Protein Alignment CROCC and Crocc

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_055490.4
• Gene: CROCC / 9696
• HGNCID: 21299
• Length: 2017
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: XP_017448904.1
• Gene: Crocc / 313663
• RGDID: 1305364
• Length: 2015
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1993
• Identity: 1657/1993 - (83%)
• Similarity: 1798/1993 - (90%)
• Gaps: 13/1993 - (0%)

Human     1 MSLGLAGAQEVELTLETVIQTLESSVL--CQEKGLGARDLAQDAQITSLPALIREIVTRNLSQPE 63
            ||||||.:.:.:|.||.|||||||.||  .|||.|..::.|||.|..|||..:|||:|.||||||
  Rat     1 MSLGLAESLQAQLALEIVIQTLESCVLEPDQEKSLSVQNPAQDFQGASLPVCVREIITSNLSQPE 65

Human    64 SPVLLPATEMASLLSLQEENQLLQQELSRVEDLLAQSRAERDELAIKYNAVSERLEQALRLEPGE 128
            :|..|...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||::||||||:|||.||
  Rat    66 TPAPLQVPEMASLLSLQEENQLLQQELSRVEDLLAQSRAERDELAIKYNAINERLEQAVRLETGE 130

Human   129 LETQEPRGLVRQSVELRRQLQEEQASYRRKLQAYQEGQQRQAQLVQRLQGKILQYKKRCSELEQQ 193
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||:|||:|:|
  Rat   131 LEAQEPRGLVRQSVELRRQLQEEQASYRRKLQAYQEGQQRQAQLVQRLQAKILQYKKQCSEMEKQ 195

Human   194 LLERSGELEQQRLRDTEHSQDLESALIRLEEEQQRSASLAQVNAMLREQLDQAGSANQALSEDIR 258
            |||||.||||||||||||||||:.||:||||||||||||||||.|||||||||..|||.|||||.
  Rat   196 LLERSTELEQQRLRDTEHSQDLDRALLRLEEEQQRSASLAQVNDMLREQLDQANLANQTLSEDIC 260

Human   259 KVTNDWTRCRKELEHREAAWRREEESFNAYFSNEHSRLLLLWRQVVGFRRLVSEVKMFTERDLLQ 323
            |||:||||..||||.|||.|||||||||||||:||||||||||||:|.||:.|||||.|||||||
  Rat   261 KVTSDWTRSCKELEQREATWRREEESFNAYFSSEHSRLLLLWRQVMGLRRMASEVKMGTERDLLQ 325

Human   324 LGGELARTSRAVQEAGLGLSTGLRLAESRAEAALEKQALLQAQLEEQLRDKVLREKDLAQQQMQS 388
            |||||.||||||||.|||||..|:.||||||||||||.|||||||||||.|:||||||||.|:||
  Rat   326 LGGELVRTSRAVQEVGLGLSASLQRAESRAEAALEKQKLLQAQLEEQLRAKLLREKDLAQLQVQS 390

Human   389 DLDKADLSARVTELGLAVKRLEKQNLEKDQVNKDLTEKLEALESLRLQEQAALETEDGEGLQQTL 453
            ||||||||||||||.|:|:.|:.||.||||||:.|::|||||||||||||..|:|||||||||||
  Rat   391 DLDKADLSARVTELALSVEHLQNQNTEKDQVNRTLSDKLEALESLRLQEQTTLDTEDGEGLQQTL 455

Human   454 RDLAQAVLSDSESGVQLSGSERTADASNGSLRGLSGQRTPSPPRRSSPGRGRSPRRGPSPACSDS 518
            ||||||.|||:|||||||.||||||.|:||.|||.|||||:|||.||||||||||||.|||||||
  Rat   456 RDLAQAALSDTESGVQLSNSERTADTSDGSFRGLFGQRTPTPPRHSSPGRGRSPRRGLSPACSDS 520

Human   519 STLALIHSALHKRQLQVQDMRGRYEASQDLLGTLRKQLSDSESERRALEEQLQRLRDKTDGAMQA 583
            |||.||||||||||||||||||||||||||||::||||||||.|||.||||||||||:|..::||
  Rat   521 STLTLIHSALHKRQLQVQDMRGRYEASQDLLGSVRKQLSDSEGERRGLEEQLQRLRDQTATSVQA 585

Human   584 HEDAQREVQRLRSANELLSREKSNLAHSLQVAQQQAEELRQEREKLQAAQEELRRQRDRLEEEQE 648
            .||||||.||||||||:|||||.||:|||||||||||:||||.|||||||||||||..:||::||
  Rat   586 QEDAQREAQRLRSANEILSREKGNLSHSLQVAQQQAEDLRQELEKLQAAQEELRRQHTQLEDQQE 650

