DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment DEPDC5 and depdc5

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001229825.1 Gene:DEPDC5 / 9681 HGNCID:18423 Length:1603 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_004910648.1 Gene:depdc5 / 100498286 XenbaseID:XB-GENE-980707 Length:1608 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1623 Identity:1289/1623 - (79%)
Similarity:1398/1623 - (86%) Gaps:60/1623 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MRTTKVYKLVIHKKGFGGSDDELVVNPKVFPHIKLGDIVEIAHPNDEYSPLLLQVKSLKEDLQKE 65
            |||.:|||||||||||||||||||:||||||:|.|||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog    26 MRTNRVYKLVIHKKGFGGSDDELVINPKVFPYINLGDIVEIAHPNDEYSPLLLQVKSLKEDLQKE 90

Human    66 TISVDQTVTQVFRLRPYQDVYVNVVDPKDVTLDLVELTFKDQYIGRGDMWRLKKSLVSTCAYITQ 130
            |:|:||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||
 Frog    91 TVSIDQTVAQVFRLRPYQDVYVNVVDPKDVTLDLVELTFKDQYIGRGDMWRLKKSLVSSCAYITQ 155

Human   131 KVEFAGIRAQAGELWVKNEKVMCGYISEDTRVVFRSTSAMVYIFIQMSCEMWDFDIYGDLYFEKA 195
            ||||||||||.||||||:|||.||||||||||||||||||||||||||.|:||||||||||||||
 Frog   156 KVEFAGIRAQVGELWVKSEKVTCGYISEDTRVVFRSTSAMVYIFIQMSSELWDFDIYGDLYFEKA 220

Human   196 VNGFLADLFTKWKEKNCSHEVTVVLFSRTFYDAKSVDEFPEINR-ASIRQDHKGRFYEDFYKVVV 259
            |||||||||.|||:||||||||||||||||||||::::|||.:| ||:.||||||||||||||||
 Frog   221 VNGFLADLFNKWKDKNCSHEVTVVLFSRTFYDAKNIEDFPEAHRNASVMQDHKGRFYEDFYKVVV 285

Human   260 QNERREEWTSLLVTIKKLFIQYPVLVRLEQAEGFPQGDNSTSAQGNYLEAINLSFNVFDKHYINR 324
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.||||.||||||||||||||||||||||
 Frog   286 QNERREEWTSLLVTIKKLFIQYPVLVRLENAEGFPPGHNSTSDQGNYLEAINLSFNVFDKHYINR 350

Human   325 NFDRTGQMSVVITPGVGVFEVDRLLMILTKQRMIDNGIGVDLVCMGEQPLHAVPLFKLHNRSAPR 389
            |||||||||||||||||||:|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|.
 Frog   351 NFDRTGQMSVVITPGVGVFQVDRSLMILTKQRMIDNGIGVDLVCMGEQPLHAVPLFKLHNRSSPG 415

Human   390 DSRLGDDYNIPHWINHSFYTSKSQLFCNSFTPRIKLAGKKPASEKAKNGRDTSLGSPKESENALP 454
            |||||||||||||||||||||:||...||||||||||.:|..|||.:.|:|.|:|||||:|||||
 Frog   416 DSRLGDDYNIPHWINHSFYTSQSQPLNNSFTPRIKLAPRKTNSEKGRTGKDPSIGSPKETENALP 480

Human   455 IQVDYDAYDAQVFRLPGPSRAQCLTTCRSVRERESHSRKSASSCDVSSSPSLPSRTLPTEEVRSQ 519
            |||||||||:||||||||||||...|.|:|  ||:..|||:.|.|.|.||  .||....||.|||
 Frog   481 IQVDYDAYDSQVFRLPGPSRAQRSITFRAV--RETQVRKSSCSYDTSCSP--VSRPFTAEEGRSQ 541

