DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment RAPGEF2 and rapgef2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001338653.1 Gene:RAPGEF2 / 9693 HGNCID:16854 Length:1685 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_012811943.1 Gene:rapgef2 / 100145659 XenbaseID:XB-GENE-5814345 Length:1661 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1696 Identity:1485/1696 - (87%)
Similarity:1563/1696 - (92%) Gaps:46/1696 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MASYVDNSFRQAVMKNPPERTPQDLEIVYSYLHGMEALSNLREHQLRLMCETVRYERHEANEVLY 65
            |||||||||||||||.|.:|:.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog     1 MASYVDNSFRQAVMKPPADRSAQDLEIVYSYLHGMEALSNLREHQLRLMCETVRYERHEANEVLY 65

Human    66 YPDDIGTCWYILLSGSVFIKESMFLPRSSFGKRSAGSFRRGCECIVLEPSEMIVVDYMDENEEYF 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
 Frog    66 YPDDIGTCWYILLSGSVFIKESMFLPRSSFGKRSAGSLRRGCECIVLEPSEMIVVDYMDENEEYF 130

Human   131 QRQASHRQSRRRFRKINQKGERQTIIDTVDPYPMGKPPLPRGYHTECTKSQLPADFTKLHLTDSL 195
            |||||||||||||||||||||||||||||:.||:||||||||||||.:|.||||||||||:||||
 Frog   131 QRQASHRQSRRRFRKINQKGERQTIIDTVESYPVGKPPLPRGYHTEGSKPQLPADFTKLHITDSL 195

Human   196 HPQVTHVSSSHSGCSITSDSGSSSLSDIYQATESEAGDMDLSGLPETAVDSEDDDDEEDIERASD 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   196 HPQVTHVSSSHSGCSITSDSGSSSLSDIYQATESEPGDMDLSGLPETAVDSEDDDDEEDIERASD 260

Human   261 PLMSRDIVRDCLEKDPIDRTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCAVMVFAVVERAGTIVL 325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||
 Frog   261 PLMSRDIVRDCLEKDPIDRTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCAVMVFAVVERAGTVVL 325

Human   326 NDGEELDSWSVILNGSVEVTYPDGKAEILCMGNSFGVSPTMDKEYMKGVMRTKVDDCQFVCIAQQ 390
            ||||||||||||||||||||||||:.|||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||
 Frog   326 NDGEELDSWSVILNGSVEVTYPDGRTEILCMGNSFGVSPTMEKEYMKGVMRTKVDDCQFVCIAQQ 390

Human   391 DYCRILNQVEKNMQKVEEEGEIVMVKEHRELDRTGTRKGHIVIKGTSERLTMHLVEEHSVVDPTF 455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:
 Frog   391 DYCRILNQVEKNMQKVEEEGEIVMVKEHRELDRTGTRKGHIVIKGTSERLTMHLVEEHSVVDPTY 455

Human   456 IEDFLLTYRTFLSSPMEVGKKLLEWFNDPSLRDKVTRVVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEN 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   456 IEDFLLTYRTFLSSPMEVGKKLLEWFNDPSLRDKVTRVVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFEN 520

Human   521 NLEREKMGGHLRLLNIACAAKAKRRLMTLTKPSREAPLPFILLGGSEKGFGIFVDSVDSGSKATE 585
            ||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||.|||||:|||||||||||.||||.|
 Frog   521 NLEREKMGGHLRLLNIACAAKAKRRLITLTKPSREAPLPFNLLGGSDKGFGIFVDSVDPGSKAAE 585

Human   586 AGLKRGDQILEVNGQNFENIQLSKAMEILRNNTHLSITVKTNLFVFKELLTRLSEEKRNGAPHLP 650
            .|||||||||||||||||||||:||:||||||||||:|||||||||||||.|:.|||||.|||||
 Frog   586 TGLKRGDQILEVNGQNFENIQLTKALEILRNNTHLSLTVKTNLFVFKELLARMLEEKRNSAPHLP 650

Human   651 KIGDIKKASRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKANTVGGRNKLKKILDKTRISILPQKPYNDIG 715
            |||||||||||||||||||||||||||||:||.||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   651 KIGDIKKASRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVSKKGKANTVGGRNKLKKILDKTRISILPQKPYNDIG 715

Human   716 IGQSQDDSIVGLRQTKHIPTALPVSGTLSSSNPDLLQSHHRILDFSATPDLPDQVLRVFKADQQS 780
            |||||||||||||||||:|..||||||||||||||||||||||||:.||:.||||||||||||||
 Frog   716 IGQSQDDSIVGLRQTKHMPATLPVSGTLSSSNPDLLQSHHRILDFNTTPEQPDQVLRVFKADQQS 780

Human   781 RYIMISKDTTAKEVVIQAIREFAVTATPDQYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQLSKLADRIQLSGR 845
            |||||||||||||||||||||||:||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   781 RYIMISKDTTAKEVVIQAIREFALTAVPDAYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQLSKLADRIQLSGR 845

Human   846 YYLKNNMETETLCSDEDAQELLRESQISLLQLSTVEVATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFKLR 910
            |||||||||||||||||||:||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||:
 Frog   846 YYLKNNMETETLCSDEDAQDLLRESQISLLQLSTIEVATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFKLK 910

Human   911 SKTSCANLKRFEEVINQETFWVASEILRETNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGL 975
            .||.|.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   911 MKTGCTNLKNFEEVINQETFWVASEILRETNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGL 975

