DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment NRXN3 and nrxn3a

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011535665.1 Gene:NRXN3 / 9369 HGNCID:8010 Length:1687 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_073783476.1 Gene:nrxn3a / 563598 ZFINID:ZDB-GENE-070206-9 Length:1699 Species:Danio rerio


Alignment Length:1706 Identity:1374/1706 - (80%)
Similarity:1520/1706 - (89%) Gaps:40/1706 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    10 FTLKVSILLGSLLGLCLGLEFMGLPNQWARYLRWDASTRSDLSFQFKTNVSTGLLLYLDDGGVCD 74
            |.:::.:|:.::||.||||||.||..||||||||||||||||||||||:|||.|:||.||||.||
Zfish     6 FPVQLQLLISTVLGPCLGLEFTGLQGQWARYLRWDASTRSDLSFQFKTDVSTALILYFDDGGFCD 70

Human    75 FLCLSLVDGRVQLRFSMDCAETAVLSNKQVNDSSWHFLMVSRDRLRTVLMLDGEGQSGELQPQRP 139
            ||.|.:|:|::||:||:|||||.|:|:|:|||||||...:||..|||||.|||..:..|::|.|.
Zfish    71 FLQLMVVEGKLQLQFSIDCAETTVVSDKRVNDSSWHSATLSRYNLRTVLGLDGVSKWAEVRPLRQ 135

Human   140 YMDVVSDLFLGGVPTDIRPSALTLDGVQAMPGFKGLILDLKYGNSEPRLLGSRGVQMDAEGPCGE 204
            ||.:||||||||||.|||.|.|||..|:.:|.|||:|.:|||.:.||.||.|:.|:||.||.|.|
Zfish   136 YMKIVSDLFLGGVPQDIRISVLTLPTVKDLPPFKGIIRELKYNSKEPILLSSQRVRMDIEGICME 200

Human   205 RPCENGGICFLLDGHPTCDCSTTGYGGKLCSEDVSQDPGLSHLMMSEQGRSKAREENVATFRGSE 269
            .||||||.|.::||.|.||||.|.|.|:.|:|:.:..||.:|:||::|.:.||||||||||||||
Zfish   201 NPCENGGTCSVVDGEPLCDCSKTEYVGRFCNEEANNIPGFAHMMMADQAKGKAREENVATFRGSE 265

Human   270 YLCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTWQRNGLILHTGKSADYVNLALKDGAVSLVINLGSGAFEAIV 334
            :.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   266 FFCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTWQRNGLILHTGKSADYVNLALKDGAVSLVINLGSGAFEAIV 330

Human   335 EPVNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQHSGIGHAM-------VTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDF 392
            ||||||||||:||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||
Zfish   331 EPVNGKFNDNSWHDVKVTRNLRQHSGIGHAMVNKLHCLVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDF 395

Human   393 FYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVAT 457
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||.|:||||||||||
Zfish   396 FYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDIRLELSRLARIVDPKMKIQGDVVFKCENVAT 460

Human   458 LDPINFETPEAYISLPKWNTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAV 522
            ||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   461 LDPISFETPEAYISLPKWNTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAV 525

Human   523 ELLDGNLYLLLDMGSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILD 587
            |||||:||||||||||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||||||||:||||
Zfish   526 ELLDGSLYLLLDMGSGTIKVKATQNKVNDGAWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGENEILD 590

Human   588 LEGDMYLGGLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCS 652
            |||||||||||::|..||||||||||||||||||||||||||||||:|||:||.||.||:|.||:
Zfish   591 LEGDMYLGGLPDSRGSLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKDIRQIAEAQNGAGIKPSCN 655

Human   653 RMSAKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMHTE 717
            :||.||||||||||..:||:|||||||||||||||.|||||||||||||||||||::||.|||||
Zfish   656 KMSGKQCDSYPCKNKGLCKEGWNRFICDCTGTGYWSRTCEREASILSYDGSMYMKVVMPTVMHTE 720

Human   718 AEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPETLYAGQK 782
            |||||.|||||||||||:|||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||
Zfish   721 AEDVSLRFMSQRAYGLLMATTSRDSADTLRLELDGSRVKLTVNLDCIRINCNSSKGPETLYAGQK 785

Human   783 LNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRYISVVPSSFIGHL 847
            |||||||||||:|||||.|||||||||||.||||||||||||||||:|||:|::|::||||||||
Zfish   786 LNDNEWHTVRVIRRGKSYKLTVDDDVAEGQMVGDHTRLEFHNIETGVMTERRFVSMIPSSFIGHL 850

Human   848 QSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQFK 912
            |||.||||||||||||||||:|||.||||:|:|||||||||:|:|||||||||||||||||||||
Zfish   851 QSLKFNGLLYIDLCKNGDIDFCELNARFGMRSIIADPVTFKSKNSYLSLATLQAYTSMHLFFQFK 915

Human   913 TTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSN 977
            |||.|||||||||||:||||||||||||||||:||||||||||||:|.|:|||||||||||||||
Zfish   916 TTSADGFILFNSGDGSDFIAVELVKGYIHYVFNLGNGPNVIKGNSERALHDNQWHNVVITRDNSN 980