Human   520 ASDDSSLGKSANILMIPHPHLHQYEVSSSLGYTSTRDVLENMMEPPQRDSSAPGRFHVGSAESML 584
            .||:|||||.:|||:||.|||||||.|||||||||||.||.|:|..|||||||||||||||||||
 Frog   542 NSDESSLGKLSNILLIPRPHLHQYEASSSLGYTSTRDFLERMIESQQRDSSAPGRFHVGSAESML 606

Human   585 HVRPGGYTPQRALINPFAPSRMPMKLTSNRRRWMHTFPVGPSGEAIQIHHQTRQNMAELQGSGQR 649
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
 Frog   607 HVRPGGYHPQRALINPFAPSRMPMKLTSNRRRWMHTFPVGPSGEAIQIHHQTRQNMAELQGSGMR 671

Human   650 DPTHSSAELLELAYHEAAGRHSNSRQPGDGMSFLNFSGTEELS----VGLLSNSGAGMNPRTQNK 710
            :.:||||||||||||||.||||..|.||:..|   ....||.|    :....|...|.|.|  .|
 Frog   672 EASHSSAELLELAYHEATGRHSGPRTPGENGS---CGSNEEFSCNTPINGQRNHNTGSNHR--EK 731

Human   711 DSLEDSVSTSPDPILTLSAPPVVPGFCCTVGVDWKSLTTPACLPLTTDYFPDRQGLQNDYTEGCY 775
            :|.:|||...|:|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
 Frog   732 ESSDDSVPCCPEPILMLSAPPVVPGFCCTVGVDWKSLTTPACLPLTTDYFPDRQSLQNDYTEGCY 796

Human   776 DLLPEADIDRRDEDGVQMTAQQVFEEFICQRLMQGYQIIVQPKTQKPNPAVPPPLSSSPLYSRGL 840
            |||||||:|||||:|.|||||||||||||||||||||||||||..|...:|||||||||||.|||
 Frog   797 DLLPEADLDRRDEEGAQMTAQQVFEEFICQRLMQGYQIIVQPKHPKAISSVPPPLSSSPLYRRGL 861

Human   841 VSRNRPEEEDQYWLSMGRTFHKVTLKDKMITVTRYLPKYPYESAQIHYTYSLCPSHSDSEFVSCW 905
            |||||.|||:||||||||||||||||||:|||||||||||||||||.|.||||||||:.:|||.|
 Frog   862 VSRNRAEEENQYWLSMGRTFHKVTLKDKIITVTRYLPKYPYESAQISYMYSLCPSHSECDFVSSW 926

Human   906 VEFSHERLEEYKWNYLDQYICSAGSEDFSLIESLKFWRTRFLLLPACVTATKRITEGEAHCDIYG 970
            |||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||:||..||||||||..|||||
 Frog   927 VEFSHERLEDYKWNYLDQYICSAGSEDFSLIESLKFWRTRFLLLPSCVGPTKRITEGEQRCDIYG 991

Human   971 DRPRADEDEWQLLDGFVRFVEGLNRIRRRHRSDRMMRKGTAMKGLQMTGPISTHSLESTAPPVGK 1035
            :|||::::|.||||||:||||||||||||||||||:|||..|||||    :.:|..|...||:||
 Frog   992 ERPRSEQEEAQLLDGFLRFVEGLNRIRRRHRSDRMIRKGAGMKGLQ----LPSHPPEPPGPPIGK 1052

Human  1036 KGTSALSALLEMEASQKCLGEQQAAVHGGKSSAQSAESSSVAMTPTYMDSPRKDGAFFMEFVRSP 1100
            ||||||||||||||:||.||||||.||..|.|:|   .|..|:||||:||||||||||:||||||
 Frog  1053 KGTSALSALLEMEANQKSLGEQQALVHAAKLSSQ---VSDPAVTPTYVDSPRKDGAFFVEFVRSP 1114

Human  1101 RTASSAFYPQVSVDQTATPMLDGTSLGICTGQSMDRGNSQTFGN--------SQNIGEQGYSSTN 1157
            |||.| |.||:|:||       ||||             .|.||        |:.|..||.:|.:
 Frog  1115 RTAPS-FTPQISIDQ-------GTSL-------------VTDGNNAMPNPTPSERIQSQGATSVD 1158

