DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SETDB1 and Setdb1

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001353346.1 Gene:SETDB1 / 9869 HGNCID:10761 Length:1292 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001157113.1 Gene:Setdb1 / 84505 MGIID:1934229 Length:1308 Species:Mus musculus


Alignment Length:1311 Identity:1192/1311 - (90%)
Similarity:1232/1311 - (93%) Gaps:22/1311 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSSLPGCIGLDAATATVESEEIAELQQAVVEELGISMEELRHFIDEELEKMDCVQQRKKQLAELE 65
            |||||||:.|.||.|..:|.|||||||||||||||||||||.:||||||||||:|||||||||||
Mouse     1 MSSLPGCMSLAAAPAAADSAEIAELQQAVVEELGISMEELRQYIDEELEKMDCIQQRKKQLAELE 65

Human    66 TWVIQKESEVAHVDQLFDDASRAVTNCESLVKDFYSKLGLQYRDSSSEDESSRPTEIIEIPDEDD 130
            |||:|||||||:||:|||||||.|||||||||||||||||||.|||||||:||||||||||||||
Mouse    66 TWVLQKESEVAYVDRLFDDASREVTNCESLVKDFYSKLGLQYHDSSSEDEASRPTEIIEIPDEDD 130

Human   131 DVLSIDSGDAGSRTPKDQKLREAMAALRKSAQDVQKFMDAVNKKSSSQDLHKGTLSQMSGELSKD 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|:|||||||
Mouse   131 DVLSIDSGDAGSRTPKDQKLREAMAALRKSAQDVQKFMDAVNKKSSSQDLHKGTLGQVSGELSKD 195

Human   196 GDLIVSMRILGKKRTKTWHKGTLIAIQTVGPGKKYKVKFDNKGKSLLSGNHIAYDYHPPADKLYV 260
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||:|
Mouse   196 GDLIVSMRILGKKRTKTWHKGTLIAIQTVGLGKKYKVKFDNKGKSLLSGNHIAYDYHPPADKLFV 260

Human   261 GSRVVAKYKDGNQVWLYAGIVAETPNVKNKLRFLIFFDDGYASYVTQSELYPICRPLKKTWEDIE 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   261 GSRVVAKYKDGNQVWLYAGIVAETPNVKNKLRFLIFFDDGYASYVTQSELYPICRPLKKTWEDIE 325

Human   326 DISCRDFIEEYVTAYPNRPMVLLKSGQLIKTEWEGTWWKSRVEEVDGSLVRILFLDDKRCEWIYR 390
            |.|||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   326 DSSCRDFIEEYITAYPNRPMVLLKSGQLIKTEWEGTWWKSRVEEVDGSLVRILFLDDKRCEWIYR 390

Human   391 GSTRLEPMFSMKTSSASALEKKQ-GQLRTRPNMGAVRSKGPVVQYTQDLTGTGTQFKPVEPPQPT 454
            ||||||||||||||||||:|||| |||||||||||||||||||||||||||||.||||:||.||.
Mouse   391 GSTRLEPMFSMKTSSASAMEKKQGGQLRTRPNMGAVRSKGPVVQYTQDLTGTGIQFKPMEPLQPI 455

Human   455 APPAPPFPPAPPLSPQAGDSESLESQLAQSRKQVAKKSTSFRPGSVGSGHSSPTSPALSENVSGG 519
            |||||  .|.|||||||.|:|||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||.|
Mouse   456 APPAP--LPIPPLSPQAADTESLESQLAQSRKQVAKKSTSFRPGSVGSGHSSPTSSTLSENVSAG 518

Human   520 KPGINQTYRSPLGSTASAPAPSALPAPP------------------APPVFHGMLERAPAEPSYR 566
            |.||||||||||.|..|.||.:|.|.||                  |||.|||||||||||||||
Mouse   519 KLGINQTYRSPLASVTSTPASAAPPVPPVPPGPPTPPGPPAPPGPLAPPAFHGMLERAPAEPSYR 583

Human   567 APMEKLFYLPHVCSYTCLSRVRPMRNEQYRGKNPLLVPLLYDFRRMTARRRVNRKMGFHVIYKTP 631
            ||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   584 APMEKLFYLPHVCSYTCLSRIRPMRNEQYRGKNPLLVPLLYDFRRMTARRRVNRKMGFHVIYKTP 648

Human   632 CGLCLRTMQEIERYLFETGCDFLFLEMFCLDPYVLVDRKFQPYKPFYYILDITYGKEDVPLSCVN 696
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||
Mouse   649 CGLCLRTMQEIERYLFETGCDFLFLEMFCLDPYVLVDRKFQPFKPFYYILDITYGKEDVPLSCVN 713