Human   978 THSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPD 1042
            .|:||||.|.|:||:||||||||||||::|||...||:|||||||||:||:||||||||||||||
Zfish   981 VHTLKVDAKAVSQVVNGAKNLDLKGDLFIAGLGPNMYNNLPKLVASREGFKGCLASVDLNGRLPD 1045

Human  1043 LINDALHRSGQIERGCE--------------GPSTTCQEDSCANQGVCMQQWEGFTCDCSMTSYS 1093
            ||||||.||||||||||              |||||||||||||.|:|:||||.:|||||||||:
Zfish  1046 LINDALFRSGQIERGCEASKNELGFTKADLKGPSTTCQEDSCANMGICIQQWENYTCDCSMTSYT 1110

Human  1094 GNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFSTTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQL 1158
            |..|||||.||||||.||||.:.||||:|||||:|||.|||||::|||||:||||||||||:|.|
Zfish  1111 GTHCNDPGTTYIFGKGGGLISFNWPANERPSTRTDRLTVGFSTSLKDGILIRIDSAPGLGDYLML 1175

Human  1159 HIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGNTDNE 1223
            |||||||||.|||||.||:::|..|.|||||||||||||||||||||||||.:|||:|:||:|||
Zfish  1176 HIEQGKIGVTFNIGTADITVQESSTAVNDGKYHVVRFTRNGGNATLQVDNWAINEHFPSGNSDNE 1240

Human  1224 RFQMVKQKIPFKYNRPVEEWLQEKGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNM 1288
            |.||..:||||||.|||||||||||||||||||||.|.|||.|:.|.||||||||||:|||||||
Zfish  1241 RIQMANKKIPFKYARPVEEWLQEKGRQLTIFNTQATITIGGSDRKRPFQGQLSGLYYNGLKVLNM 1305

Human  1289 AAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRSTASIQPTS 1353
            ||:.|||||||||||||||||: .|:.:||::|||||||.:||||||:||||||:|:..:|| |:
Zfish  1306 AAQGNPNIKINGSVRLVGEVPA-AGSARTTALPPEMSTTFIETTTTMSTTTTRKHRTPPTIQ-TT 1368

Human  1354 DDLVSSAECSSDDEDFVECEPSTGRSGGELVIPLLVEDPLATPPIATRAPSITLPPTFRPLLTII 1418
            ||:|||||||||||||.|||   |.:|||||.|::|:|||..|.:|||.|||..|||    ||||
Zfish  1369 DDMVSSAECSSDDEDFAECE---GHAGGELVFPVIVKDPLELPSVATRTPSIPFPPT----LTII 1426

Human  1419 ETTKDSLSMTSEAGLPCLSDQGSDGC-------DDDGLVISGYGSGETFDSNLPPTDDEDFYTTF 1476
            ||||:||||.:|||:|||||.|||.|       |||||:||||||||.:||||||||||||||||
Zfish  1427 ETTKESLSMATEAGVPCLSDGGSDDCGDDDDDDDDDGLMISGYGSGEAYDSNLPPTDDEDFYTTF 1491

Human  1477 SLVTDKSLSTSIFEGGYKAHAPKWESKDFRPNKVSETSRTTTTSLSPELIRFTASSSSGMVPKLP 1541
            ||||||:||:|.||||||||||||.|||||||||.::.||||.|.||:|.|.|.:|:.   ||||
Zfish  1492 SLVTDKTLSSSTFEGGYKAHAPKWGSKDFRPNKVFDSGRTTTASFSPKLSRSTTTSTP---PKLP 1553

Human  1542 AGKMNNRDLKPQPDIVLLPLPTAYELDSTKLKSPLITSPMFRNVPTANPTEPGIRRVPGASEVIR 1606
            |||||:|:||||||||||||||:||:|:|||||||||||||||||||.|||||||||||||||:|
Zfish  1554 AGKMNHRELKPQPDIVLLPLPTSYEVDNTKLKSPLITSPMFRNVPTAIPTEPGIRRVPGASEVVR 1618

Human  1607 ESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSS 1671
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||.:||:||||:
Zfish  1619 ESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYITNSAQSNGAVMKDKQQST 1683

Human  1672 KSGHKKQKNKDREYYV 1687
            |||:|||||||:||||
Zfish  1684 KSGNKKQKNKDKEYYV 1699

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
NRXN3XP_011535665.1 LamG 35..181 CDD:238058 97/145 (67%)
EGF 202..232 CDD:394967 18/29 (62%)
LamG 286..425 CDD:214598 137/145 (94%)
LamG 482..631 CDD:214598 139/148 (94%)
EGF_CA 659..692 CDD:238011 27/32 (84%)
LamG 720..854 CDD:214598 119/133 (89%)
Laminin_G_2 911..1039 CDD:460494 107/127 (84%)
LamG 1103..1282 CDD:238058 142/178 (80%)
Syndecan 1613..1669 CDD:460035 51/55 (93%)
4.1m 1633..1651 CDD:128590 17/17 (100%)
nrxn3aXP_073783476.1 None

Return to query results.
Submit another query.