Human   649 DAVQDGARVRRELERSHRQLEQLEGKRSVLAKELVEVREALSRATLQRDMLQAEKAEVAEALTKA 713
            |.||:|||.|||||||||||||||.|||.|.|||||||||||.|.||||:||.||||||||||||
  Rat   651 DTVQEGARARRELERSHRQLEQLEVKRSGLTKELVEVREALSCAVLQRDVLQTEKAEVAEALTKA 715

Human   714 EAGRVELELSMTKLRAEEASLQDSLSKLSALNESLAQDKLDLNRLVAQLEEEKSALQGRQRQAEQ 778
            ||||.:||||:||||||||||:|||||:||||||||||||:||||:|||||||:||.|||:|||.
  Rat   716 EAGRAQLELSVTKLRAEEASLRDSLSKMSALNESLAQDKLELNRLIAQLEEEKAALLGRQQQAEH 780

Human   779 EATVAREEQERLEELRLEQEVARQGLEGSLRVAEQAQEALEQQLPTLRHERSQLQEQLAQLSRQL 843
            ..::|.|:|||||:|||||||.||||||||.|||||:|||.||:..||.|||.||||:|||||||
  Rat   781 ATSLAVEKQERLEQLRLEQEVERQGLEGSLCVAEQAREALGQQILVLRSERSHLQEQVAQLSRQL 845

Human   844 SGREQELEQARREAQRQVEALERAAREKEALAKEHAGLAVQLVAAEREGRTLSEEATRLRLEKEA 908
            :||:|||:||.||:||||||||||||||||:|||.|||||||.||||||||||||..||||||||
  Rat   846 NGRDQELDQALRESQRQVEALERAAREKEAMAKERAGLAVQLAAAEREGRTLSEETIRLRLEKEA 910

Human   909 LEGSLFEVQRQLAQLEARREQLEAEGQALLLAKETLTGELAGLRQQIIATQEKASLDKELMAQKL 973
            ||.|||:|||||||||||||||||:.||||||||||||||||||||:.||:|||:||||||.|||
  Rat   911 LESSLFDVQRQLAQLEARREQLEADSQALLLAKETLTGELAGLRQQVTATEEKAALDKELMTQKL 975

Human   974 VQAEREAQASLREQRAAHEEDLQRLQREKEAAWRELEAERAQLQSQLQREQEELLARLEAEKEEL 1038
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||:|||||||.|||:|:||||||:|||||||
  Rat   976 VQAERETQASLREQRAAHEEDLQRLQREKEAAWRELQAERAQLQGQLQQEREELLARMEAEKEEL 1040

Human  1039 SEEIAALQQERDEGLLLAESEKQQALSLKESEKTALSEKLMGTRHSLATISLEMERQKRDAQSRQ 1103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
  Rat  1041 SEEIAALQQERDEGLLLAESEKQQALSLKESEKTALSEKLMGTRHSLAAISLEMERQKRDAQSRQ 1105

Human  1104 EQDRSTVNALTSELRDLRAQREEAAAAHAQEVRRLQEQARDLGKQRDSCLREAEELRTQLRLLED 1168
            ||||:|||||||||||||||.|||.|||||:|:.||||..:||:||::|:|||||||||||||||
  Rat  1106 EQDRNTVNALTSELRDLRAQLEEATAAHAQQVKELQEQTGNLGRQREACMREAEELRTQLRLLED 1170

Human  1169 ARDGLRRELLEAQRKLRESQEGREVQRQEAGELRRSLGEGAKEREALRRSNEELRSAVKKAESER 1233
            .||||||||||||||:|:||:..|..||||.||||||.||.||||||||||||||:|||||||||
  Rat  1171 TRDGLRRELLEAQRKVRDSQDSSEAHRQEASELRRSLSEGTKEREALRRSNEELRTAVKKAESER 1235

Human  1234 ISLKLANEDKEQKLALLEEARTAVGKEAGELRTGLQEVERSRLEARRELQELRRQMKMLDSENTR 1298
            |||||||||||||||||||||.:|.|||||||..|||||||||||||||||||||||.|||:|.|
  Rat  1236 ISLKLANEDKEQKLALLEEARMSVAKEAGELRASLQEVERSRLEARRELQELRRQMKTLDSDNGR 1300

Human  1299 LGRELAELQGRLALGERAEKESRRETLGLRQRLLKGEASLEVMRQELQVAQRKLQEQEGEFRTRE 1363
            ||||||:||.|||||||.|||||||.|||||::||||:|||.::||||.:||||||||.|||.||
  Rat  1301 LGRELADLQSRLALGERTEKESRREVLGLRQKVLKGESSLEALKQELQGSQRKLQEQEAEFRARE 1365

Human  1364 RRLLGSLEEARGTEKQQLDHARGLELKLEAARAEAAELGLRLSAAEGRAQGLEAELARVEVQRRA 1428
            |.||||||||||.||:.||.||.|||:||..|||.:|||||||||||||||||.||||||.|||.
  Rat  1366 RGLLGSLEEARGAEKKLLDSARSLELRLEGVRAETSELGLRLSAAEGRAQGLEVELARVEAQRRV 1430

