DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment RHOT2 and Rhot2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001339204.1 Gene:RHOT2 / 89941 HGNCID:21169 Length:619 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_861544.1 Gene:Rhot2 / 287156 RGDID:727970 Length:622 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:623 Identity:524/623 - (84%)
Similarity:559/623 - (89%) Gaps:5/623 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MRRDVRILLLGEAQVGKTSLILSLVGEEFPEEVPPRAEEITIPADVTPEKVPTHIVDYSEAEQTD 65
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||:
  Rat     1 MRRDVRILLLGEAQVGKTSLILSLVGEEFPEEVPARAEEITIPADVTPEKVPTHIVDYSEAEQTE 65

Human    66 EELREEIHKANVVCVVYDVSEEATIEKIRTKWIPLVNGGTTQGPRVPIILVGNKSDLRSGSSMEA 130
            |||:||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||:||||||||||||.||::||
  Rat    66 EELQEEIHKANVVCVVYDVSEEATIEKIRTKWIPLVNGRTATGPRLPIILVGNKSDLRPGSTIEA 130

Human   131 VLPIMSQFPEIETCVECSAKNLRNISELFYYAQKAVLHPTAPLYDPEAKQLRPACAQALTRIFRL 195
            ||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 VLPIMSQFPEIETCVECSAKHLRNISELFYYAQKAVLHPTAPLYDPEAKQLRPACAQALTRIFRL 195

Human   196 SDQDLDQALSDEELNAFQQKSCFGHPLAPQALEDVKTVVCRNVAGGVREDRLTLDGFLFLNTLFI 260
            ||||||.||||:||||| ||||||||||||||||||.|||:||||||::|||||:||||||||||
  Rat   196 SDQDLDHALSDKELNAF-QKSCFGHPLAPQALEDVKRVVCKNVAGGVQDDRLTLEGFLFLNTLFI 259

Human   261 QRGRHETTWTILRRFGYSDALELTADYLSPLIHVPPGCSTELNHLGYQFVQRVFEKHDQDRDGAL 325
            |||||||||||||||||||:||||.|||.|.::|||||||||||.|||||||||||||||.||.|
  Rat   260 QRGRHETTWTILRRFGYSDSLELTPDYLCPPLYVPPGCSTELNHRGYQFVQRVFEKHDQDHDGVL 324

Human   326 SPVELQSLFSVFPAAPWGPELPRTVRTEAGRLPLHGYLCQWTLVTYLDVRSCLGHLGYLGYPTLC 390
            ||.||:||||||..|||||||..||.||||.|.|.||||||||||||||:.||.|||||||||||
  Rat   325 SPTELESLFSVFSVAPWGPELLHTVPTEAGCLSLRGYLCQWTLVTYLDVQHCLAHLGYLGYPTLC 389

Human   391 EQD-QAHAITVTREKRLDQEKGQTQRSVLLCKVVGARGVGKSAFLQAFLGRGLGHQDTREQP--- 451
            ||| ||.||||||||||||||||||||||:|||:||||||||||||||||..||....|:.|   
  Rat   390 EQDSQAQAITVTREKRLDQEKGQTQRSVLMCKVLGARGVGKSAFLQAFLGHSLGEARDRDAPEKL 454

Human   452 PGYAIDTVQVNGQEKYLILCEVGTDGLLATSLDATCDVACLMFDGSDPKSFAHCASVYKHHYMDG 516
            |.:.|:||:|:|||||||||||..|.||.||||.||||||||||.|||::|..||::||.:||||
  Rat   455 PTHTINTVRVSGQEKYLILCEVNADSLLDTSLDTTCDVACLMFDSSDPETFVQCATIYKRYYMDG 519

Human   517 QTPCLFVSSKADLPEGVAVSGPSPAEFCRKHRLPAPVPFSCAGPAEPSTTIFTQLATMAAFPHLV 581
            ||||||:|||||||||||..|.|||||||:||||||..|||.|||:.|..:||||||||.||||.
  Rat   520 QTPCLFISSKADLPEGVAPPGLSPAEFCRRHRLPAPASFSCLGPAQSSIDVFTQLATMATFPHLA 584

Human   582 HAELHPSSFWLRGLLGVVGAAVAAVLSFSLYRVLVKSQ 619
            |.||||:.|||||:|..||.|||||||||||||||||:
  Rat   585 HTELHPTPFWLRGVLVAVGTAVAAVLSFSLYRVLVKSR 622

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
RHOT2NP_001339204.1 Miro1 3..169 CDD:206680 154/165 (93%)
EF_assoc_2 221..304 CDD:462444 71/82 (87%)
EF_assoc_1 342..409 CDD:462443 56/67 (84%)
Miro2 414..590 CDD:206679 128/178 (72%)
Rhot2NP_861544.1 Miro1 3..169 CDD:206680 154/165 (93%)
EF_assoc_2 220..303 CDD:462444 71/82 (87%)
FRQ1 <307..>340 CDD:444056 26/32 (81%)
EF_assoc_1 341..409 CDD:462443 56/67 (84%)
Miro2 414..593 CDD:206679 128/178 (72%)

Return to query results.
Submit another query.