DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment KIF3B and Kif3b

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_004789.1 Gene:KIF3B / 9371 HGNCID:6320 Length:747 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001099999.1 Gene:Kif3b / 296284 RGDID:1306815 Length:747 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:747 Identity:731/747 - (97%)
Similarity:744/747 - (99%) Gaps:0/747 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSKLKSSESVRVVVRCRPMNGKEKAASYDKVVDVDVKLGQVSVKNPKGTAHEMPKTFTFDAVYDW 65
            ||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||
  Rat     1 MSKLKSSESVRVVVRCRPMNGKEKAAAYDKVVDVDVKLGQVSVKNPKGTSHEMPKTFTFDAVYDW 65

Human    66 NAKQFELYDETFRPLVDSVLQGFNGTIFAYGQTGTGKTYTMEGIRGDPEKRGVIPNSFDHIFTHI 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||
  Rat    66 NAKQFELYDETFRPLVDSVLQGFNGTIFAYGQTGTGKTYTMEGVRGDPEKRGVIPNSFDHIFTHI 130

Human   131 SRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKDQTKRLELKERPDTGVYVKDLSSFVTKSVKEIEHVMN 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 SRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKDQTKRLELKERPDTGVYVKDLSSFVTKSVKEIEHVMN 195

Human   196 VGNQNRSVGATNMNEHSSRSHAIFVITIECSEVGLDGENHIRVGKLNLVDLAGSERQAKTGAQGE 260
            |||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 VGNQNRSVGATNMNEHSSRSHAIFVITVECSEVGLDGENHIRVGKLNLVDLAGSERQAKTGAQGE 260

Human   261 RLKEATKINLSLSALGNVISALVDGKSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTVMVANVGPASYNVE 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 RLKEATKINLSLSALGNVISALVDGKSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTVMVANVGPASYNVE 325

Human   326 ETLTTLRYANRAKNIKNKPRVNEDPKDALLREFQEEIARLKAQLEKRSIGRRKRREKRREGGGSG 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 ETLTTLRYANRAKNIKNKPRVNEDPKDALLREFQEEIARLKAQLEKRSIGRRKRREKRREGGGSG 390

Human   391 GGGEEEEEEGEEGEEEGDDKDDYWREQQEKLEIEKRAIVEDHSLVAEEKMRLLKEKEKKMEDLRR 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 GGGEEEEEEGEEGEEEGDDKDDYWREQQEKLEIEKRAIVEDHSLVAEEKMRLLKEKEKKMEDLRR 455

Human   456 EKDAAEMLGAKIKAMESKLLVGGKNIVDHTNEQQKILEQKRQEIAEQKRREREIQQQMESRDEET 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 EKDAAEMLGAKIKAMESKLLVGGKNIVDHTNEQQKILEQKRQEIAEQKRREREIQQQMESRDEET 520

Human   521 LELKETYSSLQQEVDIKTKKLKKLFSKLQAVKAEIHDLQEEHIKERQELEQTQNELTRELKLKHL 585
            |||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 LELKETYTSLQQEVDIKTKKLKKLFSKLQAVKAEIHDLQEEHIKERQELEQTQNELTRELKLKHL 585

Human   586 IIENFIPLEEKSKIMNRAFFDEEEDHWKLHPITRLENQQMMKRPVSAVGYKRPLSQHARMSMMIR 650
            |||||||||||:|||||:|||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 IIENFIPLEEKNKIMNRSFFDDEEDHWKLHPITRLENQQMMKRPVSAVGYKRPLSQHARMSMMIR 650

Human   651 PEARYRAENIVLLELDMPSRTTRDYEGPAIAPKVQAALDAALQDEDEIQVDASSFESTANKKSKA 715
            ||.|||||||:|||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||:|:||
  Rat   651 PEPRYRAENIMLLELDMPSRTTRDYEGPAISPKVQAALDAALQDEDEIQVDASSFESTANRKAKA 715

Human   716 RPKSGRKSGSSSSSSGTPASQLYPQSRGLVPK 747
            |||||||||:||||||.||||.||||||||||
  Rat   716 RPKSGRKSGASSSSSGNPASQFYPQSRGLVPK 747

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
KIF3BNP_004789.1 KISc_KIF3 8..340 CDD:276822 327/331 (99%)
Smc <352..>614 CDD:224117 257/261 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 374..412 37/37 (100%)
Globular 580..747 155/166 (93%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 699..747 42/47 (89%)
Kif3bNP_001099999.1 KISc_KIF3 8..340 CDD:276822 327/331 (99%)
Smc <352..>614 CDD:224117 257/261 (98%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C83681786
Domainoid 1 1.000 776 1.000 Domainoid score I2855
eggNOG 1 0.900 - - E2759_KOG4280
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H55849
Inparanoid 1 1.050 1440 1.000 Inparanoid score I2978
NCBI 1 1.000 - -
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D108497at7742
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0002745
OrthoInspector 1 1.000 - - oto130270
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_101005
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR24115
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X1829
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1717.260

Return to query results.
Submit another query.