DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment NRXN3 and Nrxn3

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011535665.1 Gene:NRXN3 / 9369 HGNCID:8010 Length:1687 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_036013122.1 Gene:Nrxn3 / 18191 MGIID:1096389 Length:1584 Species:Mus musculus


Alignment Length:1696 Identity:1546/1696 - (91%)
Similarity:1561/1696 - (92%) Gaps:121/1696 - (7%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSSTLHSVFFTLKVSILLGSLLGLCLGLEFMGLPNQWARYLRWDASTRSDLSFQFKTNVSTGLLL 65
            ||.|||||||||||||.||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse     1 MSFTLHSVFFTLKVSIFLGSLVGLCLGLEFMGLPNQWARYLRWDASTRSDLSFQFKTNVSTGLLL 65

Human    66 YLDDGGVCDFLCLSLVDGRVQLRFSMDCAETAVLSNKQVNDSSWHFLMVSRDRLRTVLMLDGEGQ 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||:||.|::|||||
Mouse    66 YLDDGGVCDFLCLSLVDGRVQLRFSMDCAETTVLSNKQVNDSSWHFLMVSRDRVRTGLVIDGEGQ 130

Human   131 SGELQPQRPYMDVVSDLFLGGVPTDIRPSALTLDGVQAMPGFKGLILDLKYGNSEPRLLGSRGVQ 195
            ||||:||||||||||||||||||.|||||||||||||:|||||||:|||||||||||||||:.||
Mouse   131 SGELRPQRPYMDVVSDLFLGGVPADIRPSALTLDGVQSMPGFKGLMLDLKYGNSEPRLLGSQSVQ 195

Human   196 MDAEGPCGERPCENGGICFLLDGHPTCDCSTTGYGGKLCSEDVSQDPGLSHLMMSEQGRSKAREE 260
            ::||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Mouse   196 LEAEGPCGERPCENGGICFLLDGHPTCDCSTTGYGGTLCSEDVSQGPGLSHLMMSEQGRSKAREE 260

Human   261 NVATFRGSEYLCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTWQRNGLILHTGKSADYVNLALKDGAVSLVINL 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   261 NVATFRGSEYLCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTWQRNGLILHTGKSADYVNLALKDGAVSLVINL 325

Human   326 GSGAFEAIVEPVNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQHSGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSD 390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||
Mouse   326 GSGAFEAIVEPVNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQ--------VTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSD 382

Human   391 DFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENV 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Mouse   383 DFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDIRLELSRLARIGDTKMKIYGEVVFKCENV 447

Human   456 ATLDPINFETPEAYISLPKWNTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFF 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Mouse   448 ATLDPINFETPEAYISLPKWNTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDVRSQKNTKVDFF 512

Human   521 AVELLDGNLYLLLDMGSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEI 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   513 AVELLDGNLYLLLDMGSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEI 577

Human   586 LDLEGDMYLGGLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSS 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   578 LDLEGDMYLGGLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSS 642

Human   651 CSRMSAKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||
Mouse   643 CSRMSAKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKVIMPMVMH 707

Human   716 TEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPETLYAG 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   708 TEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPETLYAG 772

Human   781 QKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRYISVVPSSFIG 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   773 QKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVAEGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKRYISVVPSSFIG 837

Human   846 HLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQ 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||
Mouse   838 HLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYLTLATLQAYTSMHLFFQ 902

Human   911 FKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDN 975
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:
Mouse   903 FKTTSADGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDS 967

Human   976 SNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRL 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   968 SNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMYSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRL 1032

Human  1041 PDLINDALHRSGQIERGCE---------GPSTTCQEDSCANQGVCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQ 1096
            |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1033 PDLINDALHRSGQIERGCEVALTKADLQGPSTTCQEDSCANQGVCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQ 1097

Human  1097 CNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFSTTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIE 1161
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1098 CNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGFSTTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIE 1162

Human  1162 QGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGNTDNERFQ 1226
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Mouse  1163 QGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVRFTRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGNTDNERLQ 1227

Human  1227 MVKQKIPFKYNRPVEEWLQEKGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAE 1291
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1228 MVKQKIPFKYNRPVEEWLQEKGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAE 1292

Human  1292 NNPNIKINGSVRLVGEVPSILGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRSTASIQPTSDDL 1356
            |||||||||||||||||||:.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1293 NNPNIKINGSVRLVGEVPSVSGTTQTTSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNRSTASIQPTSDDL 1357

Human  1357 VSSAECSSDDEDFVECEPSTGRSGGELVIPLLVEDPLATPPIATRAPSITLPPTFRPLLTIIETT 1421
            |||||||||||||||||||                                              
Mouse  1358 VSSAECSSDDEDFVECEPS---------------------------------------------- 1376

Human  1422 KDSLSMTSEAGLPCLSDQGSDGCDDDGLVISGYGSGETFDSNLPPTDDEDFYTTFSLVTDKSLST 1486
                                                                      |||||||
Mouse  1377 ----------------------------------------------------------TDKSLST 1383

Human  1487 SIFEGGYKAHAPKWESKDFRPNKVSETSRTTTTSLSPELIRFTASSSSGMVPKLPAGKMNNRDLK 1551
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1384 SIFEGGYKAHAPKWESKDFRPNKVSETSRTTTTSLSPELIRFTASSSSGMVPKLPAGKMNNRDLK 1448

Human  1552 PQPDIVLLPLPTAYELDSTKLKSPLITSPMFRNVPTANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVV 1616
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1449 PQPDIVLLPLPTAYELDSTKLKSPLITSPMFRNVPTANPTEPGIRRVPGASEVIRESSSTTGMVV 1513

Human  1617 GIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSSKSGHKKQKNK 1681
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Mouse  1514 GIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQASSKSGHKKQKNK 1578

Human  1682 DREYYV 1687
            |:||||
Mouse  1579 DKEYYV 1584

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
NRXN3XP_011535665.1 LamG 35..181 CDD:238058 136/145 (94%)
EGF 202..232 CDD:394967 29/29 (100%)
LamG 286..425 CDD:214598 130/138 (94%)
LamG 482..631 CDD:214598 147/148 (99%)
EGF_CA 659..692 CDD:238011 32/32 (100%)
LamG 720..854 CDD:214598 133/133 (100%)
Laminin_G_2 911..1039 CDD:460494 125/127 (98%)
LamG 1103..1282 CDD:238058 177/178 (99%)
Syndecan 1613..1669 CDD:460035 55/55 (100%)
4.1m 1633..1651 CDD:128590 17/17 (100%)
Nrxn3XP_036013122.1 LamG 27..181 CDD:238058 144/153 (94%)
EGF 202..231 CDD:394967 28/28 (100%)
LamG 286..417 CDD:214598 130/138 (94%)
LamG 474..623 CDD:214598 147/148 (99%)
EGF_CA 651..684 CDD:238011 32/32 (100%)
LamG 712..846 CDD:214598 133/133 (100%)
Laminin_G_2 903..1031 CDD:460494 125/127 (98%)
LamG 1104..1283 CDD:238058 177/178 (99%)
Syndecan 1510..1562 CDD:460035 51/51 (100%)
4.1m 1530..1548 CDD:128590 17/17 (100%)

Return to query results.
Submit another query.