Human   697 EIDTTPPPQVAYSKERIPGKGVFINTGPEFLVGCDCKDGCRDKSKCACHQLTIQATACTPGGQIN 761
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
Mouse   714 EIDTTPPPQVAYSKERIPGKGVFINTGPEFLVGCDCKDGCRDKSKCACHQLTIQATACTPGGQVN 778

Human   762 PNSGYQYKRLEECLPTGVYECNKRCKCDPNMCTNRLVQHGLQVRLQLFKTQNKGWGIRCLDDIAK 826
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   779 PNSGYQYKRLEECLPTGVYECNKRCNCDPNMCTNRLVQHGLQVRLQLFKTQNKGWGIRCLDDIAK 843

Human   827 GSFVCIYAGKILTDDFADKEGLEMGDEYFANLDHIESVENFKEGYESDAPCSSDSSGVDLKDQED 891
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||:|||||
Mouse   844 GSFVCIYAGKILTDDFADKEGLEMGDEYFANLDHIESVENFKEGYESDVPTSSDSSGVDMKDQED 908

Human   892 GNSGTEDPEESNDDSSDDNFCKDEDFSTSSVWRSYATRRQTRGQKENGLSETTSKDSHPPDLGPP 956
            ||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||.|||||||
Mouse   909 GNSGSEDPEESNDDSSDDNFCKDEDFSTSSVWRSYATRRQTRGQKENELSEMTSKDSRPPDLGPP 973

Human   957 HIPVPPSIPVGGCNPPSSEETPKNKVASWLSCNSVSEGGFADSDSHSSFKTNEGGEGRAGGSRME 1021
            |:|:|.|:.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||:|||:|||||.|.|
Mouse   974 HVPIPSSVSVGGCNPPSSEETPKNKVASWLSCNSVSEGGFADSDSRSSFKTSEGGDGRAGGGRGE 1038

Human  1022 AEKASTSGLGIKDEGDIKQAKKEDTDDRNKMSVVTESSRNYGYNPSPVKPEGLRRPPSKTSMHQS 1086
            ||:||||||..|||||.||.||||.::||||.||||.|:|:|:|| |:|.|||||..||.|:.||
Mouse  1039 AERASTSGLSFKDEGDNKQPKKEDPENRNKMPVVTEGSQNHGHNP-PMKSEGLRRSASKMSVLQS 1102

Human  1087 RRLMASAQSNPDDVLTLSSSTESEGESGTSRKPTAGQTSATAVDSDDIQTISSGSEGDDFEDKKN 1151
            :|::.|.||||||:||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||:|||||||||
Mouse  1103 QRVVTSTQSNPDDILTLSSSTESEGESGTSRKPTAGHTSATAVDSDDIQTISSGSDGDDFEDKKN 1167

Human  1152 MTGPMKRQVAVKSTRGFALKSTHGIAIKSTNMASVDKGESAPVRKNTRQFYDGEESCYIIDAKLE 1216
            ::||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1168 LSGPTKRQVAVKSTRGFALKSTHGIAIKSTNMASVDKGESAPVRKNTRQFYDGEESCYIIDAKLE 1232

Human  1217 GNLGRYLNHSCSPNLFVQNVFVDTHDLRFPWVAFFASKRIRAGTELTWDYNYEVGSVEGKELLCC 1281
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1233 GNLGRYLNHSCSPNLFVQNVFVDTHDLRFPWVAFFASKRIRAGTELTWDYNYEVGSVEGKELLCC 1297

Human  1282 CGAIECRGRLL 1292
            |||||||||||
Mouse  1298 CGAIECRGRLL 1308

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

Software error:

Illegal division by zero at /www/www.flyrnai.org/docroot/cgi-bin/DRSC_prot_align.pl line 591.

For help, please send mail to the webmaster (ritg@hms.harvard.edu), giving this error message and the time and date of the error.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SETDB1NP_001353346.1 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 108..147 36/38 (95%)
DUF5604 193..250 CDD:408109 55/56 (98%)
Tudor_SETDB1_rpt1 260..341 CDD:410453 78/80 (98%)
Tudor_SETDB1_rpt2 348..401 CDD:410548 52/52 (100%)
MBD 598..673 CDD:128673 74/74 (100%)
SET_SETDB1 675..>876 CDD:380915 198/200 (99%)
S-adenosyl-L-methionine binding. /evidence=ECO:0000250 814..816 1/1 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 869..1161 242/291 (83%)
SET <1203..1292 CDD:394802 88/88 (100%)