Human   976 NLAPVARLRTTWEKLPNKYEKLFQDLQDLFDPSRNMAKYRNVLNSQNLQPPIIPLFPVIKKDLTF 1040
            |||||:||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   976 NLAPVSRLRTTWEKLPSKYEKLFQDLQDLFDPSRNMAKYRNVLNSQNLQPPIIPLFPVIKKDLTF 1040

Human  1041 LHEGNDSKVDGLVNFEKLRMIAKEIRHVGRMASVNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSTNATVL 1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1041 LHEGNDSKVDGLVNFEKLRMIAKEIRHVGRMASVNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSTNATVL 1105

Human  1106 DVAQTGGHKKRVRRSSFLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSNLELEMDEESLQTLSLQCEPATNTLPK 1170
            ||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||:|:||||||:|||||:|||||||||||
 Frog  1106 DVAQSGGHKKRVRRSSFLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSDLDLEMDEENLQTLSVQCEPATNTLPK 1170

Human  1171 NPGDKKPVKSETSPVAPRAGSQQKAQSLPQPQQQPPPAHKINQGLQVPAVSLYPSRKKVPVKDLP 1235
            ||.:|:..|.:||||||||.:|.|.|.    |||.    |:||.||||||:||||||||||||||
 Frog  1171 NPCEKRAGKPDTSPVAPRAAAQHKQQQ----QQQT----KVNQALQVPAVALYPSRKKVPVKDLP 1227

Human  1236 PFGINSPQALKKILSLSEEGSLERHKKQAEDTISNASSQLSSPPTSPQSSPRKGGSGNQLRSFGS 1300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||           
 Frog  1228 PFGINSPQALKKILSLSEEGSLERHKKQAEDTISNASSQLSSPPTSPQCSPRKG----------- 1281

Human  1301 GQLDLTSSSSSLGSYTLAPSGTVDNFSDSGHSEISSRSSIVSNSSFDSVPVSLHDERRQRHSVSI 1365
                          ||:|.||||||||||||||||||||||||||||.  |.|||:||||||:||
 Frog  1282 --------------YTMAASGTVDNFSDSGHSEISSRSSIVSNSSFDC--VHLHDDRRQRHSLSI 1330

Human  1366 VETNLGMGRMERRTMIEPDQYSLGSYAPMSEGRGLYATATVISSPSTEELSQDQGDRASLDAADS 1430
            ||||||:||.:||.:|:.||.|||||||::|.|||||.|||:||||.||||||||||||||||||
 Frog  1331 VETNLGVGRADRRAIIDADQCSLGSYAPVAETRGLYAGATVLSSPSMEELSQDQGDRASLDAADS 1395

Human  1431 GRGSWTSCSSGSHDNIQTIQHQRSWETLPFGHTHFDYSGDPAGLWASSSHMDQIMFSDHSTKYNR 1495
            |||||||||||||||||||.||||||||||||.|||.:.|.:|.||:..|||..:|.||||||.|
 Frog  1396 GRGSWTSCSSGSHDNIQTIPHQRSWETLPFGHVHFDNTADGSGFWATGGHMDHGIFPDHSTKYGR 1460

Human  1496 QNQSRESLEQAQSRASWASSTGYWGEDSEGDTGTIKRRGGKDVSIEAESSSLTSVTTEETKPVPM 1560
            .:|.||.|:||||||||||||||||||||||||||||||||||::|||:||:||:|.|||||:|:
 Frog  1461 YSQGREPLDQAQSRASWASSTGYWGEDSEGDTGTIKRRGGKDVALEAETSSITSMTPEETKPLPV 1525

Human  1561 PAHIAVASSTTKGLI------ARKEGRYREPPPTPPGYIGIPITDFPEGHSHPARKPPDYNVALQ 1619
            |.|:||.:|:.||||      |||||||||||||||||:||||.||.:||...:|||||||||||
 Frog  1526 PTHVAVTASSAKGLIVYCVTTARKEGRYREPPPTPPGYVGIPIADFADGHPPLSRKPPDYNVALQ 1590

Human  1620 RSRMVARSSDTAGPSSVQQPHGHPTSSRPVNKPQWHKPNESDPRLAPYQSQGFSTEED-----ED 1679
            ||||:||.|::.|.::...|..:.||.|..||||||||||:|||||.||:||.:.::|     :|
 Frog  1591 RSRMMARRSESEGSAATSPPSHNQTSGRTANKPQWHKPNEADPRLALYQAQGVTEKDDGNFFADD 1655

Human  1680 EQVSAV 1685
            ||||||
 Frog  1656 EQVSAV 1661

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
RAPGEF2NP_001338653.1 CAP_ED 37..143 CDD:237999 104/105 (99%)
cNMP 297..412 CDD:197516 110/114 (96%)
RasGEFN 428..541 CDD:214571 111/112 (99%)
PDZ_RapGEF2_RapGEF6-like 545..627 CDD:467237 72/81 (89%)
RA_PDZ-GEF1 769..851 CDD:340483 78/81 (96%)
RasGEF 874..1099 CDD:238087 216/224 (96%)
rapgef2XP_012811943.1 CAP_ED 37..143 CDD:237999 104/105 (99%)
cNMP 297..412 CDD:197516 110/114 (96%)
RasGEFN 428..541 CDD:214571 111/112 (99%)
PDZ_RapGEF2_RapGEF6-like 545..627 CDD:467237 72/81 (89%)
RA_PDZ-GEF1 769..851 CDD:340483 78/81 (96%)
RasGEF 874..1099 CDD:238087 216/224 (96%)

Return to query results.
Submit another query.