DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment FIG4 and fig4

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_055660.1 Gene:FIG4 / 9896 HGNCID:16873 Length:907 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_031757753.1 Gene:fig4 / 100379892 XenbaseID:XB-GENE-6047255 Length:907 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:904 Identity:770/904 - (85%)
Similarity:825/904 - (91%) Gaps:1/904 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     5 AAPIISSVQKLVLYETRARYFLVGSNNAETKYRVLKIDRTEPKDLVIIDDRHVYTQQEVRELLGR 69
            ||||||.:|||:||||||||||||||:|||:|||||||||||||||||||:||||||||||||||
 Frog     4 AAPIISGIQKLILYETRARYFLVGSNHAETRYRVLKIDRTEPKDLVIIDDKHVYTQQEVRELLGR 68

Human    70 LDLGNRTKMGQKGSSGLFRAVSAFGVVGFVRFLEGYYIVLITKRRKMADIGGHAIYKVEDTNMIY 134
            |||||||||||||||||.|||||||:||||:||||||||||||||||||||||||||:|||:|||
 Frog    69 LDLGNRTKMGQKGSSGLSRAVSAFGIVGFVQFLEGYYIVLITKRRKMADIGGHAIYKIEDTSMIY 133

Human   135 IPNDSVRVTHPDEARYLRIFQNVDLSSNFYFSYSYDLSHSLQYNLTVLRMPLEMLKSEMT-QNRQ 198
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||.||||||.. ..||
 Frog   134 IPNDSVRVTHPDEARYLRIFQNVDLSSNFYFSYSYDLSHSLQYNLTILRMPAEMLKSETAPHTRQ 198

Human   199 ESFDIFEDEGLITQGGSGVFGICSEPYMKYVWNGELLDIIKSTVHRDWLLYIIHGFCGQSKLLIY 263
            |.|||||||.|..||||||||||||||||||||||||..::..||||||||||||||||||||||
 Frog   199 EGFDIFEDEELSNQGGSGVFGICSEPYMKYVWNGELLQNVRDVVHRDWLLYIIHGFCGQSKLLIY 263

Human   264 GRPVYVTLIARRSSKFAGTRFLKRGANCEGDVANEVETEQILCDASVMSFTAGSYSSYVQVRGSV 328
            ||||||||:|||||:||||||||||||||||||||||||||:.||||||||||||||||||||||
 Frog   264 GRPVYVTLMARRSSRFAGTRFLKRGANCEGDVANEVETEQIVHDASVMSFTAGSYSSYVQVRGSV 328

Human   329 PLYWSQDISTMMPKPPITLDQADPFAHVAALHFDQMFQRFGSPIIILNLVKEREKRKHERILSEE 393
            ||||||||||||||||||||||||||:.||:|||:|.||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   329 PLYWSQDISTMMPKPPITLDQADPFAYAAAIHFDKMLQRFGSPIIILNLVKEREKRKHERILSEE 393

Human   394 LVAAVTYLNQFLPPEHTIVYIPWDMAKYTKSKLCNVLDRLNVIAESVVKKTGFFVNRPDSYCSIL 458
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||:|
 Frog   394 LVAAVTYLNQFLPPEHWIVYIPWDMAKYTKSKLCNVLDRLNVIAESVVKKTGFFVNRPDPYCSVL 458

Human   459 RPDEKWNELGGCVIPTGRLQTGILRTNCVDCLDRTNTAQFMVGKCALAYQLYSLGLIDKPNLQFD 523
            |||||||||||.|..:||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   459 RPDEKWNELGGVVGQSGRLQTGVLRTNCVDCLDRTNTAQFMVGKCALAYQLYSLGLIDKPNLQFD 523

Human   524 TDAVRLFEELYEDHGDTLSLQYGGSQLVHRVKTYRKIAPWTQHSKDIMQTLSRYYSNAFSDADRQ 588
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   524 TDAVRLFEELYEDHGDTLSLQYGGSQLVHRVKTYRKIAPWTQHSKDIMQTLSRYYSNAFSDADRQ 588

Human   589 DSINLFLGVFHPTEGKPHLWELPTDFYLHHKNTMRLLPTRRSYTYWWTPEVIKHLPLPYDEVICA 653
            |:||||||||.|.|||||||||||||||||||||.|...:||||:||||:|:::||||.|||..:
 Frog   589 DAINLFLGVFRPAEGKPHLWELPTDFYLHHKNTMGLDHAKRSYTFWWTPKVLENLPLPLDEVHSS 653

Human   654 VNLKKLIVKKFHKYEEEIDIHNEFFRPYELSSFDDTFCLAMTSSARDFMPKTVGIDPSPFTVRKP 718
            .||||:.:||.::..:|.:|:||||||||||:||||||||||:||||||||:|.|||||||||||
 Frog   654 ENLKKMTIKKCNRSNDETNIYNEFFRPYELSNFDDTFCLAMTNSARDFMPKSVAIDPSPFTVRKP 718

Human   719 DETGKSVLGNKSNREEAVLQRKTAASAPPPPSEEAVSSSSEDDSGTDREEEGSVSQRSTPVKMTD 783
            |||||||.|||||:||.|||||||||||||..|||||||||||||||:|:||||||||||||.:|
 Frog   719 DETGKSVSGNKSNKEETVLQRKTAASAPPPHGEEAVSSSSEDDSGTDKEDEGSVSQRSTPVKNSD 783

Human   784 AGDSAKVTENVVQPMKELYGINLSDGLSEEDFSIYSRFVQLGQSQHKQDKNSQQPCSRCSDGVIK 848
            .||:.|.:||.:|..|:.|||||||..||.|..||:|||.||..|.||||.:....|:..:...|
 Frog   784 TGDNTKTSENYMQSTKDSYGINLSDVPSENDLQIYTRFVHLGICQQKQDKRTLHISSKPFESFAK 848

Human   849 LTPISAFSQDNIYEVQPPRVDRKSTEIFQAHIQASQGIMQPLGKEDSSMYREYIRNRYL 907
            |:.||:||.|||||||||:|||||.|||.|||||..||||||||||..||||||||||:
 Frog   849 LSCISSFSHDNIYEVQPPKVDRKSVEIFTAHIQAGHGIMQPLGKEDMLMYREYIRNRYM 907

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
FIG4NP_055660.1 Syja_N 93..423 CDD:460545 299/330 (91%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 707..788 69/80 (86%)
fig4XP_031757753.1 COG5329 13..656 CDD:227637 581/642 (90%)
Syja_N 92..423 CDD:460545 299/330 (91%)

Return to query results.
Submit another query.