Protein Alignment SMC3 and smc3

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_005436.1
• Gene: SMC3 / 9126
• HGNCID: 2468
• Length: 1217
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_999854.1
• Gene: smc3 / 324475
• ZFINID: ZDB-GENE-030131-3196
• Length: 1216
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1217
• Identity: 1158/1217 - (95%)
• Similarity: 1187/1217 - (97%)
• Gaps: 1/1217 - (0%)

Human     1 MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVIVGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQRLALL 65
            ||||||||||||||||||:||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish     1 MYIKQVIIQGFRSYRDQTVVDPFGSKHNVIVGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQRLALL 65

Human    66 HEGTGPRVISAFVEIIFDNSDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQYFLDKKMVTKNDVMNLLESAGF 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish    66 HEGTGPRVISAFVEIIFDNSDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQYFLDKKMVTKNDVMNLLESAGF 130

Human   131 SRSNPYYIVKQGKINQMATAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKEESISLMKETEGKREKINELLKY 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   131 SRSNPYYIVKQGKINQMATAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKEESISLMKETEGKREKINELLKY 195

Human   196 IEERLHTLEEEKEELAQYQKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLDELSAKRETSGEKSRQLRDAQ 260
            |||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||.|:|||||||||
Zfish   196 IEERLHTLEDEKEELAQYQKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLDELSSKRETCGDKSRQLRDAQ 260

Human   261 QDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKR 325
            ||||||:|:.||.|||||::|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   261 QDARDKVEETERVVRELKSRISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKR 325

Human   326 LLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEERGIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEE 390
            |||||||||||||||||||.|||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   326 LLKERQKLLEKIEEKQKELQETEPKFNTVKEKEERGIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEE 390

Human   391 RDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDLEDTEANKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKY 455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||:||||||||||||||||.||||||:||
Zfish   391 RDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDLEDTEQNKERNLEQYNKLDQDLNEVKTRVEELDKKY 455

Human   456 YEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQQALAAKREDLEKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFR 520
            |||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||
Zfish   456 YEVKNRKDELQSERNYLWREENAEQQALAAKREDLEKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLEHFR 520

Human   521 RKGINQHVQNGYHGIVMNNFECEPAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEV 585
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||::||||||||||||||||||||
Zfish   521 RKGINQHVINGYHGIVMNNFECEPAFYTCVEVTAGTRLFYHIVETDEVSTKILMEFNKMNLPGEV 585

Human   586 TFLPLNKLDVRDTAYPETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLARAFTMDC 650
            |||||:||||||||||||||||||||||||:..||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   586 TFLPLSKLDVRDTAYPETNDAIPMISKLRYSQNFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLARAFTMDC 650

Human   651 ITLEGDQVSHRGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENLRRNIERINNEIDQLM 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||.|||||||||
Zfish   651 ITLEGDQVSHRGALTGGYYDTRKSRLELQKDMRKAEEELGELEAKLNENLRRNIETINNEIDQLM 715

Human   716 NQMQQIETQQRKFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFMPKQRSLQSLEASLHAMESTRESLKAE 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   716 NQMQQIETQQRKFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFMPKQRSLQSLEASLHAMESTRESLKAE 780

Human   781 LGTDLLSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERIKLEGIITRVETYLNENLRKRLDQVEQ 845
            ||.|||||||||||:|||.||||||||||:||||||||||||||:||||||||||||||||||||
Zfish   781 LGADLLSQLSLEDQRRVDDLNDEIRQLQQDNRQLLNERIKLEGIMTRVETYLNENLRKRLDQVEQ 845

Human   846 ELNELRETEGGTVLTATTSELEAINKRVKDTMARSEDLDNSIDKTEAGIKELQKSMERWKNMEKE 910
            |||||||||||||||||||||:.||||:|||||||||||..|||||..|||.|||||||||:|||
Zfish   846 ELNELRETEGGTVLTATTSELDGINKRIKDTMARSEDLDTLIDKTEVEIKEHQKSMERWKNIEKE 910

Human   911 HMDAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMKKIRELGSLPQEAFEKYQTLSLKQLFRKLEQCNTE 975
            ..:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||
Zfish   911 QNEAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMKKIRELGSLPQEAFEKYQTLTLKQLFRKLEQCNTE 975

Human   976 LKKYSHVNKKALDQFVNFSEQKEKLIKRQEELDRGYKSIMELMNVLELRKYEAIQLTFKQVSKNF 1040
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Zfish   976 LKKYSHVNKKALDQFVNFSEQKEKLIKRQDELDRGYKSIMELMNVLELRKYEAIQLTFKQVSKNF 1040

Human  1041 SEVFQKLVPGGKATLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGESERGSGSQSSVPSVDQFTGVGIRVSFTGK 1105
            |||||||||||||||||||||.||.|||||||| |:|||.|.|||||||||||||||||||||||
Zfish  1041 SEVFQKLVPGGKATLVMKKGDTEGGQSQDEGEG-GDSERASSSQSSVPSVDQFTGVGIRVSFTGK 1104

Human  1106 QGEMREMQQLSGGQKSLVALALIFAIQKCDPAPFYLFDEIDQALDAQHRKAVSDMIMELAVHAQF 1170
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Zfish  1105 QGEMREMQQLSGGQKSLVALALIFAIQKCDPAPFYLFDEIDQALDAQHRKAASDMIMELAGHAQF 1169

Human  1171 ITTTFRPELLESADKFYGVKFRNKVSHIDVITAEMAKDFVEDDTTHG 1217
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Zfish  1170 ITTTFRPELLESADKFYGVKFRNKVSHIDVISAEQAKDFVEDDTTHG 1216

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
SMC3	NP_005436.1	SMC_N	2..1197	CDD:426784	1137/1194 (95%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	242..268		22/25 (88%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1059..1090		24/30 (80%)
smc3	NP_999854.1	SMC_N	2..1196	CDD:481474	1137/1194 (95%)