DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment STARD8 and Stard8

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011529371.2 Gene:STARD8 / 9754 HGNCID:19161 Length:1113 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038955618.1 Gene:Stard8 / 312113 RGDID:1560770 Length:1136 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1135 Identity:934/1135 - (82%)
Similarity:984/1135 - (86%) Gaps:41/1135 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     2 AQARGWGPAL----------RFPKP-----RTWTPWGVE-GTRWYAPR--WDPEAEAKRACEWLQ 48
            |.::|.||.|          ..|.|     .|:..||:| |    :||  |..|||||:|||||:
  Rat    20 AHSKGCGPCLCRHYPCCLGFLSPSPSWNERETFLSWGLEVG----SPRHKWCLEAEAKKACEWLR 80

Human    49 ATGFPQYVQLFEEGSFPLDIGSVKKNHGFLDEDSLGALCRRLMTLNNCASMKLEVHFQSKQNEDS 113
            |||||||.||||||.||||||||||::.|||:|||||||||||||||||||||||||:.||::||
  Rat    81 ATGFPQYAQLFEEGVFPLDIGSVKKDYSFLDQDSLGALCRRLMTLNNCASMKLEVHFRCKQDDDS 145

Human   114 EEEEQCTISSHWAFQQESKCWSPMGSSDLLAPPSPGLPATSSCESVLTELSATSLPVITVSLPPE 178
            ||||||||||||||:|||||.|..|||.|||||||.||.|||||||||||||.|||.|:|||.||
  Rat   146 EEEEQCTISSHWAFEQESKCGSLTGSSALLAPPSPSLPGTSSCESVLTELSAASLPAISVSLSPE 210

Human   179 PADLPLPGRAPSSSDRPLLSPTQGQEGPQDKAKKRHRNRSFLKHLESLRRKEKSGSQQAEPKHSP 243
            .|||||.|..||.|::|.|||||||||.|||.|| |.:|||||||||||||||..|:|.||:...
  Rat   211 SADLPLLGHVPSPSNQPFLSPTQGQEGSQDKVKK-HYSRSFLKHLESLRRKEKGDSRQTEPEQRL 274

Human   244 ATSEKVSKASSFRSCRGFLSAGFYRAKNWAATSAGGSGANTRKAWEAWPVASFRHPQWTHRGDCL 308
            |||||.:||||||:|||.||.||:||||...||.......|:|.|||||||:|||||...|.|||
  Rat   275 ATSEKATKASSFRTCRGLLSVGFHRAKNRVTTSPRVRDGETQKTWEAWPVATFRHPQPNRRHDCL 339

Human   309 VHVPGDHKPGTFPRSLSIESLCPEDGHRLADWQPGRRWGCEGRRGSCGSTGSHASTYDNLPELYP 373
            ||||.||||||||||||||||||:|...||||||.|.||.|||||||||||||||||||||||||
  Rat   340 VHVPRDHKPGTFPRSLSIESLCPDDSRHLADWQPNRCWGYEGRRGSCGSTGSHASTYDNLPELYP 404

Human   374 AEPVMVGAEAEDEDDEESGGSYAHLDDILQHVWGLQQRVELWSRAMYPDLGPGD-----EEEEEA 433
            |||:.  |||||| |||..||||||||||:|||||||||||||:||||||.|||     ||||||
  Rat   405 AEPIQ--AEAEDE-DEEGEGSYAHLDDILEHVWGLQQRVELWSQAMYPDLRPGDKEEEEEEEEEA 466

Human   434 TSSVEIATVEVKCQAEALSQMEVPAHGESPAWAQAEVQPAVLAPAQAPAEAEPVAQEEAEAPAPA 498
            ||||||||.||:.|.|||:|.|...|...|...:.||...||  .|||...||:.|.|       
  Rat   467 TSSVEIATAEVEGQDEALAQAESQVHRGFPTEVKEEVPLIVL--DQAPTVVEPLVQAE------- 522

