DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment RAPGEF2 and Rapgef2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001338653.1 Gene:RAPGEF2 / 9693 HGNCID:16854 Length:1685 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001415923.1 Gene:Rapgef2 / 310533 RGDID:1306434 Length:1657 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1686 Identity:1582/1686 - (93%)
Similarity:1611/1686 - (95%) Gaps:30/1686 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MASYVDNSFRQAVMKNPPERTPQDLEIVYSYLHGMEALSNLREHQLRLMCETVRYERHEANEVLY 65
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MASYVDNSFRQAVMKNPAERTPQDLEIVYSYLHGMEALSNLREHQLRLMCETVRYERHEANEVLY 65

Human    66 YPDDIGTCWYILLSGSVFIKESMFLPRSSFGKRSAGSFRRGCECIVLEPSEMIVVDYMDENEEYF 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 YPDDIGTCWYILLSGSVFIKESMFLPRSSFGKRSAGSFRRGCECIVLEPSEMIVVDYMDENEEYF 130

Human   131 QRQASHRQSRRRFRKINQKGERQTIIDTVDPYPMGKPPLPRGYHTECTKSQLPADFTKLHLTDSL 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 QRQASHRQSRRRFRKINQKGERQTIIDTVDPYPVGKPPLPRGYHTECTKSQLPADFTKLHLTDSL 195

Human   196 HPQVTHVSSSHSGCSITSDSGSSSLSDIYQATESEAGDMDLSGLPETAVDSEDDDDEEDIERASD 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 HPQVTHVSSSHSGCSITSDSGSSSLSDIYQATESEAGDMDLSGLPETAVDSEDDDDEEDIERASD 260

Human   261 PLMSRDIVRDCLEKDPIDRTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCAVMVFAVVERAGTIVL 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 PLMSRDIVRDCLEKDPIDRTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCAVMVFAVVERAGTIVL 325

Human   326 NDGEELDSWSVILNGSVEVTYPDGKAEILCMGNSFGVSPTMDKEYMKGVMRTKVDDCQFVCIAQQ 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 NDGEELDSWSVILNGSVEVTYPDGKAEILCMGNSFGVSPTMDKEYMKGVMRTKVDDCQFVCIAQQ 390

Human   391 DYCRILNQVEKNMQKVEEEGEIVMVKEHRELDRTGTRKGHIVIKGTSERLTMHLVEEHSVVDPTF 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 DYCRILNQVEKNMQKVEEEGEIVMVKEHRELDRTGTRKGHIVIKGTSERLTMHLVEEHSVVDPTF 455

Human   456 IEDFLLTYRTFLSSPMEVGKKLLEWFNDPSLRDKVTRVVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEN 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 IEDFLLTYRTFLSSPMEVGKKLLEWFNDPSLRDKVTRVVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEN 520

Human   521 NLEREKMGGHLRLLNIACAAKAKRRLMTLTKPSREAPLPFILLGGSEKGFGIFVDSVDSGSKATE 585
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
  Rat   521 NLEREKMGGHLRLLNIACAAKAKRRSMTLTKPSREAPLPFILLGGSEKGFGIFVDSVDSSSKATE 585

Human   586 AGLKRGDQILEVNGQNFENIQLSKAMEILRNNTHLSITVKTNLFVFKELLTRLSEEKRNGAPHLP 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 AGLKRGDQILEVNGQNFENIQLSKAMEILRNNTHLSITVKTNLFVFKELLTRLSEEKRNGAPHLP 650

Human   651 KIGDIKKASRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKANTVGGRNKLKKILDKTRISILPQKPYNDIG 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 KIGDIKKASRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKANTVGGRNKLKKILDKTRISILPQKPYNDIG 715

Human   716 IGQSQDDSIVGLRQTKHIPTALPVSGTLSSSNPDLLQSHHRILDFSATPDLPDQVLRVFKADQQS 780
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
  Rat   716 IGQSQDDSIVGLRQTKHIPAALPVSGTLSSSNPDLLQSHHRILDFSTTPDLPDQVLRVFKADQQS 780

Human   781 RYIMISKDTTAKEVVIQAIREFAVTATPDQYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQLSKLADRIQLSGR 845
            ||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   781 RYIMISKDTTAKEVVIQAIREFAVTATPEQYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQLSKLADRIQLSGR 845

Human   846 YYLKNNMETETLCSDEDAQELLRESQISLLQLSTVEVATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFKLR 910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:
  Rat   846 YYLKNNMETETLCSDEDAQELLRESQISLLQLSTVEVATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFKLK 910

Human   911 SKTSCANLKRFEEVINQETFWVASEILRETNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGL 975
            |||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   911 SKTSCANLKKFEEVINQETFWVASEILRETNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGL 975

