DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment LATS1 and lats1

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_016866963.1 Gene:LATS1 / 9113 HGNCID:6514 Length:1163 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_017949762.1 Gene:lats1 / 100145677 XenbaseID:XB-GENE-959763 Length:1117 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1177 Identity:847/1177 - (71%)
Similarity:954/1177 - (81%) Gaps:74/1177 - (6%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MKRSEKPEGYRQMRPKTFPASNYTVSSRQMLQEIRESLRNLSKPSDAAKAEHNMSKMSTEDPRQV 65
            |||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||:|.||||.||.|...:|  .||.||.
 Frog     1 MKRGEKPEGYRQMRPKTFPASNYTGSSRQMLLEIRESLRHLPKPSDVAKNEQLSAK--AEDSRQG 63

Human    66 RNPPKFGTHHKALQEIRNSLLPFANETNSS-RSTSEVNPQMLQDLQAAGFDEDMVIQALQKTNNR 129
            |:..||||:||||.|||||||||||.:.|| |..||:|.||..|||.|||||||||:|||:||:|
 Frog    64 RSTTKFGTYHKALAEIRNSLLPFANVSGSSPRGNSEINRQMFHDLQQAGFDEDMVIRALQQTNSR 128

Human   130 SIEAAIEFISKMSYQDPRREQMAAAAARPINASMK-PGNVQQSVNRKQSWKGSKESLVPQRHGPP 193
            |||||||:||:|:|  |...|....|||.:|||:| |||:|..|||:||||||||||:|||...|
 Frog   129 SIEAAIEYISRMNY--PEMYQEPHIAARTLNASIKPPGNMQNPVNRRQSWKGSKESLIPQRLVSP 191

Human   194 LGESVAYHSESPNSQTDVGRPLSGSGISAFVQAHPSNGQRVNPPPPPQVRSVT-PPPPPRGQTPP 257
            |.::|.|.||:.:|||::||||||||:|||.||.|.||||||||||||:|||| |||||||||||
 Frog   192 LSDNVVYASENSSSQTEMGRPLSGSGLSAFAQALPVNGQRVNPPPPPQMRSVTPPPPPPRGQTPP 256

Human   258 PRGTTPPPPSWEPNSQTKRYSGNMEYVISRISPVPPGAWQEGYPPPPLNTSPMNPPNQGQRGISS 322
            |:||||||.||||  |.||||||||::|.|::.:|.|:.|||:|     .|.:|..:||||.|:|
 Frog   257 PKGTTPPPTSWEP--QPKRYSGNMEFLIPRMNSIPSGSRQEGFP-----VSSVNTQSQGQRAINS 314

Human   323 VPVGRQPIIMQSS--SKFNFPSGRPGMQNGTGQTDFMIHQNVVPAGTV-NRQPPPPYPLTAANGQ 384
            |||||||||||:|  |||.: |||.|||||.|.::|:.:|.   .|.: .|||||||.:  .||.
 Frog   315 VPVGRQPIIMQTSNNSKFAY-SGRSGMQNGNGSSEFITNQG---GGNIGGRQPPPPYSI--PNGP 373

Human   385 SPSALQ----TGGSAAPSSYTNGSIPQSMMVPNRNSHNMELYNISVPGLQTNWPQSSSAPAQSSP 445
            :.:.||    :||..:.::|.|.::|.||:|.||||||:|:||||:||..|:|||:||  .||:|
 Frog   374 NTTTLQVQSGSGGPLSSNAYNNSNVPPSMLVSNRNSHNLEMYNISLPGHPTSWPQASS--TQSAP 436

Human   446 SSGHEIPTWQPNIPVRSNSFNNPLGNRASHSANSQPSATTVTAITPAPIQQPVKSMRVLKPELQT 510
            .|.|::.:||.||||||||||||:.:..:.|.|:|.|||||||:||:||||||||:|||||||||
 Frog   437 GSNHDMLSWQTNIPVRSNSFNNPVASWQALSTNTQTSATTVTAVTPSPIQQPVKSIRVLKPELQT 501

Human   511 ALAPTHPSWIPQPIQTVQPSPFPEGTASNVTVMPPVAEAPNYQGPPPPYPKHLLHQNPSVPPYES 575
            |||||||:|:   ...|||.||.||.:.|.:..  :||||||||||||||||||.||.:|  ||.
 Frog   502 ALAPTHPTWM---TPNVQPGPFQEGVSHNTSAQ--LAEAPNYQGPPPPYPKHLLQQNTTV--YEP 559

