DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment LATS1 and Lats1

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_016866963.1 Gene:LATS1 / 9113 HGNCID:6514 Length:1163 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001128015.2 Gene:Lats1 / 308265 RGDID:1564085 Length:1130 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1163 Identity:1057/1163 - (90%)
Similarity:1096/1163 - (94%) Gaps:33/1163 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MKRSEKPEGYRQMRPKTFPASNYTVSSRQMLQEIRESLRNLSKPSDAAKAEHNMSKMSTEDPRQV 65
            |||.|||||||||||||||||||:.||||||||||||||||||||||||||||::||||||||||
  Rat     1 MKRGEKPEGYRQMRPKTFPASNYSGSSRQMLQEIRESLRNLSKPSDAAKAEHNLNKMSTEDPRQV 65

Human    66 RNPPKFGTHHKALQEIRNSLLPFANETNSSRSTSEVNPQMLQDLQAAGFDEDMVIQALQKTNNRS 130
            |||||||||||||||||||||||||||:|||..|||||||.||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 RNPPKFGTHHKALQEIRNSLLPFANETSSSRIPSEVNPQMFQDLQAAGFDEDMVIQALQKTNNRS 130

Human   131 IEAAIEFISKMSYQDPRREQMAAAAARPINASMKPGNVQQSVNRKQSWKGSKESLVPQRHGPPLG 195
            ||||:||||||||||||||||||||||||||:|||||||.|::|||||||||||||||||||.||
  Rat   131 IEAAVEFISKMSYQDPRREQMAAAAARPINATMKPGNVQHSISRKQSWKGSKESLVPQRHGPSLG 195

Human   196 ESVAYHSESPNSQTDVGRPLSGSGISAFVQAHPSNGQRVNPPPPPQVRSVTPPPPPRGQTPPPRG 260
            |:|.|.|||||||.|||||||||||:||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 ENVVYRSESPNSQADVGRPLSGSGITAFAQAHPSNGQRVNPPPPPQVRSVTPPPPPRGQTPPPRG 260

Human   261 TTPPPPSWEPNSQTKRYSGNMEYVISRISPVPPGAWQEGYPPPPLNTSPMNPPNQGQRGISSVPV 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 TTPPPPSWEPNSQTKRYSGNMEYVISRISPVPPGAWQEGYPPPPLNTSPMNPPNQGQRGISSVPV 325

Human   326 GRQPIIMQSSSKFNFPSGRPGMQNGTGQTDFMIHQNVVPAGTVNRQPPPPYPLTAANGQSPSALQ 390
            |||||||||:|||||..||||:|||.|||||::||||||.|.||||||||||||.||||||||||
  Rat   326 GRQPIIMQSTSKFNFTPGRPGVQNGGGQTDFIMHQNVVPTGAVNRQPPPPYPLTPANGQSPSALQ 390

Human   391 TGGSAAPSSYTNGSIPQSMMVPNRNSHNMELYNISVPGLQTNWPQSSSAPAQSSPSSGHEIPTWQ 455
            .||.|||.|::||::|.:||||||||||||||||:||||||.||||||||.||||||||||||||
  Rat   391 AGGPAAPPSFSNGNVPPTMMVPNRNSHNMELYNINVPGLQTTWPQSSSAPVQSSPSSGHEIPTWQ 455

Human   456 PNIPVRSNSFNNPLGNRASHSANSQPSATTVTAITPAPIQQPVKSMRVLKPELQTALAPTHPSWI 520
            |||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:
  Rat   456 PNIPVRSNSFNNPLGSRASHSANSQPSATTVTAITPAPIQQPVKSMRVLKPELQTALAPTHPSWM 520

Human   521 PQPIQTVQPSPFPEGTASNVTVMPPVAEAPNYQGPPPPYPKHLLHQNPSVPPYESISKPSKEDQP 585
            |||:||||||||.||.||||.|:|||||||:|||||||||||||||.||||||||.|||.|:|||
  Rat   521 PQPVQTVQPSPFSEGAASNVPVIPPVAEAPSYQGPPPPYPKHLLHQTPSVPPYESASKPCKDDQP 585

