DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment NRXN1 and Nrxn1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001129131.1 Gene:NRXN1 / 9378 HGNCID:8008 Length:1547 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_063118475.1 Gene:Nrxn1 / 60391 RGDID:628659 Length:1523 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1556 Identity:1497/1556 - (96%)
Similarity:1506/1556 - (96%) Gaps:42/1556 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKWNACCESEMSFQLKTRSARG 65
            |||||:|.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MGTALVQHGGCCLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKWNACCESEMSFQLKTRSARG 65

Human    66 LVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRIRRQFRNTTLFI 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
  Rat    66 LVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRIRRQFRNTTLYI 130

Human   131 DQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREPFKGWIRDVRVNSSQVL 195
            |:.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
  Rat   131 DRAEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREPFKGWIRDVRVNSSQAL 195

Human   196 PVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDDQAVCDCSRTGFRGKDCSQEIK 260
            |||..|||||:||||||||||||||:||:||||||||||||||||||||||||||||||||||  
  Rat   196 PVDGSEVKLDEEPPNSGGGSPCEAGDEGDGGVCLNGGVCSVVDDQAVCDCSRTGFRGKDCSQE-- 258

Human   261 FGLQCVLPVLLHDNDQGKYCCINTAKPLTEKDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYF 325
                                           ||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   259 -------------------------------DNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYF 292

Human   326 CYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEP 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   293 CYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEP 357

Human   391 VNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQHSGIGHAMVNKLHCSVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFY 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   358 VNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQHSGIGHAMVNKLHCSVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFY 422

Human   456 VGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVATLD 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   423 VGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVATLD 487

Human   521 PITFETPESFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKVDFFAIEM 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   488 PITFETPESFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKVDFFAIEM 552

Human   586 LDGHLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPYTAPGESEILDLD 650
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   553 LDGHLYLLLDMGSGTIKIKALQKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPYTAPGESEILDLD 617

Human   651 DELYLGGLPENKAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIRQMAEVQSTAGVKPSCSKE 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||:|
  Rat   618 DELYLGGLPENKAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIRQMAEIQSTAGVKPSCSRE 682

Human   716 TAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREATVLSYDGSMFMKIQLPVVMHTEAE 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   683 TAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREATVLSYDGSMFMKIQLPVVMHTEAE 747

Human   781 DVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVKLTVNLDCIRINCNSSKGPETLFAGYNLN 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   748 DVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVKLTVNLDCIRINCNSSKGPETLFAGYNLN 812

Human   846 DNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHTRLEFHNIETGIITERRYLSSVPSNFIGHLQ 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   813 DNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHTRLEFHNIETGIITERRYLSSVPSNFIGHLQ 877

Human   911 SLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFRNIIADPVTFKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKT 975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   878 SLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFRNIIADPVTFKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKT 942

Human   976 TSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKGYLHYVFDLGNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNL 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   943 TSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKGYLHYVFDLGNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNL 1007

Human  1041 HTVKIDTKITTQITAGARNLDLKSDLYIGGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDL 1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1008 HTVKIDTKITTQITAGARNLDLKSDLYIGGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDL 1072

Human  1106 ISDALFCNGQIERGCE---------GPSTTCQEDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCND 1161
            ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1073 ISDALFCNGQIERGCEVALMKADLQGPSTTCQEDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCND 1137

Human  1162 PGTTYIFSKGGGQITYKWPPNDRPSTRADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGK 1226
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1138 PGTTYIFSKGGGQITYKWPPNDRPSTRADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGK 1202

Human  1227 IGVKFNVGTDDIAIEESNAIINDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIAR 1291
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1203 IGVKFNVGTDDIAIEESNAIINDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIAR 1267

Human  1292 QRIPYRLGRVVDEWLLDKGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDA 1356
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1268 QRIPYRLGRVVDEWLLDKGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDA 1332

Human  1357 NIAIVGNVRLVGEVPSSMTTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPTKEPISQTTDDI 1421
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1333 NIAIVGNVRLVGEVPSSMTTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPTKEPISQTTDDI 1397

Human  1422 LVASAECPSDDEDIDPCEPSSGGLANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCIL 1486
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1398 LVASAECPSDDEDIDPCEPSSGGLANPTRVGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCIL 1462

Human  1487 ILLYAMYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV 1547
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||
  Rat  1463 ILLYAMYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSANKNKKNKDKEYYV 1523

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
NRXN1NP_001129131.1 LamG 30..190 CDD:238058 156/159 (98%)
LamG 340..486 CDD:214598 145/145 (100%)
LamG 543..692 CDD:214598 147/148 (99%)
EGF_CA 720..753 CDD:238011 32/32 (100%)
Laminin_G_2 786..916 CDD:460494 129/129 (100%)
Laminin_G_2 973..1101 CDD:460494 127/127 (100%)
Laminin_G_2 1196..1344 CDD:460494 147/147 (100%)
4.1m 1492..1510 CDD:128590 17/17 (100%)
Nrxn1XP_063118475.1 None

Return to query results.
Submit another query.