Human   499 PAPAPAQDSEQEAHSGGEPTFASSLSVEEGHSISDTVASSSELDSSGNSMNEAEAAGPLAGLQAS 563
             |||.||..||:|:|..||..|||||||||||||||..|||||||||||:|||:.|..|||..||
  Rat   523 -APAQAQHPEQDANSAAEPISASSLSVEEGHSISDTAVSSSELDSSGNSVNEADVADALAGPNAS 586

Human   564 MPRERRDSGVGASLTRPCRKLRWHSFQNSHRPSLNSESLEINRQFAGQINLLHKGSLLRLTAFME 628
            :||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
  Rat   587 VPRERRDSGVGASLTRPCRKLRWHSFQNSHRPSLNSESLEINRQFAGQINLLHKGSLLRLTGFME 651

Human   629 KYTVPHKQGWVWSMPKFMRRNKTPDYRGQHVFGVPPLIHVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRSQCLDQ 693
            ||||||||.|||||||||:|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   652 KYTVPHKQAWVWSMPKFMKRNKTPDYRGHHVFGVPPLIHVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRSQCLDQ 716

Human   694 VGIFRKSGVKSRIQNLRQMNETSPDNVCYEGQSAYDVADLLKQYFRDLPEPIFTSKLTTTFLQIY 758
            ||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   717 VGIFRKSGVKSRIQSLRQMNETSPDNVCYEGQSAYDVADLLKQYFRDLPEPIFTSKLTTTFLQIY 781

Human   759 QLLPKDQWLAAAQAATLLLPDENREVLQTLLYFLSDIASAEENQMTAGNLAVCLAPSIFHLNVSK 823
            |||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   782 QLLPKEQWLAAAQAATLLLPDENREVLQTLLYFLSDIASAEENQMTAGNLAVCLAPSIFHLNVSK 846

Human   824 KDSPSPRIKSKRSLIGRPGPRDLSDNMAATQGLSHMISDCKKLFQVPQDMVLQLCSSYSAAELSP 888
            ||||||||||||||:|||||||||:||||||||||||||||||||||||||:|||.|||||||:|
  Rat   847 KDSPSPRIKSKRSLVGRPGPRDLSENMAATQGLSHMISDCKKLFQVPQDMVVQLCGSYSAAELTP 911

Human   889 PGPALAELRQAQAAGVSLSLYMEENIQDLLRDAAERFKGWMSVPGPQHTELACRKAPDGHPLRLW 953
            ||||||||||||||||||||||||::|:||||||||||||.:|||||||||||||||||||||:|
  Rat   912 PGPALAELRQAQAAGVSLSLYMEESVQELLRDAAERFKGWTNVPGPQHTELACRKAPDGHPLRMW 976

Human   954 KASTEVAAPPAVVLHRVLRERALWDEDLLRAQVLEALMPGVELYHYVTDSMAPHPCRDFVVLRMW 1018
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   977 KASTEVAAPPAVVLHRVLRERALWDEDLLRAQVLEALMPGVELYHYVTDSMAPHPCRDFVVLRMW 1041

Human  1019 RSDLPRGGCLLVSQSLDPEQPVPESGVRALMLTSQYLMEPCGLGRSRLTHICRADLRGRSPDWYN 1083
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1042 RSDLPRGGCLLVSQSLDPEQPVPESGVRALMLTSQYLMEPCGLGRSRLTHICRADLRGRSPDWYN 1106

Human  1084 KVFGHLCAMEVAKIRDSFPTLQAAGPETKL 1113
            ||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1107 KVFGHLCAMEVAKIRDSFPTLQAAGPETKL 1136

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
STARD8XP_011529371.2 SAM_superfamily 41..100 CDD:472832 50/58 (86%)
RhoGAP 659..873 CDD:470621 209/213 (98%)
SRPBCC 900..1104 CDD:472699 197/203 (97%)
Stard8XP_038955618.1 SAM_DLC1,2-like 73..132 CDD:188937 50/58 (86%)
RhoGAP 682..896 CDD:470621 209/213 (98%)
SRPBCC 923..1127 CDD:472699 197/203 (97%)

Return to query results.
Submit another query.