DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment DNAJC6 and Dnajc6

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001243793.1 Gene:DNAJC6 / 9829 HGNCID:15469 Length:970 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_006238508.1 Gene:Dnajc6 / 313409 RGDID:1309900 Length:968 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:970 Identity:902/970 - (92%)
Similarity:932/970 - (96%) Gaps:2/970 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSLLGSYRKKTSNDGYESLQLVDSNGDLSAGSGGVGGKQRVNAGAAARSPARQPPDRASTMDSSG 65
            ||||||||||||:|||||||||||:||.|| .|...|.|||..| |.||||||||.||||.||||
  Rat     1 MSLLGSYRKKTSSDGYESLQLVDSHGDSSA-RGAAAGTQRVTTG-AVRSPARQPPHRASTTDSSG 63

Human    66 ASSPDMEPSYGGGLFDMVKGGAGRLFSNLKDNLKDTLKDTSSRVIQSVTSYTKGDLDFTYVTSRI 130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||
  Rat    64 ASSPDMEPSYGGGLFDMVKGGAGRLFSNLKDNLKDTLKDTSSRVIQSVSSYTKGDLDFTYVTSRI 128

Human   131 IVMSFPLDNVDIGFRNQVDDIRSFLDSRHLDHYTVYNLSPKSYRTAKFHSRVSECSWPIRQAPSL 195
            ||||||:|:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   129 IVMSFPMDSVDIGFRNQVDDIRSFLDSRHLDHYTVYNLSPKSYRTAKFHSRVSECSWPIRQAPSL 193

Human   196 HNLFAVCRNMYNWLLQNPKNVCVVHCLDGRAASSILVGAMFIFCNLYSTPGPAIRLLYAKRPGIG 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||
  Rat   194 HNLFAVCRNMYNWLLQNPKNVCVVHCLDGRAASSILVGAMFIFCNLYSTPGPAVRLLYAKRPGIG 258

Human   261 LSPSHRRYLGYMCDLLADKPYRPHFKPLTIKSITVSPIPFFNKQRNGCRPYCDVLIGETKIYSTC 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||:|||
  Rat   259 LSPSHRRYLGYMCDLLADKPYRPHFKPLTIKAITVSPIPFFNKQRNGCRPYCDVLIGETKIFSTC 323

Human   326 TDFERMKEYRVQDGKIFIPLNITVQGDVVVSMYHLRSTIGSRLQAKVTNTQIFQLQFHTGFIPLD 390
            ||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||:||||||
  Rat   324 TDFERMKEYRVQDGKIFIPLNITVQGDVIVSMYHLRSTIGSRLQAKVTNTQIFQLQFHSGFIPLD 388

Human   391 TTVLKFTKPELDACDVPEKYPQLFQVTLDVELQPHDKVIDLTPPWEHYCTKDVNPSILFSSHQEH 455
            |||||||||||||||||||||||||||||:|:||.||||||||||||||||||||||||||.|||
  Rat   389 TTVLKFTKPELDACDVPEKYPQLFQVTLDIEVQPQDKVIDLTPPWEHYCTKDVNPSILFSSQQEH 453

Human   456 QDTLALGGQAPIDIPPDNPRHYGQSGFFASLCWQDQKSEKSFCEEDHAALVNQESEQSDDELLTL 520
            |||||||||||.|:|||:||:.||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
  Rat   454 QDTLALGGQAPADLPPDHPRNLGQGGFFASLCWQDQKSEKSRCEEDHAALVNQESEQSDDELLTL 518

Human   521 SSPHGNANGDKPHGVKKPSKKQQEPAAPPPPEDVDLLGLEGSAMSNSFSPPAAPPTNSELLSDLF 585
            |||||||:||||||.|||.|||||||||||||:|||||||||.:|.:|||.||||:|||||||||
  Rat   519 SSPHGNADGDKPHGAKKPGKKQQEPAAPPPPEEVDLLGLEGSDVSTNFSPLAAPPSNSELLSDLF 583

Human   586 GGGGAAGPTQAGQSGVEDVFHPSGPASTQSTPRRSATSTSASPTLRVGEGATFDPFGAPSKPSGQ 650
            |||||.||.||||.|||||||||||||.||||||:.||.||||||||||||||||||||:||.||
  Rat   584 GGGGATGPAQAGQVGVEDVFHPSGPASAQSTPRRATTSASASPTLRVGEGATFDPFGAPAKPPGQ 648

Human   651 DLLGSFLNTSSASSDPFLQPTRSPSPTVHASSTPAVNIQPDVSGGWDWHAKPGGFGMGSKSAATS 715
            ||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||::||||||||||||||||||||||
  Rat   649 DLLGSFLNTSNASSDPFLQPTRSPSPTVHASSTPAVNIQPDIAGGWDWHAKPGGFGMGSKSAATS 713

Human   716 PTGSSHGTPTHQSKPQTLDPFADLGTLGSSSFASKPTTPTGLGGGFPPLSSPQKASPQPMGGGWQ 780
            ||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   714 PTGSTHGTPTHQSKPQTLDPFADLGTLGSSSFASKPTTPTGLGGGFPPLSSPQKASPQPMGGGWQ 778

Human   781 QGGAYNWQQPQPKPQPSMPHSSPQNRPNYNVSFSAMPGGQNERGKGSSNLEGKQKAADFEDLLSG 845
            |...|||||.|||||.|||||||||||||||||||||.||::|||||:||||||||||||||||.
  Rat   779 QPAGYNWQQAQPKPQSSMPHSSPQNRPNYNVSFSAMPAGQSDRGKGSTNLEGKQKAADFEDLLSS 843

Human   846 QGFNAHKDKKGPRTIAEMRKEEMAKEMDPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTMHTVLWAGETKWKP 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   844 QGFNAHKDKKGPRTIAEMRKEEMAKEMDPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTMHTVLWAGETKWKP 908

Human   911 VGMADLVTPEQVKKVYRKAVLVVHPDKATGQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQGQKPLY 970
            |||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   909 VGMADLVTPEQVKKVYRRAVLVVHPDKATGQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQGQKPLY 968

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
DNAJC6NP_001243793.1 PTEN_C2 283..421 CDD:313607 133/137 (97%)
Atrophin-1 <562..829 CDD:331285 239/266 (90%)
DnaJ <918..963 CDD:99751 43/44 (98%)
Dnajc6XP_006238508.1 PTEN_C2 281..419 CDD:287393 133/137 (97%)
DnaJ <916..961 CDD:99751 43/44 (98%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C83677117
Domainoid 1 1.000 948 1.000 Domainoid score I1791
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H8865
Inparanoid 1 1.050 1795 1.000 Inparanoid score I1880
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG45626
OrthoDB 1 1.010 - - D13785at314146
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001565
OrthoInspector 1 1.000 - - oto134273
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_104372
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR23172
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X2131
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1515.410

Return to query results.
Submit another query.