DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment GABBR2 and Gabbr2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_005449.5 Gene:GABBR2 / 9568 HGNCID:4507 Length:941 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001074610.1 Gene:Gabbr2 / 242425 MGIID:2386030 Length:940 Species:Mus musculus


Alignment Length:941 Identity:922/941 - (97%)
Similarity:934/941 - (99%) Gaps:1/941 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MASPRSSGQPGPPPPPPPPPARLLLLLLLPLLLPLAPGAWGWARGAPRPPPSSPPLSIMGLMPLT 65
            ||||.||||| .|||||||||||||.|||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse     1 MASPPSSGQP-RPPPPPPPPARLLLPLLLSLLLSLAPGAWGWARGAPRPPPSSPPLSIMGLMPLT 64

Human    66 KEVAKGSIGRGVLPAVELAIEQIRNESLLRPYFLDLRLYDTECDNAKGLKAFYDAIKYGPNHLMV 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse    65 KEVAKGSIGRGVLPAVELAIEQIRNESLLRPYFLDLRLYDTECDNAKGLKAFYDAIKYGPNHLMV 129

Human   131 FGGVCPSVTSIIAESLQGWNLVQLSFAATTPVLADKKKYPYFFRTVPSDNAVNPAILKLLKHYQW 195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||::|
Mouse   130 FGGVCPSVTSIIAESLQGWNLVQLSFAATTPVLADKKKYPYFFRTVPSDNAVNPAILKLLKHFRW 194

Human   196 KRVGTLTQDVQRFSEVRNDLTGVLYGEDIEISDTESFSNDPCTSVKKLKGNDVRIILGQFDQNMA 260
            :||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   195 RRVGTLTQDVQRFSEVRNDLTGVLYGEDIEISDTESFSNDPCTSVKKLKGNDVRIILGQFDQNMA 259

Human   261 AKVFCCAYEENMYGSKYQWIIPGWYEPSWWEQVHTEANSSRCLRKNLLAAMEGYIGVDFEPLSSK 325
            |||||||:||:|:||||||||||||||:||||||.|||||||||::|||||||||||||||||||
Mouse   260 AKVFCCAFEESMFGSKYQWIIPGWYEPAWWEQVHVEANSSRCLRRSLLAAMEGYIGVDFEPLSSK 324

Human   326 QIKTISGKTPQQYEREYNNKRSGVGPSKFHGYAYDGIWVIAKTLQRAMETLHASSRHQRIQDFNY 390
            ||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   325 QIKTISGKTPQQYEREYNSKRSGVGPSKFHGYAYDGIWVIAKTLQRAMETLHASSRHQRIQDFNY 389

Human   391 TDHTLGRIILNAMNETNFFGVTGQVVFRNGERMGTIKFTQFQDSREVKVGEYNAVADTLEIINDT 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   390 TDHTLGRIILNAMNETNFFGVTGQVVFRNGERMGTIKFTQFQDSREVKVGEYNAVADTLEIINDT 454

Human   456 IRFQGSEPPKDKTIILEQLRKISLPLYSILSALTILGMIMASAFLFFNIKNRNQKLIKMSSPYMN 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   455 IRFQGSEPPKDKTIILEQLRKISLPLYSILSALTILGMIMASAFLFFNIKNRNQKLIKMSSPYMN 519

Human   521 NLIILGGMLSYASIFLFGLDGSFVSEKTFETLCTVRTWILTVGYTTAFGAMFAKTWRVHAIFKNV 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   520 NLIILGGMLSYASIFLFGLDGSFVSEKTFETLCTVRTWILTVGYTTAFGAMFAKTWRVHAIFKNV 584

Human   586 KMKKKIIKDQKLLVIVGGMLLIDLCILICWQAVDPLRRTVEKYSMEPDPAGRDISIRPLLEHCEN 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||
Mouse   585 KMKKKIIKDQKLLVIVGGMLLIDLCILICWQAVDPLRRTVERYSMEPDPAGRDISIRPLLEHCEN 649

Human   651 THMTIWLGIVYAYKGLLMLFGCFLAWETRNVSIPALNDSKYIGMSVYNVGIMCIIGAAVSFLTRD 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   650 THMTIWLGIVYAYKGLLMLFGCFLAWETRNVSIPALNDSKYIGMSVYNVGIMCIIGAAVSFLTRD 714

Human   716 QPNVQFCIVALVIIFCSTITLCLVFVPKLITLRTNPDAATQNRRFQFTQNQKKEDSKTSTSVTSV 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   715 QPNVQFCIVALVIIFCSTITLCLVFVPKLITLRTNPDAATQNRRFQFTQNQKKEDSKTSTSVTSV 779

Human   781 NQASTSRLEGLQSENHRLRMKITELDKDLEEVTMQLQDTPEKTTYIKQNHYQELNDILNLGNFTE 845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||
Mouse   780 NQASTSRLEGLQSENHRLRMKITELDKDLEEVTMQLQDTPEKTTYIKQNHYQELNDILSLGNFTE 844

Human   846 STDGGKAILKNHLDQNPQLQWNTTEPSRTCKDPIEDINSPEHIQRRLSLQLPILHHAYLPSIGGV 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   845 STDGGKAILKNHLDQNPQLQWNTTEPSRTCKDPIEDINSPEHIQRRLSLQLPILHHAYLPSIGGV 909

Human   911 DASCVSPCVSPTASPRHRHVPPSFRVMVSGL 941
            |||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   910 DASCVSPCVSPTASPRHRHVPPSFRVMVSGL 940

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
GABBR2NP_005449.5 PBP1_GABAb_receptor 58..460 CDD:380589 390/401 (97%)
7tmC_GABA-B-R2 480..749 CDD:320421 267/268 (100%)
TM helix 1 480..505 CDD:320421 24/24 (100%)
TM helix 2 517..538 CDD:320421 20/20 (100%)
TM helix 3 554..578 CDD:320421 23/23 (100%)
TM helix 4 597..617 CDD:320421 19/19 (100%)
TM helix 5 653..679 CDD:320421 25/25 (100%)
TM helix 6 688..711 CDD:320421 22/22 (100%)
TM helix 7 718..743 CDD:320421 24/24 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 763..790 26/26 (100%)
GBR2_CC 779..817 CDD:465774 37/37 (100%)
Gabbr2NP_001074610.1 PBP1_GABAb_receptor 57..459 CDD:380589 390/401 (97%)
7tmC_GABA-B-R2 479..748 CDD:320421 267/268 (100%)
TM helix 1 479..504 CDD:320421 24/24 (100%)
TM helix 2 516..537 CDD:320421 20/20 (100%)
TM helix 3 553..577 CDD:320421 23/23 (100%)
TM helix 4 596..616 CDD:320421 19/19 (100%)
TM helix 5 652..678 CDD:320421 25/25 (100%)
TM helix 6 687..710 CDD:320421 22/22 (100%)
TM helix 7 717..742 CDD:320421 24/24 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 762..789 26/26 (100%)
GBR2_CC 778..816 CDD:465774 37/37 (100%)

Return to query results.
Submit another query.