Human  1429 AEAQLGGLRSALRRGLGLGRAPSPAPRPVPGSPARDAPAEGSGEGLNSPSTLECSPGSQPPSPGP 1493
            ||||||||||||||||||||        |..||||:|||.|||:||:|||.||.||.||||||||
  Rat  1431 AEAQLGGLRSALRRGLGLGR--------VSSSPAREAPAGGSGDGLSSPSPLEYSPRSQPPSPGP 1487

Human  1494 ATSPASPDLDPEAVRGALREFLQELRSAQRERDELRTQTSALNRQLAEMEAERDSATSRARQLQK 1558
            ..|||.|||||||||.|||:||||||||||||||||.|||.|::||||||||||.|.|||:||||
  Rat  1488 VASPAPPDLDPEAVRDALRDFLQELRSAQRERDELRVQTSTLSQQLAEMEAERDHAASRAKQLQK 1552

Human  1559 AVAESEEARRSVDGRLSGVQAELALQEESVRRSERERRATLDQVATLERSLQATESELRASQEKI 1623
            ||||||||.||.|.||||.||||||||||||||.||.||||||:|.||||||||||||||||||:
  Rat  1553 AVAESEEAWRSADRRLSGAQAELALQEESVRRSRRECRATLDQMAVLERSLQATESELRASQEKV 1617

Human  1624 SKMKANETKLEGDKRRLKEVLDASESRTVKLELQRRSLEGELQRSRLGLSDREAQAQALQDRVDS 1688
            :||||.|.|||.|||||||||||||||::|||||||:||||||||||||.||||.||||||||||
  Rat  1618 NKMKATEVKLESDKRRLKEVLDASESRSIKLELQRRALEGELQRSRLGLGDREAHAQALQDRVDS 1682

Human  1689 LQRQVADSEVKAGTLQLTVERLNGALAKVEESEGALRDKVRGLTEALAQSSASLNSTRDKNLHLQ 1753
            ||||||||||||||||||||||:|||||||||||.||.||:.||:|||||||||.|::||||:||
  Rat  1683 LQRQVADSEVKAGTLQLTVERLSGALAKVEESEGTLRSKVQSLTDALAQSSASLTSSQDKNLYLQ 1747

Human  1754 KALTACEHDRQVLQERLDAARQALSEARKQSSSLGEQVQTLRGEVADLELQRVEAEGQLQQLREV 1818
            |||:.|||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||:|:|||||.:||||||||::|
  Rat  1748 KALSTCEHDRQVLQERLDAARQALSEARRQSSSLGEQVQTLRGELANLELQRGDAEGQLQQLQQV 1812

Human  1819 LRQRQEGEAAALNTVQKLQDERRLLQERLGSLQRALAQLEAEKREVERSALRLEKDRVALRRTLD 1883
            |||||||||.||.:|||||:|||||||||||||||||||||||||:|||||:|:|||||||:|||
  Rat  1813 LRQRQEGEAVALRSVQKLQEERRLLQERLGSLQRALAQLEAEKRELERSALQLDKDRVALRKTLD 1877

Human  1884 KVEREKLRSHEDTVRLSAEKGRLDRTLTGAELELAEAQRQIQQLEAQVV-VLEQSHSPAQLEVDA 1947
            |||||||||||||:||:||:||||||||||||:|||||:|||.|||||| |||::|||.|:|.|
  Rat  1878 KVEREKLRSHEDTLRLNAERGRLDRTLTGAELDLAEAQQQIQHLEAQVVEVLERNHSPVQVEAD- 1941

Human  1948 QQQQLELQQEVERLRSAQAQTERTLEARERAHRQRVRGLEEQV 1990
             :|.||||||||||||||.:||||||||||||||||.||||||
  Rat  1942 -EQHLELQQEVERLRSAQVRTERTLEARERAHRQRVSGLEEQV 1983

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CROCC	NP_055490.4	Smc	<76..>672	CDD:440809	506/595 (85%)
		Rootletin	156..332	CDD:464459	150/175 (86%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	464..518		44/53 (83%)
		Smc	<555..>1057	CDD:440809	419/501 (84%)
		Smc	<816..>1368	CDD:440809	470/551 (85%)
		SMC_prok_B	1135..1927	CDD:274008	655/791 (83%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1184..1226		30/41 (73%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1443..1575		99/131 (76%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1962..2017		26/29 (90%)
Crocc	XP_017448904.1	Smc	<73..>480	CDD:440809	348/406 (86%)
		Rootletin	158..334	CDD:464459	150/175 (86%)
		Smc	<532..>1072	CDD:440809	455/539 (84%)
		SMC_prok_B	1118..1851	CDD:274008	610/740 (82%)
		Smc	<1721..>1984	CDD:440809	222/265 (84%)