DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment DEPDC5 and depdc5

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001229825.1 Gene:DEPDC5 / 9681 HGNCID:18423 Length:1603 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_021334975.1 Gene:depdc5 / 562995 ZFINID:ZDB-GENE-091204-356 Length:1614 Species:Danio rerio


Alignment Length:1637 Identity:1224/1637 - (74%)
Similarity:1367/1637 - (83%) Gaps:61/1637 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MRTTKVYKLVIHKKGFGGSDDELVVNPKVFPHIKLGDIVEIAHPNDEYSPLLLQVKSLKEDLQKE 65
            |:..|.||||:||||||||||||::||||||.:||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish     5 MKANKSYKLVVHKKGFGGSDDELMMNPKVFPQVKLGDIVEIAHPNDEYSPLLLQVKSLKEDLQKE 69

Human    66 TISVDQTVTQVFRLRPYQDVYVNVVDPKDVTLDLVELTFKDQYIGRGDMWRLKKSLVSTCAYITQ 130
            ||||||||.|.|:||.||||.:|:||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||:||
Zfish    70 TISVDQTVAQAFKLRAYQDVIINIVDPKEVTLDLVELTFKDQYIGRGDMWRLKKSLVSTCAYVTQ 134

Human   131 KVEFAGIRAQAGELWVKNEKVMCGYISEDTRVVFRSTSAMVYIFIQMSCEMWDFDIYGDLYFEKA 195
            |||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   135 KVEFAGIRAQASELWVKGEKVTCGYISEDTRVVFRSTSAMVYIFIQMSCEMWDFDIYGDLYFEKA 199

Human   196 VNGFLADLFTKWKEKNCSHEVTVVLFSRTFYDAKSVDEFPEINRASIRQDHKGRFYEDFYKVVVQ 260
            |||||:|||.|||||||||||||||||||||.||:::||||..|||:||||:||:|||||:||.|
Zfish   200 VNGFLSDLFAKWKEKNCSHEVTVVLFSRTFYSAKTLEEFPESQRASVRQDHEGRYYEDFYRVVAQ 264

Human   261 NERREEWTSLLVTIKKLFIQYPVLVRLEQAEGFPQGDNSTSAQGNYLEAINLSFNVFDKHYINRN 325
            ||||:||.|||||||||||||||||||:.|:|||.|.||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   265 NERRDEWMSLLVTIKKLFIQYPVLVRLKGADGFPCGHNSTSAQGNYLEAINLSFNVFDKHYINRN 329

Human   326 FDRTGQMSVVITPGVGVFEVDRLLMILTKQRMIDNGIGVDLVCMGEQPLHAVPLFKLHNRSAPRD 390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:...|
Zfish   330 FDRTGQMSVVITPGVGVFEVDRLLMILTKQRMIDNGIGVDLVCMGEQPLHAVPLFKLHNRTVHGD 394

Human   391 SRLGDDYNIPHWINHSFYTSKSQLFCNSFTPRIKLAGKKPASEKAKNGRDTSLGSPKESENALPI 455
            ||:|||||:||||||||||||||..|:.|||||||||||..:|||||.::.|||:||::||:|||
Zfish   395 SRIGDDYNLPHWINHSFYTSKSQNSCSCFTPRIKLAGKKVHAEKAKNSKEHSLGAPKDAENSLPI 459

Human   456 QVDYDAYDAQVFRLPGPSRAQCLT-----------TCRSVRERESHSRKSASSCDVSSSPSLPSR 509
            ||||||||:||||||||||||..|           :.||.|||||.||||..|.||.|||  |:|
Zfish   460 QVDYDAYDSQVFRLPGPSRAQRSTNFSSSHINSTDSNRSSRERESVSRKSWGSADVGSSP--PNR 522

Human   510 TLPTEEVRSQASDDSSLGKSANILMIPHPHLHQYEVSSSLGYTS-TRDVLENMMEPPQRDSSAPG 573
            ....:|.||.|||| |||..:|||:||.|...|||||||||||| ||::||.|:| .||||||||
Zfish   523 HTGPDEQRSLASDD-SLGHMSNILLIPRPAQGQYEVSSSLGYTSCTRELLEKMVE-SQRDSSAPG 585