Human   576 ISKPSKEDQP--SLPKEDESEKSYENVDSGDKEKKQITTSPITVRKNKKDEERRESRIQSYSPQA 638
            ..|.||||..  |...::|.||:.|.. :|..|||||||||:.||:||:|||||||:||||||||
 Frog   560 GLKSSKEDAAGVSTCTQEEMEKNTEPT-TGITEKKQITTSPVPVRRNKRDEERRESQIQSYSPQA 623

Human   639 FKFFMEQHVENVLKSHQQRLHRKKQLENEMMRVGLSQDAQDQMRKMLCQKESNYIRLKRAKMDKS 703
            |||||||||||:||||.||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||:||
 Frog   624 FKFFMEQHVENILKSHHQRLHRKKQLENEMMRVGLSQEAQDQMRKMLCQKESNYIRLKRAKMEKS 688

Human   704 MFVKIKTLGIGAFGEVCLARKVDTKALYATKTLRKKDVLLRNQVAHVKAERDILAEADNEWVVRL 768
            |||||||||||||||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   689 MFVKIKTLGIGAFGEVCLARKTDTNALYAMKTLRKKDVLLRNQVAHVKAERDILAEADNEWVVRL 753

Human   769 YYSFQDKDNLYFVMDYIPGGDMMSLLIRMGIFPESLARFYIAELTCAVESVHKMGFIHRDIKPDN 833
            ||||||||||||||||||||||||||||||:|||.|||||||||||||||||||.||||||||||
 Frog   754 YYSFQDKDNLYFVMDYIPGGDMMSLLIRMGVFPEDLARFYIAELTCAVESVHKMDFIHRDIKPDN 818

Human   834 ILIDRDGHIKLTDFGLCTGFRWTHDSKYYQSGDHPRQDSMDFSNEWGDPSSCRCGDRLKPLERRA 898
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||::|||||||||||.||
 Frog   819 ILIDRDGHIKLTDFGLCTGFRWTHDSKYYQSGDHLRQDSMDFSNEWGDPANCRCGDRLKPLEWRA 883

Human   899 ARQHQRCLAHSLVGTPNYIAPEVLLRTGYTQLCDWWSVGVILFEMLVGQPPFLAQTPLETQMKPG 963
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||:|:|||||  
 Frog   884 ARQHQRCLAHSLVGTPNYIAPEVLLRTGYTQLCDWWSVGVILYEMLVGQPPFLAQSPVETQMK-- 946

Human   964 MVAHTCNPSALEGHSRKNTGTQEFEIGLGNIVINWQTSLHIPPQAKLSPEASDLIIKLCRGPEDR 1028
                                           ||.|||:||||.||||||||||||:|||||||||
 Frog   947 -------------------------------VIKWQTTLHIPAQAKLSPEASDLIVKLCRGPEDR 980

Human  1029 LGKNGADEIKAHPFFKTIDFSSDLRQQSASYIPKITHPTDTSNFDPVDPDKLWSDDNEEENVNDT 1093
            |||||.||||.|||||.||||||||||.|.|.|.|||||||||||||||:|||:|::::.|.|||
 Frog   981 LGKNGVDEIKVHPFFKNIDFSSDLRQQPAPYTPTITHPTDTSNFDPVDPEKLWNDEDKDGNKNDT 1045

Human  1094 LNGWYKNGKHPEHAFYEFTFRRFFDDNGYPYNYPKPIEYEYINSQ--GSEQQSDEDDQNTGSEIK 1156
            ||||||||||||||||||||||||||||:|||||||..|:|.::|  |.|....|:.:..|:...
 Frog  1046 LNGWYKNGKHPEHAFYEFTFRRFFDDNGHPYNYPKPFRYDYDDTQDMGGEDSDAEESEQDGNRPP 1110

Human  1157 NRDLVYV 1163
            |||||||
 Frog  1111 NRDLVYV 1117

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
LATS1XP_016866963.1 UBA_LATS1 103..143 CDD:270580 30/39 (77%)
PRK10263 <448..>596 CDD:236669 91/149 (61%)
MobB_LATS1 629..704 CDD:439273 69/74 (93%)
Protein Kinases, catalytic domain 703..1117 CDD:473864 348/413 (84%)
lats1XP_017949762.1 UBA_LATS1 102..142 CDD:270580 30/39 (77%)
MobB_LATS1 614..689 CDD:439273 69/74 (93%)
STKc_LATS1 688..1069 CDD:270775 348/413 (84%)

Return to query results.
Submit another query.