DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment LONP1 and Lonp1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_004784.2 Gene:LONP1 / 9361 HGNCID:9479 Length:959 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_596895.1 Gene:Lonp1 / 170916 RGDID:621598 Length:950 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:962 Identity:849/962 - (88%)
Similarity:889/962 - (92%) Gaps:15/962 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAASTGYVRLWGAARCWVLRRPMLAAAGGRVPTAAGAWLLRGQRTCDASPPWALWGRGPAIGGQW 65
            |||||||||||.||||||||||:||..|||||:|:|:||.||.|.||.|.||.  ||.|..||||
  Rat     1 MAASTGYVRLWAAARCWVLRRPLLAVTGGRVPSASGSWLRRGCRVCDTSTPWG--GRVPMGGGQW 63

Human    66 RGFWEASSRGGGAFSGGEDASEGGAEEGAGGAGGSAGAGEGPVITALTPMTIPDVFPHLPLIAIT 130
            ||.|:|.|||     |.::.||||.|:||     :|.:|||||:|||.|||:||||||||||||:
  Rat    64 RGLWDAGSRG-----GSDETSEGGVEDGA-----TASSGEGPVVTALAPMTVPDVFPHLPLIAIS 118

Human   131 RNPVFPRFIKIIEVKNKKLVELLRRKVRLAQPYVGVFLKRDDSNESDVVESLDEIYHTGTFAQIH 195
            |||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||
  Rat   119 RNPVFPRFIKIVEVKNKKLVELLRRKVRLAQPYVGVFLKRDDNNESDVVESLDEIYHTGTFAQIH 183

Human   196 EMQDLGDKLRMIVMGHRRVHISRQLEVEPE--EPEAENKHKPRRKSKRGKKEAEDELSARHPAEL 258
            |||||||||||||.||||:|||||||||||  |||||||.|.|||.||||||..|||.|:...|:
  Rat   184 EMQDLGDKLRMIVTGHRRIHISRQLEVEPEGLEPEAENKQKSRRKLKRGKKEVGDELGAKPQLEM 248

Human   259 AMEPTPELPAEVLMVEVENVVHEDFQVTEEVKALTAEIVKTIRDIIALNPLYRESVLQMMQAGQR 323
            ..|.|.:...||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   249 VTEATSDTSKEVLMVEVENVAHEDFQVTEEVKALTAEIVKTIRDIIALNPLYRESVLQMMQAGQR 313

Human   324 VVDNPIYLSDMGAALTGAESHELQDVLEETNIPKRLYKALSLLKKEFELSKLQQRLGREVEEKIK 388
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   314 VVDNPIYLSDMGAALTGAESHELQDVLEETNILKRLYKALSLLKKEFELSKLQQRLGREVEEKIK 378

Human   389 QTHRKYLLQEQLKIIKKELGLEKDDKDAIEEKFRERLKELVVPKHVMDVVDEELSKLGLLDNHSS 453
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
  Rat   379 QTHRKYLLQEQLKIIKKELGLEKDDKDAIEEKFRERLKELVVPKHVMDVVDEELSKLALLDNHSS 443

Human   454 EFNVTRNYLDWLTSIPWGKYSNENLDLARAQAVLEEDHYGMEDVKKRILEFIAVSQLRGSTQGKI 518
            ||||||||||||||||||:.|:|||||||||:|||||||||||||||:|||||||||||||||||
  Rat   444 EFNVTRNYLDWLTSIPWGRQSDENLDLARAQSVLEEDHYGMEDVKKRVLEFIAVSQLRGSTQGKI 508

Human   519 LCFYGPPGVGKTSIARSIARALNREYFRFSVGGMTDVAEIKGHRRTYVGAMPGKIIQCLKKTKTE 583
            |||:||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   509 LCFHGPPGVGKTSIARSIARALGREYFRFSVGGMTDVAEIKGHRRTYVGAMPGKIIQCLKKTKTE 573

Human   584 NPLILIDEVDKIGRGYQGDPSSALLELLDPEQNANFLDHYLDVPVDLSKVLFICTANVTDTIPEP 648
            |||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   574 NPLVLIDEVDKIGRGYQGDPSSALLELLDPEQNANFLDHYLDVPVDLSKVLFICTANVTDTIPEP 638

Human   649 LRDRMEMINVSGYVAQEKLAIAERYLVPQARALCGLDESKAKLSSDVLTLLIKQYCRESGVRNLQ 713
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||:||:.|||||||||||||||||||
  Rat   639 LRDRMEMINVSGYVAQEKLAIAERYLVPQARTLCGLDESKAQLSATVLTLLIKQYCRESGVRNLQ 703

Human   714 KQVEKVLRKSAYKIVSGEAESVEVTPENLQDFVGKPVFTVERMYDVTPPGVVMGLAWTAMGGSTL 778
            |||||||||:|||||||||::|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   704 KQVEKVLRKAAYKIVSGEAQTVHVTPENLQDFVGKPVFTVERMYDVTPPGVVMGLAWTAMGGSTL 768

Human   779 FVETSLRRPQDKDAKGDKDGSLEVTGQLGEVMKESARIAYTFARAFLMQHAPANDYLVTSHIHLH 843
            ||||||||||...:|.|||||||||||||:||||||||||||||||||:..|.||:|||||||||
  Rat   769 FVETSLRRPQPSGSKEDKDGSLEVTGQLGDVMKESARIAYTFARAFLMEQDPENDFLVTSHIHLH 833

Human   844 VPEGATPKDGPSAGCTIVTALLSLAMGRPVRQNLAMTGEVSLTGKILPVGGIKEKTIAAKRAGVT 908
            |||||||||||||||||||||||||:|:||.||||||||||||||:|||||||||||||||||||
  Rat   834 VPEGATPKDGPSAGCTIVTALLSLALGQPVLQNLAMTGEVSLTGKVLPVGGIKEKTIAAKRAGVT 898

Human   909 CIVLPAENKKDFYDLAAFITEGLEVHFVEHYREIFDIAFP-DEQAEALAVER 959
            ||:|||||:|||.|||.|||||||||||||||:||.|||| .|..|||||||
  Rat   899 CIILPAENRKDFSDLAPFITEGLEVHFVEHYRDIFRIAFPLREHQEALAVER 950

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
LONP1NP_004784.2 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 77..102 8/24 (33%)
lon 125..947 CDD:273258 757/823 (92%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 218..257 29/40 (73%)
Lonp1NP_596895.1 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 212..243 22/30 (73%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 67..94 15/36 (42%)
lon 113..937 CDD:273258 757/823 (92%)

Return to query results.
Submit another query.