DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment FOXP2 and Foxp2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_683696.2 Gene:FOXP2 / 93986 HGNCID:13875 Length:740 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_063142549.1 Gene:Foxp2 / 500037 RGDID:1559697 Length:736 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:740 Identity:727/740 - (98%)
Similarity:731/740 - (98%) Gaps:4/740 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MMQESATETISNSSMNQNGMSTLSSQLDAGSRDGRSSGDTSSEVSTVELLHLQQQQALQAARQLL 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MMQESATETISNSSMNQNGMSTLSSQLDAGSRDGRSSGDTSSEVSTVELLHLQQQQALQAARQLL 65

Human    66 LQQQTSGLKSPKSSDKQRPLQELLPETKLCICGHSSGDGHPHNTFAVPVSVAMMTPQVITPQQMQ 130
            ||||||||||||||||||||||||||.|||:||||.|||||::||||||||||||||||||||||
  Rat    66 LQQQTSGLKSPKSSDKQRPLQELLPEAKLCVCGHSPGDGHPYSTFAVPVSVAMMTPQVITPQQMQ 130

Human   131 QILQQQVLSPQQLQALLQQQQAVMLQQQQLQEFYKKQQEQLHLQLLQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ 195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||
  Rat   131 QILQQQVLSPQQLQALLQQQQAVMLQQQQLQEFYKKQQEQLHLQLL----QQQQQQQQQQQQQQQ 191

Human   196 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHPGKQAKEQQQQQQQQQQLAAQQLVFQQQLLQMQQLQQQQHLLS 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   192 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHPGKQAKEQQQQQQQQQQLAAQQLVFQQQLLQMQQLQQQQHLLS 256

Human   261 LQRQGLISIPPGQAALPVQSLPQAGLSPAEIQQLWKEVTGVHSMEDNGIKHGGLDLTTNNSSSTT 325
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
  Rat   257 LQCQGLISIPPGQAALPVQSLPQAGLSPAEIQQLWKEVTGVHSQEDNGIKHGGLDLTTNNSSSTT 321

Human   326 SSNTSKASPPITHHSIVNGQSSVLSARRDSSSHEETGASHTLYGHGVCKWPGCESICEDFGQFLK 390
            ||.|||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   322 SSTTSKASPPITHHSIVNGQSSVLNARRDSSSHEETGASHTLYGHGVCKWPGCESICEDFGQFLK 386

Human   391 HLNNEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLEIQLSKERERLQAMMTHLHMRPSEPKPSPKPLNLVSSVT 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   387 HLNNEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLEIQLSKERERLQAMMTHLHMRPSEPKPSPKPLNLVSSVT 451

Human   456 MSKNMLETSPQSLPQTPTTPTAPVTPITQGPSVITPASVPNVGAIRRRHSDKYNIPMSSEIAPNY 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   452 MSKNMLETSPQSLPQTPTTPTAPVTPITQGPSVITPASVPNVGAIRRRHSDKYNIPMSSEIAPNY 516

Human   521 EFYKNADVRPPFTYATLIRQAIMESSDRQLTLNEIYSWFTRTFAYFRRNAATWKNAVRHNLSLHK 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   517 EFYKNADVRPPFTYATLIRQAIMESSDRQLTLNEIYSWFTRTFAYFRRNAATWKNAVRHNLSLHK 581

Human   586 CFVRVENVKGAVWTVDEVEYQKRRSQKITGSPTLVKNIPTSLGYGAALNASLQAALAESSLPLLS 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   582 CFVRVENVKGAVWTVDEVEYQKRRSQKITGSPTLVKNIPTSLGYGAALNASLQAALAESSLPLLS 646

Human   651 NPGLINNASSGLLQAVHEDLNGSLDHIDSNGNSSPGCSPQPHIHSIHVKEEPVIAEDEDCPMSLV 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   647 NPGLINNASSGLLQAVHEDLNGSLDHIDSNGNSSPGCSPQPHIHSIHVKEEPVIAEDEDCPMSLV 711

Human   716 TTANHSPELEDDREIEEEPLSEDLE 740
            |||||||||||||||||||||||||
  Rat   712 TTANHSPELEDDREIEEEPLSEDLE 736

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
FOXP2NP_683696.2 FOXP-CC 367..434 CDD:465036 66/66 (100%)
COG5025 502..>733 CDD:227358 230/230 (100%)
FH_FOXP2 528..609 CDD:410839 80/80 (100%)
Foxp2XP_063142549.1 None

Return to query results.
Submit another query.