DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment DEPDC5 and Depdc5

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001229825.1 Gene:DEPDC5 / 9681 HGNCID:18423 Length:1603 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038947914.1 Gene:Depdc5 / 305464 RGDID:1311535 Length:1601 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1604 Identity:1518/1604 - (94%)
Similarity:1553/1604 - (96%) Gaps:4/1604 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MRTTKVYKLVIHKKGFGGSDDELVVNPKVFPHIKLGDIVEIAHPNDEYSPLLLQVKSLKEDLQKE 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MRTTKVYKLVIHKKGFGGSDDELVVNPKVFPHIKLGDIVEIAHPNDEYSPLLLQVKSLKEDLQKE 65

Human    66 TISVDQTVTQVFRLRPYQDVYVNVVDPKDVTLDLVELTFKDQYIGRGDMWRLKKSLVSTCAYITQ 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 TISVDQTVTQVFRLRPYQDVYVNVVDPKDVTLDLVELTFKDQYIGRGDMWRLKKSLVSTCAYITQ 130

Human   131 KVEFAGIRAQAGELWVKNEKVMCGYISEDTRVVFRSTSAMVYIFIQMSCEMWDFDIYGDLYFEKA 195
            ||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 KVEFAGIRAQAGELWVKNEKVMCGYISEETRVVFRSTSAMVYIFIQMSCEMWDFDIYGDLYFEKA 195

Human   196 VNGFLADLFTKWKEKNCSHEVTVVLFSRTFYDAKSVDEFPEINRASIRQDHKGRFYEDFYKVVVQ 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||:|||||:|||||||||||||||||
  Rat   196 VNGFLADLFTKWKEKNCSHEVTVVLFSRTFYDAKSIDEFPEVNRASIQQDHKGRFYEDFYKVVVQ 260

Human   261 NERREEWTSLLVTIKKLFIQYPVLVRLEQAEGFPQGDNSTSAQGNYLEAINLSFNVFDKHYINRN 325
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 NERREEWTSLLVTIKKLFIQYPVLVRLEQAGGFPQGDNSTSAQGNYLEAINLSFNVFDKHYINRN 325

Human   326 FDRTGQMSVVITPGVGVFEVDRLLMILTKQRMIDNGIGVDLVCMGEQPLHAVPLFKLHNRSAPRD 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
  Rat   326 FDRTGQMSVVITPGVGVFEVDRLLMILTKQRMIDNGIGVDLVCMGEQPLHAVPLFKLHNRSVPRD 390

Human   391 SRLGDDYNIPHWINHSFYTSKSQLFCNSFTPRIKLAGKKPASEKAKNGRDTSLGSPKESENALPI 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|:||.|||||||||:||||||.|||
  Rat   391 SRLGDDYNIPHWINHSFYTSKSQLFCNSFTPRIKLAGKKSATEKTKNGRDTSLGAPKESENTLPI 455

Human   456 QVDYDAYDAQVFRLPGPSRAQCLTTCRSVRERESHSRKSASSCDVSSSPSLPSRTLPTEEVRSQA 520
            |||||||||||||||||||||.|.|||||||:|:|:||||||||||||||||||.||||||||||
  Rat   456 QVDYDAYDAQVFRLPGPSRAQRLATCRSVREQENHNRKSASSCDVSSSPSLPSRALPTEEVRSQA 520

Human   521 SDDSSLGKSANILMIPHPHLHQYEVSSSLGYTSTR-DVLENMMEPPQRDSSAPGRFHVGSAESML 584
            |||||||||.||||||:|||||||||||||||||| ||||||:||||||||||||||||||||||
  Rat   521 SDDSSLGKSTNILMIPNPHLHQYEVSSSLGYTSTRADVLENMIEPPQRDSSAPGRFHVGSAESML 585

Human   585 HVRPGGYTPQRALINPFAPSRMPMKLTSNRRRWMHTFPVGPSGEAIQIHHQTRQNMAELQGSGQR 649
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
  Rat   586 HVRPGGYTPQRALINPFAPSRMPMKLTSNRRRWMHTFPVGPSGEAIQIHHQTRQNMAELQGSRQR 650

Human   650 DPTHSSAELLELAYHEAAGRHSNSRQPGDGMSFLNFSGTEELSVGLLSNSGAGMNPRTQNKDSLE 714
            ||||||||||||||||||||||.||||||.|| |||||||||||.||||||.|||||.|||||||
  Rat   651 DPTHSSAELLELAYHEAAGRHSTSRQPGDSMS-LNFSGTEELSVSLLSNSGTGMNPRNQNKDSLE 714

Human   715 DSVSTSPDPILTLSAPPVVPGFCCTVGVDWKSLTTPACLPLTTDYFPDRQGLQNDYTEGCYDLLP 779
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   715 DGVSTSPDPILTLSAPPVVPGFCCTVGVDWKSLTTPACLPLTTDYFPDRQGLQNDYTEGCYDLLP 779

Human   780 EADIDRRDEDGVQMTAQQVFEEFICQRLMQGYQIIVQPKTQKPNPAVPPPLSSSPLYSRGLVSRN 844
            |||:|||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||:..|||||||||||||||||||
  Rat   780 EADMDRRDEEGVQMTAQQVFEEFICQRLMQGYQIIVQPKTQKPSTTVPPPLSSSPLYSRGLVSRN 844

