DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment NRG2 and Nrg2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_053585.1 Gene:NRG2 / 9542 HGNCID:7998 Length:858 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_063133571.1 Gene:Nrg2 / 432361 RGDID:1303302 Length:862 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:875 Identity:799/875 - (91%)
Similarity:812/875 - (92%) Gaps:30/875 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MRQVCCSALPPPPLEKGRCSSYS---DSSSSSSERSSSSSSSSSESGSSSRSS------------ 50
            ||||||||| ||||||.||||||   .||||||..||||:||.|.|.||||||            
  Rat     1 MRQVCCSAL-PPPLEKARCSSYSYSDSSSSSSSNNSSSSTSSRSSSRSSSRSSRGSTTTTSSSEN 64

Human    51 --SNNSSISRPAAPPEPRPQQQPQPRSPAARRAAARSRAAAAGGMRRDPAPGFSMLLFGVSLACY 113
              ||:.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    65 SGSNSGSIFRPAAPPEPRPQPQPQPRSPAARRAAARSRAAAAGGMRRDPAPGFSMLLFGVSLACY 129

Human   114 SPSLKSVQDQAYKAPVVVEGKVQGLVPAGGSSSNSTREPPASGRVALVKVLDKWPLRSGGLQREQ 178
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   130 SPSLKSVQDQAYKAPVVVEGKVQGLAPAGGSSSNSTREPPASGRVALVKVLDKWPLRSGGLQREQ 194

Human   179 VISVGSCVPLERNQRYIFFLEPTEQPLVFKTAFAPLDTNGKNLKKEVGKILCTDCATRPKLKKMK 243
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||:|.||||:||||||||||||||||||||||
  Rat   195 VISVGSCAPLERNQRYIFFLEPTEQPLVFKTAFAPVDPNGKNIKKEVGKILCTDCATRPKLKKMK 259

Human   244 SQTGQVGEKQSLKCEAAAGNPQPSYRWFKDGKELNRSRDIRIKYGNGRKNSRLQFNKVKVEDAGE 308
            ||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   260 SQTGEVGEKQSLKCEAAAGNPQPSYRWFKDGKELNRSRDIRIKYGNGRKNSRLQFNKVKVEDAGE 324

Human   309 YVCEAENILGKDTVRGRLYVNSVSTTLSSWSGHARKCNETAKSYCVNGGVCYYIEGINQLSCKCP 373
            ||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   325 YVCEAENILGKDTVRGRLHVNSVSTTLSSWSGHARKCNETAKSYCVNGGVCYYIEGINQLSCKCP 389

Human   374 NGFFGQRCLEKLPLRLYMPDPKQKHLGFELKEAEELYQKRVLTITGICVALLVVGIVCVVAYCKT 438
            .|:.|.||.:...:..      .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   390 VGYTGDRCQQFAMVNF------SKHLGFELKEAEELYQKRVLTITGICVALLVVGIVCVVAYCKT 448

Human   439 KKQRKQMHNHLRQNMCPAHQNRSLANGPSHPRLDPEEIQMADYISKNVPATDHVIRRETETTFSG 503
            ||||:|||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
  Rat   449 KKQRRQMHHHLRQNMCPAHQNRSLANGPSHPRLDPEEIQMADYISKNVPATDHVIRREAETTFSG 513

Human   504 SHSCSPSHHCSTATPTSSHRHESHTWSLERSESLTSDSQSGIMLSSVGTSKCNSPACVEARARRA 568
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   514 SHSCSPSHHCSTATPTSSHRHESHTWSLERSESLTSDSQSGIMLSSVGTSKCNSPACVEARARRA 578

Human   569 AAYNLEERRRATAPPYHDSVDSLRDSPHSERYVSALTTPARLSPVDFHYSLATQVPTFEITSPNS 633
            |||:.||||||..||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   579 AAYSQEERRRAAMPPYHDSIDSLRDSPHSERYVSALTTPARLSPVDFHYSLATQVPTFEITSPNS 643

Human   634 AHAVSLPPAAPISYRLAEQQPLLRHPAPPGPGPGPGPGPGPGADMQRSYDSYYYPAAGPGPRRGT 698
            ||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||.
  Rat   644 AHAVSLPPAAPISYRLAEQQPLLRHPAP------PGPGPGPGADMQRSYDSYYYPAAGPGPRRGA 702

Human   699 CALGGSLGSLPASPFRIPEDDEYETTQECAPPPPPRPRARGASRRTSAGPRRWRRSRLNGLAAQR 763
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
  Rat   703 CALGGSLGSLPASPFRIPEDDEYETTQECAPPPPPRPRTRGASRRTSAGPRRWRRSRLNGLAAQR 767

Human   764 ARAARDSLSLSSGSGGGSASASDDDADDADGALAAESTPFLGLRGAHDALRSDSPPLCPAADSRT 828
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
  Rat   768 ARAARDSLSLSSGSGCGSASASDDDADDADGALAAESTPFLGLRAAHDALRSDSPPLCPAADSRT 832

Human   829 YYSLDSHSTRASSRHSRGPPPRAKQDSAPL 858
            ||||||||||||||||||||.||||||.||
  Rat   833 YYSLDSHSTRASSRHSRGPPTRAKQDSGPL 862

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
NRG2NP_053585.1 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..96 81/111 (73%)
Ig_Pro_neuregulin 237..328 CDD:409408 89/90 (99%)
putative Ig strand A 237..243 CDD:409408 5/5 (100%)
Ig strand B 253..257 CDD:409408 3/3 (100%)
Ig strand C 267..271 CDD:409408 3/3 (100%)
Ig strand E 294..298 CDD:409408 3/3 (100%)
Ig strand F 308..313 CDD:409408 4/4 (100%)
Ig strand G 321..324 CDD:409408 2/2 (100%)
Neuregulin 438..839 CDD:426627 382/400 (96%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 500..543 42/42 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 574..593 15/18 (83%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 655..689 27/33 (82%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 708..796 85/87 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 809..858 46/48 (96%)
Nrg2XP_063133571.1 None

Return to query results.
Submit another query.