Protein Alignment SMC3 and Smc3

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_005436.1
• Gene: SMC3 / 9126
• HGNCID: 2468
• Length: 1217
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_113771.2
• Gene: Smc3 / 29486
• RGDID: 62006
• Length: 1217
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1217
• Identity: 1217/1217 - (100%)
• Similarity: 1217/1217 - (100%)
• Gaps: 0/1217 - (0%)

Human     1 MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVIVGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQRLALL 65
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  Rat     1 MYIKQVIIQGFRSYRDQTIVDPFSSKHNVIVGRNGSGKSNFFYAIQFVLSDEFSHLRPEQRLALL 65

Human    66 HEGTGPRVISAFVEIIFDNSDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQYFLDKKMVTKNDVMNLLESAGF 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 HEGTGPRVISAFVEIIFDNSDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQYFLDKKMVTKNDVMNLLESAGF 130

Human   131 SRSNPYYIVKQGKINQMATAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKEESISLMKETEGKREKINELLKY 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 SRSNPYYIVKQGKINQMATAPDSQRLKLLREVAGTRVYDERKEESISLMKETEGKREKINELLKY 195

Human   196 IEERLHTLEEEKEELAQYQKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLDELSAKRETSGEKSRQLRDAQ 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 IEERLHTLEEEKEELAQYQKWDKMRRALEYTIYNQELNETRAKLDELSAKRETSGEKSRQLRDAQ 260

Human   261 QDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKR 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 QDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLELKAKDLQDELAGNSEQRKR 325

Human   326 LLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEERGIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEE 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 LLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEERGIARLAQATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEE 390

Human   391 RDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDLEDTEANKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKY 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 RDKWIKKELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDLEDTEANKEKNLEQYNKLDQDLNEVKARVEELDRKY 455

Human   456 YEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQQALAAKREDLEKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFR 520
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  Rat   456 YEVKNKKDELQSERNYLWREENAEQQALAAKREDLEKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFR 520

Human   521 RKGINQHVQNGYHGIVMNNFECEPAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEV 585
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  Rat   521 RKGINQHVQNGYHGIVMNNFECEPAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEV 585

Human   586 TFLPLNKLDVRDTAYPETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLARAFTMDC 650
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  Rat   586 TFLPLNKLDVRDTAYPETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLARAFTMDC 650

Human   651 ITLEGDQVSHRGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENLRRNIERINNEIDQLM 715
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  Rat   651 ITLEGDQVSHRGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENLRRNIERINNEIDQLM 715

Human   716 NQMQQIETQQRKFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFMPKQRSLQSLEASLHAMESTRESLKAE 780
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  Rat   716 NQMQQIETQQRKFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFMPKQRSLQSLEASLHAMESTRESLKAE 780

Human   781 LGTDLLSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERIKLEGIITRVETYLNENLRKRLDQVEQ 845
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  Rat   781 LGTDLLSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERIKLEGIITRVETYLNENLRKRLDQVEQ 845

Human   846 ELNELRETEGGTVLTATTSELEAINKRVKDTMARSEDLDNSIDKTEAGIKELQKSMERWKNMEKE 910
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  Rat   846 ELNELRETEGGTVLTATTSELEAINKRVKDTMARSEDLDNSIDKTEAGIKELQKSMERWKNMEKE 910

Human   911 HMDAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMKKIRELGSLPQEAFEKYQTLSLKQLFRKLEQCNTE 975
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  Rat   911 HMDAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKKEECMKKIRELGSLPQEAFEKYQTLSLKQLFRKLEQCNTE 975

Human   976 LKKYSHVNKKALDQFVNFSEQKEKLIKRQEELDRGYKSIMELMNVLELRKYEAIQLTFKQVSKNF 1040
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  Rat   976 LKKYSHVNKKALDQFVNFSEQKEKLIKRQEELDRGYKSIMELMNVLELRKYEAIQLTFKQVSKNF 1040

Human  1041 SEVFQKLVPGGKATLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGESERGSGSQSSVPSVDQFTGVGIRVSFTGK 1105
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  Rat  1041 SEVFQKLVPGGKATLVMKKGDVEGSQSQDEGEGSGESERGSGSQSSVPSVDQFTGVGIRVSFTGK 1105

Human  1106 QGEMREMQQLSGGQKSLVALALIFAIQKCDPAPFYLFDEIDQALDAQHRKAVSDMIMELAVHAQF 1170
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  Rat  1106 QGEMREMQQLSGGQKSLVALALIFAIQKCDPAPFYLFDEIDQALDAQHRKAVSDMIMELAVHAQF 1170

Human  1171 ITTTFRPELLESADKFYGVKFRNKVSHIDVITAEMAKDFVEDDTTHG 1217
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  Rat  1171 ITTTFRPELLESADKFYGVKFRNKVSHIDVITAEMAKDFVEDDTTHG 1217

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
SMC3	NP_005436.1	SMC_N	2..1197	CDD:426784	1194/1194 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	242..268		25/25 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1059..1090		30/30 (100%)
Smc3	NP_113771.2	SMC_N	2..1197	CDD:426784	1194/1194 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	242..268		25/25 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1059..1090		30/30 (100%)