Human  1158 ----SSDSSSQQLVA--SSLTSSSTLTEILEAMKHPSTGVQLLSEQKGLSPYCFISAEVVHWLVN 1216
                |::.|:||:..  |.|.::::|:|||||||||:||:.||||||.|.|.||||||.||||||
 Frog  1159 QPPTSTECSAQQISVGPSVLPTTASLSEILEAMKHPTTGIPLLSEQKCLPPGCFISAEAVHWLVN 1223

Human  1217 HVEGIQTQAMAIDIMQKMLEEQLITHASGEAWRTFIYGFYFYKIVTDKEPDRVA-MQQPATTWHT 1280
            ::..:|:|.||:||||||||||.|||||||.:||||||||.|||..||||||.: :.||. .||:
 Frog  1224 NISWVQSQVMAMDIMQKMLEEQYITHASGETFRTFIYGFYLYKIPADKEPDRASNLVQPC-VWHS 1287

Human  1281 AGVDDFASFQRKWFEVAFVAEELVHSEIPAFLLPWLPSRPASYASRHSSFSRSFGGRSQAAALLA 1345
            ..::||.:|||||||||.|.|||:|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1288 TAMEDFTAFQRKWFEVALVEEELLHSEIPPFLLPWLPSRPASYASRHSSFSRSFGGRSQAAALLA 1352

Human  1346 ATVPEQRTVTLDVDVNNRTDRLEWCSCYYHGNFSLNAAFEIKLHWMAVTAAVLFEMVQGWHRKAT 1410
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||:||||||||||||.
 Frog  1353 ATVPEQRTVTLDVDVNNRTDRLEWCSSYYHGNFSLTAAFEIKLHWMAATAAMLFEMVQGWHRKAP 1417

Human  1411 SCGFLLVPVLEGPFALPSYLYGDPLRAQLFIPLNISCLLKEGSEHLFDSFEPETYWDRMHLFQEA 1475
            |||||||||:||||:|||||||||||||||||||||||:|..::|||:.|||||||:||:|.||.
 Frog  1418 SCGFLLVPVVEGPFSLPSYLYGDPLRAQLFIPLNISCLVKAENDHLFEGFEPETYWERMYLLQEV 1482

Human  1476 IAHRFGFVQDKYSASAFNFPAENKPQYIHVTGTVFLQLPYSKRKFSGQQRRRRNSTSSTNQNMFC 1540
            ||:||||:||||||||||||:|||||||||||||||||||||||  ||||||||||||:.||:|.
 Frog  1483 IAYRFGFIQDKYSASAFNFPSENKPQYIHVTGTVFLQLPYSKRK--GQQRRRRNSTSSSTQNLFG 1545

Human  1541 EERVGYNWAYNTMLTKTWRSSATGDEKFADRLLKDFTDFCINRDNRLVTFWTSCLEKMHASAP 1603
            |||:||||||||||||||||..||||:|||||||||||||.||||||.|||.:|||||:.|||
 Frog  1546 EERIGYNWAYNTMLTKTWRSIGTGDERFADRLLKDFTDFCANRDNRLGTFWANCLEKMNTSAP 1608

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
DEPDC5NP_001229825.1 IML1 101..381 CDD:463510 257/280 (92%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 427..450 12/22 (55%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 484..527 22/42 (52%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 696..720 9/23 (39%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1135..1165 10/41 (24%)
DEP_DEPDC5-like 1179..1260 CDD:239896 61/80 (76%)
DEPDC5_CTD 1278..1585 CDD:466071 263/306 (86%)
depdc5XP_004910648.1 IML1 126..407 CDD:463510 257/280 (92%)
DEP_DEPDC5-like 1184..1267 CDD:239896 62/82 (76%)
DEPDC5_CTD 1285..1590 CDD:466071 263/306 (86%)

Return to query results.
Submit another query.