG 845
            |||.||||||||:|.|||||:||::||..|||||.|||:||||||||||:||.:|.|.|:|||||
  Rat   781 MTDTGDSAKVTESVAQPMKEVYGVSLSRSLSEEDHSIYARFVQLGQSQHRQDWSSPQMCARCSDG 845

Human   846 VIKLTPISAFSQDNIYEVQPPRVDRKSTEIFQAHIQASQGIMQPLGKEDSSMYREYIRNRYL 907
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:::||||||||||
  Rat   846 VIKLTPISAFSQDNIYEVQPPRVDRKSTEIFQAHIQASQGIMQPLGKEDTAIYREYIRNRYL 907

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
FIG4NP_055660.1 Syja_N 93..423 CDD:460545 312/329 (95%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 707..788 77/80 (96%)
Fig4NP_001040561.1 Syja_N 93..423 CDD:460545 312/329 (95%)

Return to query results.
Submit another query.