Human   586 SLPKEDESEKSYENVDSGDKEKKQITTSPITVRKNKKDEERRESRIQSYSPQAFKFFMEQHVENV 650
            |..||::||||.::|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 SSAKEEDSEKSLDSVDSGDKEKKQITTSPITVRKNKKDEERRESRIQSYSPQAFKFFMEQHVENV 650

Human   651 LKSHQQRLHRKKQLENEMMRVGLSQDAQDQMRKMLCQKESNYIRLKRAKMDKSMFVKIKTLGIGA 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 LKSHQQRLHRKKQLENEMMRVGLSQDAQDQMRKMLCQKESNYIRLKRAKMDKSMFVKIKTLGIGA 715

Human   716 FGEVCLARKVDTKALYATKTLRKKDVLLRNQVAHVKAERDILAEADNEWVVRLYYSFQDKDNLYF 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   716 FGEVCLARKVDTKALYATKTLRKKDVLLRNQVAHVKAERDILAEADNEWVVRLYYSFQDKDNLYF 780

Human   781 VMDYIPGGDMMSLLIRMGIFPESLARFYIAELTCAVESVHKMGFIHRDIKPDNILIDRDGHIKLT 845
            ||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   781 VMDYIPGGDMMSLLIRMGIFPENLARFYIAELTCAVESVHKMGFIHRDIKPDNILIDRDGHIKLT 845

Human   846 DFGLCTGFRWTHDSKYYQSGDHPRQDSMDFSNEWGDPSSCRCGDRLKPLERRAARQHQRCLAHSL 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||:||||||:||||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 DFGLCTGFRWTHDSKYYQSGDHPRQDSMDFSSEWGDPSNCRCGDRLKPLERRAARQHQRCLAHSL 910

Human   911 VGTPNYIAPEVLLRTGYTQLCDWWSVGVILFEMLVGQPPFLAQTPLETQMKPGMVAHTCNPSALE 975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
  Rat   911 VGTPNYIAPEVLLRTGYTQLCDWWSVGVILFEMLVGQPPFLAQTPLETQMK-------------- 961

Human   976 GHSRKNTGTQEFEIGLGNIVINWQTSLHIPPQAKLSPEASDLIIKLCRGPEDRLGKNGADEIKAH 1040
                               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   962 -------------------VINWQTSLHIPPQAKLSPEASDLIIKLCRGPEDRLGKNGADEIKAH 1007

Human  1041 PFFKTIDFSSDLRQQSASYIPKITHPTDTSNFDPVDPDKLWSDDNEEENVNDTLNGWYKNGKHPE 1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||:|||||||||||||||
  Rat  1008 PFFKTIDFSSDLRQQSASYIPKITHPTDTSNFDPVDPDKLWSDGNEEENINDTLNGWYKNGKHPE 1072

Human  1106 HAFYEFTFRRFFDDNGYPYNYPKPIEYEYINSQGSEQQSDEDDQNTGSEIKNRDLVYV 1163
            |||||||||||||||||||||||||||||::|||||||||||||:|||::.|||||||
  Rat  1073 HAFYEFTFRRFFDDNGYPYNYPKPIEYEYVSSQGSEQQSDEDDQHTGSDVNNRDLVYV 1130

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
LATS1XP_016866963.1 UBA_LATS1 103..143 CDD:270580 37/39 (95%)
PRK10263 <448..>596 CDD:236669 131/147 (89%)
MobB_LATS1 629..704 CDD:439273 74/74 (100%)
Protein Kinases, catalytic domain 703..1117 CDD:473864 375/413 (91%)
Lats1NP_001128015.2 UBA_like_SF 103..143 CDD:473871 37/39 (95%)
PHA03247 <183..590 CDD:223021 363/406 (89%)
MobB_LATS1 629..704 CDD:439273 74/74 (100%)
STKc_LATS1 703..1084 CDD:270775 375/413 (91%)

Return to query results.
Submit another query.