Human   845 RPEEEDQYWLSMGRTFHKVTLKDKMITVTRYLPKYPYESAQIHYTYSLCPSHSDSEFVSCWVEFS 909
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
  Rat   845 RPEEEGQYWLSMGRTFHKVTLKDKMITVTRYLPKYPYESAQIHYTYSLCPSHSDSEFVSCWVEFC 909

Human   910 HERLEEYKWNYLDQYICSAGSEDFSLIESLKFWRTRFLLLPACVTATKRITEGEAHCDIYGDRPR 974
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||:||
  Rat   910 HERLEEYKWNYLDQYICSAGSEDFSLIESLKFWRTRFLLLPACVTATKRITEGEVHCDIYGDKPR 974

Human   975 ADEDEWQLLDGFVRFVEGLNRIRRRHRSDRMMRKGTAMKGLQMTGPISTHSLESTAPPVGKKGTS 1039
            ||||||||||||:||||||||||||||||||:||||||||||||||||.||||||.|||||||||
  Rat   975 ADEDEWQLLDGFIRFVEGLNRIRRRHRSDRMIRKGTAMKGLQMTGPISAHSLESTGPPVGKKGTS 1039

Human  1040 ALSALLEMEASQKCLGEQQAAVHGGKSSAQSAESSSVAMTPTYMDSPRKDGAFFMEFVRSPRTAS 1104
            |||||||||||||.|||||.:|| ||||.|.||:|||||||||:|||||||||||||||||||||
  Rat  1040 ALSALLEMEASQKSLGEQQTSVH-GKSSTQPAENSSVAMTPTYVDSPRKDGAFFMEFVRSPRTAS 1103

Human  1105 SAFYPQVSVDQTATPMLDGTSLGICTGQSMDRGNSQTFGNSQNIGEQGYSSTNSSDSSSQQLVAS 1169
            ||||||.||||||..:||.||||:.|.||:||||:||||||||| ||.:.||.|.|.||||.:||
  Rat  1104 SAFYPQASVDQTAPLVLDSTSLGVSTCQSVDRGNNQTFGNSQNI-EQAFPSTGSGDGSSQQHIAS 1167

Human  1170 SLTSSSTLTEILEAMKHPSTGVQLLSEQKGLSPYCFISAEVVHWLVNHVEGIQTQAMAIDIMQKM 1234
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||:|:|||:|||||.|||||||
  Rat  1168 SLTSSSTLVEILEAMKHPSTGVQLLSEQKGLSPCCFISAEVVHWLMNNVEGVQTQAMGIDIMQKM 1232

Human  1235 LEEQLITHASGEAWRTFIYGFYFYKIVTDKEPDRVAMQQPATTWHTAGVDDFASFQRKWFEVAFV 1299
            ||||||.||||||||||:|||||||||||:||:|||||||:..||||||||||||||||||||||
  Rat  1233 LEEQLIAHASGEAWRTFVYGFYFYKIVTDREPERVAMQQPSAPWHTAGVDDFASFQRKWFEVAFV 1297

Human  1300 AEELVHSEIPAFLLPWLPSRPASYASRHSSFSRSFGGRSQAAALLAATVPEQRTVTLDVDVNNRT 1364
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1298 AEELVHSEIPAFLLPWLPSRPASYASRHSSFSRSFGGRSQAAALLAATVPEQRTVTLDVDVNNRT 1362

Human  1365 DRLEWCSCYYHGNFSLNAAFEIKLHWMAVTAAVLFEMVQGWHRKATSCGFLLVPVLEGPFALPSY 1429
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1363 DRLEWCSCYYHGNFSLNAAFEIKLHWMAVTATVLFEMVQGWHRKATSCGFLLVPVLEGPFALPSY 1427

Human  1430 LYGDPLRAQLFIPLNISCLLKEGSEHLFDSFEPETYWDRMHLFQEAIAHRFGFVQDKYSASAFNF 1494
            |||||||||||||||:.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1428 LYGDPLRAQLFIPLNLGCLLKEGSEHLFDSFEPETYWDRMHLFQEAIAHRFGFVQDKYSASAFNF 1492

Human  1495 PAENKPQYIHVTGTVFLQLPYSKRKFSGQQRRRRNSTSSTNQNMFCEERVGYNWAYNTMLTKTWR 1559
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1493 PAENKPQYIHVTGTVFLQLPYSKRKFSGQQRRRRNSTSSTNQNMFCEERVGYNWAYNTMLTKTWR 1557

Human  1560 SSATGDEKFADRLLKDFTDFCINRDNRLVTFWTSCLEKMHASAP 1603
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||
  Rat  1558 SSATGDEKFADRLLKDFTDFCINRDNRLVTFWTNCLEKMHASAP 1601

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
DEPDC5NP_001229825.1 IML1 101..381 CDD:463510 274/279 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 427..450 18/22 (82%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 484..527 38/42 (90%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 696..720 20/23 (87%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1135..1165 21/29 (72%)
DEP_DEPDC5-like 1179..1260 CDD:239896 73/80 (91%)
DEPDC5_CTD 1278..1585 CDD:466071 303/306 (99%)
Depdc5XP_038947914.1 IML1 101..381 CDD:463510 274/279 (98%)
DEP_DEPDC5-like 1177..1258 CDD:239896 73/80 (91%)
DEPDC5_CTD 1276..1583 CDD:466071 303/306 (99%)

Return to query results.
Submit another query.