DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment NRXN1 and Nrxn1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001129131.1 Gene:NRXN1 / 9378 HGNCID:8008 Length:1547 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_011244620.1 Gene:Nrxn1 / 18189 MGIID:1096391 Length:1516 Species:Mus musculus


Alignment Length:1556 Identity:1496/1556 - (96%)
Similarity:1501/1556 - (96%) Gaps:49/1556 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKWNACCESEMSFQLKTRSARG 65
            |||||:|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse     1 MGTALVQRGGCCLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKWNACCESEMSFQLKTRSARG 65

Human    66 LVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRIRRQFRNTTLFI 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
Mouse    66 LVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRIRRQFRNTTLYI 130

Human   131 DQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREPFKGWIRDVRVNSSQVL 195
            |:.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Mouse   131 DRAEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREPFKGWIRDVRVNSSQAL 195

Human   196 PVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDDQAVCDCSRTGFRGKDCSQEIK 260
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Mouse   196 PVDGGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDDQAVCDCSRTGFRGKDCSQE-- 258

Human   261 FGLQCVLPVLLHDNDQGKYCCINTAKPLTEKDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYF 325
                                           ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   259 -------------------------------DNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYF 292

Human   326 CYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEP 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   293 CYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEP 357

Human   391 VNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQHSGIGHAMVNKLHCSVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFY 455
            |||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   358 VNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQHSGIGHAM-------VTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFY 415

Human   456 VGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVATLD 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   416 VGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVATLD 480

Human   521 PITFETPESFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKVDFFAIEM 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   481 PITFETPESFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKVDFFAIEM 545

Human   586 LDGHLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPYTAPGESEILDLD 650
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   546 LDGHLYLLLDMGSGTIKIKALQKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPYTAPGESEILDLD 610

Human   651 DELYLGGLPENKAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIRQMAEVQSTAGVKPSCSKE 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||
Mouse   611 DELYLGGLPENKAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIRQMAEIQSTAGVKPSCSKE 675

Human   716 TAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREATVLSYDGSMFMKIQLPVVMHTEAE 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   676 TAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREATVLSYDGSMFMKIQLPVVMHTEAE 740

Human   781 DVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVKLTVNLDCIRINCNSSKGPETLFAGYNLN 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   741 DVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVKLTVNLDCIRINCNSSKGPETLFAGYNLN 805

Human   846 DNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHTRLEFHNIETGIITERRYLSSVPSNFIGHLQ 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   806 DNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHTRLEFHNIETGIITERRYLSSVPSNFIGHLQ 870

Human   911 SLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFRNIIADPVTFKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKT 975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   871 SLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFRNIIADPVTFKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKT 935

Human   976 TSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKGYLHYVFDLGNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNL 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   936 TSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKGYLHYVFDLGNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNL 1000

Human  1041 HTVKIDTKITTQITAGARNLDLKSDLYIGGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDL 1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1001 HTVKIDTKITTQITAGARNLDLKSDLYIGGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDL 1065

Human  1106 ISDALFCNGQIERGCE---------GPSTTCQEDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCND 1161
            ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1066 ISDALFCNGQIERGCEVALMKADLQGPSTTCQEDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCND 1130

Human  1162 PGTTYIFSKGGGQITYKWPPNDRPSTRADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGK 1226
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1131 PGTTYIFSKGGGQITYKWPPNDRPSTRADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGK 1195

Human  1227 IGVKFNVGTDDIAIEESNAIINDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIAR 1291
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1196 IGVKFNVGTDDIAIEESNAIINDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIAR 1260

Human  1292 QRIPYRLGRVVDEWLLDKGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDA 1356
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1261 QRIPYRLGRVVDEWLLDKGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDA 1325

Human  1357 NIAIVGNVRLVGEVPSSMTTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPTKEPISQTTDDI 1421
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1326 NIAIVGNVRLVGEVPSSMTTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPTKEPISQTTDDI 1390

Human  1422 LVASAECPSDDEDIDPCEPSSGGLANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCIL 1486
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1391 LVASAECPSDDEDIDPCEPSSGGLANPTRVGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCIL 1455

Human  1487 ILLYAMYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV 1547
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||
Mouse  1456 ILLYAMYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSANKNKKNKDKEYYV 1516

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
NRXN1NP_001129131.1 LamG 30..190 CDD:238058 156/159 (98%)
LamG 340..486 CDD:214598 138/145 (95%)
LamG 543..692 CDD:214598 147/148 (99%)
EGF_CA 720..753 CDD:238011 32/32 (100%)
Laminin_G_2 786..916 CDD:460494 129/129 (100%)
Laminin_G_2 973..1101 CDD:460494 127/127 (100%)
Laminin_G_2 1196..1344 CDD:460494 147/147 (100%)
4.1m 1492..1510 CDD:128590 17/17 (100%)
Nrxn1XP_011244620.1 LamG 30..190 CDD:238058 156/159 (98%)
LamG 307..446 CDD:214598 138/145 (95%)
LamG 503..652 CDD:214598 147/148 (99%)
EGF_CA 680..713 CDD:238011 32/32 (100%)
Laminin_G_2 746..876 CDD:460494 129/129 (100%)
Laminin_G_2 933..1061 CDD:460494 127/127 (100%)
Laminin_G_2 1165..1313 CDD:460494 147/147 (100%)
4.1m 1461..1479 CDD:128590 17/17 (100%)

Return to query results.
Submit another query.