Human   976 NLAPVARLRTTWEKLPNKYEKLFQDLQDLFDPSRNMAKYRNVLNSQNLQPPIIPLFPVIKKDLTF 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:.||||||:|||||||||||||
  Rat   976 NLAPVARLRTTWEKLPNKYEKLFQDLQDLFDPSRNMAKYRNVLSGQNLQPPVIPLFPVIKKDLTF 1040

Human  1041 LHEGNDSKVDGLVNFEKLRMIAKEIRHVGRMASVNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSTNATVL 1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
  Rat  1041 LHEGNDSKVDGLVNFEKLRMIAKEIRHVGRMASVNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSANATVL 1105

Human  1106 DVAQTGGHKKRVRRSSFLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSNLELEMDEESLQTLSLQCEPATNTLPK 1170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||
  Rat  1106 DVAQTGGHKKRVRRSSFLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSNLELEMDEESLQTLSLQCEPATSTLPK 1170

Human  1171 NPGDKKPVKSETSPVAPRAGSQQKAQSLPQPQQQPPPAHKINQGLQVPAVSLYPSRKKVPVKDLP 1235
            ||.|:|||||||||||||||.|||||. .||...|.|:||::|||||||||||||||||||||||
  Rat  1171 NPADRKPVKSETSPVAPRAGPQQKAQP-QQPLAPPQPSHKVSQGLQVPAVSLYPSRKKVPVKDLP 1234

Human  1236 PFGINSPQALKKILSLSEEGSLERHKKQAEDTISNASSQLSSPPTSPQSSPRKGGSGNQLRSFGS 1300
            |||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||           
  Rat  1235 PFGINSPQALKKILSLSEEGSLERHRKQAEDTISNASSQLSSPPTSPQSSPRKG----------- 1288

Human  1301 GQLDLTSSSSSLGSYTLAPSGTVDNFSDSGHSEISSRSSIVSNSSFDSVPVSLHDERRQRHSVSI 1365
                          |.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1289 --------------YALALSGTVDNFSDSGHSEISSRSSIVSNSSFDSVPVSLHDERRQRHSVSI 1339

Human  1366 VETNLGMGRMERRTMIEPDQYSLGSYAPMSEGRGLYATATVISSPSTEELSQDQGDRASLDAADS 1430
            ||:|||:|||||||::||||||||||||:||.|||||.|||||||||||||.|||||||||||||
  Rat  1340 VESNLGVGRMERRTLMEPDQYSLGSYAPVSESRGLYAAATVISSPSTEELSHDQGDRASLDAADS 1404

Human  1431 GRGSWTSCSSGSHDNIQTIQHQRSWETLPFGHTHFDYSGDPAGLWASSSHMDQIMFSDHSTKYNR 1495
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|:|||..||||||||||||||||
  Rat  1405 GRGSWTSCSSGSHDNIQTIQHQRSWETLPFGHTHFDYSGDATGIWASGGHMDQIMFSDHSTKYNR 1469

Human  1496 QNQSRESLEQAQSRASWASSTGYWGEDSEGDTGTIKRRGGKDVSIEAESSSLTSVTTEETKPVPM 1560
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||:..|||||.|||||
  Rat  1470 QNQSRESLEQAQSRASWASSTGYWGEDSEGDTGTIKRRGGKDVSTEAESSSMVPVTTEEAKPVPM 1534

Human  1561 PAHIAVASSTTKGLIARKEGRYREPPPTPPGYIGIPITDFPEGHSHPARKPPDYNVALQRSRMVA 1625
            ||||||..||||||||||||||||||||||||:||||.|||||..||||||||||||||||||||
  Rat  1535 PAHIAVTPSTTKGLIARKEGRYREPPPTPPGYVGIPIADFPEGPCHPARKPPDYNVALQRSRMVA 1599

Human  1626 RSSDTAGPSSVQQPHGHPTSSRPVNKPQWHKPNESDPRLAPYQSQGFS-TEEDEDEQVSAV 1685
            |.::...|.  |.|.. .|:|||.:|||||||:::||||||:|.|||: .|||||||||||
  Rat  1600 RPTEAPAPG--QTPPA-ATASRPGSKPQWHKPSDADPRLAPFQPQGFAGAEEDEDEQVSAV 1657

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
RAPGEF2NP_001338653.1 CAP_ED 37..143 CDD:237999 105/105 (100%)
cNMP 297..412 CDD:197516 114/114 (100%)
RasGEFN 428..541 CDD:214571 112/112 (100%)
PDZ_RapGEF2_RapGEF6-like 545..627 CDD:467237 79/81 (98%)
RA_PDZ-GEF1 769..851 CDD:340483 80/81 (99%)
RasGEF 874..1099 CDD:238087 219/224 (98%)
Rapgef2NP_001415923.1 None

Return to query results.
Submit another query.