Human   574 RFHVGSAESMLHVRPGGYTPQRALINPFAPSRMPMKLTSNRRRWMHTFPVGPSGEAIQIHHQTRQ 638
            ||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Zfish   586 RFTVGSAESTLHVRPGGYTPQRALINPFAPSRMPMKLTSNRRRWMHTFPVGPSGEPIQIHHQTRQ 650

Human   639 NMAELQGSGQRDPTHSSAELLELAYHEAAG-RHSNSRQPGDGMSFL-----NFSGTEELSVGLLS 697
            ||||||||.||||..:||||||||||||.| :.:.||..|:...::     |.||:...|    |
Zfish   651 NMAELQGSEQRDPARTSAELLELAYHEATGSKRTASRHAGENGLYISGVPDNISGSPASS----S 711

Human   698 NSGAGMNPRTQNKDSLEDSVSTSPDPILTLSAPPVVPGFCCTVGVDWKSLTTPACLPLTTDYFPD 762
            ::|..:     |:.|.|| .|.|.||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Zfish   712 STGTPV-----NRGSFED-YSGSLDPILLLSAPPTVPSFCCTVGVDWKSLTTPACLPLTTDYFPD 770

Human   763 RQGLQNDYTEGCYDLLPEADIDRRDEDGVQMTAQQVFEEFICQRLMQGYQIIVQPKTQKPNPAVP 827
            ||.||||||||||||||..|::|||::...|||.||||||||||||||||||||| .:||.||:.
Zfish   771 RQTLQNDYTEGCYDLLPHTDLERRDDETPVMTAHQVFEEFICQRLMQGYQIIVQP-NRKPQPAIA 834

Human   828 PPLSSSPLYSRGLVSRNRPEEEDQ-YWLSMGRTFHKVTLKDKMITVTRYLPKYPYESAQIHYTYS 891
            ||||||||||||||||.:||||:. ||||||||||||.||||:||||||||||||||.||.|:|:
Zfish   835 PPLSSSPLYSRGLVSRRKPEEEESLYWLSMGRTFHKVCLKDKIITVTRYLPKYPYESTQIQYSYN 899

Human   892 LCPSHSDSEFVSCWVEFSHERLEEYKWNYLDQYICSAGSEDFSLIESLKFWRTRFLLLPACVTAT 956
            |||.|:|:.|:..||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||  ...
Zfish   900 LCPPHADAHFMPFWVEFSHERLEEYKWNYLDQYICSAGSEDFSLIDSLKFWRTRFLLLPA--GGA 962

Human   957 KRITEGEAHCDIYGDRPRADED------EWQLLDGFVRFVEGLNRIRRRHRSDRMMRKGTAMKGL 1015
            :|:.:||.|.|:||:...|..|      :|.|||||:||:|||||||||||||||:|||..:|||
Zfish   963 RRVADGEGHWDVYGEGAGAGRDGLAGTGDWTLLDGFIRFLEGLNRIRRRHRSDRMIRKGATIKGL 1027

Human  1016 QMTGPISTHSLESTAPPVGKKGTSALSALLEMEASQKCLGEQQ-AAVHGGKSSAQSAESSSVAMT 1079
            |:||.:::::.|..|||:|||||||||||||:|.:||...||| ||.||||.....:|:::||:|
Zfish  1028 QVTGALTSYTPEPIAPPLGKKGTSALSALLELEQTQKTFEEQQLAAQHGGKPCGPFSEAANVALT 1092

Human  1080 PTYMDSPRKDGAFFMEFVRSPRTASSAFYPQVSVDQT-ATPMLDGTSLGICTGQSMDRGNSQTFG 1143
            .|::||||||.||.::|:|||| :|...:.|:..:|. |.|:..|.|     .:..::...:|..
Zfish  1093 TTFVDSPRKDAAFILDFIRSPR-SSYICHSQLPAEQVPANPIEGGLS-----DKISNQPGERTSA 1151

Human  1144 NSQNIGE--QGYSSTNSSDSSSQQLVASSLTSSSTLTEILEAMKHPSTGVQLLSEQKGLSPYCFI 1206
            .||..|:  .|.|......|.|..|   ||:|||||.|||||:|||:||||||.||:||.|.||:
Zfish  1152 ASQATGDPTPGASLETGGQSGSSGL---SLSSSSTLMEILEAIKHPTTGVQLLPEQRGLPPNCFV 1213

Human  1207 SAEVVHWLVNHVEGIQTQAMAIDIMQKMLEEQLITHASGEAWRTFIYGFYFYKIVTDKEPDRVAM 1271
            |||||||||:.||.:.||.:|::||||||||.|||||||:|.|||:||||||:|| ||:.::..:
Zfish  1214 SAEVVHWLVSTVENVATQGIAVEIMQKMLEEGLITHASGDAMRTFVYGFYFYRIV-DKDNEKAPL 1277

Human  1272 QQ----PATTWHTAGVDDFASFQRKWFEVAFVAEELVHSEIPAFLLPWLPSRPASYASRHSSFSR 1332
            .|    .|..|..|.::|||.|||||||||||.||....::||||||||||||||||||||||||
Zfish  1278 TQLPPAGANVWSAAALEDFALFQRKWFEVAFVMEERRPCDLPAFLLPWLPSRPASYASRHSSFSR 1342

Human  1333 SFGGRSQAAALLAATVPEQRTVTLDVDVNNRTDRLEWCSCYYHGNFSLNAAFEIKLHWMAVTAAV 1397
            |||||||||||||||||||:|||||||||||:||.||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish  1343 SFGGRSQAAALLAATVPEQKTVTLDVDVNNRSDRTEWCSCYYHGNFSLNAAFEIKLHWMAVTAAV 1407

Human  1398 LFEMVQGWHRKATSCGFLLVPVLEGPFALPSYLYGDPLRAQLFIPLNISCLLKEGSEHLFDSFEP 1462
            ||||||||||||.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||.|||||||::||:.|||
Zfish  1408 LFEMVQGWHRKAASCGFLLVPVLEVPFALSSYLYGDPLRAQLFIPLNIQCLLKEGSDNLFEGFEP 1472

Human  1463 ETYWDRMHLFQEAIAHRFGFVQDKYSASAFNFPAENKPQYIHVTGTVFLQLPYSKRKFSGQQRRR 1527
            |||||||.||||||..||||||||:||||||||:|||||||||||||||||||||||:|..||||
Zfish  1473 ETYWDRMQLFQEAILTRFGFVQDKFSASAFNFPSENKPQYIHVTGTVFLQLPYSKRKYSSGQRRR 1537

Human  1528 RNSTSSTNQNMF-CEERVGYNWAYNTMLTKTWRSSATGDEKFADRLLKDFTDFCINRDNRLVTFW 1591
            ||||:||||::| .||||||||||||||||.||:...||||.|||||:||||||.|:||||||||
Zfish  1538 RNSTTSTNQSLFGSEERVGYNWAYNTMLTKAWRTGVLGDEKLADRLLRDFTDFCANKDNRLVTFW 1602

Human  1592 TSCLEKMHASAP 1603
            .||:|||:||||
Zfish  1603 ESCVEKMNASAP 1614

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
DEPDC5NP_001229825.1 IML1 101..381 CDD:463510 255/279 (91%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 427..450 13/22 (59%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 484..527 25/42 (60%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 696..720 7/23 (30%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1135..1165 8/31 (26%)
DEP_DEPDC5-like 1179..1260 CDD:239896 60/80 (75%)
DEPDC5_CTD 1278..1585 CDD:466071 261/307 (85%)
depdc5XP_021334975.1 IML1 105..385 CDD:463510 255/279 (91%)
DEP_DEPDC5-like 1184..1267 CDD:239896 61/82 (74%)
DEPDC5_CTD 1288..1596 CDD:466071 261/307 (85%)

Return to query results.
Submit another query.